맞춤기술찾기

홈으로 가기
맞춤기술찾기
이전대상기술
프린트하기

이전대상기술

게놈 수준에서의 부탄올 생산 미생물의 대사 네트워크 모델 및 이를 이용한 부탄올 생성 미생물의 대사특성분석 및 결실 표적 스크리닝 방법

  • 기술번호 : KST2015113400
  • 담당센터 : 대전기술혁신센터
  • 전화번호 : 042-610-2279
상담신청 PDF 받기
요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 본 발명은 부탄올 생성 미생물의 대사 특성 분석용 대사 네트워크 모델 및 이를 이용한 부탄올 생성 미생물의 대사특성분석 및 결실 표적 스크리닝 방법에 관한 것으로, 보다 상세하게는 유전자-단백질-생화학 반응관계를 이용한 부탄올 생성 미생물의 대사 네트워크 모델의 구축 및 구축된 모델을 이용한 대사흐름 등 대사특성의 분석과, 대사흐름분석에 기반한 시뮬레이션을 이용하여 결실 시 특정 대사산물의 생성능을 향상시키는 결실 표적을 스크리닝하는 방법에 관한 것이다. 본 발명에 따른 대사 네트워크 모델은 부탄올 생성 미생물의 대사흐름 등 대사특성 분석 및 특정 대사산물의 생산을 증가시키기 위한 결실 표적 효소 또는 그 유전자의 스크리닝에 유용하며, 본 발명에 따른 결실 표적 스크리닝 방법은 기존의 방법과 달리, 효율적으로 결실 표적들을 예측할 수 있게 하며, 시간 및 비용을 절약할 수 있게 하고, 특정 대사산물을 고효율로 생산할 수 있는 변이 미생물을 제공하는 효과가 있으므로, 유용하다. 대사 네트워크 모델, 대사특성분석, 클로스트리듐 속, 부탄올, 가상 세포
Int. CL C12Q 1/32 (2006.01) G06F 19/18 (2011.01) C12P 7/16 (2006.01)
CPC G06F 19/18(2013.01) G06F 19/18(2013.01) G06F 19/18(2013.01)
출원번호/일자 1020090032406 (2009.04.14)
출원인 한국과학기술원, 바이오퓨얼켐 주식회사, 지에스칼텍스 주식회사
등록번호/일자 10-1100866-0000 (2011.12.23)
공개번호/일자 10-2009-0109072 (2009.10.19) 문서열기
공고번호/일자 (20120102) 문서열기
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보 대한민국  |   1020080034238   |   2008.04.14
법적상태 등록
심사진행상태 수리
심판사항
구분 신규
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2009.04.14)
심사청구항수 16

출원인

번호, 이름, 국적, 주소의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 인명정보 - 출원인 표입니다.
번호 이름 국적 주소
1 한국과학기술원 대한민국 대전광역시 유성구
2 바이오퓨얼켐 주식회사 대한민국 대전광역시 유성구
3 지에스칼텍스 주식회사 대한민국 서울특별시 강남구

발명자

번호, 이름, 국적, 주소의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 인명정보 - 발명자 표입니다.
번호 이름 국적 주소
1 이상엽 대한민국 대전광역시 유성구
2 이종민 대한민국 강원 원주시
3 윤홍석 대한민국 대전 유성구
4 정광섭 대한민국 대전광역시 유성구

대리인

번호, 이름, 국적, 주소의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 인명정보 - 대리인 표입니다.
번호 이름 국적 주소
1 배영심 대한민국 서울특별시 성북구 화랑로**길 *(하월곡동) 한국과학기술연구원 L* *층 연구성과확산팀(한국과학기술연구원)
2 이처영 대한민국 서울특별시 강남구 언주로 ***, **층 (역삼동, 윤익빌딩)(*T국제특허법률사무소)

