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단백질-약 상호작용 예측과 그 예측의 불확실성을 판단하기 위한 단백질-약 상호작용 예측 모델 생성 장치 및 방법과, 단백질-약 상호작용 예측 장치 및 방법

  • 기술번호 : KST2023002223
  • 담당센터 : 서울동부기술혁신센터
  • 전화번호 : 02-2155-3662
요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 일 양상에 따른 단백질-약 상호작용 예측 모델 생성 장치는 단백질 데이터, 약 분자 데이터 및 단백질과 약 분자 사이의 상호작용 데이터를 수집하는 데이터 수집부; 상기 단백질 데이터로부터 단백질 표현형 데이터를 생성하고, 상기 약 분자 데이터로부터 약 분자 표현형 데이터를 생성하는 표현형 생성부; 및 상기 단백질 표현형 데이터, 상기 약 분자 표현형 데이터 및 상기 상호작용 데이터를 학습 데이터로 이용하여 베이지언 뉴럴 네트워크를 학습시켜, 단백질-약 상호작용 예측 모델을 생성하는 모델 생성부; 를 포함할 수 있다.
Int. CL G16B 15/30 (2019.01.01) G16B 5/00 (2019.01.01) G16B 35/10 (2019.01.01) G06N 3/04 (2023.01.01)
CPC G16B 15/30(2013.01) G16B 5/00(2013.01) G16B 35/10(2013.01) G06N 3/045(2013.01) G06N 3/042(2013.01)
출원번호/일자 1020220045226 (2022.04.12)
출원인 서울대학교산학협력단
등록번호/일자
공개번호/일자 10-2023-0044116 (2023.04.03) 문서열기
공고번호/일자
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보 대한민국  |   1020210126415   |   2021.09.24
법적상태 공개
심사진행상태 수리
심판사항
구분 국내출원/신규
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2022.04.12)
심사청구항수 19

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 서울대학교산학협력단 대한민국 서울특별시 관악구

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 제원호 서울특별시 관악구
2 김규환 서울특별시 관악구

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 특허법인리채 대한민국 서울특별시 강남구 테헤란로**길**, *층

