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액체 크로마토그래프 질량 분석을 이용한 시료의 정량 분석 장치 및 방법

  • 기술번호 : KST2019012854
  • 담당센터 : 서울동부기술혁신센터
  • 전화번호 : 02-2155-3662
요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 시료의 정량 분석 장치는, 제1 라벨(label) 물질이 부착된 제1 물질, 및 상기 제1 라벨 물질과 질량이 상이한 제2 라벨 물질이 부착된 제2 물질을 포함하는 시료의 액체 크로마토그래프 질량 분석(Liquid Chromatograph-Mass Spectrometry) 스펙트럼을 수신하도록 구성된 스펙트럼 인식부; 상기 스펙트럼 인식부에 수신된 질량 분석 스펙트럼으로부터 상기 제1 라벨 물질에 대응되는 펩타이드 정합 스펙트럼(Peptide Spectrum Match; PSM)을 추출하며, 상기 제1 라벨 물질의 PSM을 이용하여 상기 제1 물질의 템플릿(template)을 특정하고, 상기 제1 라벨 물질과 상기 제2 라벨 물질의 예측된 리텐션 시간(Retention Time; RT) 편이(shift)를 산출하며, 상기 예측된 RT 편이를 이용하여 상기 제2 물질의 템플릿을 특정하고, 상기 제1 물질과 상기 제2 물질의 템플릿을 이용하여 상기 제1 물질과 상기 제2 물질의 신호를 재구성함으로써 상기 시료의 펩타이드 수준 정량 분석을 수행하도록 구성된 PSM 분석부를 포함한다. 상기 시료의 정량 분석 장치에 의하면, 라벨 물질에서 수소(H)의 중수소(2H, 또는 D(Deuterium)) 치환 등에 의하여 발생하는 리텐션 시간의 편이를 기계 학습을 적용하여 정확하고 효율적으로 예측할 수 있다.
Int. CL G01N 33/68 (2006.01.01) G01N 30/86 (2006.01.01) G01N 30/88 (2006.01.01)
CPC G01N 33/6848(2013.01) G01N 33/6848(2013.01) G01N 33/6848(2013.01) G01N 33/6848(2013.01) G01N 33/6848(2013.01) G01N 33/6848(2013.01) G01N 33/6848(2013.01) G01N 33/6848(2013.01) G01N 33/6848(2013.01)
출원번호/일자 1020170085558 (2017.07.05)
출원인 서울대학교산학협력단, 기초과학연구원
등록번호/일자 10-1958900-0000 (2019.03.11)
공개번호/일자 10-2019-0005034 (2019.01.15) 문서열기
공고번호/일자 (20190318) 문서열기
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보
법적상태 등록
심사진행상태 수리
심판사항
구분 신규
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2017.07.05)
심사청구항수 17

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 서울대학교산학협력단 대한민국 서울특별시 관악구
2 기초과학연구원 대한민국 대전광역시 유성구

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 김빛내리 대한민국 서울특별시 강남구
2 김종서 대한민국 서울특별시 관악구
3 정교원 대한민국 경기도 과천시 관문로
4 최연 대한민국 서울특별시 관악구

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 김 순 영 대한민국 서울특별시 종로구 종로*길 **, **층 케이씨엘특허법률사무소 (수송동, 석탄회관빌딩)
2 김영철 대한민국 서울특별시 종로구 종로*길 **, **층 케이씨엘특허법률사무소 (수송동, 석탄회관빌딩)

