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대상 단백질을 구성하는 아미노산 서열에 포함된 일련의 알파탄소의 좌표정보를 입력받아 각각의 알파탄소에 대응하는 가상중심을 상기 각각의 알파탄소와 인접한 알파탄소와의 사이에서 결정된 지점에 배치하는 가상중심 결정부;상기 대상 단백질에 대하여 결정된 가상중심들 중에서 사전에 설정된 개수의 연속하는 가상중심 간의 거리 및 이면각을 기초로 상기 연속하는 가상중심에 대응하는 복수의 아미노산이 형성하는 2차 구조가 나선구조에 해당하는지 여부를 판별하는 나선구조 판별부; 및상기 나선구조에 해당하지 않는 것으로 판별된 가상중심들 중에서 사전에 설정된 개수의 연속하는 가상중심으로 이루어진 복수의 가상중심 서열에 대하여 서로 다른 가상중심 서열에 포함된 가상중심 간의 거리를 기초로 상기 각각의 가상중심 서열에 속하는 가상중심에 대응하는 복수의 아미노산이 형성하는 2차 구조가 병풍구조에 해당하는지 여부를 판별하는 병풍구조 판별부;를 포함하는 것을 특징으로 하는 단백질 2차 구조 판별장치
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제 1항에 있어서,상기 나선구조 판별부는,상기 가상중심들 중에서 연속하는 네 개의 가상중심에 대하여 첫 번째 가상중심과 네 번째 가상중심 간의 거리가 사전에 설정된 제1거리범위에 속하고, 네 개의 가상중심이 이루는 이면각이 사전에 설정된 제1각도범위에 속하면 상기 네 개의 가상중심에 대응하는 아미노산 서열이 형성하는 2차 구조가 알파 나선구조인 것으로 판별하는 알파 나선구조 판별부; 및상기 연속하는 네 개의 가상중심에 대하여 첫 번째 가상중심과 세 번째 가상중심 간의 거리, 두 번째 가상중심과 네 번째 가상중심 간의 거리 및 첫 번째 가상중심과 네 번째 가상중심 간의 거리가 각각 사전에 설정된 제2거리범위, 제3거리범위 및 제4거리범위에 속하고, 네 개의 가상중심이 이루는 이면각이 사전에 설정된 제2거리범위에 속하면 상기 네 개의 가상중심에 대응하는 아미노산 서열이 형성하는 2차 구조가 3/10 나선구조인 것으로 판별하는 3/10 나선구조 판별부;를 포함하는 것을 특징으로 하는 단백질 2차 구조 판별장치
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제 2항에 있어서,상기 병풍구조 판별부는,진행방향이 동일한 서로 다른 가상중심 서열에 포함된 가상중심 간의 거리가 사전에 설정된 제5거리범위에 속하고, 상기 서로 다른 가상중심 서열에 포함된 가상중심에 대해 연속하는 가상중심 간의 거리가 사전에 설정된 제6거리범위에 속하면 상기 서로 다른 가상중심 서열에 대응하는 아미노산 서열이 형성하는 2차 구조가 평행 병풍구조인 것으로 판별하는 평행구조 판별부; 및진행방향이 반대인 서로 다른 가상중심 서열에 포함된 가상중심 간의 거리가 사전에 설정된 제7거리범위에 속하고, 상기 서로 다른 가상중심 서열에 포함된 가상중심에 대해 연속하는 가상중심 간의 거리가 사전에 설정된 제8거리범위에 속하며, 상기 서로 다른 가상중심 서열에 포함된 가상중심에 각각 대응하는 알파탄소 간의 거리가 사전에 설정된 제9거리범위에 속하면 상기 서로 다른 가상중심 서열에 대응하는 아미노산 서열이 형성하는 2차 구조가 역평행 병풍구조인 것으로 판별하는 역평행구조 판별부;를 포함하는 것을 특징으로 하는 단백질 2차 구조 판별장치
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제 1항 내지 제 3항 중 어느 한 항에 있어서,상기 가상중심 결정부는 서로 인접한 두 개의 알파탄소 사이의 중심 지점에 상기 가상중심을 배치하는 것을 특징으로 하는 단백질 2차 구조 판별장치
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제 2항 또는 제 3항에 있어서,상기 알파 나선구조 판별부는 상기 연속하는 네 개의 가상중심에 대응하는 아미노산 서열에 프롤린(proline)이 포함되어 있으면 해당 아미노산 서열에 대하여는 알파 나선구조에 해당하는지 여부를 판별하지 않는 것을 특징으로 하는 단백질 2차 구조 판별장치
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제 3항에 있어서,상기 역평행구조 판별부는 연속하는 복수의 가상중심 서열에 대응하는 아미노산 서열이 모두 역평행 병풍구조인 것으로 판별되면 연속하여 역평행 병풍구조를 가지는 연속 아미노산 서열의 양단에 위치하는 가상중심 각각에 대하여 상기 양단에 위치하는 가상중심에 대해 상기 연속 아미노산 서열의 바깥쪽으로 인접한 가상중심이 수소결합을 형성하는지 여부에 따라 상기 역평행 병풍구조에 포함시킬 것인지 여부를 결정하는 것을 특징으로 하는 단백질 2차 구조 판별장치
