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약물 부작용 방지를 위한 개인별 단백질 손상 정보 기반의 약물 선택 방법 및 시스템

  • 기술번호 : KST2015136792
  • 담당센터 : 서울동부기술혁신센터
  • 전화번호 : 02-2155-3662
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요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 본 발명은 개인 유전체 염기서열 분석을 이용한, 개인별 단백질 손상 정보 기반의 맞춤형 약물 선택 방법 및 시스템에 관한 것으로, 본 발명에 따른 방법 및 시스템은 소정 약물 또는 약물군의 약력학 또는 약동학에 관여하는 다양한 단백질을 코딩하는 유전자 엑손 영역의 서열 분석을 통하여 개인별로 특정 약물에 대한 부작용 또는 위험성을 예측할 수 있는 기술로서 신뢰도가 높을 뿐 아니라, 적용범위 또한 넓은 범용적 기술이다.
Int. CL G01N 33/15 (2006.01) C12Q 1/68 (2006.01)
CPC C12Q 1/6844(2013.01) C12Q 1/6844(2013.01)
출원번호/일자 1020140107916 (2014.08.19)
출원인 서울대학교산학협력단
등록번호/일자 10-1524562-0000 (2015.05.26)
공개번호/일자 10-2015-0021476 (2015.03.02) 문서열기
공고번호/일자 (20150602) 문서열기
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보 대한민국  |   1020130097651   |   2013.08.19
법적상태 등록
심사진행상태 수리
심판사항
구분 신규
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2014.08.19)
심사청구항수 24

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 서울대학교산학협력단 대한민국 서울특별시 관악구

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 김주한 대한민국 서울특별시 송파구
2 백수연 대한민국 경기도 평택시 비
3 이수연 대한민국 경기도 과천시

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 김순웅 대한민국 서울시 구로구 디지털로**길 **, ***호 (구로동,에이스테크노타워*차)(정진국제특허법률사무소)

최종권리자

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번호 이름 국적 주소
1 싸이퍼롬, 인코퍼레이티드 미국 캘리포니아 ***** 새너제이 스위트 *** 젠커 로드 *
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번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 [특허출원]특허출원서
[Patent Application] Patent Application		 2014.08.19 수리 (Accepted) 1-1-2014-0784755-05
2 [우선심사신청]심사청구(우선심사신청)서
[Request for Preferential Examination] Request for Examination (Request for Preferential Examination)		 2014.09.12 수리 (Accepted) 1-1-2014-0865116-73
3 [우선심사신청]선행기술조사의뢰서
[Request for Preferential Examination] Request for Prior Art Search		 2014.09.15 수리 (Accepted) 9-1-9999-9999999-89
4 [우선심사신청]선행기술조사보고서
[Request for Preferential Examination] Report of Prior Art Search		 2014.09.28 수리 (Accepted) 9-1-2014-0076834-05
5 의견제출통지서
Notification of reason for refusal		 2014.10.30 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2014-0743309-07
6 [명세서등 보정]보정서
[Amendment to Description, etc.] Amendment		 2014.12.29 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) 1-1-2014-1274626-74
7 [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견(답변, 소명)서
[Opinion according to the Notification of Reasons for Refusal] Written Opinion(Written Reply, Written Substantiation)		 2014.12.29 수리 (Accepted) 1-1-2014-1274617-63
8 등록결정서
Decision to grant		 2015.02.23 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2015-0124260-96
9 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2015.03.17 수리 (Accepted) 4-1-2015-5033829-92
10 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2015.05.13 수리 (Accepted) 4-1-2015-5062924-01
11 [대리인선임]대리인(대표자)에 관한 신고서
[Appointment of Agent] Report on Agent (Representative)		 2017.04.06 수리 (Accepted) 1-1-2017-0338003-10
12 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2019.05.13 수리 (Accepted) 4-1-2019-5093546-10
13 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2019.05.23 수리 (Accepted) 4-1-2019-5101798-31
14 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2019.08.02 수리 (Accepted) 4-1-2019-5154561-59
번호, 청구항의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 청구항 표입니다.