최종권리자

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번호 이름 국적 주소
1 서울대학교산학협력단 서울특별시 관악구
2 기초과학연구원 대전광역시 유성구
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번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 [특허출원]특허출원서
[Patent Application] Patent Application
2017.07.05 수리 (Accepted) 1-1-2017-0645351-06
2 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2018.01.24 수리 (Accepted) 4-1-2018-5013866-16
3 선행기술조사의뢰서
Request for Prior Art Search
2018.03.12 수리 (Accepted) 9-1-9999-9999999-89
4 선행기술조사보고서
Report of Prior Art Search
2018.06.08 수리 (Accepted) 9-1-2018-0027080-97
5 의견제출통지서
Notification of reason for refusal
2018.10.17 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2018-0704723-86
6 [명세서등 보정]보정서
[Amendment to Description, etc.] Amendment
2018.10.22 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) 1-1-2018-1038576-58
7 [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견(답변, 소명)서
[Opinion according to the Notification of Reasons for Refusal] Written Opinion(Written Reply, Written Substantiation)
2018.10.22 수리 (Accepted) 1-1-2018-1038575-13
8 등록결정서
Decision to grant
2018.12.10 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2018-0846122-42
9 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2019.05.13 수리 (Accepted) 4-1-2019-5093546-10
10 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2019.05.23 수리 (Accepted) 4-1-2019-5101798-31
11 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2019.08.02 수리 (Accepted) 4-1-2019-5154561-59
12 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2020.11.25 수리 (Accepted) 4-1-2020-5265458-48
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번호 청구항
1 1
제1 라벨 물질이 부착된 제1 물질, 및 상기 제1 라벨 물질과 질량이 상이한 제2 라벨 물질이 부착된 제2 물질을 포함하는 시료의 액체 크로마토그래프 질량 분석 스펙트럼을 수신하도록 구성된 스펙트럼 인식부; 및 상기 스펙트럼 인식부에 수신된 질량 분석 스펙트럼으로부터 상기 제1 라벨 물질에 대응되는 펩타이드 정합 스펙트럼을 추출하며, 상기 제1 라벨 물질의 펩타이드 정합 스펙트럼을 이용하여 상기 제1 물질의 템플릿을 특정하고, 상기 제1 라벨 물질과 상기 제2 라벨 물질의 예측된 리텐션 시간 편이를 산출하며, 상기 예측된 리텐션 시간 편이를 이용하여 상기 제2 물질의 템플릿을 특정하고, 상기 제1 물질과 상기 제2 물질의 템플릿을 이용하여 상기 제1 물질과 상기 제2 물질의 신호를 재구성함으로써 상기 시료의 펩타이드 정합 스펙트럼 수준의 정량 분석을 수행하도록 구성된 펩타이드 정합 스펙트럼 분석부를 포함하는 시료의 정량 분석 장치
2 2
제1항에 있어서,하나 이상의 물질에 대한 상기 펩타이드 정합 스펙트럼 수준 정량 분석 결과를 이용하여 상기 시료의 단백질 수준 정량 분석을 수행하도록 구성된 단백질 분석부를 포함하는 시료의 정량 분석 장치
3 3
제1항에 있어서,상기 제1 라벨 물질은 탄소, 질소 및 수소를 포함하는 펩타이드이며,상기 제2 라벨 물질은 상기 제1 라벨 물질의 하나 이상의 수소를 중수소로 치환한 펩타이드인 시료의 정량 분석 장치
4 4
제3항에 있어서,상기 제2 라벨 물질은, 치환된 중수소의 개수에 따라 상기 제1 라벨 물질의 질량으로부터 순차적으로 질량이 증가하는 5개 이상의 펩타이드를 포함하는 시료의 정량 분석 장치
5 5
제1항에 있어서,상기 펩타이드 정합 스펙트럼 분석부는 상기 예측된 리텐션 시간 편이를 산출하는 리텐션 시간 편이 예측부를 포함하며, 상기 리텐션 시간 편이 예측부는, 상기 질량 분석 스펙트럼으로부터 미리 결정된 하나 이상의 특징을 추출하도록 구성된 특징 추출부; 및 질량 분석 스펙트럼의 훈련 세트를 입력값으로 이용한 기계 학습을 통해 얻어진 규칙에 상기 하나 이상의 특징을 적용하도록 구성된 기계 학습부를 포함하는 시료의 정량 분석 장치