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대상 단백질을 구성하는 아미노산 서열에 포함된 일련의 알파탄소의 좌표정보를 입력받아 각각의 알파탄소에 대응하는 가상중심을 상기 각각의 알파탄소와 인접한 알파탄소와의 사이에서 결정된 지점에 배치하는 가상중심 결정단계;상기 대상 단백질에 대하여 결정된 가상중심들 중에서 사전에 설정된 개수의 연속하는 가상중심 간의 거리 및 이면각을 기초로 상기 연속하는 가상중심에 대응하는 복수의 아미노산이 형성하는 2차 구조가 나선구조에 해당하는지 여부를 판별하는 나선구조 판별단계; 및상기 나선구조에 해당하지 않는 것으로 판별된 가상중심들 중에서 사전에 설정된 개수의 연속하는 가상중심으로 이루어진 복수의 가상중심 서열에 대하여 서로 다른 가상중심 서열에 포함된 가상중심 간의 거리를 기초로 상기 각각의 가상중심 서열에 속하는 가상중심에 대응하는 복수의 아미노산이 형성하는 2차 구조가 병풍구조에 해당하는지 여부를 판별하는 병풍구조 판별단계;를 포함하는 것을 특징으로 하는 단백질 2차 구조 판별방법
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제 7항에 있어서,상기 나선구조 판별단계는,상기 가상중심들 중에서 연속하는 네 개의 가상중심에 대하여 첫 번째 가상중심과 네 번째 가상중심 간의 거리가 사전에 설정된 제1거리범위에 속하고, 네 개의 가상중심이 이루는 이면각이 사전에 설정된 제1각도범위에 속하면 상기 네 개의 가상중심에 대응하는 아미노산 서열이 형성하는 2차 구조가 알파 나선구조인 것으로 판별하는 알파 나선구조 판별단계; 및상기 연속하는 네 개의 가상중심에 대하여 첫 번째 가상중심과 세 번째 가상중심 간의 거리, 두 번째 가상중심과 네 번째 가상중심 간의 거리 및 첫 번째 가상중심과 네 번째 가상중심 간의 거리가 각각 사전에 설정된 제2거리범위, 제3거리범위 및 제4거리범위에 속하고, 네 개의 가상중심이 이루는 이면각이 사전에 설정된 제2거리범위에 속하면 상기 네 개의 가상중심에 대응하는 아미노산 서열이 형성하는 2차 구조가 3/10 나선구조인 것으로 판별하는 3/10 나선구조 판별단계;를 포함하는 것을 특징으로 하는 단백질 2차 구조 판별방법
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제 8항에 있어서,상기 병풍구조 판별단계는,진행방향이 동일한 서로 다른 가상중심 서열에 포함된 가상중심 간의 거리가 사전에 설정된 제5거리범위에 속하고, 상기 서로 다른 가상중심 서열에 포함된 가상중심에 대해 연속하는 가상중심 간의 거리가 사전에 설정된 제6거리범위에 속하면 상기 서로 다른 가상중심 서열에 대응하는 아미노산 서열이 형성하는 2차 구조가 평행 병풍구조인 것으로 판별하는 평행구조 판별단계; 및진행방향이 반대인 서로 다른 가상중심 서열에 포함된 가상중심 간의 거리가 사전에 설정된 제7거리범위에 속하고, 상기 서로 다른 가상중심 서열에 포함된 가상중심에 대해 연속하는 가상중심 간의 거리가 사전에 설정된 제8거리범위에 속하며, 상기 서로 다른 가상중심 서열에 포함된 가상중심에 각각 대응하는 알파탄소 간의 거리가 사전에 설정된 제9거리범위에 속하면 상기 서로 다른 가상중심 서열에 대응하는 아미노산 서열이 형성하는 2차 구조가 역평행 병풍구조인 것으로 판별하는 역평행구조 판별단계;를 포함하는 것을 특징으로 하는 단백질 2차 구조 판별방법
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제 7항 내지 제 9항 중 어느 한 항에 있어서,상기 가상중심 결정단계에서, 서로 인접한 두 개의 알파탄소 사이의 중심 지점에 상기 가상중심을 배치하는 것을 특징으로 하는 단백질 2차 구조 판별방법
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제 8항 또는 제 9항에 있어서,상기 알파 나선구조 판별단계에서, 상기 연속하는 네 개의 가상중심에 대응하는 아미노산 서열에 프롤린(proline)이 포함되어 있으면 해당 아미노산 서열에 대하여는 알파 나선구조에 해당하는지 여부를 판별하지 않는 것을 특징으로 하는 단백질 2차 구조 판별방법
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제 9항에 있어서,상기 역평행구조 판별단계에서, 연속하는 복수의 가상중심 서열에 대응하는 아미노산 서열이 모두 역평행 병풍구조인 것으로 판별되면 연속하여 역평행 병풍구조를 가지는 연속 아미노산 서열의 양단에 위치하는 가상중심 각각에 대하여 상기 양단에 위치하는 가상중심에 대해 상기 연속 아미노산 서열의 바깥쪽으로 인접한 가상중심이 수소결합을 형성하는지 여부에 따라 상기 역평행 병풍구조에 포함시킬 것인지 여부를 결정하는 것을 특징으로 하는 단백질 2차 구조 판별방법
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제 7항 내지 제 9항 중 어느 한 항에 기재된 단백질 2차 구조 판별방법을 컴퓨터에서 실행시키기 위한 프로그램을 기록한 컴퓨터로 읽을 수 있는 기록매체
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