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헤어핀 모양의 RNA에 특이적으로 결합하는 양면성 펩타이드의 탐색 방법

  • 기술번호 : KST2015135059
  • 담당센터 : 서울동부기술혁신센터
  • 전화번호 : 02-2155-3662
요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 본 발명은 헤어핀 모양의 RNA에 특이적으로 결합하는 양면성 펩타이드의 탐색 방법에 관한 것으로, 보다 상세하게는 양면성 펩타이드의 친수성면 및 소수성면을 변화시킨 펩타이드 라이브러리를 이용하여 헤어핀 구조의 표적 RNA에 특이적이고 강력한 결합력을 갖는 양면성 펩타이드의 탐색 방법에 관한 것이다. 본 발명의 방법은 헤어핀 모양의 RNA 특이적 결합 양면성 펩타이드를 탐색하는 방법을 제공함으로써 선별된 펩타이드를 이용하여 헤어핀 모양의 RNA의 기능 탐구에 이용될 수 있고 자연에 존재하는 펩타이드보다 강력하고 특이적으로 헤어핀 모양의 RNA 표적에 결합하는 인공적인 펩타이드를 이용한 신약의 제조에 유용하게 이용될 수 있다. 양면성 펩타이드, 헤어핀 RNA, 라이브러리, 탐색 방법
Int. CL C07K 7/08 (2006.01.01) C07K 7/00 (2006.01.01) G01N 33/48 (2006.01.01) G01N 33/576 (2006.01.01)
CPC
출원번호/일자 1020090000147 (2009.01.02)
출원인 서울대학교산학협력단
등록번호/일자 10-1087168-0000 (2011.11.21)
공개번호/일자 10-2010-0080724 (2010.07.12) 문서열기
공고번호/일자 (20111125) 문서열기
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보
법적상태 등록
심사진행상태 수리
심판사항
구분 신규
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2009.01.02)
심사청구항수 18

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 서울대학교산학협력단 대한민국 서울특별시 관악구

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 유재훈 대한민국 서울 강남구
2 이수진 대한민국 서울시 종로구
3 키프트 제프리 미국 미국, 콜로라도, 오로라, *****

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 이원희 대한민국 서울특별시 강남구 테헤란로 ***, 성지하이츠빌딩*차 ***호 (역삼동)

