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온톨로지 기반의 단백질 상호작용 검색 엔진

  • 기술번호 : KST2014029068
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요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 본 발명은 온톨로지 기반의 단백질 상호작용 검색 엔진에 관한 것으로서, 더욱 상세하게는 변형된 괴델수에 의한 단백질 간의 생물학적 관계의 표현을 사용한 단백질 상호작용 검색 엔진은 특정 단백질과 상호작용하는 대부분의 단백질을 효율적으로 검색할 수 있고 유전자 온톨로지 용어 간의 계층구조를 반영하므로 더욱 특정한 용어를 사용하여 검색할 수 있으므로, 다양한 상호작용을 효율적으로 검색할 수 있는 검색 엔진으로서 유용하게 사용할 수 있다.
Int. CL G06F 17/00 (2006.01) G06F 17/30 (2006.01)
CPC G06F 19/18(2013.01) G06F 19/18(2013.01) G06F 19/18(2013.01)
출원번호/일자 1020100019754 (2010.03.05)
출원인 인하대학교 산학협력단
등록번호/일자 10-1106174-0000 (2012.01.09)
공개번호/일자 10-2011-0100757 (2011.09.15) 문서열기
공고번호/일자 (20120120) 문서열기
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보
법적상태 소멸
심사진행상태 수리
심판사항
구분 신규
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2010.03.05)
심사청구항수 13

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 인하대학교 산학협력단 대한민국 인천광역시 미추홀구

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 한경숙 대한민국 인천광역시 남구
2 박병규 대한민국 인천광역시 남구

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 이원희 대한민국 서울특별시 강남구 테헤란로 ***, 성지하이츠빌딩*차 ***호 (역삼동)

