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유전자 온톨로지를 이용한 단백질 상호작용 네트워크 검색시스템 및 방법

  • 기술번호 : KST2015096911
  • 담당센터 : 대전기술혁신센터
  • 전화번호 : 042-610-2279
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요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 본 발명은 단백질 상호작용 네트워크의 검색에 있어 불리언 연산자와 is-a, part-of의 계층구조를 갖는 유전자 온톨로지 개념을 이용하여 확장된 패싯 질의 기반으로 사용자 의도와 의미적으로 일치하는 정보를 순위화하여 제공하는 단백질 상호작용 네트워크 검색 시스템 및 방법에 관한 것이다. 본 발명은 각종 단백질 및 단백질 상호작용 정보와 유전자 온톨로지 정보를 데이터베이스화하는 단계; 사용자로부터 단백질 검색을 위한 각 질의항목들을 입력받는 단계; 데이터베이스의 계층구조 및 불리언 조합을 통해 사용자 질의를 확장하는 단계; 확장된 사용자 질의를 바탕으로 단백질를 검색하고 그 검색결과를 순위화하여 출력하는 단계; 및 단백질 검색결과중 사용자가 선택한 단백질리스트만을 포함하는 단백질 상호작용 네트워크 정보를 탐색하고 그 결과를 가중치 값에 따라 순위화하여 출력하는 단계;로 이루어진다. 유전자 온톨로지, 생명정보학, 단백질 상호작용 네트워크, 패싯항목, 불리언 연산자
Int. CL G06F 17/30 (2011.01) G06F 19/28 (2011.01)
CPC G06F 19/28(2013.01) G06F 19/28(2013.01) G06F 19/28(2013.01)
출원번호/일자 1020030087745 (2003.12.04)
출원인 한국전자통신연구원
등록번호/일자 10-0551954-0000 (2006.02.07)
공개번호/일자 10-2005-0054377 (2005.06.10) 문서열기
공고번호/일자 (20060220) 문서열기
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보
법적상태 소멸
심사진행상태 수리
심판사항
구분
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2003.12.04)
심사청구항수 11

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 한국전자통신연구원 대한민국 대전광역시 유성구

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 정재영 대한민국 대전광역시유성구
2 최재훈 대한민국 대전광역시유성구
3 박선희 대한민국 대전광역시서구
4 김대희 대한민국 대전광역시서구

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 권태복 대한민국 서울시 강남구 테헤란로*길 **, *층 (역삼동, 청원빌딩)(아리특허법률사무소)
2 이화익 대한민국 서울시 강남구 테헤란로*길** (역삼동,청원빌딩) *층,***,***호(영인국제특허법률사무소)

