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위식도경계부선암의 진단 및 표적 치료를 위한 마커
- 기술번호 : KST2019016959
- 담당센터 : 서울동부기술혁신센터
- 전화번호 : 02-2155-3662
| 요약 | 위식도경계부암을 식도암 또는 위저부/체부암으로 진단하기 위한 알고리즘, 마커 및 치료 표적을 제공한다. 상기 마커는 ERBB2 또는 EGFR을 포함한다. |
|---|---|
| Int. CL | C12Q 1/6886 (2018.01.01) G01N 33/574 (2006.01.01) G16B 20/00 (2019.01.01) |
| CPC | C12Q 1/6886(2013.01) C12Q 1/6886(2013.01) C12Q 1/6886(2013.01) C12Q 1/6886(2013.01) C12Q 1/6886(2013.01) C12Q 1/6886(2013.01) C12Q 1/6886(2013.01) |
| 출원번호/일자 | 1020180020009 (2018.02.20) |
| 출원인 | 서울대학교병원, 이화여자대학교 산학협력단 |
| 등록번호/일자 | |
| 공개번호/일자 | 10-2019-0099928 (2019.08.28) 문서열기 |
| 공고번호/일자 | 문서열기 |
| 국제출원번호/일자 | |
| 국제공개번호/일자 | |
| 우선권정보 | |
| 법적상태 | 등록 |
| 심사진행상태 | 수리 |
| 심판사항 | |
| 구분 | 신규 |
| 원출원번호/일자 | |
| 관련 출원번호 | |
| 심사청구여부/일자 | Y (2018.02.20) |
| 심사청구항수 | 19 |
출원인
| 번호 | 이름 | 국적 | 주소 |
|---|---|---|---|
| 1 | 서울대학교병원 | 대한민국 | 서울특별시 종로구 |
| 2 | 이화여자대학교 산학협력단 | 대한민국 | 서울특별시 서대문구 |
발명자
| 번호 | 이름 | 국적 | 주소 |
|---|---|---|---|
| 1 | 서윤석 | 서울특별시 종로구 | |
| 2 | 나득채 | 서울특별시 강남구 | |
| 3 | 이장철 | 미국 코네티컷주 ** | |
| 4 | 양한광 | 서울특별시 종로구 |
대리인
| 번호 | 이름 | 국적 | 주소 |
|---|---|---|---|
| 1 | 리앤목특허법인 | 대한민국 | 서울 강남구 언주로 **길 **, *층, **층, **층, **층(도곡동, 대림아크로텔) |
최종권리자
| 번호 | 이름 | 국적 | 주소 |
|---|---|---|---|
| 1 | 서울대학교병원 | 서울특별시 종로구 | |
| 2 | 이화여자대학교 산학협력단 | 서울특별시 서대문구 |
| 번호 | 서류명 | 접수/발송일자 | 처리상태 | 접수/발송번호 |
|---|---|---|---|---|
| 1 | [특허출원]특허출원서 [Patent Application] Patent Application |
2018.02.20 | 수리 (Accepted) | 1-1-2018-0179008-31 |
| 2 | 보정요구서 Request for Amendment |
2018.03.07 | 발송처리완료 (Completion of Transmission) | 1-5-2018-0036042-13 |
| 3 | [출원서등 보정]보정서 [Amendment to Patent Application, etc.] Amendment |
2018.04.06 | 수리 (Accepted) | 1-1-2018-0346799-90 |
| 4 | 의견제출통지서 Notification of reason for refusal |
2019.05.16 | 발송처리완료 (Completion of Transmission) | 9-5-2019-0351144-15 |
| 5 | [명세서등 보정]보정서 [Amendment to Description, etc.] Amendment |
2019.07.16 | 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) | 1-1-2019-0727139-03 |
| 6 | [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견(답변, 소명)서 [Opinion according to the Notification of Reasons for Refusal] Written Opinion(Written Reply, Written Substantiation) |