번호 청구항
1 1
개인 유전체 염기서열 정보로부터 소정 약물 또는 약물군의 약력학(pharmaco-dynamics) 또는 약동학(pharmaco-kinetics)에 관여하는 하나 이상의 유전자 염기서열 변이 정보를 결정하는 단계; 상기 유전자 염기서열 변이 정보를 하기 수학식 1 또는 2에 적용하여 개인별 단백질 손상 점수를 산출하는 단계; 및상기 개인별 단백질 손상 점수를 하기 수학식 3 또는 4에 적용하여 개인별 약물 점수를 산출하는 단계를 포함하는, 개인 유전체 염기서열 변이를 이용한 맞춤형 약물 선택을 위한 정보를 제공하는 방법
2 2
제 1 항에 있어서, 상기 유전자 염기서열 변이 정보는 유전자의 엑손(exon)을 구성하는 염기의 치환, 부가 또는 결실인, 개인 유전체 염기서열 변이를 이용한 맞춤형 약물 선택을 위한 정보를 제공하는 방법
3 3
제 2 항에 있어서, 상기 염기의 치환, 부가 또는 결실은 염색체의 절단, 결실, 중복, 역위 또는 전좌를 포함하는 구조적 이상에 의한 것인, 개인 유전체 염기서열 변이를 이용한 맞춤형 약물 선택을 위한 정보를 제공하는 방법
4 4
삭제
5 5
삭제
6 6
제 1 항에 있어서, 상기 유전자 염기서열 변이 점수는 SIFT (Sorting Intolerant From Tolerant), PolyPhen (Polymorphism Phenotyping), PolyPhen-2, MAPP (Multivariate Analysis of Protein Polymorphism), Logre (Log R Pfam E-value), MutationAssessor, MutationTaster, MutationTaster2, PROVEAN (Protein Variation Effect Analyzer), PMut, Condel, GERP (Genomic Evolutionary Rate Profiling), GERP++, CEO (Combinatorial Entropy Optimization), SNPeffect, fathmm, 및 CADD (Combined Annotation-Dependent Depletion)로 이루어진 군에서 선택된 하나 이상의 알고리즘을 유전자 염기서열 변이에 적용하여 산출되는 것인, 개인 유전체 염기서열 변이를 이용한 맞춤형 약물 선택을 위한 정보를 제공하는 방법
7 7
제 1 항에 있어서, 상기 단백질 손상 점수는, 단백질을 코딩하는 유전자에서 발견되는 분석대상 염기서열 변이가 두 개 이상인 경우, 상기 유전자 염기서열 변이 점수들의 평균값으로 산출되는 것인, 개인 유전체 염기서열 변이를 이용한 맞춤형 약물 선택을 위한 정보를 제공하는 방법
8 8
제 7 항에 있어서, 상기 평균값은 기하평균, 산술평균, 조화평균, 산술기하평균, 산술조화평균, 기하조화평균, 피타고라스 평균, 헤론 평균, 역조화평균, 평균제곱근편차, 센트로이드 평균, 사분평균, 이차평균, 절삭평균, 윈저화 평균, 가중평균, 가중기하평균, 가중산술평균, 가중조화평균, 함수의 평균, 멱평균, 일반화된 f-평균, 백분위수, 최대값, 최소값, 최빈값, 중앙값, 중앙범위, 중심경향도(measures of central tendency), 단순 곱 및 가중 곱으로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상에 의해 계산되는 것인, 개인 유전체 염기서열 변이를 이용한 맞춤형 약물 선택을 위한 정보를 제공하는 방법
9 9
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10 10
삭제
11 11
제 1 항에 있어서,상기 약물 점수는, 소정 약물 또는 약물군의 약력학 또는 약동학에 관여하는 단백질의 손상이 두 개 이상인 경우, 단백질 손상 점수들의 평균값으로 산출되는 것인, 개인 유전체 염기서열 변이를 이용한 맞춤형 약물 선택을 위한 정보를 제공하는 방법