최종권리자

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번호 이름 국적 주소
1 한국전자통신연구원 대전광역시 유성구
번호, 서류명, 접수/발송일자, 처리상태, 접수/발송일자의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 행정처리 표입니다.
번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 특허출원서
Patent Application		 2003.12.04 수리 (Accepted) 1-1-2003-0464321-07
2 공지예외적용주장대상(신규성,출원시의특례)증명서류제출서
Submission of Document Verifying Exclusion from Being Publically Known (Novelty, Special Provisions for Application)		 2004.01.02 수리 (Accepted) 1-1-2004-5000338-96
3 선행기술조사의뢰서
Request for Prior Art Search		 2005.06.15 수리 (Accepted) 9-1-9999-9999999-89
4 선행기술조사보고서
Report of Prior Art Search		 2005.07.15 수리 (Accepted) 9-1-2005-0041574-19
5 의견제출통지서
Notification of reason for refusal		 2005.07.26 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2005-0354642-61
6 명세서등보정서
Amendment to Description, etc.		 2005.09.26 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) 1-1-2005-0537165-39
7 의견서
Written Opinion		 2005.09.26 수리 (Accepted) 1-1-2005-0537172-59
8 등록결정서
Decision to grant		 2006.01.27 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2006-0053910-11
9 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2009.08.04 수리 (Accepted) 4-1-2009-5150899-36
10 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2015.02.02 수리 (Accepted) 4-1-2015-0006137-44
번호, 청구항의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 청구항 표입니다.
번호 청구항
1 1
단백질 및 단백질 상호작용 정보와 유전자 온톨로지 정보를 포함하는 데이터베이스부; 사용자로부터 패싯 질의항목들을 입력받는 사용자 질의입력부; 상기 사용자 질의항목에 대해 불리언 조합을 하고, 상기 데이터베이스부의 계층구조 정보를 참조하여 사용자 질의를 확장하는 중앙처리부; 상기 질의 처리 결과를 바탕으로 개념기반 단백질 정보 검색을 수행하는 단백질 검색부; 및 상기 검색된 단백질 리스트를 포함하는 단백질 상호작용 네트워크 정보를 검색 제공하는 단백질 상호작용 네트워크 검색부;로 구성되는 것을 특징으로 하는 유전자 온톨로지를 이용한 단백질 상호작용 네트워크 검색 시스템
2 2
제 1항에 있어서, 상기 데이터베이스부는, 계층구조에서의 상관도에 따라 각각의 데이터베이스 값에 대해 가중치를 미리 정의하여 두는 것을 특징으로 하는 유전자 온톨로지를 이용한 단백질 상호작용 네트워크 검색 시스템
3 3
제 2항에 있어서, 상기 단백질 검색부, 및 상기 단백질 상호작용 네트워크 검색부는, 질의 확장시 적용된 데이터베이스 값들의 가중치에 따라, 그 검색결과 리스트를 순위화하여 출력하는 것을 특징으로 하는 유전자 온톨로지를 이용한 단백질 상호작용 네트워크 검색 시스템
4 4
제 1항에 있어서, 상기 데이터베이스부는, 단백질 종의 계층구조 정보가 저장되는 종 DB; 단백질 이름, 단백질 유사명, 유전자 이름을 포함하는 단백질 관련 정보와, 유전자 및 단백질 정보 데이터베이스를 갖는 외부 사이트의 URL 정보가 저장되는 단백질 DB; 세포 성분, 생물학적 처리, 및 분자 기능의 세 부분으로 이루어진 단백질들간의 상호 연관성을 나타내는 유전자 온톨로지 정보 및 유전자 온톨로지 계층구조 정보가 저장되는 유전자 온톨로지 DB; 및 단백질간의 물리 화학적 결합관계 정보인 단백질 상호작용 네트워크 정보를 갖는 단백질 상호작용 DB;를 포함하는 것을 특징으로 하는 유전자 온톨로지를 이용한 단백질 상호작용 네트워크 검색 시스템
