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이라스틴에 대한 반응성 예측용 마커 및 이의 용도
- 기술번호 : KST2021005718
- 담당센터 : 서울동부기술혁신센터
- 전화번호 : 02-2155-3662
| 요약 | 본 발명은 이라스틴에 대한 반응성 예측용 마커 및 이의 용도에 관한 것으로서, 보다 구체적으로는 항암제인 이라스틴에 대한 반응성을 예측할 수 있는 마커 유전자, 이의 발현수준을 측정하는 제제를 포함하는 반응성 예측용 조성물 및 키트, 및 상기 마커 유전자를 이용해 반응성을 예측하는 방법에 관한 것이다. 본 발명에 따른 유전자 바이오마커는 이라스틴 항암제에 대한 반응성을 예측하는데 유효한 마커임을 확인하였는바, 이라스틴 또는 이라스틴 유사체를 이용한 치료에서 상기 유전자들의 발현수준을 측정함으로써 암 환자, 특히 폐암 환자에서 이라스틴 항암제에 대한 반응성을 미리 예측할 수 있고, 이를 통해 반응성 유무에 따라 암 환자를 효율적으로 분류하여 적절하고 효과적인 치료법을 적용하는데 유용하게 활용될 것으로 기대된다. |
|---|---|
| Int. CL | C12Q 1/6886 (2018.01.01) G01N 33/574 (2006.01.01) |
| CPC | C12Q 1/6886(2013.01) G01N 33/574(2013.01) C12Q 2600/106(2013.01) C12Q 2600/158(2013.01) G01N 2800/52(2013.01) G01N 2800/60(2013.01) |
| 출원번호/일자 | 1020190143564 (2019.11.11) |
| 출원인 | 이화여자대학교 산학협력단, 서울대학교산학협력단 |
| 등록번호/일자 | |
| 공개번호/일자 | 10-2021-0056748 (2021.05.20) 문서열기 |
| 공고번호/일자 | |
| 국제출원번호/일자 | |
| 국제공개번호/일자 | |
| 우선권정보 | |
| 법적상태 | 공개 |
| 심사진행상태 | 수리 |
| 심판사항 | |
| 구분 | |
| 원출원번호/일자 | |
| 관련 출원번호 | |
| 심사청구여부/일자 | Y (2020.08.20) |
| 심사청구항수 | 14 |
출원인
| 번호 | 이름 | 국적 | 주소 |
|---|---|---|---|
| 1 | 이화여자대학교 산학협력단 | 대한민국 | 서울특별시 서대문구 |
| 2 | 서울대학교산학협력단 | 대한민국 | 서울특별시 관악구 |
발명자
| 번호 | 이름 | 국적 | 주소 |
|---|---|---|---|
| 1 | 김완규 | 서울특별시 송파구 | |
| 2 | 차혁진 | 서울특별시 강남구 | |
| 3 | 권옥선 | 서울특별시 서대문구 | |
| 4 | 이해승 | 서울특별시 동대문구 |
대리인
| 번호 | 이름 | 국적 | 주소 |
|---|---|---|---|
| 1 | 특허법인(유한)아이시스 | 대한민국 | 서울특별시 강남구 테헤란로**길 **, 인화빌딩 *층 (삼성동) |
최종권리자
| 번호 | 이름 | 국적 | 주소 |
|---|---|---|---|
| 최종권리자 정보가 없습니다 | |||
| 번호 | 서류명 | 접수/발송일자 | 처리상태 | 접수/발송번호 |
|---|---|---|---|---|
| 1 | [특허출원]특허출원서 [Patent Application] Patent Application |
2019.11.11 | 수리 (Accepted) | 1-1-2019-1154990-70 |
| 2 | 보정요구서 Request for Amendment |
2019.11.12 | 발송처리완료 (Completion of Transmission) | 1-5-2019-0180234-06 |
| 3 | [출원서 등 보정]보정서 [Amendment to Patent Application, etc.] Amendment |
2019.11.14 | 수리 (Accepted) | 1-1-2019-1167127-09 |
| 4 | [심사청구]심사청구서·우선심사신청서 |
2020.08.20 | 수리 (Accepted) | 1-1-2020-0874340-02 |
| 5 | 출원인정보변경(경정)신고서 Notification of change of applicant's information |
2020.11.25 | 수리 (Accepted) | 4-1-2020-5265458-48 |
| 6 | 선행기술조사의뢰서 Request for Prior Art Search |
2021.04.16 | 수리 (Accepted) | 9-1-9999-9999999-89 |
| 번호 | 청구항 |
|---|---|
| 1 |
1 ACOX1(acyl-CoA oxidase 1; GenBank 접근(accession) 번호: NM_001185039, NM_004035, NM_007292), ALOX5AP(arachidonate 5-lipoxygenase activating protein; NM_001204406, NM_001629), ANKRD1(ankyrin repeat domain 1; NM_014391), BAAT(bile acid-CoA:amino acid N-acyltransferase; NM_001127610, NM_001701), BHLHE40(basic helix-loop-helix family member e40; NM_003670), CCL2(C-C motif chemokine ligand 2; NM_002982), CYP1A1(cytochrome P450 family 1 subfamily A member 1; NM_000499, NM_001319216, NM_001319217), DNAJC7(DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C7; NM_001144766, NM_003315), ESR1(estrogen receptor 1; NM_000125, NM_001122740, NM_001122741, NM_001122742, NM_001291230, NM_001291241, NM_001328100), GCLC(glutamate-cysteine ligase catalytic