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전령 RNA의 3′말단 서열 분석 방법

  • 기술번호 : KST2019011860
  • 담당센터 : 서울동부기술혁신센터
  • 전화번호 : 02-2155-3662
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요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 본 발명은 mRNA의 3′말단 부위의 서열 분석에 대한 새로운 프로토콜을 제공한다. 본 발명은 현재의 서열결정 방법들로는 분석하기 어려운 핵산분자의 반복서열, 특히 mRNA의 호모폴리머 서열[폴리(A) 서열]을 분석하는데 매우 유용하게 이용될 수 있다. 본 발명은 기존의 방법에 비해 전령 RNA에 대한 민감도가 크게 향상되어 소량의 시료로부터 많은 유전자에 대한 정보를 얻을 수 있다. 본 발명의 방법은 mRNA의 3′말단 부위의 서열 분석에 있어서 시간과 비용을 절감시키고, 다양한 시료에 적용할 수 있다는 장점이 있어, 배아발생, 암, 신경전달 등 모든 생명현상과 관련하여, RNA의 생성/소멸과 단백질 생산을 연구하는데 유용한 도구로 사용될 수 있다.
Int. CL C12Q 1/68 (2018.01.01)
CPC C12Q 1/6869(2013.01) C12Q 1/6869(2013.01) C12Q 1/6869(2013.01) C12Q 1/6869(2013.01) C12Q 1/6869(2013.01)
출원번호/일자 1020160141190 (2016.10.27)
출원인 서울대학교산학협력단, 기초과학연구원
등록번호/일자 10-1786396-0000 (2017.10.10)
공개번호/일자
공고번호/일자 (20171124) 문서열기
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보
법적상태 등록
심사진행상태 수리
심판사항
구분 신규
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2016.10.27)
심사청구항수 6

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 서울대학교산학협력단 대한민국 서울특별시 관악구
2 기초과학연구원 대한민국 대전광역시 유성구

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 김빛내리 대한민국 서울특별시 강남구
2 임재철 대한민국 서울특별시 관악구
3 장혜식 대한민국 경기도 안양시 동안구

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 윤대웅 대한민국 서울특별시 관악구 남부순환로 ****(봉천동), ***호(제니스특허법률사무소)
2 공병욱 대한민국 서울특별시 관악구 남부순환로 ****(봉천동), ***호(제니스특허법률사무소)