2019.07.16 | 수리 (Accepted) | 1-1-2019-0727138-57 |
| 7 | 출원인정보변경(경정)신고서 Notification of change of applicant's information |
2019.08.19 | 수리 (Accepted) | 4-1-2019-5164229-95 |
| 8 | 등록결정서 Decision to grant |
2019.11.27 | 발송처리완료 (Completion of Transmission) | 9-5-2019-0857010-29 |
| 번호 | 청구항 |
|---|---|
| 1 |
1 위암 또는 식도암의 진단에 필요한 정보를 제공하기 위하여,개체로부터 분리된 위 또는 식도 조직의 EGFR 및 ERBB2의 발현량을 측정하는 단계;상기 EGFR 및 ERBB2의 발현량이 대조군에 비해 증가한 경우, 식도암으로 판정하는 단계; 및상기 EGFR 및 ERBB2의 발현량이 대조군에 비해 증가하지 않은 경우, 위저부/체부암으로 판정하는 단계를 포함하는 방법 |
| 2 |
2 청구항 1에 있어서, 상기 위암 또는 식도암은 위식도경계부선암(adenocarcinoma of gastroesophageal junction),분문부암(cardia cancer), 위식도경계부/분문부암, 상부위암(upperthird gastric cancer), 위저부암(gastric cancer located at fundus),위체부암(gastric cancer located at body), 위저부/체부암(gastric adenocarcinoma located at fundusor body of the stomach: GCFB), 식도 선암(esophageal adenocarcinoma: EAC), 또는 이들의 조합인 방법 |
| 3 |
3 청구항 1에 있어서, 상기 EGFR 및 ERBB2의 발현량을 측정하는 단계는 EGFR 및 ERBB2의 복제 수(copy number)를 확인하는 단계를 포함하는 것인 방법 |
| 4 |
4 청구항 1에 있어서, 상기 EGFR 및 ERBB2의 발현량을 측정하는 단계는 HER1 또는 HER2의 단백질의 양을 측정하는 단계를 포함하는 것인 방법 |
| 5 |
5 청구항 1에 있어서, 상기 EGFR 및 ERBB2의 발현량을 측정하는 단계는 역상 단백질 분석(reverse phase protein analysis), 조직 마이크로어레이(tissue microarray), 면역조직화학(imunohistochemistry: IHC), 은 제자리 부합법(silver in situ hybridization: SISH), 또는 이들의 조합을 이용하여 수행하는 것인 방법 |
| 6 |
6 삭제 |
| 7 |
7 청구항 1에 있어서, 상기 EGFR 및 ERBB2의 발현량이 대조군에 비해 증가한 경우는 ERBB2 유전자의 복제 수가 증가한 경우인 것인 방법 |
| 8 |
8 삭제 |
| 9 |
9 청구항 1에 있어서, 상기 개체로부터 분리된 위 또는 식도 조직의 BCCP (Bayesian Compound Covariate Predictor)점수를 측정하는 단계;개체의 위암 또는 식도암을 진단하기 위한 정보를 제공하기 위하여, 개체로부터 분리된 조직의 유전자의 발현 프로필을 측정하는 단계; 및상기 유전자 발현 프로필로부터 BCCP (Bayesian Compound Covariate Predictor) 알고리즘을 실행하는 컴퓨터 시스템을 이용하여 BCCP 점수를 얻는 단계를 더 포함하는 유전자 발현 프로필 분석 방법으로서, 상기 유전자는 아래의 유전자로 구성된 것인 방법: KRT5, KRT13, KRT6A, KRT14, RHCG, KRT4, S100A7, SPRR3, KRT6C, SPRR2A, MUC21, KRT6B, PKP1, SERPINB3, CLCA2, SPRR1B, MUC4, TBX5, CRNN, SPRR2D, DUOX2, GJB6, SPRR2E, S100A2, KRT16, KRT17, SCEL, DSC3, CALML3, HEPHL1, A2ML1, NKX6-1, DUOXA2, SBSN, TMPRSS11D, CLCA4, ANXA8, FGFBP1, TGM1, IVL, DUOX1, DSG3, EREG, SERPINB4, KRT78, HOXC10, DUOXA1, ZNF750, SPRR1A