6 6
제5항에 있어서,상기 하나 이상의 특징은, 상기 제2 라벨 물질에 치환된 중수소의 개수, 상기 질량 분석 스펙트럼의 정규화된 리텐션 시간, 상기 제1 라벨 물질의 펩타이드 서열 길이, 상기 제2 물질에서 상기 제2 라벨 물질이 표지된 위치의 비율 또는 상기 질량 분석 스펙트럼의 정규화된 피크 폭 중 하나 이상을 포함하는 시료의 정량 분석 장치
7 7
제5항에 있어서,상기 펩타이드 정합 스펙트럼 분석부는, 제1 라벨 물질에 대응되는 펩타이드 정합 스펙트럼으로부터 얻어진 정규분포 곡선과 상기 제1 물질을 구성하는 원소들의 미리 알려진 동위원소 분포 프로파일을 이용하여 상기 제1 물질의 템플릿을 특정하도록 구성된 동위원소 분리부를 포함하는 시료의 정량 분석 장치
8 8
제5항에 있어서,상기 펩타이드 정합 스펙트럼 분석부는, 상기 제1 물질의 템플릿 및 상기 제2 물질의 템플릿을 이용하여 상기 제1 물질 및 상기 제2 물질의 상대량을 산출함으로써 상기 시료의 액체 크로마토그래프 질량 분석 스펙트럼을 상기 제1 물질의 신호 및 상기 제2 물질의 신호로 재구성하도록 구성된 재구성부를 포함하는 시료의 정량 분석 장치
9 9
정량 분석 장치가, 제1 라벨 물질이 부착된 제1 물질, 및 상기 제1 라벨 물질과 질량이 상이한 제2 라벨 물질이 부착된 제2 물질을 포함하는 시료의 액체 크로마토그래프 질량 분석 스펙트럼을 수신하는 단계; 상기 정량 분석 장치가, 상기 질량 분석 스펙트럼으로부터 상기 제1 라벨 물질과 상기 제2 라벨 물질의 예측된 리텐션 시간 편이를 산출하는 단계;상기 정량 분석 장치가, 상기 질량 분석 스펙트럼으로부터 상기 제1 라벨 물질에 대응되는 펩타이드 정합 스펙트럼을 추출하는 단계;상기 정량 분석 장치가, 추출된 상기 제1 라벨 물질의 펩타이드 정합 스펙트럼을 이용하여 상기 제1 물질의 템플릿을 특정하는 단계;상기 정량 분석 장치가, 상기 제1 물질의 템플릿 및 상기 예측된 리텐션 시간 편이를 이용하여 상기 제2 물질의 템플릿을 특정하는 단계;상기 정량 분석 장치가, 상기 제1 물질과 상기 제2 물질의 템플릿을 이용하여 상기 제1 물질과 상기 제2 물질의 신호를 재구성하는 단계; 및 상기 정량 분석 장치가, 재구성된 상기 제1 물질 및 상기 제2 물질의 신호를 이용하여 상기 시료의 펩타이드 정합 스펙트럼 수준 정량 분석을 수행하는 단계를 포함하는 시료의 정량 분석 방법
10 10
제9항에 있어서,상기 정량 분석 장치가, 하나 이상의 물질에 대한 상기 펩타이드 정합 스펙트럼 수준 정량 분석 결과를 이용하여 상기 시료의 단백질 수준 분석을 수행하는 단계를 더 포함하는 시료의 정량 분석 방법
11 11
제9항에 있어서,상기 제1 라벨 물질은 탄소, 질소 및 수소를 포함하는 펩타이드이며,상기 제2 라벨 물질은 상기 제1 라벨 물질의 하나 이상의 수소를 중수소로 치환한 펩타이드인 시료의 정량 분석 방법
12 12
제11항에 있어서,상기 제2 라벨 물질은, 치환된 중수소의 개수에 따라 상기 제1 라벨 물질의 질량으로부터 순차적으로 질량이 증가하는 5개 이상의 펩타이드를 포함하는 시료의 정량 분석 방법
13 13
제9항에 있어서,상기 예측된 리텐션 시간 편이를 산출하는 단계는, 상기 질량 분석 스펙트럼으로부터 미리 결정된 하나 이상의 특징을 추출하는 단계; 및 질량 분석 스펙트럼의 훈련 세트를 입력값으로 이용한 기계 학습을 통해 얻어진 규칙에 상기 하나 이상의 특징을 적용함으로써 상기 예측된 리텐션 시간 편이를 산출하는 단계를 포함하는 시료의 정량 분석 방법
14 14
제13항에 있어서,상기 하나 이상의 특징은, 상기 제2 라벨 물질에 치환된 중수소의 개수, 상기 질량 분석 스펙트럼의 정규화된 리텐션 시간, 상기 제1 라벨 물질의 펩타이드 서열 길이, 상기 제2 물질에서 상기 제2 라벨 물질이 표지된 위치의 비율 또는 상기 질량 분석 스펙트럼의 정규화된 피크 폭 중 하나 이상을 포함하는 시료의 정량 분석 방법
15 15
제9항에 있어서,상기 제1 물질의 템플릿을 특정하는 단계는, 제1 라벨 물질에 대응되는 펩타이드 정합 스펙트럼으로부터 얻어진 정규분포 곡선과 상기 제1 물질을 구성하는 원소들의 미리 알려진 동위원소 분포 프로파일을 이용하여 상기 제1 물질의 템플릿을 특정하는 단계를 포함하는 시료의 정량 분석 방법
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제9항에 있어서,상기 제1 물질과 상기 제2 물질의 신호를 재구성하는 단계는, 상기 제1 물질의 템플릿 및 상기 제2 물질의 템플릿을 이용하여 상기 제1 물질 및 상기 제2 물질의 상대량을 산출하는 단계를 포함하는 시료의 정량 분석 방법
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하드웨어와 결합되어 제9항 내지 제16항 중 어느 한 항에 따른 시료의 정량 분석 방법을 실행하도록 매체에 저장된 컴퓨터 프로그램
지정국 정보가 없습니다
패밀리정보가 없습니다
순번, 연구부처, 주관기관, 연구사업, 연구과제의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 국가R&D 연구정보 정보 표입니다.
순번 연구부처 주관기관 연구사업 연구과제
1 미래창조과학부 기초과학연구원 기초과학연구원연구운영비지원 RNA에 의한 세포 운명 조절 연구