최종권리자

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번호 이름 국적 주소
1 기초과학연구원 대한민국 대전광역시 유성구
2 서울대학교산학협력단 대한민국 서울특별시 관악구
번호, 서류명, 접수/발송일자, 처리상태, 접수/발송일자의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 행정처리 표입니다.
번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 [특허출원]특허출원서
[Patent Application] Patent Application		 2016.10.27 수리 (Accepted) 1-1-2016-1048594-80
2 보정요구서
Request for Amendment		 2016.11.07 발송처리완료 (Completion of Transmission) 1-5-2016-0160203-18
3 [출원서등 보정]보정서
[Amendment to Patent Application, etc.] Amendment		 2016.11.11 수리 (Accepted) 1-1-2016-1105957-21
4 [우선심사신청]심사청구(우선심사신청)서
[Request for Preferential Examination] Request for Examination (Request for Preferential Examination)		 2016.12.29 수리 (Accepted) 1-1-2016-1292518-32
5 [우선심사신청]선행기술조사의뢰서
[Request for Preferential Examination] Request for Prior Art Search		 2017.01.03 수리 (Accepted) 9-1-9999-9999999-89
6 [우선심사신청]선행기술조사보고서
[Request for Preferential Examination] Report of Prior Art Search		 2017.01.09 수리 (Accepted) 9-1-2017-0000291-13
7 의견제출통지서
Notification of reason for refusal		 2017.01.19 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2017-0050334-87
8 [지정기간연장]기간연장(단축, 경과구제)신청서
[Designated Period Extension] Application of Period Extension(Reduction, Progress relief)		 2017.03.20 수리 (Accepted) 1-1-2017-0274616-08
9 [지정기간연장]기간연장(단축, 경과구제)신청서
[Designated Period Extension] Application of Period Extension(Reduction, Progress relief)		 2017.04.19 수리 (Accepted) 1-1-2017-0385190-19
10 [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견(답변, 소명)서
[Opinion according to the Notification of Reasons for Refusal] Written Opinion(Written Reply, Written Substantiation)		 2017.05.16 수리 (Accepted) 1-1-2017-0464278-14
11 [명세서등 보정]보정서
[Amendment to Description, etc.] Amendment		 2017.05.16 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) 1-1-2017-0464279-60
12 등록결정서
Decision to grant		 2017.07.03 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2017-0466473-15
13 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2018.01.24 수리 (Accepted) 4-1-2018-5013866-16
14 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2019.05.13 수리 (Accepted) 4-1-2019-5093546-10
15 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2019.05.23 수리 (Accepted) 4-1-2019-5101798-31
16 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2019.08.02 수리 (Accepted) 4-1-2019-5154561-59
17 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2020.11.25 수리 (Accepted) 4-1-2020-5265458-48
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번호 청구항
1 1
다음의 단계를 포함하는 전령 RNA(messenger RNA, mRNA)의 3′말단 서열 분석 방법:(a) mRNA의 3′-말단에 바이오틴(biotin)이 결합되어 있는 3′헤어핀 어댑터를 연결시키는 단계;(b) 상기 3′헤어핀 어댑터가 연결된 mRNA를 부분적으로 절단하는 단계;(c) 스트렙타비딘(streptavidin)을 이용하여 상기 절단된 mRNA를 수득하여 5′-말단 인산화(phosphorylation) 및 엔도뉴클레오리틱 절단(endonucleolytic cleavage) 반응을 실시하는 단계; (d) 상기 단계 (c)의 결과물로부터 300-750 nt의 mRNA를 정제하고 5′-말단에 5′어댑터를 연결시키는 단계; (e) 상기 단계 (d)의 결과물인 mRNA를 증폭하는 단계; 및(f) 상기 증폭 산물을 시퀀싱하는 단계
2 2
제 1 항에 있어서, 상기 3′헤어핀 어댑터는 5′-/5Phos(5′인산화)/CTGACATGNNNNNNNNNNNNTGGAATTCTCGGGTGCCAAGGC/iSpC3(internal C3 phosphoramidite)//idSp(internal 1′,2′-dideoxyribose)//idSp//iBiodT(internal biotinylated deoxythymine)//iBiodT/GGCACCCGAGAATT/iSp18(internal 18-atomhexaethyleneglycol spacer)/CATGTCAGTTTTTTTT/3InvdT(3′ inverted deoxythynime)/-3′, 5′-/5Phos/CTGACATGNNNNNNNNNNNNTGGAATTCTCGGG TGCCAAGGC/iSpC3//idSp//idSp//iBiodT//iBiodT/GGCACCCGAGAATT/iSp18/CATGTCAGATTTTTTT/3InvdT/-3′또는 5′-/5Phos/CTGACATGNNNNNNNNNNNNTGGAATTCTCGGG TGCCAAGGC/iSpC3//idSp//idSp//iBiodT//iBiodT/GGCACCCGAGAATT/iSp18/CATGTCAGAATTTTTT/3InvdT/-3′로 이루어진 것을 특징으로 하는 방법
3 3
삭제
4 4
제 1 항에 있어서, 상기 5′어댑터는 서열목록 제1서열로 표시되는 뉴클레오타이드를 포함하는 것을 특징으로 하는 방법
5 5
제 1 항에 있어서, 상기 mRNA 절단은 RNA 분해효소(RNase)를 이용하여 실시하는 것을 특징으로 하는 방법
6 6
삭제
7 7
제 1 항에 있어서, 상기 단계 (e)의 mRNA 증폭은 RT-PCR(Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction)을 수행한 다음 PCR을 통해 실시하는 것을 특징으로 하는 방법
8 8
제 1 항에 있어서, 상기 시퀀싱은 생거방법(Sanger method), 454 방법 또는 일루미나 방법(Illumina method)을 포함하는 형광시그널을 이용하는 시퀀싱 방법에 의해 실시되는 것을 특징으로 하는 방법
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1 US10633696 US 미국 FAMILY
2 US20180119213 US 미국 FAMILY

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1 US10633696 US 미국 DOCDBFAMILY
2 US2018119213 US 미국 DOCDBFAMILY
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순번 연구부처 주관기관 연구사업 연구과제
1 교육과학기술부 서울대학교산학협력단 기초과학연구원연구운영비지원 RNA에 의한 세포 운명 조절 연구