맞춤기술찾기

이전대상기술

단동위원소 질량 결정 프로그램

  • 기술번호 : KST2014066717
  • 담당센터 : 서울동부기술혁신센터
  • 전화번호 : 02-2155-3662
요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 폴리펩타이드의 동위원소집단을 찾아 단동위원소 질량을 결정하는 방법 및 기록 매체가 제공된다. 본 발명의 방법은 동위원소집단내 각 피크 세기에 의해 정의된 확률 모델에 기반하여 동위원소집단을 찾고 단동위원소 질량을 결정하는 알고리즘을 포함한다. 동위원소집단의 확률 모델은 질량에 대한 특성 함수들로서, 두 개의 피크 세기의 비율 함수, 및 세 개의 피크로 얻는 두 비율의 곱 함수를 포함한다. 이들 질량에 대한 특성 함수는 어떤 동위원소집단의 질량에 대해 실제 동위원소집단에서 허용되는 피크들의 모양을 정의한다. 이에 기반한 동위원소집단을 찾는 알고리즘은 특성 함수들을 이용해 어떤 동위원소집단이 이론적인 동위원소집단의 스펙트럼 모양과 가까운 정도를 점수로 계산한다. 먼저, 1Da 간격으로 같은 동위원소집단이 될 수 있는 피크들을 발견한 후, 피크 세기의 비율, 및 비율곱이 미리 정의된 특성 함수의 최대, 및 최소값 범위에 들어오는지 여부, 평균값에 가까운 정도를 고려해 점수를 계산한다. 이에 따라, 각 동위원소집단을 결정할 수 있으며, 최종적으로 각 피크는 하나의 동위원소집단에만 속하도록 중복되는 동위원소집단을 제거하고 각 동위원소집단의 단동위원소 질량을 결정한다. 질량 스펙트럼, 폴리펩타이드, 동위원소집단, 단동위원소 질량
Int. CL G06F 19/24 (2011.01.01) G06F 19/16 (2011.01.01) G01N 33/68 (2006.01.01)
CPC G06F 19/24(2013.01) G06F 19/24(2013.01) G06F 19/24(2013.01)
출원번호/일자 1020070013405 (2007.02.08)
출원인 재단법인서울대학교산학협력재단, 서울시립대학교 산학협력단
등록번호/일자 10-0789430-0000 (2007.12.20)
공개번호/일자
공고번호/일자 (20071228) 문서열기
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보
법적상태 소멸
심사진행상태 수리
심판사항
구분
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2007.02.08)
심사청구항수 14

출원인

번호, 이름, 국적, 주소의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 인명정보 - 출원인 표입니다.
번호 이름 국적 주소
1 재단법인서울대학교산학협력재단 대한민국 서울특별시 관악구
2 서울시립대학교 산학협력단 대한민국 서울특별시 동대문구

발명자

번호, 이름, 국적, 주소의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 인명정보 - 발명자 표입니다.
번호 이름 국적 주소
1 박근수 대한민국 서울 동작구
2 윤주영 대한민국 서울 관악구
3 이선호 대한민국 서울 서초구
4 백은옥 대한민국 서울 서초구
5 박희진 대한민국 서울 동작구
6 이상원 대한민국 서울 성북구

대리인

번호, 이름, 국적, 주소의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 인명정보 - 대리인 표입니다.
번호 이름 국적 주소
1 특허법인충정 대한민국 서울특별시 강남구 역삼로***,*층(역삼동,성보역삼빌딩)

