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뉴클레오타이드 염기의 극성을 이용한 뉴클레오타이드의시각화 및 극성구조 분석 방법, 그리고 이를 포함하는유전자 코드 분석 프로그램

  • 기술번호 : KST2015160535
  • 담당센터 : 서울동부기술혁신센터
  • 전화번호 : 02-2155-3662
요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 본원 발명은 뉴클레오타이드 염기의 극성을 이용한 뉴클레오타이드의 시각화 및 극성구조 분석 방법, 그리고 이를 이용한 유전자 코드 분석 프로그램 및 유전자 코드 분석 장치에 관한 것이다.본원 발명은 특히 (i) 유전자의 염기서열에서 A, G, T 또는 U, 그리고 C의 뉴클레오타이드 염기들을 수평선을 중심으로 A는 위쪽 빈 반원, G는 위쪽 찬 반원, T 또는 U는 아래쪽 빈 반원, 그리고 C는 아래쪽 찬 반원의 기호로 시각화하는 단계; (ⅱ) 상기의 기호로 표시된 뉴클레오타이드의 염기서열의 배열에서 피리미딘(들)-퓨린(들)의 연속 배열을 묶어서 뉴클레오타이드 마디(segment)로 구분하는 단계; 및 (ⅲ) 상기 구분된 뉴클레오타이드 마디(segments)들에 대하여 뉴클레오타이드 내부의 전자의 이동 패턴을 이용하여 뉴클레오타이드 총 염기쌍 결합 에너지(total DHE/DS), 뉴클레오타이드 마디 평균 염기쌍 결합 에너지(average DHE/DS) 및 뉴클레오타이드 마디 극성 염기쌍 결합 에너지(polarity DHE/DS)를 계산하는 단계를 포함하는 뉴클레오타이드 염기의 극성을 이용한 뉴클레오타이드의 시각화 및 극성구조 분석 방법을 제공한다.이러한 뉴클레오타이드 염기의 극성 분석은 PCR 프라이머나 DNA 프로브를 위한 DNA 염기서열의 선택, DNA에서 제한효소 절단 부위 검색, 지노믹 DNA (gDNA)에서 프로모터 부위 또는 엑손과 인트론 염기서열 구분, 유전자 변이 탐색 등에 활용할 수 있으며, DNA 코드의 정전기적 구조를 통하여 DNA 복제 또는 RNA 전사를 위한 DNA 코드 암호를 해독하는 데에 효과적으로 사용할 수 있다.뉴클레오타이드, 염기, 극성, 시각화, 극성구조
Int. CL C12Q 1/68 (2006.01)
CPC G16B 45/00(2013.01) G16B 45/00(2013.01) G16B 45/00(2013.01) G16B 45/00(2013.01)
출원번호/일자 1020070011753 (2007.02.05)
출원인 재단법인서울대학교산학협력재단
등록번호/일자 10-1287040-0000 (2013.07.11)
공개번호/일자 10-2008-0073130 (2008.08.08) 문서열기
공고번호/일자 (20130717) 문서열기
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보
법적상태 등록
심사진행상태 수리
심판사항
구분
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2010.12.24)
심사청구항수 13

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 재단법인서울대학교산학협력재단 대한민국 서울특별시 관악구

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 이석근 대한민국 강원 강릉시
2 김연숙 대한민국 강원 강릉시
3 이윤우 대한민국 서울특별시 송파구
4 지제근 대한민국 서울특별시 강남구
5 박상철 대한민국 서울특별시 강남구
6 이대성 대한민국 강원 강릉시
7 이대관 대한민국 강원 강릉시

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 특허법인세신 대한민국 서울특별시 금천구 가산디지털*로 *** (가산동, 월드메르디앙벤처센터II)