최종권리자

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번호 이름 국적 주소
1 한경숙 서울특별시 양천구
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번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 [특허출원]특허출원서
[Patent Application] Patent Application		 2010.03.05 수리 (Accepted) 1-1-2010-0141686-45
2 선행기술조사의뢰서
Request for Prior Art Search		 2011.03.11 수리 (Accepted) 9-1-9999-9999999-89
3 선행기술조사보고서
Report of Prior Art Search		 2011.04.19 수리 (Accepted) 9-1-2011-0036743-18
4 의견제출통지서
Notification of reason for refusal		 2011.05.17 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2011-0262886-11
5 [명세서등 보정]보정서
[Amendment to Description, etc.] Amendment		 2011.07.01 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) 1-1-2011-0506073-18
6 [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견(답변, 소명)서
[Opinion according to the Notification of Reasons for Refusal] Written Opinion(Written Reply, Written Substantiation)		 2011.07.01 수리 (Accepted) 1-1-2011-0506071-27
7 등록결정서
Decision to grant		 2012.01.06 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2012-0011047-46
8 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2015.07.22 수리 (Accepted) 4-1-2015-5098802-16
9 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2016.09.05 수리 (Accepted) 4-1-2016-5127132-49
10 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2018.03.02 수리 (Accepted) 4-1-2018-5036549-31
11 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2018.12.27 수리 (Accepted) 4-1-2018-5266647-91
번호, 청구항의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 청구항 표입니다.
번호 청구항
1 1
단백질 정보를 입력받아 생물학적 데이터베이스 또는 유전자 온톨로지 데이터베이스에 적용하여 상기 단백질에 대응되는 분자적 기능(molecular function) 분류, 생물학적 과정(biological process) 분류 및 세포성분(cellular component) 분류의 유전자 온톨로지 용어를 할당하는 유전자 온톨로지 용어 할당 수단; 상기 유전자 온톨로지 용어 할당 수단에 의해 할당된 유전자 온톨로지 용어에 소수를 순차적으로 지정하는 알고리즘, 상기 지정된 소수를 로컬 DB에 저장하는 알고리즘, 및 생물학적 데이터베이스에 분류된 단백질 정보를 바탕으로, 상호작용하는 단백질의 유전자 온톨로지 용어에 지정된 소수 및 이의 루트 용어에 지정된 소수들을 곱하는 알고리즘을 통해 생성되는 변형된 괴델수(Godel number)로, 유전자 온톨로지 용어 간의 관계를 표현하는 표현 수단;상기 표현 수단에 의해 생성된 변형된 괴델수의 표현을 바탕으로, 분석하고자 하는 단백질에 대한 단백질 상호작용 정보를 검색하는 단백질 상호작용 검색 수단; 및상기 검색 수단에 의한 결과로부터 상기 분석하고자 하는 단백질과 상호작용하는 단백질을 판정하는 판정 수단을 포함하는 유전자 온톨로지 기반의 단백질 상호작용 검색 엔진
2 2
제 1항에 있어서, 상기 유전자 온톨로지 데이터베이스는 GO(Gene Ontology)를 바탕으로 하는 것을 특징으로 하는 유전자 온톨로지 기반의 단백질 상호작용 검색 엔진
3 3
제 1항에 있어서, 상기 단백질 상호작용 검색 수단은 유전자 온톨로지 용어 간의 상호작용 관계에 지정된 변형된 괴델수와 분석하고자 하는 단백질에 지정된 변형된 괴델수의 나눗셈 및 모듈로 연산(modulo operation)을 통해 수행되는 것을 특징으로 하는 유전자 온톨로지 기반의 단백질 상호작용 검색 엔진
4 4
삭제
5 5
제 1항에 있어서, 상기 판정 수단은 검색 수단을 통해 수행된 연산값 중에서, 유전자 온톨로지 용어 간의 상호작용 관계에 지정된 변형된 괴델수를 분석하고자 하는 단백질에 지정된 변형된 괴델수로 나눈 나머지가 0일 경우, 상기 유전자 온톨로지 용어가 할당된 단백질과 상기 분석하고자 하는 단백질이 상호작용하는 것으로 판단하는 것을 특징으로 하는 유전자 온톨로지 기반의 단백질 상호작용 검색 엔진
6 6
분석하고자 하는 단백질과 상호작용하는 단백질을 검색 및 판정하는 제 1항의 검색 엔진; 및상기 검색 엔진을 통해 선별된 단백질 상호작용 정보에 대한 시각화 데이터를 생성하는 시각화 수단을 포함하는 유전자 온톨로지 기반의 단백질 상호작용 검색 장치
7 7
제 6항에 있어서, 상기 분석하고자 하는 단백질의 정보는 유전자 기호, 유전자 명칭, 단백질 명칭 및 단백질의 아미노산 서열로 구성된 군으로부터 선택되는 어느 하나인 것을 특징으로 하는 유전자 온톨로지 기반의 단백질 상호작용 검색 장치
8 8
1) 컴퓨터 입력 수단을 통해 분석하고자 하는 단백질 정보를 입력하는 단계;2) 유전자 온톨로지 용어 할당 수단을 통해 생물학적 데이터베이스 또는 유전자 온톨로지 용어 할당 수단을 통해 유전자 온톨로지 데이터베이스에 적용하여 분석하고자 하는 단백질에 대응되는 분자적 기능(molecular function) 분류, 생물학적 과정(biological process) 분류 및 세포성분(cellular component) 분류의 유전자 온톨로지 용어를 할당하는 단계; 3) 표현 수단을 통해 생물학적 데이터베이스에 분류된 단백질 정보를 바탕으로 유전자 온톨로지 용어에 소수를 순차적으로 지정하는 알고리즘, 상기 지정된 소수를 로컬 DB에 저장하는 알고리즘, 및 상호작용하는 단백질의 유전자 온톨로지 용어에 지정된 소수 및 이의 루트 용어에 지정된 소수들을 곱하는 알고리즘으로 변형된 괴델수(Godel number)를 생성하여, 상기 변형된 괴델수로서 유전자 온톨로지 용어 간의 관계를 표현하는 단계;4) 단백질 상호작용 검색 수단을 통해 단계 3)의 변형된 괴델수의 표현을 바탕으로 상기 단계 1)에서 입력된 단백질에 대한 단백질 상호작용 정보를 검색하는 단계; 및5) 판정 수단을 통해 상기 단계 4)의 단백질 상호작용 검색 결과로부터 상기 분석하고자 하는 단백질과 상호작용하는 단백질을 판정하는 단계를 포함하는 유전자 온톨로지 기반의 단백질 상호작용 검색 방법
9 9
제 8항에 있어서, 단계 1)의 입력 수단은 자동완성기능(autocomplete functionality)을 가지는 것을 특징으로 하는 유전자 온톨로지 기반의 단백질 상호작용 검색 방법
10 10
제 8항에 있어서, 단계 1)의 단백질 정보는 유전자 기호, 유전자 명칭, 단백질 명칭 및 단백질의 아미노산 서열로 구성된 군으로부터 선택되는 어느 하나인 것을 특징으로 하는 유전자 온톨로지 기반의 단백질 상호작용 검색 방법
11 11
제 8항에 있어서, 단계 1)의 분석하고자 하는 단백질의 특성은 하나 또는 그 이상을 지정하는 것을 특징으로 하는 유전자 온톨로지 기반의 단백질 상호작용 검색 방법
12 12
제 8항에 있어서, 단계 4)의 단백질 상호작용 정보를 검색하는 단계는 유전자 온톨로지 용어 간의 상호작용 관계에 지정된 변형된 괴델수와 분석하고자 하는 단백질에 지정된 변형된 괴델수의 정수 나눗셈 및 모듈로 연산을 통해 수행되는 것을 특징으로 하는 유전자 온톨로지 기반의 단백질 상호작용 검색 방법
13 13
제 8항에 있어서, 단계 5)의 분석하고자 하는 단백질과 상호작용하는 단백질을 판정하는 단계는 검색 단계를 통해 수득한 연산값 중에서, 유전자 온톨로지 용어들 간의 상호작용 관계에 지정된 변형된 괴델수를, 분석하고자 하는 단백질에 지정된 변형된 괴델수로 나눈 나머지가 0일 경우, 상기 유전자 온톨로지 용어가 할당된 단백질과 상기 분석하고자 하는 단백질이 상호작용하는 것으로 판단하는 것을 특징으로 하는 유전자 온톨로지 기반의 단백질 상호작용 검색 방법
14 14
제 8항에 있어서, 상기 단계 5) 이후에a) 시각화 수단을 통해 상기 단계 5)의 판정 수단을 통해 선별된 단백질 상호작용 정보에 대한 시각화 데이터를 생성하는 단계; 및b) 출력 수단을 통해 상기 단계 6)의 시각화 데이터를 출력하는 단계를 추가적으로 포함하는 것을 특징으로 하는 유전자 온톨로지 기반의 단백질 상호작용 검색 방법
지정국 정보가 없습니다
패밀리정보가 없습니다
순번, 연구부처, 주관기관, 연구사업, 연구과제의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 국가R&D 연구정보 정보 표입니다.
순번 연구부처 주관기관 연구사업 연구과제
1 교육과학기술부 인하대학교 기초연구사업 (여성과학자 지원사업) 온톨로지 기반의 단백질 상호작용 검색 기법