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유전자 발현 특징을 이용한 순환종양세포 검출 유전자를 발굴하는 시스템으로서,순환종양세포 조건과 정상혈액세포 조건을 가지는 유전자 발현 데이터를 이용하여 상기 순환종양세포 조건과 상기 정상혈액세포 조건 간 유의성을 평가하고, 유의성 평가를 통해 산출된 제1 유의 확률(p-value)이 기 정의된 임계 조건을 충족하는 유전자를 순환종양세포 연관 유전자로 선정하는 순환종양세포 연관 유전자 선정부,상기 순환종양세포 연관 유전자 중에서 세포사멸 연관 유전자를 제외한 생존력 보장 순환종양세포 연관 유전자를 선별하는 생존력 보장 기능 선정부,상기 생존력 보장 순환종양세포 연관 유전자 중에서 기 저장된 세포표면 단백질에 대응하는 유전자를 세포검출 가능 유전자로 선별하는 세포검출 가능 유전자 선정부, 암 조직세포 조건과 정상 조직세포 조건을 가지는 암 종별 유전자 발현 데이터를 이용하여 상기 암 조직세포 조건과 상기 정상 조직세포 조건 간 유의성을 평가하고, 유의성 평가를 통해 산출된 제2 유의 확률(p-value)이 기 정의된 임계 조건을 충족하는 유전자를 암 종별로 각각의 암에 대한 암 연관 유전자로 선정하는 암 규명 유전자 선정부, 그리고상기 생존력 보장 순환종양세포 연관 유전자, 상기 세포검출 가능 유전자 및 상기 암 연관 유전자에 공통으로 존재하는 유전자의 상기 제1 유의 확률(p-value) 및 상기 제2 유의 확률(p-value)을 합산하여 점수를 부여하고, 상기 점수가 가장 낮은 유전자를 암 종별로 원발암 규명 가능한 순환종양세포 검출 유전자로 선정하는 순환종양세포 검출 유전자 선정부를 포함하는 순환종양세포 검출 표지자 발굴 시스템
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제1항에 있어서,상기 순환종양세포 연관 유전자 선정부는,상기 유전자 발현 데이터를 저장하는 순환종양세포 유전자 발현 DB, 상기 유전자 발현 데이터에 정규화를 수행하여 조건별 차이를 제거하는 정규화 모듈,정규화된 유전자 발현 데이터를 이용하여 유의성 평가를 수행하여 제1 유의 확률(p-value)을 산출하는 유의성 평가 모듈, 그리고상기 제1 유의 확률(p-value)이 기 정의된 임계치 이하인 유전자를 상기 순환종양세포 연관 유전자로 선정하는 순환종양세포 연관 유전자 제공 모듈을 포함하는 순환종양세포 검출 표지자 발굴 시스템
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제3항에 있어서,상기 제1 유의 확률(p-value)은,순환종양세포 조건과 정상혈액세포 조건에서 유의한 발현 차이를 보이는 유전자를 선정하는 t-test를 통해 산출되고 오류 발견률(false discovery rate)을 이용하여 보정되는 순환종양세포 검출 표지자 발굴 시스템
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재1항에 있어서, 상기 생존력 보장 기능 선정부는,유전자 온톨로지 기반 세포기능 유전자를 저장하는 세포기능 DB,상기 세포기능 DB에 저장된 세포기능 유전자 중에서 세포사멸 연관 기능인 세포사멸(apoptotic process)에 속해 있는 세포사멸 연관 유전자를 선정하는 세포사멸 연관 기능 선정 모듈, 그리고상기 순환종양세포 연관 유전자 중에서 상기 세포사멸 연관 유전자를 제외하여 생존력 보장 순환종양세포 연관 유전자를 선정하는 생존력 보장 기능 선별 모듈을 포함하는 순환종양세포 검출 표지자 발굴 시스템
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제1항에 있어서,상기 세포검출 가능 유전자 선정부는,세포표면에 있는 단백질을 저장하는 세포표면 단백질 DB, 그리고상기 생존력 보장 순환종양세포 연관 유전자 중에서 상기 세포표면 단백질 DB 내 대응하는 단백질을 확인하여 세포검출 가능 유전자를 선별하는 세포검출 가능 유전자 선별 모듈을 포함하는 순환종양세포 검출 표지자 발굴 시스템
