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차세대 염기서열분석을 이용한 기계학습 기반 유방암 예후 예측 방법 및 예측 시스템

  • 기술번호 : KST2019005274
  • 담당센터 : 서울동부기술혁신센터
  • 전화번호 : 02-2155-3662
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요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 차세대 염기서열분석을 이용한 기계학습 기반 유방암 예후 예측 방법은 컴퓨터 장치가 피험자 조직(tissue)의 RNA 시퀀싱 데이터를 이용하여 타겟 유전자의 발현량을 측정하는 단계, 상기 컴퓨터 장치가 상기 타겟 유전자의 발현량을 사전에 마련한 인공신경망(Artificial Neural Network)에 입력하는 단계 및 상기 컴퓨터 장치가 상기 인공신경망의 출력값을 기준으로 상기 피험자에 대한 유방암 예후를 추정하는 단계를 포함한다. 상기 인공신경망은 복수의 샘플의 타겟 유전자 발현량를 입력값으로 갖고, 상기 복수의 샘플에 대한 온코타입(Oncotype DX)의 재발 점수(recurrence score)에 따른 결과를 출력하도록 사전에 마련된다.
Int. CL G16B 40/00 (2019.01.01) G16B 30/00 (2019.01.01) G16H 50/20 (2018.01.01)
CPC G16B 40/00(2013.01) G16B 40/00(2013.01) G16B 40/00(2013.01)
출원번호/일자 1020170149834 (2017.11.10)
출원인 울산대학교 산학협력단, 서울대학교병원, 서울대학교산학협력단, 고려대학교 산학협력단, 재단법인 아산사회복지재단
등록번호/일자
공개번호/일자 10-2019-0053695 (2019.05.20) 문서열기
공고번호/일자 문서열기
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보
법적상태 등록
심사진행상태 수리
심판사항
구분 신규
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2017.11.10)
심사청구항수 11

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 주식회사 디시젠 대한민국 서울특별시 종로구

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 한원식 서울특별시 송파구
2 이한별 서울특별시 강남구
3 박인애 서울시 강남구
4 유한석 서울시 강남구
5 안세현 서울특별시 송파구
6 이종원 서울특별시 송파구
7 이새별 서울특별시 송파구
8 이희진 서울특별시 송파구
9 김애리 서울시 강남구
10 김정렬 경기도 의정부시 전좌로
11 윤성로 서울 관악구
12 김선 서울특별시 관악구
13 권선영 서울 관악구
14 김민수 서울특별시 관악구
15 조정희 서울특별시 관악구

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 이재영 대한민국 서울특별시 강남구 테헤란로**길 **(역삼동) 청수빌딩 *층(파도국제특허법률사무소)