최종권리자

번호, 이름, 국적, 주소의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 인명정보 - 최종권리자 표입니다.
번호 이름 국적 주소
1 서울시립대학교 산학협력단 대한민국 서울특별시 동대문구
2 재단법인서울대학교산학협력재단 대한민국 서울특별시 관악구
번호, 서류명, 접수/발송일자, 처리상태, 접수/발송일자의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 행정처리 표입니다.
번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 특허출원서
Patent Application
2007.02.08 수리 (Accepted) 1-1-2007-0119873-22
2 보정요구서
Request for Amendment
2007.02.21 발송처리완료 (Completion of Transmission) 1-5-2007-0022754-49
3 서지사항보정서
Amendment to Bibliographic items
2007.03.09 수리 (Accepted) 1-1-2007-0192596-25
4 안내문(직권수리)
Notification(Ex officio Acceptance)
2007.03.13 발송처리완료 (Completion of Transmission) 1-5-2007-0031928-08
5 출원인변경신고서
Applicant change Notification
2007.06.25 수리 (Accepted) 1-1-2007-0458177-70
6 선행기술조사의뢰서
Request for Prior Art Search
2007.08.02 수리 (Accepted) 9-1-9999-9999999-89
7 선행기술조사보고서
Report of Prior Art Search
2007.09.11 수리 (Accepted) 9-1-2007-0051836-24
8 등록결정서
Decision to grant
2007.10.26 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2007-0573289-41
9 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2008.01.29 수리 (Accepted) 4-1-2008-5015497-73
10 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2011.01.05 수리 (Accepted) 4-1-2011-5002044-04
11 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2014.01.03 수리 (Accepted) 4-1-2014-0000287-10
12 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2014.08.22 수리 (Accepted) 4-1-2014-5100909-62
13 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2015.03.20 수리 (Accepted) 4-1-2015-5036045-28
14 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2017.01.17 수리 (Accepted) 4-1-2017-5009116-18
15 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2019.09.10 수리 (Accepted) 4-1-2019-5191631-69
번호, 청구항의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 청구항 표입니다.
번호 청구항
1 1
동위원소집단의 단동위원소 질량 결정을 위한 동위원소집단의 확률 모델 결정 방법에 있어서, 동위원소집단 내의 각 피크 세기(Ik), 두 피크 세기의 비율() 및 세개의 피크로 얻는 두 비율의 곱()을 확률식으로 근사하는 단계; 및 상기 확률식을 이용하여, 질량이 M인 폴리펩타이드의 k번째 비율에 대한 최대, 최소, 및 평균 함수(Rmax(k, M), Rmin(k, M), Ravg(k, M)), 및 상기 질량이 M인 폴리펩타이드의 k번째 비율 곱에 대한 최대, 최소, 및 평균 함수(RPmin(k, M), RPmax(k, M), RPavg(k, M))를 구하는 단계 를 포함하는 것을 특징으로 하는 확률 모델 결정 방법
2 2
제1항에 있어서, 상기 각 피크 세기는 폴리펩타이드내의 원소 개수와 각 원소의 동위원소 존재 확률에 기초한 식으로 나타내며, 상기 각 피크 세기에 대한 식으로부터 계산되는 상기 비율 및 비율 곱의 확률식은 상기 질량 M을 포함하는 식으로 나타내는 것을 특징으로 하는 확률 모델 결정 방법
3 3
제1항에 있어서, 상기 비율 및 비율 곱 각각에 대한 최대, 최소, 및 평균 함수를 구하는 단계는, 데이터베이스로부터 소정 폴리펩타이드 데이터를 샘플링하고, 상기 샘플링된 데이터에 근사화되도록 시뮬레이션 스펙트럼을 계산하여 상기 비율 및 비율 곱 각각에 대한 최대, 최소, 및 평균 함수의 상수를 결정하는 것을 특징으로 하는 확률 모델 결정 방법
4 4