12 12
제 11 항에 있어서, 상기 평균값은 기하평균, 산술평균, 조화평균, 산술기하평균, 산술조화평균, 기하조화평균, 피타고라스 평균, 헤론 평균, 역조화평균, 평균제곱근편차, 센트로이드 평균, 사분평균, 이차평균, 절삭평균, 윈저화 평균, 가중평균, 가중기하평균, 가중산술평균, 가중조화평균, 함수의 평균, 멱평균, 일반화된 f-평균, 백분위수, 최대값, 최소값, 최빈값, 중앙값, 중앙범위, 중심경향도(measures of central tendency), 단순 곱 및 가중 곱으로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상에 의해 계산되는 것인, 개인 유전체 염기서열 변이를 이용한 맞춤형 약물 선택을 위한 정보를 제공하는 방법
13 13
삭제
14 14
삭제
15 15
제 1 항에 있어서, 상기 단백질 손상 점수 또는 약물 점수는 해당 단백질의 종류, 해당 단백질의 약동학적 또는 약력학적 분류, 해당 약물 효소 단백질의 약동학 파라미터, 인구 집단, 또는 인종별 분포를 고려하여 결정된 값으로 가중치를 부여하여 산출되는 것인, 개인 유전체 염기서열 변이를 이용한 맞춤형 약물 선택을 위한 정보를 제공하는 방법
16 16
제 1 항에 있어서, 상기 방법은 상기 개인별 약물 점수를 이용하여 상기 개인에 대해 적용되는 약물 간의 우선순위를 결정하는 단계; 또는 상기 개인별 약물 점수를 이용하여 상기 개인에 적용되는 약물의 사용 여부를 결정하는 단계;를 추가로 포함하는, 개인 유전체 염기서열 변이를 이용한 맞춤형 약물 선택을 위한 정보를 제공하는 방법
17 17
제 1 항에 있어서, 상기 소정 약물 또는 약물군은 사용자가 입력한 정보, 처방전으로부터 입력된 정보 또는 소정 질환에 치료효과가 있는 약물에 대한 정보를 포함하는 데이터베이스로부터 입력된 정보인, 개인 유전체 염기서열 변이를 이용한 맞춤형 약물 선택을 위한 정보를 제공하는 방법
18 18
제 1 항에 있어서, 상기 유전자 염기서열 변이 정보는 참조군의 유전체 염기서열과의 비교 분석을 통해 수득되는 것인, 개인 유전체 염기서열 변이를 이용한 맞춤형 약물 선택을 위한 정보를 제공하는 방법
19 19
제 1 항에 있어서, 상기 방법은 상기 소정 약물 또는 약물군의 약력학 또는 약동학에 관여하는 유전자의 염기서열 변이 정보를 컴퓨터 시스템으로 접수하는 단계를 추가로 포함하며, 상기 컴퓨터 시스템은 상기 소정 약물 또는 약물군의 약력학 또는 약동학에 관여하는 유전자 정보를 포함하는 데이터베이스를 포함하거나 또는 상기 데이터베이스에 접근 가능한 것인, 개인 유전체 염기서열 변이를 이용한 맞춤형 약물 선택을 위한 정보를 제공하는 방법
20 20
제 16 항에 있어서, 상기 방법은 상기 약물 간의 우선순위에 의해 결정된 약물이 두 개 이상이고 동시 투약이 필요한 경우, 상기 각 약물에 대하여 결정된 약물 점수의 평균값으로 처방 점수를 산출하는 단계를 추가로 포함하는, 개인 유전체 염기서열 변이를 이용한 맞춤형 약물 선택을 위한 정보를 제공하는 방법
21 21
삭제
22 22
제 1 항에 있어서, 상기 방법은 유전자 염기서열 변이 정보, 단백질 손상 점수, 약물 점수 및 그 산출에 사용된 정보로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 정보를 제공하는 단계를 추가로 포함하는, 개인 유전체 염기서열 변이를 이용한 맞춤형 약물 선택을 위한 정보를 제공하는 방법
23 23
제 1 항에 있어서,상기 방법은 약물 부작용 방지를 목적으로 수행되는 것을 특징으로 하는, 개인 유전체 염기서열 변이를 이용한 맞춤형 약물 선택을 위한 정보를 제공하는 방법
