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(a) 바이오 정보 문헌 데이터베이스로부터 검색된 단백질 관련 문서들 중 단백질 상호작용 관계를 텍스트 마이닝 방법을 이용하여 추출하는 단계; (b) 상기 단백질 상호작용 관계 정보를 온톨로지 아이디로 매핑하는 단계; 및 (c) 상기 매핑된 단백질 상호작용 관계 정보 중 상기 정보의 출현 빈도 및 해당 단백질 관련 문서의 영향력 요인을 기준으로 높은 가중치를 갖는 정보를 필터링 하는 단계;를 포함하는 단백질 상호작용 검증 방법
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제 1항에 있어서,(d) 상기 단백질 관련 문서 정보, 문서 내의 단백질 관련 문장 정보, 온톨로지 아이디 정보, 단백질 상호작용 관계 정보 및 그의 정확도 정보를 색인하는 단계;를 추가로 포함하는 것을 특징으로 하는 단백질 상호작용 검증 방법
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제 1항에 있어서, 상기 (a) 단계는 (a1) 상기 단백질 관련 문서에 포함된 용어에 대해 태깅을 수행하는 단계; (a2) 상기 태깅된 문서로부터 단백질 상호작용 관계에 관련된 문장을 추출하는 단계; 및(a3) 상기 추출된 문장 중에서 하나의 단백질에 관한 주체 문자, 다른 단백질에 관한 객체 문자 및 그들 사이의 관계를 나타내는 이벤트 문자를 인식하는 단계;를 포함하는 것을 특징으로 하는 단백질 상호작용 검증 방법
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제 1항에 있어서, 상기 (b) 단계는 온톨로지 데이터베이스를 이용하여 상기 단백질 상호작용 관계 정보를 종에 따라 매핑하는 것을 특징으로 하는 단백질 상호작용 검증 방법
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제 1항에 있어서, 상기 (c) 단계는 (c1) 상기 복수의 단백질 상호작용 정보가 충돌하는 경우 각 정보의 가중치를 산정하는 단계; 및(c2) 상기 정보들의 가중치 차이가 특정 임계치를 초과하는 경우 상기 정보들 중 높은 가중치를 갖는 정보를 선택하는 단계;를 포함하는 것을 특징으로 하는 단백질 상호작용 검증 방법
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단백질들 사이의 상호 연관성 정보 및 계층 구조 정보를 저장하는 온톨로지 데이터베이스;단백질 관련 문서들 중 단백질 상호작용 관계를 텍스트 마이닝 방법을 이용하여 추출하는 텍스트 마이닝부; 상기 온톨로지 데이터베이스를 이용하여 상기 단백질 상호작용 관계 정보를 온톨로지 아이디로 매핑하는 온톨로지 매핑부; 및 상기 매핑된 단백질 상호작용 관계 정보 중 상기 정보의 출현 빈도 및 해당 단백질 관련 문서의 영향력 요인을 기준으로 높은 가중치를 갖는 정보를 필터링 하는 정보 필터링부;를 포함하는 단백질 상호작용 검증 시스템
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제 6항에 있어서,상기 단백질 관련 문서 정보, 문서 내의 단백질 관련 문장 정보, 온톨로지 아이디 정보, 단백질 상호작용 관계 정보 및 그의 정확도 정보를 색인하고, 상기 색인 정보를 상호작용 정보 데이터베이스에 저장하는 정보 색인부;를 추가로 포함하는 것을 특징으로 하는 단백질 상호작용 검증 시스템
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제 6항에 있어서, 상기 텍스트 마이닝부는 (a1) 상기 단백질 관련 문서에 포함된 용어에 대해 태깅을 수행하는 단계; (a2) 상기 태깅된 문서로부터 단백질 상호작용 관계에 관련된 문장을 추출하는 단계; 및(a3) 상기 추출된 문장 중에서 하나의 단백질에 관한 주체 문자, 다른 단백질에 관한 객체 문자 및 그들 사이의 관계를 나타내는 이벤트 문자를 인식하는 단계;를 수행하는 것을 특징으로 하는 단백질 상호작용 검증 시스템
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제 6항에 있어서, 상기 정보 필터링부는 (c1) 상기 복수의 단백질 상호작용 정보가 충돌하는 경우 각 정보의 가중치를 산정하는 단계; 및(c2) 상기 정보들의 가중치 차이가 특정 임계치를 초과하는 경우 상기 정보들 중 높은 가중치를 갖는 정보를 선택하는 단계;를 수행하는 것을 특징으로 하는 단백질 상호작용 검증 시스템
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