subunit; NM_001197115, NM_001498), GPAM(glycerol-3-phosphate acyltransferase, mitochondrial; NM_001244949, NM_020918), GSTM1(glutathione S-transferase mu 1; NM_000561, NM_146421), HES1(hes family bHLH transcription factor 1; NM_005524), HSPA1A(heat shock protein family A (Hsp70) member 1A; NM_005345), IL17B(interleukin 17B; NM_001317987, NM_014443), JUND(JunD proto-oncogene, AP-1 transcription factor subunit; NM_001286968, NM_005354), MFGE8(milk fat globule-EGF factor 8 protein; NM_001114614, NM_001310319, NM_001310320, NM_001310321, NM_005928), NAV3(neuron navigator 3; NM_001024383, NM_014903), NCOA6(nuclear receptor coactivator 6; NM_001242539, NM_001318240, NM_014071), NQO1(NAD(P)H quinone dehydrogenase 1; NM_000903, NM_001025433, NM_001025434, NM_001286137), PLTP(phospholipid transfer protein; NM_001242920, NM_001242921, NM_006227, NM_182676), PMP2(peripheral myelin protein 2; NM_001348381, NM_002677), PRDX1(peroxiredoxin 1; NM_001202431, NM_002574, NM_181696, NM_181697), PTGES3(prostaglandin E synthase 3; NM_001282601, NM_001282602, NM_001282603, NM_001282604, NM_001282605, NM_006601), PTGR1(prostaglandin reductase 1; NM_001146108, NM_001146109, NM_012212), PTPA(protein phosphatase 2 phosphatase activator; NM_001193397, NM_001271832, NM_021131, NM_178000, NM_178001, NM_178002, NM_178003), RXRA(retinoid X receptor alpha; NM_001291920, NM_001291921, NM_002957), S100P(S100 calcium binding protein P; NM_005980), SEC14L1(SEC14 like lipid binding 1; NM_001039573, NM_001143998, NM_001143999, NM_001144001, NM_001204408, NM_001204410, NM_003003), SERPINB2(serpin family B member 2; NM_001143818, NM_002575), SLC2A12(solute carrier family 2 member 12; NM_145176), SLC2A13(solute carrier family 2 member 13; NM_052885), SLC39A12(solute carrier family 39 member 12; NM_001145195, NM_001282733, NM_001282734, NM_152725), SLC39A3(solute carrier family 39 member 3; NM_144564, NM_213568), SLC39A7(solute carrier family 39 member 7; NM_001077516, NM_001288777, NM_006979), SLC5A4(solute carrier family 5 member 4; NM_014227), SLC6A18(solute carrier family 6 member 18; NM_182632), SLC6A7(solute carrier family 6 member 7; NM_014228), SLC7A11(solute carrier family 7 member 11; NM_014331), SLC7A5(solute carrier family 7 member 5; NM_003486), TGFBR2(transforming growth factor beta receptor 2; NM_001024847, NM_003242), TNF(tumor necrosis factor; NM_000594) 및 TNS4(tensin 4; NM_032865)로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 유전자, 또는 상기 유전자가 암호화하는 단백질을 포함하는, 이라스틴(Erastin)에 대한 반응성 예측용 마커 조성물 |
| 2 |
2 제1항에 있어서,상기 GSTM1, HSPA1A, PRDX1, PTGR1, RXRA, SLC2A12, SLC2A13, SLC39A12, SLC39A3, SLC39A7, SLC5A4, SLC6A18, SLC6A7, SLC7A11, TGFBR2, GCLC 및 NQO1은 NRF2(Nuclear factor erythroid 2-related factor 2) 경로에 관련된 유전자인 것을 특징으로 하는, 마커 조성물 |
| 3 |
3 제1항에 있어서,상기 CYP1A1, ESR1, HES1, IL17B, JUND, PTGES3, SERPINB2, SLC7A5, TNF, GCLC 및 NQO1은 AhR(Aryl hydrocarbon receptor) 경로에 관련된 유전자인 것을 특징으로 하는, 마커 조성물 |
| 4 |