최종권리자

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번호 이름 국적 주소
1 주식회사 디시젠 서울특별시 종로구
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번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 [특허출원]특허출원서
[Patent Application] Patent Application		 2017.11.10 수리 (Accepted) 1-1-2017-1119279-91
2 보정요구서
Request for Amendment		 2017.11.20 발송처리완료 (Completion of Transmission) 1-5-2017-0165836-05
3 [지정기간연장]기간연장(단축, 경과구제)신청서
[Designated Period Extension] Application of Period Extension(Reduction, Progress relief)		 2017.12.20 수리 (Accepted) 1-1-2017-1268728-40
4 [지정기간연장]기간연장(단축, 경과구제)신청서
[Designated Period Extension] Application of Period Extension(Reduction, Progress relief)		 2018.01.16 수리 (Accepted) 1-1-2018-0050801-96
5 [지정기간연장]기간연장(단축, 경과구제)신청서
[Designated Period Extension] Application of Period Extension(Reduction, Progress relief)		 2018.02.20 수리 (Accepted) 1-1-2018-0178054-53
6 [지정기간연장]기간연장(단축, 경과구제)신청서
[Designated Period Extension] Application of Period Extension(Reduction, Progress relief)		 2018.03.20 수리 (Accepted) 1-1-2018-0278332-64
7 지정기간연장 관련 안내서
Notification for Extension of Designated Period		 2018.03.22 발송처리완료 (Completion of Transmission) 1-5-2018-0044672-99
8 [출원서등 보정]보정서
[Amendment to Patent Application, etc.] Amendment		 2018.04.02 수리 (Accepted) 1-1-2018-0325341-67
9 수수료 반환 안내서
Notification of Return of Official Fee		 2018.04.06 발송처리완료 (Completion of Transmission) 1-5-2018-0053639-03
10 지분약정 무효처분통지서
Notice for Invalidation of Share Agreement		 2018.05.15 발송처리완료 (Completion of Transmission) 1-5-2018-0075111-13
11 우선권주장 무효처분통지서
Notice for Disposition of Invalidation of Priority Claim		 2018.05.15 발송처리완료 (Completion of Transmission) 1-5-2018-0074712-75
12 [출원인변경]권리관계변경신고서
[Change of Applicant] Report on Change of Proprietary Status		 2018.07.02 수리 (Accepted) 1-1-2018-0648396-09
13 [출원인지분변경]권리관계변경신고서
[Applicant Share Change] Report on Change of Proprietary Status		 2018.07.18 수리 (Accepted) 1-1-2018-0711483-30
14 [대리인선임]대리인(대표자)에 관한 신고서
[Appointment of Agent] Report on Agent (Representative)		 2018.11.16 수리 (Accepted) 1-1-2018-1144917-33
15 [대리인해임]대리인(대표자)에 관한 신고서
[Dismissal of Sub-agent] Report on Agent (Representative)		 2018.11.30 수리 (Accepted) 1-1-2018-1203283-13
16 [대리인선임]대리인(대표자)에 관한 신고서
[Appointment of Agent] Report on Agent (Representative)		 2019.04.10 수리 (Accepted) 1-1-2019-0364351-17
17 의견제출통지서
Notification of reason for refusal		 2019.04.22 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2019-0288739-03
18 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2019.05.13 수리 (Accepted) 4-1-2019-5093546-10
19 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2019.05.23 수리 (Accepted) 4-1-2019-5101798-31
20 [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견(답변, 소명)서
[Opinion according to the Notification of Reasons for Refusal] Written Opinion(Written Reply, Written Substantiation)		 2019.06.21 수리 (Accepted) 1-1-2019-0640044-02
