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단일 세포 전사체 분석을 통한 암 미세 환경 내 세포 클러스터의 표적 후보 추천 방법, 그 장치 및 프로그램

  • 기술번호 : KST2023008652
  • 담당센터 : 서울동부기술혁신센터
  • 전화번호 : 02-2155-3662
요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 본 발명에 따른 컴퓨팅 장치에 의해 수행되는 단일 세포 전사체 정보를 통한 표적 후보 물질 제안 방법은, 비정상 조직과 정상조직의 단일 세포 전사체 정보를 수집하고, 단일 세포 전사체 정보에 대한 클러스터링 결과를 대응하는 세포군으로 매칭하고, 세포군 중 관심 세포군을 선정하고, 관심 세포군에서 비정상 조직에서 정상조직 대비 발현율이 높은 분자마커를 도출하고, 및 분자마커 중 표면 단백질 발현 가능한 분자마커를 도출하는 단계를 포함한다.
Int. CL G16B 25/10 (2019.01.01) G16B 40/30 (2019.01.01) G16B 45/00 (2019.01.01) G16B 20/00 (2019.01.01) C12Q 1/6883 (2018.01.01)
CPC G16B 25/10(2013.01) G16B 40/30(2013.01) G16B 45/00(2013.01) G16B 20/00(2013.01) C12Q 1/6883(2013.01) C12Q 2600/156(2013.01)
출원번호/일자 1020230041265 (2023.03.29)
출원인 주식회사 포트래이, 서울대학교산학협력단
등록번호/일자
공개번호/일자 10-2023-0140439 (2023.10.06) 문서열기
공고번호/일자
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보 대한민국  |   1020220038613   |   2022.03.29
법적상태 공개
심사진행상태 수리
심판사항
구분 국내출원/신규
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2023.04.07)
심사청구항수 17

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 주식회사 포트래이 대한민국 서울특별시 종로구
2 서울대학교산학협력단 대한민국 서울특별시 관악구

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 임형준 서울 종로구
2 이성준 서울특별시 종로구
3 박정빈 경기도 시흥시 신현
4 이대승 대한민국 서울특별시 성동구

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 박수영 대한민국 서울특별시 송파구 송파대로 ***(문정동) 테라타워 에이동 ***호(특허그룹제이엔피)