4 ACOX1(acyl-CoA oxidase 1; GenBank 접근(accession) 번호: NM_001185039, NM_004035, NM_007292), ALOX5AP(arachidonate 5-lipoxygenase activating protein; NM_001204406, NM_001629), ANKRD1(ankyrin repeat domain 1; NM_014391), BAAT(bile acid-CoA:amino acid N-acyltransferase; NM_001127610, NM_001701), BHLHE40(basic helix-loop-helix family member e40; NM_003670), CCL2(C-C motif chemokine ligand 2; NM_002982), CYP1A1(cytochrome P450 family 1 subfamily A member 1; NM_000499, NM_001319216, NM_001319217), DNAJC7(DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C7; NM_001144766, NM_003315), ESR1(estrogen receptor 1; NM_000125, NM_001122740, NM_001122741, NM_001122742, NM_001291230, NM_001291241, NM_001328100), GCLC(glutamate-cysteine ligase catalytic subunit; NM_001197115, NM_001498), GPAM(glycerol-3-phosphate acyltransferase, mitochondrial; NM_001244949, NM_020918), GSTM1(glutathione S-transferase mu 1; NM_000561, NM_146421), HES1(hes family bHLH transcription factor 1; NM_005524), HSPA1A(heat shock protein family A (Hsp70) member 1A; NM_005345), IL17B(interleukin 17B; NM_001317987, NM_014443), JUND(JunD proto-oncogene, AP-1 transcription factor subunit; NM_001286968, NM_005354), MFGE8(milk fat globule-EGF factor 8 protein; NM_001114614, NM_001310319, NM_001310320, NM_001310321, NM_005928), NAV3(neuron navigator 3; NM_001024383, NM_014903), NCOA6(nuclear receptor coactivator 6; NM_001242539, NM_001318240, NM_014071), NQO1(NAD(P)H quinone dehydrogenase 1; NM_000903, NM_001025433, NM_001025434, NM_001286137), PLTP(phospholipid transfer protein; NM_001242920, NM_001242921, NM_006227, NM_182676), PMP2(peripheral myelin protein 2; NM_001348381, NM_002677), PRDX1(peroxiredoxin 1; NM_001202431, NM_002574, NM_181696, NM_181697), PTGES3(prostaglandin E synthase 3; NM_001282601, NM_001282602, NM_001282603, NM_001282604, NM_001282605, NM_006601), PTGR1(prostaglandin reductase 1; NM_001146108, NM_001146109, NM_012212), PTPA(protein phosphatase 2 phosphatase activator; NM_001193397, NM_001271832, NM_021131, NM_178000, NM_178001, NM_178002, NM_178003), RXRA(retinoid X receptor alpha; NM_001291920, NM_001291921, NM_002957), S100P(S100 calcium binding protein P; NM_005980), SEC14L1(SEC14 like lipid binding 1; NM_001039573, NM_001143998, NM_001143999, NM_001144001, NM_001204408, NM_001204410, NM_003003), SERPINB2(serpin family B member 2; NM_001143818, NM_002575), SLC2A12(solute carrier family 2 member 12; NM_145176), SLC2A13(solute carrier family 2 member 13; NM_052885), SLC39A12(solute carrier family 39 member 12; NM_001145195, NM_001282733, NM_001282734, NM_152725), SLC39A3(solute carrier family 39 member 3; NM_144564, NM_213568), SLC39A7(solute carrier family 39 member 7; NM_001077516, NM_001288777, NM_006979), SLC5A4(solute carrier family 5 member 4; NM_014227), SLC6A18(solute carrier family 6 member 18; NM_182632), SLC6A7(solute carrier family 6 member 7; NM_014228), SLC7A11(solute carrier family 7 member 11; NM_014331), SLC7A5(solute carrier family 7 member 5; NM_003486), TGFBR2(transforming growth factor beta receptor 2; NM_001024847, NM_003242), TNF(tumor necrosis factor; NM_000594) 및 TNS4(tensin 4; NM_032865)로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 유전자의 mRNA, 또는 상기 유전자가 암호화하는 단백질 수준을 측정하는 제제를 포함하는, 이라스틴(Erastin)에 대한 반응성 예측용 조성물 |