최종권리자

번호, 이름, 국적, 주소의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 인명정보 - 최종권리자 표입니다.
번호 이름 국적 주소
1 지에스칼텍스 주식회사 서울특별시 강남구
번호, 서류명, 접수/발송일자, 처리상태, 접수/발송일자의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 행정처리 표입니다.
번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 [특허출원]특허출원서
[Patent Application] Patent Application		 2009.04.14 수리 (Accepted) 1-1-2009-0224971-19
2 선행기술조사의뢰서
Request for Prior Art Search		 2010.10.08 수리 (Accepted) 9-1-9999-9999999-89
3 선행기술조사보고서
Report of Prior Art Search		 2010.11.16 수리 (Accepted) 9-1-2010-0071352-90
4 의견제출통지서
Notification of reason for refusal		 2011.01.20 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2011-0039648-86
5 [지정기간연장]기간연장(단축, 경과구제)신청서
[Designated Period Extension] Application of Period Extension(Reduction, Progress relief)		 2011.03.17 수리 (Accepted) 1-1-2011-0197257-52
6 [지정기간연장]기간연장(단축, 경과구제)신청서
[Designated Period Extension] Application of Period Extension(Reduction, Progress relief)		 2011.04.14 수리 (Accepted) 1-1-2011-0276069-51
7 [지정기간연장]기간연장(단축, 경과구제)신청서
[Designated Period Extension] Application of Period Extension(Reduction, Progress relief)		 2011.05.20 수리 (Accepted) 1-1-2011-0379409-19
8 [복대리인선임]대리인(대표자)에 관한 신고서
[Appointment of Sub-agent] Report on Agent (Representative)		 2011.05.31 수리 (Accepted) 1-1-2011-0410342-22
9 [명세서등 보정]보정서
[Amendment to Description, etc.] Amendment		 2011.06.17 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) 1-1-2011-0462335-65
10 [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견(답변, 소명)서
[Opinion according to the Notification of Reasons for Refusal] Written Opinion(Written Reply, Written Substantiation)		 2011.06.17 수리 (Accepted) 1-1-2011-0462334-19
11 등록결정서
Decision to grant		 2011.12.08 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2011-0728409-53
12 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2013.02.01 수리 (Accepted) 4-1-2013-5019983-17
13 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2014.12.24 수리 (Accepted) 4-1-2014-5157993-01
14 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2014.12.24 수리 (Accepted) 4-1-2014-5158129-58
15 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2014.12.24 수리 (Accepted) 4-1-2014-5157968-69
16 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2019.04.24 수리 (Accepted) 4-1-2019-5081392-49
17 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2020.05.15 수리 (Accepted) 4-1-2020-5108396-12
18 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2020.06.12 수리 (Accepted) 4-1-2020-5131486-63
번호, 청구항의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 청구항 표입니다.
번호 청구항
1 1
하기 표 1의 효소반응식, 대사 산물 및 화학량론적 계수(stoichiometric coefficient)를 포함하는 데이터베이스를 포함하는, 부탄올 생성 미생물의 대사 특성 분석용 대사 네트워크 모델을 포함하는 컴퓨터로 읽을 수 있는 매체, 이때, 상기 부탄올 생성 미생물은 클로스트리듐(Clostridium) 속 미생물임을 특징으로 함: 003c#표 1003e#