최종권리자

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번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 [특허출원]특허출원서
[Patent Application] Patent Application
2022.04.12 수리 (Accepted) 1-1-2022-0390491-37
2 특허고객번호 정보변경(경정)신고서·정정신고서
2022.08.11 수리 (Accepted) 4-1-2022-5189083-38
3 특허고객번호 정보변경(경정)신고서·정정신고서
2022.10.07 수리 (Accepted) 4-1-2022-5235636-01
번호, 청구항의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 청구항 표입니다.
번호 청구항
1 1
단백질 데이터, 약 분자 데이터 및 단백질과 약 분자 사이의 상호작용 데이터를 수집하는 데이터 수집부;상기 단백질 데이터로부터 단백질 표현형 데이터를 생성하고, 상기 약 분자 데이터로부터 약 분자 표현형 데이터를 생성하는 표현형 생성부; 및상기 단백질 표현형 데이터, 상기 약 분자 표현형 데이터 및 상기 상호작용 데이터를 학습 데이터로 이용하여 베이지언 뉴럴 네트워크를 학습시켜, 단백질-약 상호작용 예측 모델을 생성하는 모델 생성부; 를 포함하는,단백질-약 상호작용 예측 모델 생성 장치
2 2
제1항에 있어서,상기 표현형 생성부는 상기 약 분자 데이터로부터 그래프 구조의 약 분자 표현형 데이터를 생성하고, 전이학습을 통해 생성된 단백질 표현형 생성 모델을 이용하여 상기 단백질 데이터로부터 단백질 표현형 데이터를 생성하는,단백질-약 상호작용 예측 모델 생성 장치
3 3
제1항에 있어서,상기 베이지언 뉴럴 네트워크는,드롭아웃이 적용된 1차원 컨볼루션 네트워크;드롭아웃이 적용된 그래프 네트워크;결합 레이어; 및드롭아웃이 적용된 완전연결 네트워크를 포함하는,단백질-약 상호작용 예측 모델 생성 장치
4 4
제3항에 있어서,상기 1차원 컨볼루션 네트워크는 상기 단백질 표현형 데이터를 업데이트하고,상기 그래프 네트워크는 상기 약 분자 표현형 데이터를 업데이트하고,상기 결합 레이어는 상기 업데이트된 단백질 표현형 데이터와 상기 업데이트된 약 분자 표현형 데이터를 결합하여 결합 데이터를 생성하고,상기 완전연결 네트워크는 상기 결합 데이터를 입력받아 단백질과 약 분자 사이의 상호작용 예측값을 출력하는,단백질-약 상호작용 예측 모델 생성 장치
5 5
제1항에 있어서,상기 단백질 데이터는 아미노산 문자의 배열로 이루어진 1차원 문자열 시퀀스 데이터이고, 상기 약 분자 데이터는 분자의 구조를 1차원 문자열로 나타낸 SMILES(Simplified molecular-input line-entry system) 데이터인,단백질-약 상호작용 예측 모델 생성 장치
6 6
단백질 데이터와 약 분자 데이터를 획득하는 데이터 획득부;상기 단백질 데이터로부터 단백질 표현형 데이터를 생성하고, 상기 약 분자 데이터로부터 약 분자 표현형 데이터를 생성하는 표현형 생성부; 및베이지언 뉴럴 네트워크를 학습시켜 생성된 단백질-약 상호작용 예측 모델을 이용하여, 상기 단백질 표현형 데이터와 상기 약 분자 표현형 데이터를 기반으로 단백질과 약 분자 사이의 상호작용을 예측하고, 그 예측의 불확실성을 판단하는 상호작용 예측부; 를 포함하는,단백질-약 상호작용 예측 장치
7 7
제6항에 있어서,상기 표현형 생성부는 상기 약 분자 데이터로부터 그래프 구조의 약 분자 표현형 데이터를 생성하고, 전이학습을 통해 생성된 단백질 표현형 생성 모델을 이용하여 상기 단백질 데이터로부터 단백질 표현형 데이터를 생성하는,단백질-약 상호작용 예측 장치
8 8
제6항에 있어서,상기 베이지언 뉴럴 네트워크는 드롭아웃이 적용된 베이지언 뉴럴 네트워크이고,상기 상호작용 예측부는 드롭아웃을 적용하여 단백질과 약 분자 사이의 상호작용을 복수회 예측하고, 복수회의 예측 결과를 기반으로 단백질과 약 분자 사이의 상호작용의 최종 예측값과 상기 최종 예측값의 불확실성을 판단하는,단백질-약 상호작용 예측 장치
9 9
제8항에 있어서,상기 상호작용 예측부는 상기 복수회의 예측 결과를 평균하여 상기 최종 예측값을 판단하고, 상기 복수회의 예측 결과의 분포로부터 상기 최종 예측값의 불확실성을 판단하는,단백질-약 상호작용 예측 장치
10 10
제9항에 있어서,상기 최종 예측값의 불확실성은 모델 불확실성(epistemic uncertainty)과 데이터 불확실성(aleatoric uncertainty)을 포함하는,단백질-약 상호작용 예측 장치
11 11
제10항에 있어서,상기 상호작용 예측부는 하기 수학식을 이용하여 모델 불확실성을 판단하는,단백질-약 상호작용 예측 장치
12 12
제10항에 있어서,상기 상호작용 예측부는 하기 수학식을 이용하여 데이터 불확실성을 판단하는,단백질-약 상호작용 예측 장치
13 13
단백질 데이터와 약 분자 데이터를 획득하는 단계;상기 단백질 데이터로부터 단백질 표현형 데이터를 생성하는 단계;상기 약 분자 데이터로부터 약 분자 표현형 데이터를 생성하는 단계; 및베이지언 뉴럴 네트워크를 학습시켜 생성된 단백질-약 상호작용 예측 모델을 이용하여, 상기 단백질 표현형 데이터와 상기 약 분자 표현형 데이터를 기반으로 단백질과 약 분자 사이의 상호작용을 예측하고, 그 예측의 불확실성을 판단하는 단계; 를 포함하는,단백질-약 상호작용 예측 방법
14 14
제13항에 있어서,상기 단백질 표현형 데이터를 생성하는 단계는 전이학습을 통해 생성된 단백질 표현형 생성 모델을 이용하여 상기 단백질 데이터로부터 단백질 표현형 데이터를 생성하고,상기 약 분자 표현형 데이터를 생성하는 단계는 상기 약 분자 데이터로부터 그래프 구조의 약 분자 표현형 데이터를 생성하는,단백질-약 상호작용 예측 방법
15 15
제13항에 있어서,상기 베이지언 뉴럴 네트워크는 드롭아웃이 적용된 베이지언 뉴럴 네트워크이고,상기 단백질과 약 분자 사이의 상호작용을 예측하고 그 예측의 불확실성을 판단하는 단계는 드롭아웃을 적용하여 단백질과 약 분자 사이의 상호작용을 복수회 예측하고, 복수회의 예측 결과를 기반으로 단백질과 약 분자 사이의 상호작용의 최종 예측값과 상기 최종 예측값의 불확실성을 판단하는 단계를 포함하는,단백질-약 상호작용 예측 방법
16 16
제15항에 있어서,상기 최종 예측값과 상기 최종 예측값의 불확실성을 판단하는 단계는 상기 복수회의 예측 결과를 평균하여 상기 최종 예측값을 판단하고, 상기 복수회의 예측 결과의 분포로부터 상기 최종 예측값의 불확실성을 판단하는,단백질-약 상호작용 예측 방법
17 17
제16항에 있어서,상기 최종 예측값의 불확실성은 모델 불확실성(epistemic uncertainty)과 데이터 불확실성(aleatoric uncertainty)을 포함하는,단백질-약 상호작용 예측 방법
18 18
제17항에 있어서,상기 최종 예측값의 불확실성을 판단하는 단계는 하기 수학식을 이용하여 모델 불확실성을 판단하는,단백질-약 상호작용 예측 방법
19 19
제17항에 있어서,상기 최종 예측값의 불확실성을 판단하는 단계는 하기 수학식을 이용하여 데이터 불확실성을 판단하는,단백질-약 상호작용 예측 방법
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순번 연구부처 주관기관 연구사업 연구과제
1 미래창조과학부 서울대학교 개인연구지원 0차원 나노플루이딕스 연구단