| 5 |
5 제4항에 있어서, 상기 유전자의 mRNA 수준을 측정하는 제제는 유전자의 mRNA에 상보적으로 결합하는 센스 및 안티센스 프라이머, 또는 프로브인 것을 특징으로 하는, 조성물 |
| 6 |
6 제4항에 있어서, 상기 단백질 수준을 측정하는 제제는 상기 유전자가 암호화하는 단백질에 특이적으로 결합하는 항체인 것을 특징으로 하는, 조성물 |
| 7 |
7 제4항에 있어서,상기 GSTM1, HSPA1A, PRDX1, PTGR1, RXRA, SLC2A12, SLC2A13, SLC39A12, SLC39A3, SLC39A7, SLC5A4, SLC6A18, SLC6A7, SLC7A11, TGFBR2, GCLC 및 NQO1은 NRF2(Nuclear factor erythroid 2-related factor 2) 경로에 관련된 유전자인 것을 특징으로 하는, 조성물 |
| 8 |
8 제4항에 있어서,상기 CYP1A1, ESR1, HES1, IL17B, JUND, PTGES3, SERPINB2, SLC7A5, TNF, GCLC 및 NQO1은 AhR(Aryl hydrocarbon receptor) 경로에 관련된 유전자인 것을 특징으로 하는, 조성물 |
| 9 |
9 제4항의 조성물을 포함하는, 이라스틴(Erastin)에 대한 반응성 예측용 키트 |
| 10 |
10 암 환자유래의 생물학적 시료에서 ACOX1(acyl-CoA oxidase 1; GenBank 접근(accession) 번호: NM_001185039, NM_004035, NM_007292), ALOX5AP(arachidonate 5-lipoxygenase activating protein; NM_001204406, NM_001629), ANKRD1(ankyrin repeat domain 1; NM_014391), BAAT(bile acid-CoA:amino acid N-acyltransferase; NM_001127610, NM_001701), BHLHE40(basic helix-loop-helix family member e40; NM_003670), CCL2(C-C motif chemokine ligand 2; NM_002982), CYP1A1(cytochrome P450 family 1 subfamily A member 1; NM_000499, NM_001319216, NM_001319217), DNAJC7(DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C7; NM_001144766, NM_003315), ESR1(estrogen receptor 1; NM_000125, NM_001122740, NM_001122741, NM_001122742, NM_001291230, NM_001291241, NM_001328100), GCLC(glutamate-cysteine ligase catalytic subunit; NM_001197115, NM_001498), GPAM(glycerol-3-phosphate acyltransferase, mitochondrial; NM_001244949, NM_020918), GSTM1(glutathione S-transferase mu 1; NM_000561, NM_146421), HES1(hes family bHLH transcription factor 1; NM_005524), HSPA1A(heat shock protein family A (Hsp70) member 1A; NM_005345), IL17B(interleukin 17B; NM_001317987, NM_014443), JUND(JunD proto-oncogene, AP-1 transcription factor subunit; NM_001286968, NM_005354), MFGE8(milk fat globule-EGF factor 8 protein; NM_001114614, NM_001310319, NM_001310320, NM_001310321, NM_005928), NAV3(neuron navigator 3; NM_001024383, NM_014903), NCOA6(nuclear receptor coactivator 6; NM_001242539, NM_001318240, NM_014071), NQO1(NAD(P)H quinone dehydrogenase 1; NM_000903, NM_001025433, NM_001025434, NM_001286137), PLTP(phospholipid transfer protein; NM_001242920, NM_001242921, NM_006227, NM_182676), PMP2(peripheral myelin protein 2; NM_001348381, NM_002677), PRDX1(peroxiredoxin 1; NM_001202431, NM_002574, NM_181696, NM_181697), PTGES3(prostaglandin E synthase 3; NM_001282601, NM_001282602, NM_001282603, NM_001282604, NM_001282605, NM_006601), PTGR1(prostaglandin reductase 1; NM_001146108, NM_001146109, NM_012212), PTPA(protein phosphatase 2 phosphatase activator; NM_001193397, NM_001271832, NM_021131, NM_178000, NM_178001, NM_178002, NM_178003), RXRA(retinoid X receptor alpha; NM_001291920, NM_001291921, NM_002957), S100P(S100 calcium binding protein P; NM_005980), SEC14L1(SEC14 like lipid binding 1; NM_001039573, NM_001143998, NM_001143999, NM_001144001, NM_001204408, NM_001204410, NM_003003), SERPINB2(serpin