, KRT7, TMPRSS11A, CXCL6, KLK13, CRCT1, PAX9, HORMAD1, FAM83A, S100A7A, GPR110, CAPN14, ABCA12, WFDC2, TMPRSS11B, CEACAM5, MUC12, SERPINB13, PADI1, FAT2, IL1RL2, STK31, SPINK5, DDX3Y, PI3, FAM83C, LYPD2, KLK5, IL1F5, KRT15, BBOX1, GPR87, ACTL8, SLC34A2, USP9Y, TGM3, LASS3, TMPRSS13, GUCY1B2, SPRR2F, KDM5D, KRT23, LY6D, VTCN1, SLC5A12, ABCA13, S100A8, GBP6, CEACAM7, IL1F9, MUC15, PPP1R14C, KLK7, DEFB1, MMP3, TM4SF20, SYCP2, TMEM40, CEACAM6, VWA2, CYorf15B, TDRD5, DCDC2, KLK12, C10orf99, CARD14, HOXC13, LOC642587, GABRR1, DNAH2, SLC15A1, KLK8, LGALS7B, ALDH1L1, FOXN1, RAET1L, TP63, ATP13A4, UTY, DSG1, ALOX12B, AMY2B, SAA2, SAA1, GPR115, LCN2, KRT24, PRKY, PADI3, SCNN1A, PGLYRP3, PRSS27, ANXA8L2, WISP3, IL20RB, FOXE1, ZFY, ALG1L, LY6K, NCCRP1, SLC44A5, NMU, CDH17, RNASE7, FER1L4, C4BPB, CALML5, CXorf61, SPACA4, ULBP2, KRTDAP, MYO7B, , C7orf54, SLC6A20, LOC221442, GOLGA8B, GPR81, ALDH3B2, TRIM29, C21orf125, BNC1, IL1F6, TRPA1, C12orf27, LOC440905, POU5F1, LOC100131726, KCNH8, SPRR2C, IL13RA2, C3orf67, SAA4, LYPD3, GJB5, ULBP1, PHACTR3, S100A9, TRIM54, KLK11, ITIH5L, BNIPL, LOC284233, LOC387646, MRPL42P5, FLJ42393, PCDHAC2, IFNE, BCL2L10, FLJ45445, COL7A1, GDA, ARL14, VIP, CLC, PPP2R2B, FABP4, SFRP5, CCL8, CD79A, HIST1H1E, CCL4L2, SYNPO2, SLC47A1, CXCR2P1, C1QTNF7, CDH2, SIGLEC7, GZMA, NKX6-3, PGM5, LILRB4, NMUR1, XCL2, SOX10, FCGR1A, ST6GALNAC5, CCL4, ACSM5, FOLR2, KCNA1, CCL26, FCGR1C, VSIG4, C1QA, NCF1B, NXPH3, C1QC, TAGLN, PTPRN, TYROBP, ISL1, HCST, RGMA, APOBEC3H, PRND, ADIPOQ, CCL11, GLP2R, PNMA6A, CD8B, FCGR1B, PCBP3, CD8A, GPR27, DPP6, F13A1, EPYC, CXCL9, GREM2, SNORA12, DNAJC5B, HLA-DQA2, PLP1, CHGB, APOC2, FAT3, TLR7, CHRDL1, LY86, AGTR1, ISLR, CR1, FCGR3A, DPEP1, PPAPDC1A, ODZ3, MAPK4, C17orf87, KCNJ5, MSR1, RELN, APOE, C1QB, PHYHIPL, CCDC80, NCF1C, SLITRK5, TREM2, FGF14, PGA5, NKX2-3, PRELP, FCRLA, CCL5, GNAO1, PCDH9, WSCD2, MS4A1, RNF150, KLRD1, KCNK2, MATK, HUNK, IGFBPL1, IGF1, CDO1, COLEC12, FIBIN, CARTPT, VPREB3, PPP1R1A, GDF6, NCAM2, CLEC10A, KIAA0408, BHLHE22, CD52, SULT4A1, SIT1, FNDC1, GRIK3, SUCNR1, TMEM90B, CYP1B1, MKX, SV2B, BMP3, TCEAL2, CADM3, SPOCK1, GREM1, SIGLEC8, ADCY2, CDC26, OGN, FCRL6, PSD, VIPR2