최종권리자

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번호 이름 국적 주소
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번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 [특허출원]특허출원서
[Patent Application] Patent Application
2023.03.29 수리 (Accepted) 1-1-2023-0354978-61
2 [심사청구]심사청구서·우선심사신청서
2023.04.07 수리 (Accepted) 1-1-2023-0396846-16
번호, 청구항의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 청구항 표입니다.
번호 청구항
1 1
컴퓨팅 장치에 의해 수행되는 단일 세포 전사체 정보를 통한 표적 후보 물질 제안 방법에 있어서,비정상 조직과 정상조직의 단일 세포 전사체 정보를 수집하는 단계;단일 세포 전사체 정보에 대한 클러스터링 결과를 대응하는 세포군으로 매칭하는 단계;세포군 중 관심 세포군을 선정하는 단계;관심 세포군에서 비정상 조직에서 정상조직 대비 발현율이 높은 분자마커를 도출하는 단계; 및분자마커 중 표면 단백질 발현 가능한 분자마커를 도출하는 단계;를 포함하는 것을 특징으로 하는 표적 후보 물질 제안 방법
2 2
제1 항에 있어서,상기 비정상 조직은 악성 종양인 것을 특징으로 하는 표적 후보 물질 제안 방법
3 3
제1항에 있어서,상기 비정상 조직과 정상조직의 단일 세포 전사체 정보를 수집하는 단계는,암 종류를 선정하는 단계를 포함하는 것을 특징으로 하는 표적 후보 물질 제안 방법
4 4
제1 항에 있어서,상기 단일 세포 전사체 정보에 대한 클러스터링 결과를 대응하는 세포군으로 매칭하는 단계는, 비지도학습에 의한 클러스터링 되는 것을 특징으로 하는 표적 후보 물질 제안 방법
5 5
제1 항에 있어서,상기 단일 세포 전사체 정보에 대한 클러스터링 결과를 대응하는 세포군으로 매칭하는 단계는, 전체 전사체 발현 프로파일의 유사도가 기준치를 넘어서는 지를 기준으로 그룹화 하는 것을 특징으로 하는 표적 후보 물질 제안 방법
6 6
제1 항에 있어서,상기 세포군 중 관심 세포군을 선정하는 단계는,특이적 생체 마커의 발현율을 연산하여 선정하는 것을 특징으로 하는 표적 후보 물질 제안 방법
7 7
제1 항에 있어서,정상인과 환자의 조직 전사체 정보를 수집하는 단계; 및표면 단백질 발현 가능한 분자마커를 조직 전사체 정보에서 검증하여 특이적 마커를 도출하는 단계;를 더 포함하는 것을 특징으로 하는 표적 후보 물질 제안 방법
8 8
제1 항에 있어서,표면 단백질 발현 가능한 분자마커를 조직 전사체 정보에서 검증하여 특이적 마커 후보를 도출하는 단계를 더 포함하는 것을 특징으로 하는 표적 후보 물질 제안 방법
9 9
제8 항에 있어서,타겟 암종의 레퍼런스 세포들에 대한 공간전사체 분포를 확인하는 단계를 더 포함하는 것을 특징으로 하는 표적 후보 물질 제안 방법
10 10
제9 항에 있어서,암 특이적 마커 후보에 대한 공간전사체 분포와 레퍼런스 세포들에 대한 공간전사체 분포의 상관관계를 도출하는 단계를 더 포함하는 것을 특징으로 하는 표적 후보 물질 제안 방법
11 11
제10 항에 있어서,양의 상관관계를 가지는 세포와 암 특이적 마커 후보의 세포 분포를 2차적으로 확인하는 단계를 더 포함하는 것을 특징으로 하는 표적 후보 물질 제안 방법
12 12
제11 항에 있어서,암 특이적 마커 후보의 유전자 연관성을 판단하는 단계를 더 포함하는 것을 특징으로 하는 표적 후보 물질 제안 방법
13 13
제12 항에 있어서,상기 암 특이적 마커 후보의 유전자 연관성을 판단하는 단계는,Gene Ontology(GO) 분석 또는 경로 분석(pathway analysis)를 이용하여 유전자 연관성을 정량적으로 판단하는 단계인 것을 특징으로 하는 표적 후보 물질 제안 방법
14 14
제13 항에 있어서,암 특이적 마커 후보의 유전자 연관성을 판단하여 정량적으로 판단된 연관성 높은 유전자가 암 발현에 기준치 이상의 영향성을 주는 암발현 관련 유전자 인지를 판단하는 단계;를 더 포함하는 것을 특징으로 하는 표적 후보 물질 제안 방법
15 15
제14 항에 있어서,암 특이적 마커 후보 중에 암발현 관련 유전자의 숫자가 높은 순서로 최종 암 특이적 마커를 선별하는 단계;를 더 포함하는 것을 특징으로 하는 표적 후보 물질 제안 방법
16 16
컴퓨팅 장치를 이용하여 제1 항 내지 제15 항 중 어느 한 항의 방법을 실행시키기 위하여 기록매체에 저장된 컴퓨터 프로그램
17 17
프로세서;를 포함하고, 상기 프로세서는, 비정상 조직과 정상조직의 단일 세포 전사체 정보를 수집하고, 단일 세포 전사체 정보에 대한 클러스터링 결과를 대응하는 세포군으로 매칭하고, 세포군 중 관심 세포군을 선정하고, 관심 세포군에서 비정상 조직에서 정상조직 대비 발현율이 높은 분자마커를 도출하고, 및 분자마커 중 표면 단백질 발현 가능한 분자마커를 도출하는 것을 수행하는 것을 특징으로 하는 표적 후보 물질 제안 장치
지정국 정보가 없습니다
패밀리정보가 없습니다
국가 R&D 정보가 없습니다.