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유전자 발현 데이터를 이용하여 하나 이상의 장기(organs)에 대한 약물-유도성 독성을 예측하는 방법에 있어서,상기 하나 이상의 장기에 대한 유전자 발현 데이터를 이용하여 특정 약물에 대한 상기 하나 이상의 장기의 증상 별 개별 병리 예측 모델(individual pathology prediction models)을 구축하는 단계;상기 하나 이상의 장기의 증상들 사이의 병리 유사성을 이용하여 상기 하나 이상의 장기의 증상들에 대한 병리적 상관 관계를 산출하는 제1 산출 단계; 및상기 개별 병리 예측 모델 및 상기 병리적 상관 관계를 이용하여 상기 특정 약물에 대한 증상 별 통합 예측 점수(integrative prediction score)를 산출하는 제 2 산출 단계; 를 포함하는 예측 방법
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제1항에 있어서,상기 제 1 산출 단계는,자카드 계수(Jaccard coefficient)를 이용하여 상기 하나 이상의 장기의 증상들 사이의 병리 유사성을 산출하는 단계;를 포함하는 것을 특징으로 하는 예측 방법
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제2항에 있어서,상기 산출된 병리 유사성을 정규화(normalized)하는 단계;를 더 포함하며,상기 제2 산출단계는,상기 정규화된 병리 유사성과 상기 개별 병리 예측 모델을 통해 산출된 개별 병리 예측 점수를 이용하여 상기 특정 약물에 대한 증상 별 통합 예측 점수를 산출하는 것을 특징으로 하는 예측 방법
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제3항에 있어서,상기 제1 산출단계는,제1 증상과 상기 제1 증상을 제외한 다른 증상들 사이의 병리 유사성을 산출하고, 상기 산출된 병리 유사성들을 정규화하여 상기 제1 증상과 상기 다른 증상 사이의 정규화된 병리 유사성을 산출하고,상기 제2 산출 단계는,상기 제1 증상과 상기 다른 증상 사이의 정규화된 병리 유사성과 병리 유사성에 대응되는 증상의 개별 병리 예측 점수의 곱들을 합하여 상기 제1 증상에 대한 통합 예측 점수를 산출하는 것을 특징으로 하는 예측 방법
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제1항에 있어서,상기 구축하는 단계는,상기 특정 약물이 투여된 하나 이상의 장기의 학습 데이터(training data)를 획득하는 단계;RMA(Robust Multi-array Average) 기법을 이용하여 상기 획득된 학습 데이터에 포함된 유전자 발현 데이터를 정규화하는 단계; 및상기 정규화된 유전자 발현 데이터를 이용하여 병리 예측 점수(pathology prediction score)를 산출하는 단계; 를 포함하는 예측 방법
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유전자 발현 데이터를 이용하여 하나 이상의 장기에 대한 약물-유도성 독성을 예측하는 장치에 있어서,상기 하나 이상의 장기에 대한 유전자 발현 데이터를 이용하여 특정 약물에 대한 상기 하나 이상의 장기의 증상 별 개별 병리 예측 모델(individual pathology prediction models)을 구축하는 구축부;상기 하나 이상의 장기의 증상들 사이의 병리 유사성을 이용하여 상기 하나 이상의 장기의 증상들에 대한 병리적 상관 관계를 산출하는 제1 산출부; 및상기 개별 병리 예측 모델 및 상기 병리적 상관 관계를 이용하여 상기 특정 약물에 대한 증상 별 통합 예측 점수(integrative prediction score)를 산출하는 제 2 산출부; 를 포함하는 예측 장치
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제6항에 있어서,상기 제 1 산출부는, 자카드 계수(Jaccard coefficient)를 이용하여 상기 하나 이상의 장기의 증상들 사이의 병리 유사성을 산출하는 것을 특징으로 하는 예측 장치
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제7항에 있어서,상기 산출된 병리 유사성을 정규화하는 특징을 더 포함하며,상기 제2 산출부는,상기 정규화된 병리 유사성과 상기 개별 병리 예측 모델을 통해 산출된 개별 병리 예측 점수를 이용하여 상기 특정 약물에 대한 증상 별 통합 예측 점수를 산출하는 것을 특징으로 하는 예측 장치
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제8항에 있어서,상기 제1 산출부는,제1 증상과 상기 제1 증상을 제외한 다른 증상들 사이의 병리 유사성을 산출하고, 상기 산출된 병리 유사성들을 정규화하여 상기 제1 증상과 상기 다른 증상 사이의 정규화된 병리 유사성을 산출하고,상기 제2 산출부는,상기 제1 증상과 상기 다른 증상 사이의 정규화된 병리 유사성과 병리 유사성에 대응되는 증상의 개별 병리 예측 점수의 곱들을 합하여 상기 제1 증상에 대한 통합 예측 점수를 산출하는 것을 특징으로 하는 예측 장치
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제 6항에 있어서,상기 구축부는,상기 특정 약물이 투여된 하나 이상의 장기의 학습 데이터를 획득하는 단계;RMA(Robust Multi-array Average) 기법을 이용하여 상기 획득된 학습 데이터에 포함된 유전자 발현 데이터를 정규화하는 단계; 및상기 정규화된 유전자 발현 데이터를 이용하여 병리 예측 점수를 산출하는 단계; 를 포함하는 예측 장치
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