, GZMM, ADH1B, CCL19, PLD4, TMEM189-UBE2V1, NKG7, EOMES, STMN2, GZMH, NPTX1, CNTFR, TMEM130, CTNND2, ITGBL1, ECEL1, ACTG2, COL10A1, ST6GAL2, NRK, PI16, NALCN, GZMK, NCAM1, RMRP, CHRM2, KCNMA1, HSPB7, SLIT2, PDZRN4, CNN1, CHRDL2, OMD, PTGIS, RSPO3, PLA2G2D, SMYD1, ZNF683, NRXN3, PCSK1N, HSPB6, C16orf89, PGA3, COMP, C2orf40, C7, GKN2, DES, CILP, COL11A1, LIPF, GATA5, MFAP5, SCRG1, SFRP2, GKN1, PGA4, CCL21, SIX2, NKX3-2, SFRP4, NBLA00301, THBS4, HAND2, 및 BARX1 |
| 10 |
10 청구항 9에 있어서, 상기 BCCP 점수가 0 |
| 11 |
11 청구항 9에 있어서, 상기 BCCP 점수가 0 |
| 12 |
12 청구항 1에 있어서, 상기 EGFR 및 ERBB2의 발현량이 증가한 경우, EGFR 및 ERBB2의 저해제를 투여하기로 결정하는 단계를 더 포함하는 방법 |
| 13 |
13 청구항 12에 있어서, 상기 EGFR 및 ERBB2의 저해제는 라파티닙(lapatinib), 트라스투주맙(Trastuzumab), 세툭시맙(cetuximab), 제피티닙(gefitinib), 에피티닙(efitinib) 또는 이들의 조합을 포함하는 것인 방법 |
| 14 |
14 청구항 1에 있어서, 상기 위암 또는 식도암은 선암(adenocarcinoma)인 방법 |
| 15 |
15 청구항 1에 있어서, 상기 EGFR 및 ERBB2의 발현량을 측정하는 단계는 RT-PCR, RNase 보호 분석법(RNase protection assay: RPA), 노던 블롯팅, 및 DNA 칩으로부터 선택된 하나 이상의 방법으로 수행하는 것인 방법 |
| 16 |
16 청구항 1에 있어서, 상기 EGFR 및 ERBB2의 발현량을 측정하는 단계는 웨스턴 블롯팅, ELISA, 방사선면역분석, 방사 면역 확산법, 오우크테로니 면역 확산법, 로케트면역전기영동, 면역침전 분석법, 보체 고정 분석법, FACS, 또는 단백질 칩으로부터 선택된 하나 이상의 방법으로 수행하는 것인 방법 |
| 17 |
17 EGFR 및 ERBB2 단백질, 또는 이들 각각의 단편에 특이적으로 결합하는 항체, 항원 결합 단편, 또는 폴리펩티드, 또는 EGFR 및 ERBB2 단백질을 코딩하는 폴리뉴클레오티드 서열에 특이적으로 결합하는 프로브, 프라이머 세트, 또는 뉴클레오티드를 포함하는 개체의 위암 또는 식도암을 진단하기 위한 것이며, 개체의 위암 또는 식도암을 진단하기 위한 정보를 제공하기 위하여, 개체로부터 분리된 조직의 유전자의 발현 프로필을 측정하기 위한 물질을 포함하는 개체의 위암 또는 식도암을 진단하기 위한 조성물로서, 상기 유전자는 아래의 유전자를 포함하는 것인 조성물: KRT5, KRT13, KRT6A, KRT14, RHCG, KRT4, S100A7, SPRR3, KRT6C, SPRR2A, MUC21, KRT6B, PKP1, SERPINB3, CLCA2, SPRR1B, MUC4, TBX5, CRNN, SPRR2D, DUOX2, GJB6, SPRR2E, S100A2, KRT16, KRT17, SCEL, DSC3, CALML3, HEPHL1, A2ML1, NKX6-1, DUOXA2, SBSN, TMPRSS11D, CLCA4, ANXA8, FGFBP1, TGM1, IVL, DUOX1, DSG3, EREG, SERPINB4, KRT78, HOXC10, DUOXA1, ZNF750, SPRR1A, KRT7, TMPRSS11A, CXCL6, KLK13, CRCT1, PAX9, HORMAD1, FAM83A, S100A7A, GPR110, CAPN14, ABCA12, WFDC2, TMPRSS11B, CEACAM5, MUC12, SERPINB13, PADI1, FAT2, IL1RL2, STK31, SPINK5, DDX3Y, PI3, FAM83C, LYPD2, KLK5, IL1F5, KRT15, BBOX1, GPR87, ACTL8, SLC34A2, USP9Y, TGM3, LASS3, TMPRSS13, GUCY1B2