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RNA 은 제자리 혼성화 방법을 통한 AIMP2-DX2 신호 자동화 검출 방법

  • 기술번호 : KST2020000244
  • 담당센터 : 서울동부기술혁신센터
  • 전화번호 : 02-2155-3662
요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 본 발명은 RNA 은 제자리 혼성화 방법을 통한 AIMP2-DX2 신호 자동화 검출 방법에 관한 것으로, 보다 상세하게는 RNA 은 제자리 혼성화 방법을 이용하여 피검체로부터 수득한 생물학적 시료에서 AIMP2의 플라이싱 변이체(splicing variant)인 AIMP2-DX2 신호의 비율을 자동으로 검출하는 방법에 관한 것이다. 본 발명의 방법에 따르면 동일 시료 내에서 AIMP2-DX2의 비율을 정량적으로 검출할 수 있고 자동화가 가능하며, 진단결과의 정확도가 우수할 뿐만 아니라 FFPE 시료를 사용하여 임상에 적용 가능하기 때문에, 암의 구분진단, 예후 예측 등에 매우 유용하게 활용될 수 있다.
Int. CL C12Q 1/6813 (2018.01.01) C12Q 1/6886 (2018.01.01) G01N 1/36 (2006.01.01) G06T 7/11 (2017.01.01)
CPC C12Q 1/6813(2013.01) C12Q 1/6813(2013.01) C12Q 1/6813(2013.01) C12Q 1/6813(2013.01) C12Q 1/6813(2013.01) C12Q 1/6813(2013.01) C12Q 1/6813(2013.01)
출원번호/일자 1020180073640 (2018.06.26)
출원인 재단법인 의약바이오컨버젼스연구단, 서울대학교병원
등록번호/일자
공개번호/일자 10-2020-0001101 (2020.01.06) 문서열기
공고번호/일자
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보
법적상태 등록
심사진행상태 수리
심판사항
구분 신규
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2019.10.18)
심사청구항수 9

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 재단법인 의약바이오컨버젼스연구단 대한민국 인천광역시 연수구
2 서울대학교병원 대한민국 서울특별시 종로구

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 고영일 대한민국 서울특별시 성동구
2 김유식 대한민국 대전광역시 유성구
3 김성훈 대한민국 서울특별시 강남구
4 권남훈 대한민국 경기도 용인시 수지구

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 김석만 대한민국 서울시 강남구 테헤란로**길 ** *층 (역삼동, JS빌딩)(시원국제특허법률사무소)
2 이희숙 대한민국 서울특별시 강남구 테헤란로 **길 ** *층 (역삼동, JS빌딩)(시원국제특허법률사무소)