최종권리자

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번호 이름 국적 주소
1 서울대학교산학협력단 대한민국 서울특별시 관악구
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번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 [특허출원]특허출원서
[Patent Application] Patent Application
2009.01.02 수리 (Accepted) 1-1-2009-0001083-61
2 선행기술조사의뢰서
Request for Prior Art Search
2010.08.04 수리 (Accepted) 9-1-9999-9999999-89
3 선행기술조사보고서
Report of Prior Art Search
2010.09.13 수리 (Accepted) 9-1-2010-0056277-66
4 의견제출통지서
Notification of reason for refusal
2011.02.21 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2011-0097615-28
5 [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견(답변, 소명)서
[Opinion according to the Notification of Reasons for Refusal] Written Opinion(Written Reply, Written Substantiation)
2011.04.08 수리 (Accepted) 1-1-2011-0259410-85
6 [명세서등 보정]보정서
[Amendment to Description, etc.] Amendment
2011.04.08 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) 1-1-2011-0259411-20
7 출원인정보변경(경정)신고서
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2011.09.27 수리 (Accepted) 4-1-2011-5195109-43
8 등록결정서
Decision to grant
2011.10.30 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2011-0632780-04
9 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2013.01.14 수리 (Accepted) 4-1-2013-5007213-54
10 출원인정보변경(경정)신고서
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2015.03.17 수리 (Accepted) 4-1-2015-5033829-92
11 출원인정보변경(경정)신고서
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2015.05.13 수리 (Accepted) 4-1-2015-5062924-01
12 출원인정보변경(경정)신고서
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2019.05.13 수리 (Accepted) 4-1-2019-5093546-10
13 출원인정보변경(경정)신고서
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2019.05.23 수리 (Accepted) 4-1-2019-5101798-31
14 출원인정보변경(경정)신고서
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2019.08.02 수리 (Accepted) 4-1-2019-5154561-59
15 출원인정보변경(경정)신고서
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2020.11.25 수리 (Accepted) 4-1-2020-5265458-48
번호, 청구항의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 청구항 표입니다.
번호 청구항
1 1
소수성 아미노산인 루신(Leucine, L)과 친수성 아미노산인 라이신(Lysine, K) 또는 글라이신(Glycine G)이 한 개 또는 두 개씩 교대로 배열된 아미노산 서열을 가지며 14 내지 150개의 아미노산으로 구성되는 양면성 펩타이드에서 한 개의 라이신(Lysine, K)을 한 개의 알라닌(Alanine, A)으로 치환한 아미노산 서열을 가지는 양면성 펩타이드를 포함하는 양면성 펩타이드 라이브러리
2 2
제 1항에 있어서, 상기 양면성 펩타이드는 서열번호 2 내지 8로 기재되는 아미노산 서열을 갖는 펩타이드 중 어느 하나 이상을 포함하는 것을 특징으로 하는 양면성 펩타이드 라이브러리
3 3
삭제
4 4
소수성 아미노산인 루신(Leucine, L)과 친수성 아미노산인 라이신(Lysine, K) 또는 글라이신(Glycine G)이 한 개 또는 두 개씩 교대로 배열된 아미노산 서열을 가지며 14 내지 150개의 아미노산으로 구성되는 양면성 펩타이드에서 한 개 또는 두 개의 라이신(Lysine, K)을 상기 라이신 보다 탄소수가 적은 아미노산으로 치환시킨 양면성 펩타이드들 중 어느 하나 이상을 포함하는 양면성 펩타이드 라이브러리
5 5