, SPRR2F, KDM5D, KRT23, LY6D, VTCN1, SLC5A12, ABCA13, S100A8, GBP6, CEACAM7, IL1F9, MUC15, PPP1R14C, KLK7, DEFB1, MMP3, TM4SF20, SYCP2, TMEM40, CEACAM6, VWA2, CYorf15B, TDRD5, DCDC2, KLK12, C10orf99, CARD14, HOXC13, LOC642587, GABRR1, DNAH2, SLC15A1, KLK8, LGALS7B, ALDH1L1, FOXN1, RAET1L, TP63, ATP13A4, UTY, DSG1, ALOX12B, AMY2B, SAA2, SAA1, GPR115, LCN2, KRT24, PRKY, PADI3, SCNN1A, PGLYRP3, PRSS27, ANXA8L2, WISP3, IL20RB, FOXE1, ZFY, ALG1L, LY6K, NCCRP1, SLC44A5, NMU, CDH17, RNASE7, FER1L4, C4BPB, CALML5, CXorf61, SPACA4, ULBP2, KRTDAP, MYO7B, , C7orf54, SLC6A20, LOC221442, GOLGA8B, GPR81, ALDH3B2, TRIM29, C21orf125, BNC1, IL1F6, TRPA1, C12orf27, LOC440905, POU5F1, LOC100131726, KCNH8, SPRR2C, IL13RA2, C3orf67, SAA4, LYPD3, GJB5, ULBP1, PHACTR3, S100A9, TRIM54, KLK11, ITIH5L, BNIPL, LOC284233, LOC387646, MRPL42P5, FLJ42393, PCDHAC2, IFNE, BCL2L10, FLJ45445, COL7A1, GDA, ARL14, VIP, CLC, PPP2R2B, FABP4, SFRP5, CCL8, CD79A, HIST1H1E, CCL4L2, SYNPO2, SLC47A1, CXCR2P1, C1QTNF7, CDH2, SIGLEC7, GZMA, NKX6-3, PGM5, LILRB4, NMUR1, XCL2, SOX10, FCGR1A, ST6GALNAC5, CCL4, ACSM5, FOLR2, KCNA1, CCL26, FCGR1C, VSIG4, C1QA, NCF1B, NXPH3, C1QC, TAGLN, PTPRN, TYROBP, ISL1, HCST, RGMA, APOBEC3H, PRND, ADIPOQ, CCL11, GLP2R, PNMA6A, CD8B, FCGR1B, PCBP3, CD8A, GPR27, DPP6, F13A1, EPYC, CXCL9, GREM2, SNORA12, DNAJC5B, HLA-DQA2, PLP1, CHGB, APOC2, FAT3, TLR7, CHRDL1, LY86, AGTR1, ISLR, CR1, FCGR3A, DPEP1, PPAPDC1A, ODZ3, MAPK4, C17orf87, KCNJ5, MSR1, RELN, APOE, C1QB, PHYHIPL, CCDC80, NCF1C, SLITRK5, TREM2, FGF14, PGA5, NKX2-3, PRELP, FCRLA, CCL5, GNAO1, PCDH9, WSCD2, MS4A1, RNF150, KLRD1, KCNK2, MATK, HUNK, IGFBPL1, IGF1, CDO1, COLEC12, FIBIN, CARTPT, VPREB3, PPP1R1A, GDF6, NCAM2, CLEC10A, KIAA0408, BHLHE22, CD52, SULT4A1, SIT1, FNDC1, GRIK3, SUCNR1, TMEM90B, CYP1B1, MKX, SV2B, BMP3, TCEAL2, CADM3, SPOCK1, GREM1, SIGLEC8, ADCY2, CDC26, OGN, FCRL6, PSD, VIPR2, GZMM, ADH1B, CCL19, PLD4, TMEM189-UBE2V1, NKG7, EOMES, STMN2, GZMH, NPTX1, CNTFR, TMEM130, CTNND2, ITGBL1, ECEL1, ACTG2, COL10A1, ST6GAL2, NRK, PI16, NALCN, GZMK, NCAM1, RMRP, CHRM2, KCNMA1, HSPB7, SLIT2, PDZRN4, CNN1, CHRDL2, OMD, PTGIS, RSPO3, PLA2G2D, SMYD1, ZNF683, NRXN3, PCSK1N, HSPB6, C16orf89, PGA3, COMP, C2orf40, C7, GKN2, DES, CILP, COL11A1, LIPF, GATA5, MFAP5, SCRG1, SFRP2, GKN1, PGA4, CCL21, SIX2, NKX3-2, SFRP4, NBLA00301, THBS4, HAND2, 및 BARX1 |