질량 스펙트럼으로부터 동위원소집단을 찾아 단동위원소 질량을 결정하는 방법에 있어서, 질량 스펙트럼에서 질량대 전하량 비(m/z) 순서로 피크를 선택한 후, 상기 피크로부터 시작하는 (1~10)z 범위의 전하량을 가지는 동위원소 집단을 탐색하는 단계; 상기 탐색으로부터 발견한 동위원소집단에 대하여 피크 3개 이상과 피크 2개의 경우로 나누어 점수를 계산하는 단계; 상기 계산된 점수가 기준 점수 이상인 동위원소집단에서 중복 피크를 가지는 두 동위원소집단 중 어느 하나를 제거하는 단계; 및 상기 계산된 점수가 기준 점수 이상인 각 동위원소집단의 단동위원소 질량을 계산하는 단계 를 포함하는 것을 특징으로 하는 단동위원소 질량 결정 방법
5 5
제4항에 있어서, 상기 점수를 계산하는 단계에서, 동위원소집단에 속하는 3개의 피크를 발견하면, 이론적인 동위원소집단에서 k번째 피크부터 k+2번째 피크로 가정하고, 상기 3개의 피크로부터 계산되는 두 개의 비율에 대한 각 점수와 하나의 비율 곱에 대한 점수를 합하고 상기 동위원소집단 앞의 피크에 대한 보정을 통하여 해당 동위원소집단의 점수에 반영하며, 기준 점수 이상의 점수를 가진 동위원소집단에 대하여 추가로 확장 가능한 피크가 존재한 경우에, 각 피크마다 하나의 비율에 대한 점수와 하나의 비율 곱에 대한 점수를 합하여 점수를 추가하고, 확장이 끝난 후 상기 동위원소집단 뒤의 피크에 대한 보정을 통하여 해당 동위원소집단의 점수에 반영하는 것을 특징으로 하는 단동위원소 질량 결정 방법
6 6
제4항에 있어서, 상기 점수를 계산하는 단계에서, 동위원소집단에 속하는 피크가 2개만 발견되면, 상기 2개의 피크에 따른 하나의 비율 점수를 구하고, 상기 동위원소집단의 앞과 뒤의 피크에 대한 보정을 통하여 해당 동위원소집단의 점수에 반영하는 것을 특징으로 하는 단동위원소 질량 결정 방법
7 7
제5항 및 제6항 중 어느 한 항에 있어서, 확률 모델로부터 샘플링하여 얻은 비율 및 비율 곱 각각에 대한 최대, 최소, 및 평균 함수를 이용하여, 상기 비율 및 비율 곱이 상기 평균에 가까울수록 각각의 점수가 높고, 상기 비율 및 비율 곱이 상기 최대 및 최소 사이의 범위에서 양의 점수를 가지며, 상기 비율 및 비율 곱이 상기 최대 및 최소 사이의 범위를 벗어나면 음의 점수를 갖도록 상기 비율 및 비율 곱에 대하여 각 점수를 부여하는 것을 특징으로 하는 단동위원소 질량 결정 방법
8 8
제7항에 있어서, 비율 계산에 사용되는 두 피크 중 더 작은 피크가 에러만큼 커지거나 작아지는 경우를 고려하여 상기 샘플링으로부터 얻은 상기 최대 및 최소 함수를 확장시키고, 상기 확장된 최대, 및 최소 함수를 상기 점수 계산에 이용하는 것을 특징으로 하는 단동위원소 질량 결정 방법
9 9
제5항 및 제6항 중 어느 한 항에 있어서, 확률 모델로부터 샘플링하여 얻은 비율 및 비율곱 각각에 대한 평균 및 표준 편차 함수를 이용하여, 특정 질량에 대한 비율 및 비율곱의 확률 분포를 정규분포로 가정하여 상기 비율 및 비율 곱에 대하여 각 점수를 부여하는 것을 특징으로 하는 단동위원소 질량 결정 방법
10 10
제5항 및 제6항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 앞의 피크에 대한 보정은, 동위원소집단의 첫 번째 피크가 이론적인 동위원소집단에서 첫 번째 피크가 아닌 경우에, 전체 질량 스펙트럼에서 앞의 피크가 존재하는 일정 범위 내에서 가장 큰 피크를 찾고, 상기 가장 큰 피크의 세기가 이론적인 최소값보다 작은 경우에 상기 첫 번째 피크와 상기 가장 큰 피크의 비율에 대한 점수를 계산하여 감점하며, 상기 뒤의 피크에 대한 보정은, 전체 질량 스펙트럼에서 뒤의 피크가 존재하는 일정 범위 내에서 가장 큰 피크를 찾고, 상기 가장 큰 피크의 세기가 이론적인 최소값보다 작은 경우에 상기 동위원소집단의 마지막 피크와 상기 가장 큰 피크의 비율에 대한 점수를 계산하여 감점하는 것을 특징으로 하는 단동위원소 질량 결정 방법
11 11
제4항에 있어서, 찾아낸 모든 동위원소집단 중에서 서로 공유하는 중복 피크가 존재하는 두 동위원소집단에 대하여 우선순위가 높은 하나의 동위원소집단만을 남기는 것을 특징으로 하는 단동위원소 질량 결정 방법
12 12
제11항에 있어서, 상기 우선순위는 가장 큰 세기의 피크가 더 큰 것, 전하량이 더 큰 것, 및 동위원소집단 점수가 더 높은 것의 순서로 비교하여 결정되는 것을 특징으로 하는 단동위원소 질량 결정 방법
13 13
제4항에 있어서, 상기 단동위원소 질량을 계산하는 단계에서, 동위원소집단 내의 피크의 세기가 가장 큰 피크에 가장 높은 가중치를 부여하여 질량을 결정하는 것을 특징으로 하는 단동위원소 질량 결정 방법
14 14
제1항 내지 제13항 중 어느 한 항의 방법을 수행하기 위한 컴퓨터로 판독 가능한 프로그램을 기록한 기록 매체
지정국 정보가 없습니다
순번, 패밀리번호, 국가코드, 국가명, 종류의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 패밀리정보 - 패밀리정보 표입니다.
순번 패밀리번호 국가코드 국가명 종류
1 US08321153 US 미국 FAMILY
2 US20100114498 US 미국 FAMILY
3 WO2008096962 WO 세계지적재산권기구(WIPO) FAMILY

DOCDB 패밀리 정보

순번, 패밀리번호, 국가코드, 국가명, 종류의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 패밀리정보 - DOCDB 패밀리 정보 표입니다.
순번 패밀리번호 국가코드 국가명 종류
1 US2010114498 US 미국 DOCDBFAMILY
2 US8321153 US 미국 DOCDBFAMILY
3 WO2008096962 WO 세계지적재산권기구(WIPO) DOCDBFAMILY
국가 R&D 정보가 없습니다.