21 [명세서등 보정]보정서
[Amendment to Description, etc.] Amendment		 2019.06.21 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) 1-1-2019-0640074-61
22 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2019.08.02 수리 (Accepted) 4-1-2019-5154561-59
23 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2019.08.19 수리 (Accepted) 4-1-2019-5164229-95
24 거절결정서
Decision to Refuse a Patent		 2019.08.23 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2019-0608973-98
25 [명세서등 보정]보정서(재심사)
Amendment to Description, etc(Reexamination)		 2019.09.23 보정승인 (Acceptance of amendment) 1-1-2019-0971687-13
26 [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견(답변, 소명)서
[Opinion according to the Notification of Reasons for Refusal] Written Opinion(Written Reply, Written Substantiation)		 2019.09.23 수리 (Accepted) 1-1-2019-0971668-45
27 등록결정서
Decision to Grant Registration		 2019.09.26 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2019-0696723-87
28 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2019.10.10 수리 (Accepted) 4-1-2019-5210941-09
29 [출원인변경]권리관계변경신고서
[Change of Applicant] Report on Change of Proprietary Status		 2020.01.20 수리 (Accepted) 1-1-2020-0063075-07
30 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2020.04.28 수리 (Accepted) 4-1-2020-5096793-19
번호, 청구항의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 청구항 표입니다.
번호 청구항
1 1
컴퓨터 장치가 피험자 조직(tissue)의 RNA 시퀀싱 데이터를 이용하여 타겟 유전자의 발현량을 측정하고,상기 컴퓨터 장치로부터 측정된 복수의 샘플의 타겟 유전자 발현량을 입력값으로 갖고, 상기 입력값을 상기 복수의 샘플에 대한 온코타입(Oncotype DX)의 재발 점수(recurrence score)에 기반한 인공신경망(Artificial Neural Network)에 입력하여 출력값을 가지며,상기 타겟 유전자는 하기 149개의 유전자 모두를 포함하며:ACTB, APOBEC3B, ASF1B, ASPM, AURKA, AURKB, BAG1, BCL2, BIRC5, BLM, BUB1, BUB1B, C14orf45, C16orf61, C7orf63, CACNA1D, CCNA2, CCNB1, CCNB2, CCNE1, CCNE2, CCT5, CD68, CDC20, CDC25A, CDC45, CDC6, CDCA3, CDCA8, CDK1, CDKN3, CENPA, CENPE, CENPF, CENPM, CENPN, CEP55, CHEK1, CIRBP, CKS2, CRIM1, CTSL2, CX3CR1, CYBRD1, DBF4, DDX39, DLGAP5, DNMT3B, DONSON, DTL, E2F1, E2F8, ECHDC2, ERBB2, ERCC6L, ESPL1, ESR1, EXO1, EZH2, FAM64A, FANCI, FBXO5, FEN1, FOXM1, GAPDH, GINS1, GRB7, GSTM1, GTSE1, GUSB, HJURP, HMMR, HN1, IFT46, KIF11, KIF13B, KIF14, KIF15, KIF18A, KIF18B, KIF20A, KIF23, KIF2C, KIF4A, KIFC1, KPNA2, LMNB1, LMNB2, LRIG1, LRRC48, LRRC59, MAD2L1, MARCH8, MCM10, MCM2, MCM6, MELK, MKI67, MLF1IP, MMP11, MYBL2, NCAPG, NCAPG2, NCAPH, NDC80, NEK2, NUP93, NUSAP1, OIP5, PBK, PDSS1, PGR, PKMYT1, PLK1, PLK4, PRC1, PTTG1, RACGAP1, RAD51, RAD51AP1, RAI2, RFC4, RPLP0, RRM2, SCUBE2, SETBP, SF3B3, SHCBP1, SHMT2, SLC25A1, SLC7A5, SPAG5, SPC25, SQLE, STARD13, STIL, STMN1, SYNC, TACC3, TFRC, TK1, TOP2A, TPX2, TRIP13, TROAP, TTK, UBE2C, UBE2S, 및 ZWINT,상기 피험자는 ER(Estrogen) 수용체가 양성인, 유방암 예후 예측 방법
2 2
제1항에 있어서,상기 컴퓨터 장치는 NGS(next-generation sequencing) 기법으로 상기 타겟 유전자의 발현량을 측정하는 유방암 예후 예측 방법
3 3
제1항에 있어서,상기 타겟 유전자는 온코타입 재발 점수 연산에 사용되는 16개의 유전자 및 상기 재발 점수와의 상관도가 기준값 이상인 추가 유전자를 포함하되, 임파선 전이가 없는 샘플의 유전자들 각각에 대하여 상기 재발 점수와 상관 분석(Correlation Analysis)을 수행하여 상관 계수가 기준값 이상인 유전자들로 선택하는 유방암 예후 예측 방법