5 5
제 1항에 있어서, 상기 사용자 질의 입력부는, 사용자로부터 단백질 이름, 단백질 종, 세포성분, 생물학적 처리, 분자 기능을 포함하는 패싯단위의 질의항목들을 입력받는 것을 특징으로 하는 유전자 온톨로지를 이용한 단백질 상호작용 네트워크 검색 시스템
6 6
제 1항에 있어서, 상기 중앙처리부는, 상기 데이터베이스부를 참조하여 사용자의 질의항목 입력값과 매칭되는 데이터베이스 값을 추출하는 패싯항목 아이디 추출부; 상기 데이터베이스 값 추출 시 사용자 질의 입력값과의 상관 정도에 따른 검색 가중치를 부여하는 검색 가중치 추출부; 상기 데이터베이스부의 계층구조 정보를 참조하여 사용자 질의를 확장하는 질의 확장부; 및 상기 확장된 사용자 질의를 불리언 연산자를 사용하여 조합 표현하는 불리언 연산 조합부;로 이루어지는 것을 특징으로 하는 유전자 온톨로지를 이용한 단백질 상호작용 네트워크 검색 시스템
7 7
(a) 각종 단백질 및 단백질 상호작용 정보와 유전자 온톨로지 정보를 포함하여 데이터베이스화하는 단계; (b) 사용자로부터 단백질 검색을 위한 각 질의항목들을 입력받는 단계; (c) 상기 데이터베이스의 단백질 계층구조 정보와 불리언 조합을 통해 사용자 질의를 확장하는 단계; (d) 상기 확장된 사용자 질의를 바탕으로 개념기반 단백질 정보를 검색하고 그 검색결과 리스트를 순위화하여 출력하는 단계; 및 (e) 상기 단백질 검색결과 리스트를 포함하는 단백질 상호작용 네트워크 정보를 탐색하고 그 결과를 가중치 값에 따라 순위화하여 출력하는 단계;로 이루어지는 것을 특징으로 하는 유전자 온톨로지를 이용한 단백질 상호작용 네트워크 검색 방법
8 8
제 7항에 있어서, 상기 (a)단계는, 단백질 종의 계층구조 정보, 단백질 관련정보 및 단백질 정보를 갖는 외부 사이트의 URL 정보, 단백질 상호작용 네트워크 정보, 유전자 온톨로지 정보 및 유전자 온톨로지 계층구조 정보를 각각 데이터베이스화하여 관리하는 것을 특징으로 하는 유전자 온톨로지를 이용한 단백질 상호작용 네트워크 검색 방법
9 9
제 7항에 있어서, 상기 (b)단계는, 사용자로부터 단백질 이름, 단백질 종, 세포성분, 생물학적 처리, 분자 기능의 질의를 입력받는 것을 특징으로 하는 유전자 온톨로지를 이용한 단백질 상호작용 네트워크 검색 방법
10 10
제 7항에 있어서, 상기 (c)단계는, 상기 데이터베이스를 참조하여 각각의 사용자 질의항목과 일치하는 패싯항목 아이디를 추출하는 단계; 상기 패싯항목 아이디 추출 시 사용자 질의 입력값과의 상관 정도에 따라 검색 가중치를 추출하는 단계; 상기 데이터베이스의 계층구조를 참조하여 상기 추출된 각 패싯항목 아이디의 계층구조를 확장하는 단계; 및 상기 확장 결과에 불리언 연산 조합을 수행하는 단계;로 이루어지는 것을 특징으로 하는 유전자 온톨로지를 이용한 단백질 상호작용 네트워크 검색 방법
11 11
제 7항에 있어서, 상기 (e)단계는, 상기 단백질 검색 결과들 중에서 사용자로부터 원하는 단백질들을 선택받는 단계; 상기 데이터베이스를 참조하여 상기 선택된 단백질 명을 확장하는 단계; 상기 확장된 단백질 명에 대해 불리언 조합을 수행하고 그 검색 가중치를 추출하는 단계; 및 상기 불리언 조합 결과를 바탕으로 상기 데이터베이스의 단백질 상호작용 정보를 참조하여 사용자 선택 단백질들에 대한 단백질 상호작용 네트워크 리스트를 추출하고, 상기 추출된 검색 가중치 값에 따라 순위화하여 출력하는 단계;로 이루어지는 것을 특징으로 하는 유전자 온톨로지를 이용한 단백질 상호작용 네트워크 검색 방법
12 11
제 7항에 있어서, 상기 (e)단계는, 상기 단백질 검색 결과들 중에서 사용자로부터 원하는 단백질들을 선택받는 단계; 상기 데이터베이스를 참조하여 상기 선택된 단백질 명을 확장하는 단계; 상기 확장된 단백질 명에 대해 불리언 조합을 수행하고 그 검색 가중치를 추출하는 단계; 및 상기 불리언 조합 결과를 바탕으로 상기 데이터베이스의 단백질 상호작용 정보를 참조하여 사용자 선택 단백질들에 대한 단백질 상호작용 네트워크 리스트를 추출하고, 상기 추출된 검색 가중치 값에 따라 순위화하여 출력하는 단계;로 이루어지는 것을 특징으로 하는 유전자 온톨로지를 이용한 단백질 상호작용 네트워크 검색 방법
지정국 정보가 없습니다
패밀리정보가 없습니다
국가 R&D 정보가 없습니다.