family B member 2; NM_001143818, NM_002575), SLC2A12(solute carrier family 2 member 12; NM_145176), SLC2A13(solute carrier family 2 member 13; NM_052885), SLC39A12(solute carrier family 39 member 12; NM_001145195, NM_001282733, NM_001282734, NM_152725), SLC39A3(solute carrier family 39 member 3; NM_144564, NM_213568), SLC39A7(solute carrier family 39 member 7; NM_001077516, NM_001288777, NM_006979), SLC5A4(solute carrier family 5 member 4; NM_014227), SLC6A18(solute carrier family 6 member 18; NM_182632), SLC6A7(solute carrier family 6 member 7; NM_014228), SLC7A11(solute carrier family 7 member 11; NM_014331), SLC7A5(solute carrier family 7 member 5; NM_003486), TGFBR2(transforming growth factor beta receptor 2; NM_001024847, NM_003242), TNF(tumor necrosis factor; NM_000594) 및 TNS4(tensin 4; NM_032865)로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 유전자의 mRNA, 또는 상기 유전자가 암호화하는 단백질 발현수준을 측정하는 단계를 포함하는, 이라스틴(Erastin)에 대한 반응성 예측을 위한 정보제공방법 |
| 11 |
11 제10항에 있어서,상기 GSTM1, HSPA1A, PRDX1, PTGR1, RXRA, SLC2A12, SLC2A13, SLC39A12, SLC39A3, SLC39A7, SLC5A4, SLC6A18, SLC6A7, SLC7A11, TGFBR2, GCLC 및 NQO1은 NRF2(Nuclear factor erythroid 2-related factor 2) 경로에 관련된 유전자인 것을 특징으로 하는, 정보제공방법 |
| 12 |
12 제10항에 있어서,상기 CYP1A1, ESR1, HES1, IL17B, JUND, PTGES3, SERPINB2, SLC7A5, TNF, GCLC 및 NQO1은 AhR(Aryl hydrocarbon receptor) 경로에 관련된 유전자인 것을 특징으로 하는, 정보제공방법 |
| 13 |
13 제10항에 있어서, 상기 mRNA의 발현수준은 in situ 교잡법(in situ hybridization), 중합효소연쇄반응(PCR), 역전사 중합효소연쇄반응(RT-PCR), 실시간 중합효소연쇄반응(Real-time PCR), RNase 보호 분석법(RNase protection assay; RPA), 마이크로어레이(microarray), 및 노던 블롯팅(northern blotting)으로 이루어진 군으로부터 선택되는 1종 이상의 방법을 통해 측정되는 것을 특징으로 하는, 정보제공방법 |
| 14 |
14 제10항에 있어서, 상기 단백질의 발현수준은 웨스턴 블롯팅(western blotting), 방사선면역분석법(radioimmunoassay; RIA), 방사 면역 확산법(radioimmunodiffusion), 효소면역분석법(ELISA), 면역침강법(immunoprecipitation), 유세포분석법(flow cytometry), 면역형광염색법(immunofluorescence), 오우크테로니(ouchterlony), 보체 고정 분석법(complement fixation assay), 및 단백질 칩(protein chip)으로 이루어진 군으로부터 선택되는 1종 이상의 방법을 통해 측정되는 것을 특징으로 하는, 정보제공방법 |
| 지정국 정보가 없습니다 |
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| 패밀리정보가 없습니다 |
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| 순번 | 연구부처 | 주관기관 | 연구사업 | 연구과제 |
|---|---|---|---|---|
| 1 | 과학기술정보통신부 | 이화여자대학교 산학협력단 | 원천기술개발사업(학술진흥)(2017)-포스트게놈 다부처유전체사업-기반산업화 인프라 | 시스템 생명정보 분석 기반 약물 작용점 발굴 |
| 등록사항 정보가 없습니다 |
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| 번호 | 서류명 | 접수/발송일자 | 처리상태 | 접수/발송번호 |
|---|---|---|---|---|
| 1 | [특허출원]특허출원서 | 2019.11.11 | 수리 (Accepted) | 1-1-2019-1154990-70 |
| 2 | 보정요구서 | 2019.11.12 | 발송처리완료 (Completion of Transmission) | 1-5-2019-0180234-06 |
| 3 | [출원서 등 보정]보정서 | 2019.11.14 | 수리 (Accepted) | 1-1-2019-1167127-09 |
| 4 | [심사청구]심사청구서·우선심사신청서 | 2020.08.20 | 수리 (Accepted) | 1-1-2020-0874340-02 |
| 5 | 출원인정보변경(경정)신고서 | 2020.11.25 | 수리 (Accepted) | 4-1-2020-5265458-48 |
| 6 | 선행기술조사의뢰서 | 2021.04.16 | 수리 (Accepted) | 9-1-9999-9999999-89 |
| 기술정보가 없습니다 |
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| 과제정보가 없습니다 |
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