24 24
개인에 대해 적용대상이 되는 약물 또는 약물군에 대하여, 상기 약물 또는 약물군의 약력학 또는 약동학에 관여하는 유전자 또는 단백질과 관련된 정보 검색 또는 추출이 가능한 데이터베이스;상기 데이터베이스에 접근 가능한 통신부; 상기 정보에 기초하여 상기 약물 또는 약물군의 약력학 또는 약동학에 관여하는 하나 이상의 유전자 염기서열 변이 정보를 산출하는 제1 산출모듈; 상기 유전자 염기서열 변이 정보를 하기 수학식 1 또는 2에 적용하여 개인별 단백질 손상 점수를 산출하는 제2 산출모듈; 상기 개인별 단백질 손상 점수를 하기 수학식 3 또는 4에 적용하여 개인별 약물 점수를 산출하는 제3 산출모듈; 및상기 산출모듈에서 산출된 산출값을 표시하는 표시부를 포함하는, 개인 유전체 염기서열 변이를 이용한 맞춤형 약물 선택 시스템
25 25
제 24 항에 있어서, 상기 시스템은 상기 제3 산출모듈에서 산출된 상기 개인별 약물 점수를 이용하여 상기 개인에 대해 적용되는 약물 간의 우선순위를 산출; 또는 상기 개인별 약물 점수를 이용하여 상기 개인에 적용되는 약물의 사용 여부를 결정;하는 제4 산출모듈을 추가로 포함하는, 개인 유전체 염기서열 변이를 이용한 맞춤형 약물 선택 시스템
26 26
제 25 항에 있어서, 상기 시스템은 상기 제4 산출모듈에서 약물 간의 우선순위에 의해 결정된 약물이 두 개 이상이고 동시 투약이 필요한 경우, 상기 각 약물에 대하여 결정된 상기 약물 점수의 평균값으로 처방 점수를 산출하는 제5 산출모듈을 추가로 포함하는, 개인 유전체 염기서열 변이를 이용한 맞춤형 약물 선택 시스템
27 27
제 24 항에 있어서, 상기 시스템은 사용자에 의한 약물 또는 약물군 목록의 입력에 따라 상기 약물 또는 약물군의 약물 점수를 산출하여 제공하는 사용자 인터페이스를 추가로 포함하는, 개인 유전체 염기서열 변이를 이용한 맞춤형 약물 선택 시스템
28 28
제 24 항에 있어서, 상기 표시부는 상기 각 산출모듈에서 산출된 값, 계산 과정, 또는 상기 계산의 기초가 된 정보를 추가로 표시하는 표시부를 추가로 포함하는, 개인 유전체 염기서열 변이를 이용한 맞춤형 약물 선택 시스템
29 29
제 24 항 내지 제 28 항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 각 산출모듈은 상기 유전자 염기서열 변이 정보, 단백질 손상 점수, 약물 점수 및 그 산출의 근거가 되는 정보가 저장되며,상기 데이터베이스의 갱신에 따라 상기 각 산출모듈의 정보가 갱신되는, 개인 유전체 염기서열 변이를 이용한 맞춤형 약물 선택 시스템
30 30
하기 프로세서를 실행시키는 실행모듈을 포함하는 컴퓨터 판독 가능한 매체: 개인 유전체 염기서열 정보로부터 소정 약물 또는 약물군의 약력학 또는 약동학에 관여하는 하나 이상의 유전자 염기서열 변이 정보를 입수하는 단계; 상기 유전자 염기서열 변이 정보를 하기 수학식 1 또는 2에 적용하여 개인별 단백질 손상 점수를 산출하는 단계; 및상기 개인별 단백질 손상 점수를 하기 수학식 3 또는 4에 적용하여 개인별 약물 점수를 산출하는 단계를 포함하는 동작을 수행하는 프로세서
31 31
제 30 항에 있어서, 상기 프로세서는 상기 개인별 약물 점수를 이용하여 상기 개인에 대해 적용되는 약물 간의 우선순위를 결정하는 단계; 또는 상기 개인별 약물 점수를 이용하여 상기 개인에 적용되는 약물의 사용 여부를 결정하는 단계;를 추가로 포함하는, 컴퓨터 판독가능한 매체
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1 교육부 서울대학교 선도연구센터 국가핵심연구센터(NCRC) 시스템 바이오 정보의학 연구센터