맞춤기술찾기

홈으로 가기
맞춤기술찾기
이전대상기술
프린트하기

이전대상기술

태그멘테이션을 이용한 벡터 삽입위치 검출 및 클론 정량 방법

  • 기술번호 : KST2023009628
  • 담당센터 : 서울동부기술혁신센터
  • 전화번호 : 02-2155-3662
상담신청 PDF 받기
요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 본 발명은 유전체 내 벡터 삽입위치 검출방법에 관한 것으로, 본 발명의 방법에 따르면 간편하고 신속하게 유전체 내 다수의 DNA 모티프(사이트)에 대한 바이러스 벡터의 양적인 삽입위치 분석을 수행할 수 있는 바, 유전자 치료제의 안전성 및 효과 모니터링 등에 유용하게 이용될 수 있다.
Int. CL C12Q 1/6809 (2018.01.01) C12Q 1/686 (2018.01.01) C12N 15/10 (2017.01.01) G16B 30/00 (2019.01.01)
CPC C12Q 1/6809(2013.01) C12Q 1/686(2013.01) C12N 15/1082(2013.01) C12N 15/1089(2013.01) G16B 30/00(2013.01) C12Q 2565/514(2013.01)
출원번호/일자 1020230051116 (2023.04.19)
출원인 서울대학교산학협력단, 서울대학교병원
등록번호/일자
공개번호/일자 10-2023-0149744 (2023.10.27) 문서열기
공고번호/일자
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보 대한민국  |   1020220047914   |   2022.04.19
법적상태 공개
심사진행상태 수리
심판사항
구분 국내출원/신규
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2023.04.19)
심사청구항수 12

출원인

번호, 이름, 국적, 주소의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 인명정보 - 출원인 표입니다.
번호 이름 국적 주소
1 서울대학교산학협력단 대한민국 서울특별시 관악구
2 서울대학교병원 대한민국 서울특별시 종로구

발명자

번호, 이름, 국적, 주소의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 인명정보 - 발명자 표입니다.
번호 이름 국적 주소
1 김종일 서울특별시 마포구
2 김재력 서울특별시 성북구
3 강형진 서울특별시 송파구
4 박미영 서울특별시 구

대리인

번호, 이름, 국적, 주소의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 인명정보 - 대리인 표입니다.
번호 이름 국적 주소
1 특허법인엠에이피에스 대한민국 서울특별시 강남구 테헤란로*길 **, *층 (역삼동, 한동빌딩)

최종권리자

번호, 이름, 국적, 주소의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 인명정보 - 최종권리자 표입니다.
번호 이름 국적 주소
최종권리자 정보가 없습니다
번호, 서류명, 접수/발송일자, 처리상태, 접수/발송일자의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 행정처리 표입니다.
번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 [특허출원]특허출원서
[Patent Application] Patent Application		 2023.04.19 수리 (Accepted) 1-1-2023-0438954-13
2 특허고객번호 정보변경(경정)신고서·정정신고서
 2023.05.02 수리 (Accepted) 4-1-2023-5107652-42
번호, 청구항의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 청구항 표입니다.
번호 청구항
1 1
다음의 단계를 포함하는, 유전체 내 벡터 삽입위치(integration site) 검출방법:비드-결합 트랜스포좀(bead-linked transposome)을 이용한 태그멘테이션 단계;유전자 증폭(gene amplification)을 통한 라이브러리 제작 단계;라이브러리 풀링(pooling) 및 시퀀싱(sequencing) 단계; 및생물정보학적 분석(bioinformatics analysis)을 통한 유전체 내 삽입위치 결정 단계
2 2
제1항에 있어서, 상기 태그멘테이션 단계는 DNA 파편화(fragmentation) 및 어댑터(adapter) 태깅(tagging)이 동시에 수행되는 것인, 유전체 내 벡터 삽입위치 검출방법
3 3
제1항에 있어서, 상기 라이브러리 제작 단계는 다음의 단계에 의해 수행되는 것인, 유전체 내 벡터 삽입위치 검출방법:제1 중합효소연쇄반응(Polymerase Chain Reaction; PCR) 단계; 및제2 중합효소연쇄반응 단계
4 4
제3항에 있어서, 상기 제1 중합효소연쇄반응은 30 사이클로 수행되는 것인, 유전체 내 벡터 삽입위치 검출방법
5 5
제3항에 있어서, 상기 제2 중합효소연쇄반응은 nested-PCR로 수행되는 것인, 유전체 내 벡터 삽입위치 검출방법
6 6
제3항에 있어서, 상기 제1 중합효소연쇄반응 및 제2 중합효소연쇄반응의 신장(elongation)은 2분 동안 수행되는 것인, 유전체 내 벡터 삽입위치 검출방법
7 7
제1항에 있어서, 상기 유전체 내 삽입위치 결정 단계는 다음의 단계에 의해 수행되는 것인, 유전체 내 벡터 삽입위치 검출방법:키메라 리드(Chimeric read) 추출 단계;3' LTR-특이적 서열 제거 단계;숙주(host)/벡터 융합 게놈(genome) 생성 단계;숙주/벡터 융합 게놈에 대한 리드 정렬 단계;PCR 중복(duplicate) 제거 단계;리드 필터링 단계; 및삽입위치 결정 단계
8 8
제7항에 있어서, 상기 유전체 내 삽입위치 결정 단계는 Seqkit, Cutadapt, BWA, Picard, Samtools 및 In-house Python script로 이루어진 군으로부터 선택되는 1종 이상의 툴(tool)을 활용한 결과 값을 이용하는 것인, 유전체 내 벡터 삽입위치 검출방법
9 9
제1항에 있어서, 상기 벡터는 바이러스 벡터인 것인, 유전체 내 벡터 삽입위치 검출방법
10 10
제9항에 있어서, 상기 바이러스는 렌티바이러스 및 레트로바이러스로 이루어진 군으로부터 선택되는 것인, 유전체 내 벡터 삽입위치 검출방법
11 11
제1항에 있어서, 상기 방법은 삽입위치의 양적인(quantity) 분석이 가능한 것인, 유전체 내 벡터 삽입위치 검출방법
12 12
다음의 단계를 포함하는, 유전체 내 벡터가 삽입된 클론의 정량방법:비드-결합 트랜스포좀을 이용한 태그멘테이션 단계;유전자 증폭을 통한 라이브러리 제작 단계;라이브러리 풀링 및 시퀀싱 단계; 및생물정보학적 분석을 통한 유전체 내 삽입위치 결정 단계
지정국 정보가 없습니다
패밀리정보가 없습니다
국가 R&D 정보가 없습니다.