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인간 막단백질을 분류하고 기능을 예측하는 시스템에 있어서,외부로부터 입력되는 여러 종류의 단백질 정보 중 세포 내 위치 정보, 막위상 정보 및 분자 기능 정보를 토대로 막단백질 정보만을 추출하고, 인간의 막단백질 정보인 제1 막단백질 정보를 수집하여 저장하는 제1 정보 추출부;다른 생물체의 상동 막단백질 정보인 제2 막단백질 정보를 수집하여 저장하는 제2 정보 저장부;상기 제1 정보 추출부에 저장되어 있는 제1 막단백질 정보와 상기 제2 정보 저장부에 저장되어 있는 제2 막단백질 정보를 토대로, 외부로부터 입력되는 후보 막단백질 정보를 단백질 구조 또는 상호 작용에 따라 복수의 막단백질 클래스로 분류하는 제1 막단백질 분류부;상기 제1 막단백질 분류부에서 복수의 막단백질 클래스로 분류된 복수의 막단백질들을 기능 또는 질병에 따라 복수의 막단백질 군으로 분류하는 제2 막단백질 분류부; 및상기 제2 막단백질 분류부에서 분류된 막단백질 군들의 기능을 분석하고, 각각의 막단백질 군의 기능이 질병을 다른 단백질 기능과 비교하여 임의의 특징 정보를 발굴하며, 발굴한 특징 정보를 토대로 막단백질의 기능과 질병을 예측하는 기능 및 질병 연관성 예측부를 포함하는 막단백질 분류 및 기능 예측 시스템
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제1항에 있어서,상기 제1 막단백질 분류부는,상기 후보 막단백질 정보와 미리 저장되어 있는 단백질 서열 정보를 토대로, 상기 후보 막단백질 정보에 대응되는 후보 막단백질들이 내재성 막단백질인지 여부를 확인하는 제1 막단백질 분류기;상기 제1 막단백질 분류기에서 내재성 막단백질로 확인되지 않은 후보 막단백질 정보와 미리 저장되어 있는 전사 후 변형 정보를 토대로, 상기 내재성 막단백질로 확인되지 않은 후보 막단백질 정보에 대응되는 후보 막단백질들이 지질고정 막단백질인지 여부를 확인하는 제2 막단백질 분류기; 및상기 제2 막단백질 분류기에서 지질고정 막단백질로 확인되지 않은 후보 막단백질 정보와 미리 저장되어 있는 상호작용 정보를 토대로, 상기 지질고정 막단백질로 확인되지 않은 후보 막단백질 정보에 대응되는 후보 막단백질들이 표재성 막단백질인지 여부를 확인하고, 표재성 막단백질이 아닌 후보 막단백질 정보는 삭제하는 제3 막단백질 분류기를 포함하는 막단백질 분류 및 기능 예측 시스템
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제2항에 있어서,상기 제1 막단백질 분류부는,상기 제1 막단백질 분류기로 제공하는 상기 단백질 서열 정보를 저장하는 단백질 서열 저장부;상기 제2 막단백질 분류기로 제공하는 상기 전사 후 변형 정보를 저장하는 지질고정 PTM 저장부; 및상기 제3 막단백질 분류기로 제공하는 상기 상호작용 정보를 저장하는 상호작용 정보 저장부를 포함하는 막단백질 분류 및 기능 예측 시스템
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제1항에 있어서,상기 제2 막단백질 분류부는,막단백질들을 군으로 분류하기 위한, 복수의 군 생성 기준 정보들을 저장하는 정보 저장부;상기 정보 저장부에 저장되어 있는 군 생성 기준 정보를 수신하는 정보 수신부; 및상기 정보 수신부가 수신한 군 생성 기준 정보를 토대로, 상기 제1 막단백질 분류부에서 복수의 클래스로 분류된 복수의 막단백질을 복수의 막단백질 군으로 분류하여 생성하는 막단백질 군 생성부를 포함하는 막단백질 분류 및 기능 예측 시스템
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제4항에 있어서,상기 정보 저장부는,단백질의 기능적이나 구조적인 단위가 되는 단백질 서열의 보존 정보를 저장하는 도메인 정보 저장부;단백질 내 세포의 기능을 수행하기 위해 외부로부터 전달되는 신호가 어떤 경로로 이동하는지에 대한 정보를 저장하는 신호전달 경로 정보 저장부;단백질이 활성화 상태가 될 때 발생할 수 있는 세포 기능 정보를 저장하는 세포기능 정보 저장부;어떠한 유전자에 의해 질병이 발생하는지에 대한 정보를 저장하는 질병 유전자 정보 저장부; 및특정 약물에 대해 단백질이 반응하는지에 대한 정보를 저장하는 약물타깃 정보 저장부를 포함하는 막단백질 분류 및 기능 예측 시스템
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막단백질 분류 시스템이 인간 막단백질을 분류하고 기능을 예측하는 방법에 있어서,외부로부터 복수의 후보 막단백질 정보를 수신하는 단계;상기 수신한 복수의 후보 막단백질 정보를 미리 저장되어 있는 정보들을 토대로 복수의 클래스로 분류하는 단계;상기 복수의 클래스로 분류된 막단백질 정보를 기능과 질병 유사도 기반으로 분류하여 복수의 막단백질 군을 생성하는 단계; 및상기 생성한 막단백질 군 각각의 기능 정보 또는 질병에 대한 정보를 분석하여, 이미 알려져 있는 기능 또는 질병 유발 막단백질 이외의 새로운 막단백질 기능 또는 막단백질에 의해 발생될 수 있는 질병을 예측하는 단계를 포함하는 막단백질 분류 및 기능 예측 방법
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제6항에 있어서,상기 복수의 클래스로 분류하는 단계는,미리 저장되어 있는 단백질 서열 정보를 토대로, 상기 복수의 후보 막단백질 정보 중 내재성 막단백질을 분류하는 단계;내재성 막단백질로 분류되지 않은 나머지 후보 막단백질 정보를, 미리 저장되어 있는 전사 후 변형 정보를 토대로 지질고정 막단백질을 분류하는 단계; 및지질고정 막단백질로 분류되지 않은 나머지 후보 막단백질 정보를, 미리 저장되어 있는 상호작용 정보를 토대로 표재성 막단백질을 분류하는 단계를 포함하는 막단백질 분류 및 기능 예측 방법
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제7항에 있어서,표재성 막단백질을 분류하는 단계 이후에,상기 표재성 막단백질로 분류되지 않은 후보 막단백질 정보를 삭제하는 단계를 포함하는 막단백질 분류 및 기능 예측 방법
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제6항에 있어서,상기 복수의 막단백질 군을 생성하는 단계는,상기 복수의 클래스로 분류된 막단백질 정보를 미리 저장되어 있는 모든 단백질에 대한 도메인 정보, 신호전달 경로 정보, 세포기능 정보, 질병 유전자 정보 및 약물타깃 정보를 이용하여 막단백질을 그룹지어 막단백질 군으로 생성하는 막단백질 분류 및 기능 예측 방법
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제6항에 있어서,상기 복수의 후보 막단백질 정보를 수신하는 단계 이전에,세포 내 위치 정보, 막위상 정보 및 분자 기능 정보를 토대로 복수의 단백질 정보 중 상기 후보 막단백질 정보를 분류하기 위한 막단백질 정보를 추출하는 단계를 포함하는 막단백질 분류 및 기능 예측 방법
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