2 2
삭제
3 3
삭제
4 4
삭제
5 5
제1항의 대사 네트워크 모델로 부탄올 생성 미생물의 대사흐름을 모사하는 단계를 포함하는 부탄올 생성 미생물의 대사특성 분석방법
6 6
제5항에 있어서, 상기 대사특성은 대사흐름인 것을 특징으로 하는 방법
7 7
제6항에 있어서, 다음 단계를 포함하는 것을 특징으로 하는 방법: (a) 상기 대사 네트워크 모델 중 사용가능한 탄소원 및 질소원에 대한 수송 반응식을 보정하는 단계; 및 (b) 상기 탄소원 및 질소원을 이용하여 대사흐름분석하는 단계
8 8
다음 중 어느 하나의 클로스터 계수 Cn을 이용하여 제1항의 대사 네트워크 모델의 토폴로지(topology)를 분석하는 방법: (a) Cn = N/M N : n번째 노드와 이웃한 노드간의 연결된 선의 개수 M : n번째 노드와 이웃한 노드간의 최대한으로 연결 가능한 선의 개수 여기서, 상기 노드는 상기 대사 네트워크의 대사산물을 나타내고, 2개의 노드를 연결하는 상기 선은 두 대사산물을 매개하는 효소반응식임; 및 (b)Cn = 2en/(kn(kn-1)) (단일방향으로 구성된 네트워크의 경우) Cn = en/(kn(kn-1)) (양방향으로 구성된 네트워크의 경우) kn : n번째 노드의 인접한 연결된 노드의 개수 en : n번째 노드의 모든 이웃 중 연결된 쌍의 수 여기서, 상기 노드는 상기 대사 네트워크의 대사산물을 나타냄
9 9
삭제
10 10
삭제
11 11
제1항의 대사 네트워크 모델에서 효소반응식들을 하나 또는 둘 이상씩 차단하며 선형계획법을 적용하되, 특정 대사산물의 생성능이 증가하는 경우 차단된 효소 반응식의 효소를 결실 표적효소로 선정하거나, 이를 코딩하는 유전자를 결실 표적유전자로 선정하는 것을 특징으로 하는 부탄올 생성 미생물의 특정 대사산물의 생산을 증가시키기 위한 결실 표적 효소 또는 그 유전자의 스크리닝 방법
12 12
제11항에 있어서, 성장 반응식의 반응속도 또는 대사흐름값이 양수인 조건에서 특정 대사산물의 생성능이 증가하는 경우에 차단된 효소 반응식의 효소를 결실 표적효소로 선정하거나, 이를 코딩하는 유전자를 결실 표적유전자로 선정하는 것을 특징으로 하는 방법
13 13
제12항에 있어서, 부탄올 생산 미생물의 대사 네트워크 모델에서 효소반응식들을 하나 또는 둘 이상씩 차단하며 선형계획법을 적용하는 단계를 추가로 수행하되, 성장 반응식의 반응속도 또는 대사흐름값이 0인 조건에서 특정 대사산물의 생성능이 증가하는 경우에 차단된 효소 반응식의 효소를 2차 결실 표적효소 후보로 선정한 후, 상기 성장 반응식의 반응속도 또는 대사흐름값이 양수인 조건의 결실 표적효소와 중복되는 경우에만 결실 표적효소로 선정하거나, 이를 코딩하는 유전자를 결실 표적유전자로 선정하는 것을 특징으로 하는 방법
14 14
제12항에 있어서, 상기 성장 반응식은 반응식 Ⅰ인 것을 특징으로 하는 방법: [반응식 Ⅰ] 0
15 15
제11항에 있어서, 상기 특정 대사산물은 부탄올, 아세트산, 부틸레이트(butyrate), 에탄올 및 아세트산으로 구성된 군에서 선택되는 것임을 특징으로 하는 방법
16 16
부탄올 생성 미생물에서 제11항의 방법에 의하여 스크리닝된 결실 표적유전자를 결실시키는 것을 특징으로 하는 특정 대사산물의 생성능이 증가된 변이 미생물의 제조방법
17 17
제16항의 방법으로 제조된 특정 대사산물의 생성능이 증가된 변이 미생물
18 18
제17항의 변이 미생물을 배양하는 단계; 및 상기 변이 미생물의 배양액으로부터 특정 대사산물을 회수하는 단계를 포함하는 특정 대사산물의 제조방법
19 19
제1항의 대사 네트워크 모델로 부탄올 생성 미생물의 대사흐름을 모사하는 단계를 포함하는 부탄올 생성 미생물의 대사흐름 예측방법
20 20
제19항에 있어서, 기질의 흡수속도를 선행 입력값으로 한 선형계획법 또는 이차계획법을 이용하는 것을 특징으로 하는 부탄올 생성 미생물의 대사흐름 예측방법
21 21
제20항에 있어서, 다음의 반응식 Ⅱ을 이용하는 것을 특징으로 하는 방법: [반응식 Ⅱ] 제한 조건: S·ν=0, νmin≤ν≤νmax 여기서, νacid는 산 생성기에서의 대사흐름 벡터이고; νsol는 용매 생성기에서의 대사흐름 벡터이고; 는 용매 생성기에서 조효소 A 전달 효소에 의한 부티르산의 흡수 속도이고; 는 용매 생성기에서 조효소 A 전달 효소에 의한 아세트산의 흡수 속도이고; 는 산 생성기에서 부티르산의 생성 속도이고; 는 산 생성기에서 아세트산의 생성 속도임
지정국 정보가 없습니다
순번, 패밀리번호, 국가코드, 국가명, 종류의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 패밀리정보 - 패밀리정보 표입니다.
순번 패밀리번호 국가코드 국가명 종류
1 WO2009128644 WO 세계지적재산권기구(WIPO) FAMILY
2 WO2009128644 WO 세계지적재산권기구(WIPO) FAMILY
3 WO2009128644 WO 세계지적재산권기구(WIPO) FAMILY

DOCDB 패밀리 정보

순번, 패밀리번호, 국가코드, 국가명, 종류의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 패밀리정보 - DOCDB 패밀리 정보 표입니다.
순번 패밀리번호 국가코드 국가명 종류
1 WO2009128644 WO 세계지적재산권기구(WIPO) DOCDBFAMILY
2 WO2009128644 WO 세계지적재산권기구(WIPO) DOCDBFAMILY
3 WO2009128644 WO 세계지적재산권기구(WIPO) DOCDBFAMILY
국가 R&D 정보가 없습니다.