제 4항에 있어서, 상기 라이신 보다 탄소수가 적은 아미노산은 오르니틴(ornithine, Orn), 1,4-다이아미노뷰티르산(1,4-diaminobutyric acid, Dab) 및 1,3-다이프로파노익산(1,3-dipropanoic acid, Dap)으로 구성된 군으로부터 선택된 어느 하나인 것을 특징으로 하는 양면성 펩타이드 라이브러리
6 6
제 4항에 있어서, 상기 양면성 펩타이드는 서열번호 9 내지 21로 기재되는 아미노산 서열을 갖는 펩타이드 중 어느 하나 이상을 포함하는 것을 특징으로 하는 양면성 펩타이드 라이브러리
7 7
삭제
8 8
소수성 아미노산인 루신(Leucine, L)과 친수성 아미노산인 라이신(Lysine, K) 또는 글라이신(Glycine G)이 한 개 또는 두 개씩 교대로 배열된 아미노산 서열을 가지며 14 내지 150개의 아미노산으로 구성되는 양면성 펩타이드에서 한 개의 루신(Leucine, L)을 트립토판(tryptophane, W)으로 치환시킨 양면성 알파 나선형 펩타이드들 중 어느 하나 이상을 포함하는 양면성 펩타이드 라이브러리
9 9
제 8항에 있어서, 상기 양면성 펩타이드는 서열번호 22 내지 29로 기재되는 아미노산 서열을 갖는 펩타이드 중 어느 하나 이상을 포함하는 것을 특징으로 하는 양면성 펩타이드 라이브러리
10 10
삭제
11 11
소수성 아미노산인 루신(Leucine, L)과 친수성 아미노산인 라이신(Lysine, K) 및 글라이신(Glycine G)이 한 개 또는 두 개씩 교대로 배열된 아미노산 서열을 가지며 14 내지 150개의 아미노산으로 구성되는 양면성 펩타이드에서 한 개 또는 두 개의 라이신(Lysine, K)을 상기 라이신 보다 탄소수가 적은 아미노산으로 치환시키고, 한 개의 루신(Leucine, L)을 트립토판(tryptophane, W)으로 치환시킨 양면성 펩타이드들 중 어느 하나 이상을 포함하는 양면성 펩타이드 라이브러리
12 12
제 11항에 있어서, 상기 라이신 보다 탄소수가 적은 아미노산은 오르니틴(ornithine, Orn), 1,4-다이아미노뷰티르산(1,4-diaminobutyric acid, Dab) 및 1,3-다이프로파노익산(1,3-dipropanoic acid, Dap)으로 구성된 군으로부터 선택된 어느 하나인 것을 특징으로 하는 양면성 펩타이드 라이브러리
13 13
제 11항에 있어서, 상기 양면성 펩타이드는 서열번호 30 내지 37로 기재되는 아미노산 서열을 갖는 펩타이드 중 어느 하나 이상을 포함하는 것을 특징으로 하는 양면성 펩타이드 라이브러리
14 14
삭제
15 15
1) 제 1항의 양면성 펩타이드 라이브러리를 제조하는 단계; 2) 상기 양면성 펩타이드 라이브러리에 탐색하고자 하는 헤어핀 모양의 RNA를 합성하는 단계; 3) 상기 양면성 펩타이드, 헤어핀 모양의 RNA 및 탐침 분자를 혼합하여 형광광도계로 형광이방성을 측정하여 양면성 펩타이드에 대한 RNA의 결합력 및 결합편차를 산출하는 단계; 및 4) 상기 양면성 펩타이드에 대한 결합력 및 결합편차가 작은 헤어핀 모양의 RNA를 선별하는 단계를 포함하는 난잡한 헤어핀 RNA 탐색방법
16 16
1) 제 4항, 제 8항 및 제 11항으로 구성된 군으로부터 선택된 어느 하나의 양면성 펩타이드 라이브러리를 제조하는 단계; 2) 특이적 결합 리간드를 탐색하고자 하는 헤어핀 모양의 RNA를 합성하는 단계; 3) 상기 양면성 펩타이드, 헤어핀 모양의 RNA 및 탐침 분자를 혼합하여 형광광도계로 형광이방성을 측정하여 RNA와 펩타이드의 결합강도를 산출하는 단계; 및 4) 상기 표적 헤어핀 모양의 RNA에 대해 결합력이 강한 양면성 펩타이드를 선택하는 단계를 포함하는 표적 헤어핀 모양의 RNA에 특이적으로 결합하는 양면성 펩타이드 탐색 방법
17 17
제 16항에 있어서, 단계 2)의 헤어핀 모양의 RNA는 RRE(Rev responsive element) RNA, TAR(trans-activating region) RNA, 16S rRNA의 A-site 및 IRES(Internal Ribosome Entry Site) RNA으로 구성된 군으로부터 선택된 어느 하나인 것을 특징으로 하는 탐색 방법
18 18
제 16항에 있어서, 단계 3)의 탐침 분자는 형광을 띄고 양면성 펩타이드와 경쟁하여 표적 헤어핀 모양의 RNA에 결합할 수 있는 태그로 표지되어 있는 화합물인 것을 특징으로 하는 탐색 방법
19 19
제 16항의 방법에 의해 선별된 양면성 펩타이드를 유효성분으로 함유하는 헤어핀 모양의 RNA 활성 저해제
20 20
표적 헤어핀 모양의 RNA가 RRE RNA 또는 TAR RNA일 때, 제 16항의 방법에 의해 선별된 양면성 펩타이드를 유효성분으로 함유하는 AIDS 치료제 또는 진단시약
21 21
표적 헤어핀 모양의 RNA가 16S rRNA A-site일 때, 제 16항의 방법에 의해 선별된 양면성 펩타이드를 유효성분으로 함유하는 항생제 또는 진단시약
22 22
표적 헤어핀 모양의 RNA가 IRES RNA일 때, 제 16항의 방법에 의해 선별된 양면성 펩타이드를 유효성분으로 함유하는 C형간염 치료제 또는 진단시약
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1 한국과학재단 생체기능조절물질개발사업단 교육과학기술부 21C 프론티어사업 양면성 알파나선 펩타이드를 분자막대기로 이용한 분자막대기로 이용한 라이브러리의 제조 및 이를 이용한 생리활성 스크리닝