4 4
제1항에 있어서,상기 RNA 시퀀싱 데이터는 복수의 샘플 데이터에서 공통되게 발현되는 보존된 엑손(conserved exon) 영역을 포함하는 유방암 예후 예측 방법
5 5
제1항에 있어서,상기 컴퓨터 장치는 TMM(Trimmed Mean of M-value) 기법을 이용하여 상기 타겟 유전자의 발현량을 정규화하는, 유방암 예후 예측 방법
6 6
삭제
7 7
제1항에 있어서,상기 컴퓨터 장치는 상기 출력값이 기준값 이상인 경우 상기 피험자가 고위험이라고 예후를 추정하고, 상기 출력값이 기준값 미만인 경우 상기 피험자가 저위험이라고 예후를 추정하는 유방암 예후 예측 방법
8 8
컴퓨터에서 상기 제1항 내지 제5항, 및 제7항 중 어느 하나의 항에 기재된 유방암 예후 예측 방법을 실행하기 위한 프로그램을 기록한 컴퓨터로 읽을 수 있는 기록 매체
9 9
피험자 조직(tissue)의 RNA 유전자 데이터를 저장하는 클라이언트 장치; 및 상기 유전자 데이터에 대한 NGS(next-generation sequencing) 기반 시퀀싱을 수행한 RNA 시퀀싱 데이터를 이용하여 타겟 유전자의 발현량을 측정하여, 상기 피험자에 대한 유방암 예후를 추정하는 분석 서버;를 포함하되,상기 분석 서버는 복수의 샘플의 타겟 유전자 발현량을 입력값으로 갖고, 상기 입력값을 상기 복수의 샘플에 대한 온코타입(Oncotype DX)의 재발 점수(recurrence score)에 기반한 인공신경망(Artificial Neural Network)에 입력하여 출력값을 가지며, 상기 타겟 유전자는 하기 149개의 유전자 모두를 포함하며:ACTB, APOBEC3B, ASF1B, ASPM, AURKA, AURKB, BAG1, BCL2, BIRC5, BLM, BUB1, BUB1B, C14orf45, C16orf61, C7orf63, CACNA1D, CCNA2, CCNB1, CCNB2, CCNE1, CCNE2, CCT5, CD68, CDC20, CDC25A, CDC45, CDC6, CDCA3, CDCA8, CDK1, CDKN3, CENPA, CENPE, CENPF, CENPM, CENPN, CEP55, CHEK1, CIRBP, CKS2, CRIM1, CTSL2, CX3CR1, CYBRD1, DBF4, DDX39, DLGAP5, DNMT3B, DONSON, DTL, E2F1, E2F8, ECHDC2, ERBB2, ERCC6L, ESPL1, ESR1, EXO1, EZH2, FAM64A, FANCI, FBXO5, FEN1, FOXM1, GAPDH, GINS1, GRB7, GSTM1, GTSE1, GUSB, HJURP, HMMR, HN1, IFT46, KIF11, KIF13B, KIF14, KIF15, KIF18A, KIF18B, KIF20A, KIF23, KIF2C, KIF4A, KIFC1, KPNA2, LMNB1, LMNB2, LRIG1, LRRC48, LRRC59, MAD2L1, MARCH8, MCM10, MCM2, MCM6, MELK, MKI67, MLF1IP, MMP11, MYBL2, NCAPG, NCAPG2, NCAPH, NDC80, NEK2, NUP93, NUSAP1, OIP5, PBK, PDSS1, PGR, PKMYT1, PLK1, PLK4, PRC1, PTTG1, RACGAP1, RAD51, RAD51AP1, RAI2, RFC4, RPLP0, RRM2, SCUBE2, SETBP, SF3B3, SHCBP1, SHMT2, SLC25A1, SLC7A5, SPAG5, SPC25, SQLE, STARD13, STIL, STMN1, SYNC, TACC3, TFRC, TK1, TOP2A, TPX2, TRIP13, TROAP, TTK, UBE2C, UBE2S, 및 ZWINT,상기 피험자는 ER(Estrogen) 수용체가 양성인, 유방암 예후 예측 시스템
10 10
제9항에 있어서,상기 타겟 유전자는 임파선 전이가 없는 샘플의 유전자들 각각에 대하여 상기 재발 점수와 상관 분석(Correlation Analysis)을 수행하여 상관 계수가 기준값 이상인 유전자들을 포함하는 유방암 예후 예측 시스템
11 11
제9항에 있어서,상기 RNA 시퀀싱 데이터는 복수의 샘플 데이터에서 공통되게 발현되는 보존된 엑손(conserved exon) 영역을 포함하는 유방암 예후 예측 시스템
12 12
제9항에 있어서,상기 분석 서버는 TMM(Trimmed Mean of M-value) 기법을 이용하여 상기 타겟 유전자의 발현량을 정규화하는, 유방암 예후 예측 시스템
지정국 정보가 없습니다
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순번 패밀리번호 국가코드 국가명 종류
1 CN110070915 CN 중국 FAMILY
2 WO2019093814 WO 세계지적재산권기구(WIPO) FAMILY
3 WO2019093814 WO 세계지적재산권기구(WIPO) FAMILY

DOCDB 패밀리 정보

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1 CN110070915 CN 중국 DOCDBFAMILY
2 WO2019093814 WO 세계지적재산권기구(WIPO) DOCDBFAMILY
3 WO2019093814 WO 세계지적재산권기구(WIPO) DOCDBFAMILY
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순번 연구부처 주관기관 연구사업 연구과제
1 보건복지부 서울대학교병원 포스트게놈 다부처 유전체사업 차세대 염기서열분석 기반의 다유전자 구성 유방암 예후예측 도구 개발
2 보건복지부 서울대학교병원 연구중심병원 육성 R＆D 사업 고위험군 예측 유전단백체 시그니처 개발