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제1항에 있어서,상기 암규명 유전자 선정부는,상기 암 종별 유전자 발현 데이터를 저장하는 암 유전자 발현 DB, 상기 암 종별 유전자 발현 데이터에 대한 정규화를 수행하여 조건별 차이를 제거하는 정규화 모듈,정규화된 암 종별 유전자 발현 데이터를 이용한 유의성 평가를 수행하여 상기 제2 유의 확률(p-value)을 산출하는 유의성 평가 모듈, 그리고상기 제2 유의 확률(p-value)이 기 정의된 임계치 이하인 유전자를 암 연관 유전자로 선별하는 암 연관 유전자 선택 모듈을 포함하는 순환종양세포 검출 표지자 발굴 시스템
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제7항에 있어서,상기 제2 유의 확률(p-value)은,상기 정규화된 암종별 유전자 발현 데이터에 대한 t-test를 통해 산출되고, 오류 발견률을 이용하여 보정되는 순환종양세포 검출 표지자 발굴 시스템
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순환종양세포 검출 표지자 발굴 시스템이 유전자 발현 특징을 이용한 순환종양세포 검출 유전자를 발굴하는 방법으로서, 순환종양세포 조건과 정상혈액세포 조건을 가지는 유전자 발현 데이터를 이용하여 상기 순환종양세포 조건과 상기 정상혈액세포 조건 간 유의성을 평가하고, 유의성 평가를 통해 제1 유의 확률(p-value)을 계산하는 단계,상기 제1 유의 확률(p-value)이 기 정의된 임계 조건을 충족하는 유전자를 순환종양세포 연관 유전자로 선정하는 단계,상기 순환종양세포 연관 유전자 중에서 세포사멸 연관 유전자를 제외한 생존력 보장 순환종양세포 연관 유전자를 선별하는 단계,상기 생존력 보장 순환종양세포 연관 유전자 중에서 기 저장된 세포표면 단백질에 대응하는 유전자를 세포검출 가능 유전자로 선별하는 단계,암 조직세포 조건과 정상 조직세포 조건을 가지는 암 종별 유전자 발현 데이터를 이용하여 상기 암 조직세포 조건과 상기 정상 조직세포 조건 간 유의성을 평가하고, 유의성 평가를 통해 산출된 제2 유의 확률(p-value)이 기 정의된 임계 조건을 충족하는 유전자를 암 종별로 각각의 암에 대한 암 연관 유전자로 선정하는 단계, 그리고상기 생존력 보장 순환종양세포 연관 유전자, 상기 세포검출 가능 유전자 및 상기 암 연관 유전자에 공통으로 존재하는 유전자의 상기 제1 유의 확률(p-value) 및 상기 제2 유의 확률(p-value)을 합산한 점수가 가장 낮은 유전자를 암 종별로 원발암 규명 가능한 순환종양세포 검출 유전자로 선정하는 단계 를 포함하는 순환종양세포 검출 유전자 발굴 방법
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제9항에 있어서, 상기 제1 유의 확률(p-value)을 계산하는 단계는,상기 유전자 발현 데이터에 정규화를 수행하여 상기 순환종양세포조건과 상기 정상 혈액세포 조건 간의 차이를 제거하는 단계, 그리고정규화된 유전자 발현 데이터를 이용한 유의성 평가를 수행하여 상기 제1 유의 확률(p-value)을 계산하는 단계를 포함하는 순환종양세포 검출 유전자 발굴 방법
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제11항에 있어서, 상기 생존력 보장 순환종양세포 연관 유전자를 선별하는 단계는,유전자 온톨로지 기반 세포기능 유전자 중에서 세포사멸 연관 유전자를 선정하는 단계, 그리고상기 순환종양세포 연관 유전자 중에서 상기 세포사멸 연관 유전자를 제외한 생존력 보장 순환종양세포 연관 유전자를 선정하는 단계를 포함하는 순환종양세포 검출 유전자 발굴 방법
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제12항에 있어서,상기 암 연관 유전자를 선정하는 단계는,상기 암 종별 유전자 발현 데이터에 대한 정규화를 수행하여 조건별 차이를 제거하는 단계,정규화된 암 종별 유전자 발현 데이터를 이용한 유의성 평가를 수행하여 상기 제2 유의 확률(p-value)을 계산하는 단계, 그리고상기 제2 유의 확률(p-value)이 임계치 이하인 유전자를 상기 암 연관 유전자로 선별하는 단계를 포함하는 순환종양세포 검출 유전자 발굴 방법
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