최종권리자

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번호 이름 국적 주소
1 재단법인서울대학교산학협력재단 서울특별시 관악구
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번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 특허출원서
Patent Application
2007.02.05 수리 (Accepted) 1-1-2007-0107578-32
2 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2008.01.29 수리 (Accepted) 4-1-2008-5015497-73
3 [심사청구]심사청구(우선심사신청)서
[Request for Examination] Request for Examination (Request for Preferential Examination)
2010.12.24 수리 (Accepted) 1-1-2010-0855927-56
4 선행기술조사의뢰서
Request for Prior Art Search
2012.02.24 수리 (Accepted) 9-1-9999-9999999-89
5 선행기술조사보고서
Report of Prior Art Search
2012.03.21 수리 (Accepted) 9-1-2012-0021731-54
6 의견제출통지서
Notification of reason for refusal
2012.10.30 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2012-0650481-14
7 [지정기간연장]기간연장(단축, 경과구제)신청서
[Designated Period Extension] Application of Period Extension(Reduction, Progress relief)
2012.12.27 수리 (Accepted) 1-1-2012-1084600-62
8 [명세서등 보정]보정서
[Amendment to Description, etc.] Amendment
2013.01.29 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) 1-1-2013-0085203-28
9 [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견(답변, 소명)서
[Opinion according to the Notification of Reasons for Refusal] Written Opinion(Written Reply, Written Substantiation)
2013.01.29 수리 (Accepted) 1-1-2013-0085204-74
10 등록결정서
Decision to grant
2013.06.26 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2013-0439953-47
11 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2014.08.22 수리 (Accepted) 4-1-2014-5100909-62
12 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2015.03.20 수리 (Accepted) 4-1-2015-5036045-28
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번호 청구항
1 1
(i) 유전자의 염기서열에서 A, G, T 또는 U, 그리고 C의 뉴클레오타이드 염기들을 수평선을 중심으로 A는 위쪽 빈 반원, G는 위쪽 찬 반원, T 또는 U는 아래쪽 빈 반원, 그리고 C는 아래쪽 찬 반원의 기호로 시각화하는 단계;(ⅱ) 상기의 기호로 표시된 뉴클레오타이드의 5′끝에서 3′끝으로 진행되는 염기서열의 배열에서 피리미딘(들)-퓨린(들)의 연속 배열을 묶어서 뉴클레오타이드 마디(segment)로 구분하는 단계; 및(ⅲ) 상기 구분된 뉴클레오타이드 마디(segments)들에 대하여 뉴클레오타이드 내부의 전자의 이동 패턴을 이용하여 뉴클레오타이드 총 염기쌍 결합 에너지(total DHE/DS), 뉴클레오타이드 마디 평균 염기쌍 결합 에너지(average DHE/DS) 및 뉴클레오타이드 마디 극성 염기쌍 결합 에너지(polarity DHE/DS)를 각각 하기 수학식 1 내지 3에 의해 계산하는 단계를 포함하는 뉴클레오타이드 염기의 극성을 이용한 뉴클레오타이드의 시각화 및 극성구조 분석 방법
2 2
제 1항에 있어서, 상기 단계 (ⅰ)의 뉴클레오타이드 염기의 시각화 기호는 반원 대신 다각형 또는 타원형으로 하는 것을 특징으로 하는 방법
3 3
제 1항 및 제 2항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 단계 (ⅱ)의 기호로 표시된 뉴클레오타이드의 염기서열의 배열에서 구분된 뉴클레오타이드 마디(segments)들을 뉴클레오타이드 마디 극성 염기쌍 결합 에너지의 값에 따라 음성 뉴클레오타이드 마디, 양성 뉴클레오타이드 마디 및 중성 뉴클레오타이드 마디로 구분하고, 음성 뉴클레오타이드 마디(들)-양성 뉴클레오타이드 마디(들)의 연속 배열을 묶어서 뉴클레오타이드 절(section)로 나누고 뉴클레오타이드 절 내부의 총 염기쌍 결합 에너지, 뉴클레오타이드 절의 평균 염기쌍 결합 에너지, 및 뉴클레오타이드 절의 극성 염기쌍 결합 에너지를 계산하는 것을 특징으로 하는 방법