최종권리자

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번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 [특허출원]특허출원서
[Patent Application] Patent Application
2018.06.26 수리 (Accepted) 1-1-2018-0628491-70
2 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2019.08.19 수리 (Accepted) 4-1-2019-5164229-95
3 [심사청구]심사청구(우선심사신청)서
[Request for Examination] Request for Examination (Request for Preferential Examination)
2019.10.18 수리 (Accepted) 1-1-2019-1065303-79
4 의견제출통지서
Notification of reason for refusal
2020.08.26 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2020-0586335-97
5 [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견서·답변서·소명서
2020.10.26 수리 (Accepted) 1-1-2020-1136719-15
6 [명세서등 보정]보정서
[Amendment to Description, etc.] Amendment
2020.10.26 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) 1-1-2020-1136738-83
7 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2020.11.13 수리 (Accepted) 4-1-2020-5256819-16
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번호 청구항
1 1
암 진단 또는 예후 예측에 필요한 정보를 제공하기 위하여, 하기 단계를 포함하는 AIMP2-DX2 신호의 검출 방법:(a) 피검체로부터 시료를 제공하는 단계;(b) 상기 시료로부터 분리된 세포 내 AIMP2-DX2를 프로브 세트를 이용하여 은 제자리 혼성화(silver in situ hybridization)하고, 신호를 유발하여 촬상하여 이미지화하는 단계;(c) 미리 정해진(pre-determined) 임계값 1을 적용하여 상기 이미지에서 암 세포 영역의 이미지를 분리하는 단계;(d) 상기 분리된 암세포 영역에서 AIMP2-DX2 신호를 선정하기 위해, 미리 정해진 임계값 2를 설정하고 적용하는 단계; 및(e) 하기 식에 따라 암세포 신호에 대한 AIMP2-DX2 신호의 상대적인 비율을 계산하는 단계
2 2
제1항에 있어서, 상기 단계 단계 (b)에서 상기 시료로부터 분리된 세포를 세포 염색 용액과 반응시키는 단계를 추가로 포함하는 것을 특징으로 하는 방법
3 3
제2항에 있어서, 상기 세포 염색 용액은 세포핵을 염색하는 DAPI(4',6-diamidino-2-phenylindole), 메틸렌블루(methylene blue), 아세트산카민(acetocarmine), 톨루이딘블루(toluidine blue), 헤마톡실린(hematoxylin) 또는 Hoechst; 세포질을 염색하는 에오신(eosin), 크리스탈바이올렛(crystal violet) 또는 오렌지 G(orange G); 및 미토콘드리아를 염색하는 로다민 123(rhodamine 123), 미토트랙커(MitoTracker), 야누스그린 B(janus green B), 테트라졸리움염(tetrazolium salt), DASPMI(Dimethylaminostyrylmethylpyridiniumiodine), DASPEI(2-(4-(dimethylamino)styryl)-N-Ethylpyridinium Iodide), DiOC6(3,3'-dihexyloxacarbocyanine iodide), DiOC7(3,3'-Diheptyloxacarbocyanine Iodide) 또는 JC-1(5,5,6,6-tetrachloro-1,1,3,3-tetraethyl-benzimidazolylcarbocyanine chloride)로 이루어진 군에서 선택되는 1종 이상인 것을 특징으로 하는 방법
4 4
제1항에 있어서, 상기 단계 (b)의 프로브 세트는 서열번호 2로 표시되는 염기와 상보적인 올리고뉴클레오티드를 포함하는 AIMP2-DX2 검출용 프로브 세트인 것을 특징으로 하는 방법
5 5
제1항에 있어서, 상기 단계 (b)에서 얻어진 이미지로부터 RGB 영상을 추출하는 단계를 추가로 포함하며, 상기 단계 (c) 및 단계 (d)에서의 임계값 1 및 2는 각각 하기 조건에 따른 RGB 신호값을 만족하는 것을 특징으로 하는 방법:[임계값 1]Red: 170~230, Green: 145~215, Blue: 160~220, Red-Green 003e#6 및 Blue-Green 003e#6[임계값 2]Red 003c#181, Green 003c#151, Blue 003c#181, Red-Green 003e#30 및 Blue-Green 003e#7
6 6
제1항에 있어서, 상기 시료는 포르말린 고정 파라핀 포매 절편(FFPE)인 것을 특징으로 하는 방법
7 7
제1항에 있어서, 상기 암은 대장암, 자궁경부암, 폐암, 췌장암, 비소세포성폐암, 간암, 결장암, 골암, 피부암, 두부 또는 경부 암, 피부 또는 안구내 흑색종, 자궁암, 난소암, 직장암, 위암, 항문부근암, 결장암, 유방암, 나팔관암종, 자궁내막암종, 질암종, 음문암종, 식도암, 소장암, 내분비선암, 갑상선암, 부갑상선암, 부신암, 연조직 육종, 요도암, 음경암, 전립선암, 방광암, 신장암 또는 수뇨관 암으로 이루어진 군에서 선택되는 것을 특징으로 하는 방법
8 8
암 환자의 예후 예측에 필요한 정보를 제공하기 위하여, 하기 단계를 포함하는 암 예후 예측치를 산출하는 자동화된(automated) 방법:(a) 피검체로부터 시료를 제공하는 단계;(b) 상기 시료로부터 분리된 세포 내 AIMP2-DX2를 프로브 세트를 이용하여 은 제자리 혼성화(silver in situ hybridization)하고, 신호를 유발하여 촬상하여 이미지화하는 단계;(c) 미리 정해진(pre-determined) 임계값 1을 적용하여 상기 이미지에서 암 세포 영역의 이미지를 분리하는 단계;(d) 상기 분리된 암세포 영역에서 AIMP2-DX2 신호를 선정하기 위해, 미리 정해진 임계값 2를 설정하고 적용하는 단계; 및(e) 하기 식에 따라 암세포 신호에 대한 AIMP2-DX2 신호의 상대적인 비율을 계산하는 단계
9 9
제8항에 있어서, 상기 예후는 전체 생존(overall survival), 무진행 생존(progression-free survival) 및 무병생존(disease-free survival)으로 이루어진 군에서 선택되는 것을 특징으로 하는 방법
10 10
제8항에 있어서, 상기 암은 대장암, 자궁경부암, 폐암, 췌장암, 비소세포성폐암, 간암, 결장암, 골암, 피부암, 두부 또는 경부 암, 피부 또는 안구내 흑색종, 자궁암, 난소암, 직장암, 위암, 항문부근암, 결장암, 유방암, 나팔관암종, 자궁내막암종, 질암종, 음문암종, 식도암, 소장암, 내분비선암, 갑상선암, 부갑상선암, 부신암, 연조직 육종, 요도암, 음경암, 전립선암, 방광암, 신장암 또는 수뇨관 암으로 이루어진 군에서 선택되는 것을 특징으로 하는 방법
지정국 정보가 없습니다
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순번 패밀리번호 국가코드 국가명 종류
패밀리 정보가 없습니다

DOCDB 패밀리 정보

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순번 패밀리번호 국가코드 국가명 종류
1 WO2020004904 WO 세계지적재산권기구(WIPO) DOCDBFAMILY
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순번 연구부처 주관기관 연구사업 연구과제
1 과학기술정보통신부 (재) 의약바이오컨버젼스연구단 글로벌프론티어지원 중앙연계사업
2 과학기술정보통신부 (재) 의약바이오컨버젼스연구단 글로벌프론티어지원 실용화개발사업