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대상 유전자를 제공하는 단계;
상기 대상 유전자에 대응하는 복수 개의 유전체 마커를 수집하는 단계;
상기 복수 개의 유전체 마커의 성능 기대값을 나타내는 기준 평가 지표를 결정하는 단계로서, 상기 기준 평가 지표는 임계 커버리지(Threshold Coverage, Tc) 값, 임계 검정력(Threshold Power, Tp) 값, 또는 이들의 조합인 단계;
상기 복수 개의 유전체 마커 중 2 이상을 포함하는 유전체 마커 군들의 평가 지표를 계산하는 단계로서,
상기 계산하는 단계는 상기 유전체 마커 군에 포함된 유전체 마커 중 제1 유전체 마커를 제거한 제1 유전체 마커 군의 평가 지표를 계산하는 단계, 및
상기 제1 유전체 마커를 상기 제1 유전체 마커 군에 복귀시키되, 다른 제2 유전체 마커를 제거한 제2 유전체 마커 군의 평가 지표를 계산하는 단계를 포함하고,
상기 평가 지표는 커버리지(coverage) 값, 검정력(statistical power) 값, 거리 값, 또는 이들의 조합인 것인 단계; 및
상기 제1 유전체 마커 군 및 제2 유전체 마커 군 중에서 상기 기준 평가 지표에 대해 더 높은 평가 지표를 갖는 유전체 마커 군을 선택하는 단계를 포함하는 유전체 마커 선택 방법으로서,
상기 커버리지 값은 상기 유전체 마커들이 질병 또는 약물에 관련된 유전자들 각각의 유전체 변이 모두를 커버할 수 있는 비율을 나타내는 값이고,
상기 검정력 값은 상기 유전체 마커들이 질병 또는 약물에 관련된 유전자들 각각의 유전체 변이를 결정할 수 있는 확률을 나타내는 값이고,
상기 거리 값은 하기 식에 의해 산출되는 값으로서,
상기 식에서 D는 거리 값이고, C는 커버리지 값이고, P는 검정력 값이고, w1 및 w2는 각각 커버리지 및 검정력에 대한 가중치(weight)인 것인, 유전체 마커 선택 방법
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제1항에 있어서, 상기 제2 유전체 마커 군의 평가 지표를 계산하는 단계는 상기 유전체 마커 군들 중에서 최적의 평가 지표를 갖는 유전체 마커 군이 선택될 때까지 반복되는 것인 유전체 마커 선택 방법
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제5항에 있어서, 상기 선택된 최적의 평가 지표를 갖는 유전체 마커 군에 대하여 상기 계산 단계 및 선택 단계는 최적의 평가 지표를 갖는 유전체 마커 군이 선택될 때까지 반복되는 것인 유전체 마커 선택 방법
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제1항에 있어서, 상기 유전체 마커는 SNP(Single Nucleotide Polymorphism), CNV(Copy Number Variation), STS(Sequence Tagged Site), STR(Short Tandem Repeat), LTR(Long Terminal Repeat) 및 Indel(Insertion Deletion)으로 구성된 군으로부터 선택되는 것인 유전체 마커 선택 방법
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제1항에 있어서, 상기 커버리지 값은 인구 집단 내의 유전자형 정보를 사용하여 계산하는 것인 유전체 마커 선택 방법
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제1항, 제5항 내지 제7항, 및 제9항 중 어느 한 항의 방법을 컴퓨터에서 실행시키기 위한 프로그램을 기록한 컴퓨터로 읽을 수 있는 기록 매체
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대상 유전자에 대응하는 복수 개의 유전체 마커 중 2 이상의 유전체 마커를 포함하는 유전체 마커 군들의 평가 지표를 계산하는 계산부로서,
상기 유전체 마커 군에 포함된 유전체 마커 중 제1 유전체 마커를 제거한 제1 유전체 마커 군의 평가 지표를 계산하는 수단, 및
상기 제1 유전체 마커를 상기 제1 유전체 마커 군에 복귀시키되, 다른 제2 유전체 마커를 제거한 제2 유전체 마커 군의 평가 지표를 계산하는 수단을 포함하고,
상기 평가 지표는 커버리지 값, 검정력 값, 거리 값, 또는 이들의 조합인 것인 계산부; 및
상기 유전체 마커 군들 중 기준 평가 지표에 대해 더 높은 평가 지표를 갖는 유전체 마커 군을 선택하는 선택부로서,
상기 기준 평가 지표는 임계 커버리지(Tc) 값, 임계 검정력(Tp) 값, 또는 이들의 조합인 것인 선택부를 포함하는 유전체 마커 선택 장치로서,
상기 커버리지 값은 상기 유전체 마커들이 질병 또는 약물에 관련된 유전자들 각각의 유전체 변이 모두를 커버할 수 있는 비율을 나타내는 값이고,
상기 검정력 값은 상기 유전체 마커들이 질병 또는 약물에 관련된 유전자들 각각의 유전체 변이를 결정할 수 있는 확률을 나타내는 값이고,
상기 거리 값은 하기 식에 의해 산출되는 값으로서,
상기 식에서 D는 거리 값이고, C는 커버리지 값이고, P는 검정력 값이고, w1 및 w2는 각각 커버리지 및 검정력에 대한 가중치(weight)인 것인, 유전체 마커 선택 장치
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