4 4
삭제
5 5
삭제
6 6
삭제
7 7
제 1항 및 제 2항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 단계 (i)의 유전자는 gDNA, cDNA, tRNA, mRNA, rRNA 및 이들의 단편으로 구성된 그룹에서 선택된 DNA, RNA, 또는 DNA와 RNA의 혼성 서열임을 특징으로 하는 방법
8 8
제 1항 및 제 2항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 방법은 PCR 프라이머 선택, 제한 효소 절단 부위의 염기서열 확인, DNA의 이차 구조 검색, DNA의 직렬 반복 (tandem repeat) 염기서열의 검색, gDNA에서의 인트론 및 엑손 염기서열 구분, 또는 유전자 변이 가능성이 있는 염기서열의 탐색에 이용됨을 특징으로 하는 방법
9 9
제 8항에 있어서, 상기 방법은 마디 수가 4 내지 6개이며, 상기 뉴클레오타이드 마디 평균 염기쌍 결합 에너지(average DHE/DS) 및 뉴클레오타이드 마디 극성 염기쌍 결합 에너지(polarity DHE/DS)를 분석하여 각각의 결합 에너지값이 상기 유전자의 모든 뉴클레오타이드 마디의 평균값 이상인 프라이머를 선택하는데 사용됨을 특징으로 하는 방법
10 10
제 8항에 있어서, 상기 방법은 DNA 염기쌍 극성 기호에서 점대칭 구조의 염기서열을 이루는 제한 효소 절단 부위를 검색하거나 특이성 있는 제한 효소 절단 부위 염기쌍 극성을 검색하는데 사용됨을 특징으로 하는 방법
11 11
제 8항에 있어서, 상기 방법은 유전자의 직렬 반복 (tandem repeat) 염기서열의 구조를 DNA 염기쌍 극성 기호나 극성 결합 에너지의 크기로 판정하여 직렬 반복 염기서열을 검색하는데 사용됨을 특징으로 하는 방법
12 12
제 8항에 있어서, 상기 방법은 유전자의 머리핀 루프 염기서열의 구조를 가지는 RNA의 염기서열을 검색하는 데 사용됨을 특징으로 하는 방법
13 13
제 8항에 있어서, 상기 방법은 뉴클레오타이드의 염기쌍의 극성구조의 특이성을 이용하여 유전자 발현 촉진 영역을 구분하고 유전자의 인트론 및 엑손 염기서열의 위치를 검색하는데 사용됨을 특징으로 하는 방법
14 14
제 8항에 있어서, 상기 방법은 뉴클레오타이드의 염기쌍의 극성 분석을 통하여 DNA 이중 나선 구조를 파악하고, DNA 합성이나 RNA 잔사 시에 불균형으로 작용되는 상기 유전자의 모든 뉴클레오타이드의 음성극성 마디 또는 양성극성 마디들의 마디 극성 염기쌍 결합 에너지(polarity DHE/DS)의 평균값보다 높은 강한 음성극성의 마디 또는 강한 양성극성의 마디를 포함하는 부위에서 유전자 변이가 호발되는 유전자 염기서열을 탐색하는데 사용됨을 특징으로 하는 방법
15 15
(i) 유전자의 염기서열에서 A, G, T 또는 U, 그리고 C의 뉴클레오타이드 염기들을 수평선을 중심으로 A는 위쪽 빈 반원, G는 위쪽 찬 반원, T 또는 U는 아래쪽 빈 반원, 그리고 C는 아래쪽 찬 반원의 기호로 시각화하는 단계;(ⅱ) 상기의 기호로 표시된 뉴클레오타이드의 염기서열의 배열에서 피리미딘(들)-퓨린(들)의 연속 배열을 묶어서 뉴클레오타이드 마디(segment)로 구분하는 단계; 및(ⅲ) 상기 구분된 뉴클레오타이드 마디(segments)들에 대하여 뉴클레오타이드 내부의 전자의 이동 패턴을 이용하여 뉴클레오타이드 총 염기쌍 결합 에너지(total DHE/DS), 뉴클레오타이드 마디 평균 염기쌍 결합 에너지(average DHE/DS) 및 뉴클레오타이드 마디 극성 염기쌍 결합 에너지(polarity DHE/DS)를 각각 하기 수학식 1 내지 3에 의해 계산하는 단계를 포함하는 뉴클레오타이드 염기의 극성을 이용한 유전자 코드 분석 프로그램을 기록한 컴퓨터로 읽을 수 있는 기록 매체
16 16
(i) 유전자의 염기서열에서 A, G, T 또는 U, 그리고 C의 뉴클레오타이드 염기들을 수평선을 중심으로 A는 위쪽 빈 반원, G는 위쪽 찬 반원, T 또는 U는 아래쪽 빈 반원, 그리고 C는 아래쪽 찬 반원의 기호로 시각화하는 시각화부;(ⅱ) 상기의 기호로 표시된 뉴클레오타이드의 염기서열의 배열에서 피리미딘(들)-퓨린(들)의 연속 배열을 묶어서 뉴클레오타이드 마디(segment)로 구분하는 뉴클레오타이드 마디 정보 처리부; 및(ⅲ) 상기 구분된 뉴클레오타이드 마디(segments)들에 대하여 뉴클레오타이드 내부의 전자의 이동 패턴을 이용하여 뉴클레오타이드 총 염기쌍 결합 에너지(total DHE/DS), 뉴클레오타이드 마디 평균 염기쌍 결합 에너지(average DHE/DS) 및 뉴클레오타이드 마디 극성 염기쌍 결합 에너지(polarity DHE/DS)를 각각 하기 수학식 1 내지 3에 의해 계산하는 결합 에너지 정보 처리부를 포함하는 뉴클레오타이드 염기의 극성을 이용한 유전자 코드 분석 장치
지정국 정보가 없습니다
패밀리정보가 없습니다
국가 R&D 정보가 없습니다.