| 18 |
18 청구항 17에 있어서, 상기 위암 또는 식도암은 위식도경계부선암(adenocarcinoma of gastroesophageal junction),분문부암(cardia cancer), 위식도경계부/분문부암, 상부위암(upperthird gastric cancer), 위저부암(gastric cancer located at fundus),위체부암(gastric cancer located at body), 위저부/체부암(gastric adenocarcinoma located at fundusor body of the stomach: GCFB), 식도 선암(esophageal adenocarcinoma: EAC), 또는 이들의 조합인 조성물 |
| 19 |
19 청구항 18에 있어서, 상기 조성물은 개체의 식도암 또는 위저부/체부암을 진단하기 위한 것인 조성물 |
| 20 |
20 청구항 17의 조성물, 시약 및 포장 단위를 포함하는 위암 또는 식도암을 진단하기 위한 키트 |
| 21 |
21 삭제 |
| 22 |
22 삭제 |
| 23 |
23 삭제 |
| 24 |
24 삭제 |
| 25 |
25 청구항 9에 있어서, 상기 유전자 발현 프로필을 측정하는 단계는 RT-PCR, RNase 보호 분석법(RNase protection assay: RPA), 노던 블롯팅, 및 DNA 칩으로부터 선택된 하나 이상의 방법으로 수행하는 것인 방법 |
| 26 |
26 삭제 |
| 27 |
27 삭제 |
| 지정국 정보가 없습니다 |
|---|
| 패밀리정보가 없습니다 |
|---|
| 순번 | 연구부처 | 주관기관 | 연구사업 | 연구과제 |
|---|---|---|---|---|
| 1 | 보건복지부 | 서울대학교병원 | 연구중심병원 육성 R＆D | 맞춤형 암-만성염증 극복을 위한 개방형 연구 비즈니스 플랫폼 구축 |
| 2 | 보건복지부 | 이화여자대학교 산학협력단 | 보건의료기술연구개발사업-글로벌화장품신소재사업 | 환자맞춤형PDX동물모델확립 |
| 등록사항 정보가 없습니다 |
|---|
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| 번호 | 서류명 | 접수/발송일자 | 처리상태 | 접수/발송번호 |
|---|---|---|---|---|
| 1 | [특허출원]특허출원서 | 2018.02.20 | 수리 (Accepted) | 1-1-2018-0179008-31 |
| 2 | 보정요구서 | 2018.03.07 | 발송처리완료 (Completion of Transmission) | 1-5-2018-0036042-13 |
| 3 | [출원서등 보정]보정서 | 2018.04.06 | 수리 (Accepted) | 1-1-2018-0346799-90 |
| 4 | 의견제출통지서 | 2019.05.16 | 발송처리완료 (Completion of Transmission) | 9-5-2019-0351144-15 |
| 5 | [명세서등 보정]보정서 | 2019.07.16 | 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) | 1-1-2019-0727139-03 |
| 6 | [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견(답변, 소명)서 | 2019.07.16 | 수리 (Accepted) | 1-1-2019-0727138-57 |
| 7 | 출원인정보변경(경정)신고서 | 2019.08.19 | 수리 (Accepted) | 4-1-2019-5164229-95 |
| 8 | 등록결정서 | 2019.11.27 | 발송처리완료 (Completion of Transmission) | 9-5-2019-0857010-29 |
| 기술정보가 없습니다 |
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| 과제정보가 없습니다 |
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