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초기 유방암 환자의 예후 예측 방법

  • 기술번호 : KST2021012937
  • 담당센터 : 서울동부기술혁신센터
  • 전화번호 : 02-2155-3662
요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 본 발명은 유방암 환자의 예후 예측 방법에 관한 것으로, 보다 상세하게는 면역관련 유전자를 조합하여 유방암의 예후를 예측하는 방법에 대한 것이다. 본 발명은 유방암 분자 아형에 관계없이 모든 유방암 환자에 적용 가능할 뿐만 아니라, 본 발명에서 제공하는 바에 따라 면역관련 유전자 조합을 유방암 예후 예측에 이용하면 증식 유전자에 대한 정보 없이도 유방암 환자의 예후 예측이 가능하다.
Int. CL C12Q 1/6886 (2018.01.01) G01N 33/574 (2006.01.01)
CPC C12Q 1/6886(2013.01) G01N 33/57415(2013.01) C12Q 2600/118(2013.01) G01N 2800/52(2013.01)
출원번호/일자 1020200056699 (2020.05.12)
출원인 서울대학교산학협력단
등록번호/일자
공개번호/일자 10-2021-0138405 (2021.11.19) 문서열기
공고번호/일자
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보
법적상태 공개
심사진행상태 수리
심판사항
구분 국내출원/신규
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2020.05.12)
심사청구항수 18

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 서울대학교산학협력단 대한민국 서울특별시 관악구

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 신영기 서울특별시 관악구
2 이한나 서울특별시 관악구

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 김석만 대한민국 서울특별시 강남구 논현로 ***, *층 (역삼동, 청송빌딩)(시원국제특허법률사무소)
2 이희숙 대한민국 서울특별시 강남구 논현로 ***, *층 (역삼동, 청송빌딩)(시원국제특허법률사무소)

최종권리자

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번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 [특허출원]특허출원서
[Patent Application] Patent Application
2020.05.12 수리 (Accepted) 1-1-2020-0479645-12
2 보정요구서
Request for Amendment
2020.05.12 발송처리완료 (Completion of Transmission) 1-5-2020-0068253-82
3 [출원서 등 보정]보정서
[Amendment to Patent Application, etc.] Amendment
2020.05.21 수리 (Accepted) 1-1-2020-0515564-46
4 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2020.11.25 수리 (Accepted) 4-1-2020-5265458-48
5 의견제출통지서
Notification of reason for refusal
2021.07.19 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2021-0566099-82
6 특허고객번호 정보변경(경정)신고서·정정신고서
2021.07.29 수리 (Accepted) 4-1-2021-5205564-29
7 [지정기간연장]기간 연장신청서·기간 단축신청서·기간 경과 구제신청서·절차 계속신청서
2021.09.17 수리 (Accepted) 1-1-2021-1084987-15
8 [명세서등 보정]보정서
[Amendment to Description, etc.] Amendment
2021.10.18 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) 1-1-2021-1186765-56
9 [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견서·답변서·소명서
2021.10.18 수리 (Accepted) 1-1-2021-1186791-33
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번호 청구항
1 1
유방암 환자의 예후 예측에 필요한 정보를 제공하기 위하여, 하기 단계를 포함하는 유방암 예후 예측 방법:(a) 유방암 환자로부터 수득한 생물학적 시료로부터 면역 관련 유전자들의 발현수준을 측정하는 단계;(b) 상기 (a) 단계에서 측정된 발현 수준을 표준화하는 단계;(c) 상기 (b) 단계에서 표준화된 면역 관련 유전자들의 발현 수준을 조합하여 유방암 예후를 예측하는 단계로서, 조합된 면역 관련 유전자들의 과발현은 좋은 예후인 것으로 유방암 예후를 예측하는 단계
2 2
제1항에 있어서, 상기 유방암 예후는 재발, 전이 및 전이성 재발로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나 이상인 것을 특징으로 하는 방법
3 3
제1항에 있어서, 상기 유방암은 HR+/HER2-, HR+/HER2+, HR-/HER2+ 및 TNBC로 이루어진 군에서 선택되는 아형(subtype)인 것을 특징으로 하는 방법
4 4
제1항에 있어서, 상기 유방암은 암전이분류(Tumor Node Metastasis:TNM) 시스템에 따라 LN-여부가 0 (림프절로 전이가 일어나지 않음) 또는 1 (림프절로 전이가 일어남)으로 분류되는 초기 유방암인 것을 특징으로 하는 방법
5 5
제1항에 있어서, 상기 면역반응 관련 유전자들은 TRBV20-1, CCL19, CD52, SRGN, CD3D, IGJ, HLA-DRA, LOC91316, IGF1, CYBRD1, TMC5, ALDH1A1, OGN, PDCD4, FRZB, CX3CR1, IGFBP6, GLA, LOC96610, IGLL3, ITPR1, SERPINA1, EPHX2, MFAP4, RNASET2, CCNG1, FBLN5, SORBS2, CCBL2, BTN3A2, TFAP2B, LTF, ITM2A, HLA-DPB1, HLA-DMA, RPL3, LOC100130100, FAM129A, ELOVL5, GBP2, RARRES3, GOLM1, RTN1, ICAM3, LAMA2, CXCL13, ZCCHC24, CD37, VTCN1, PYCARD, CORO1A, SH3BGRL, TPSAB1, TNFSF10, ACSF2, TGFBR2, DUSP4, ARHGDIB, TMPRSS3, DCN, LRIG1, FMOD, ZNF423, SQRDL, TPST2, CD44, MREG, GIMAP6, GJA1, IFITM3, BTG2, PIP, RPS9, HLA-DPA1, IMPDH2, TNFRSF17, C14orf139, SPRY2, XBP1, THYN1, APOD, C10orf116, VAV3, FAS, MYBPC1, CFB, TRIM22, ARID5B, PTGDS, TGFBR3, TNFAIP8, SEMA3C, TMEM135, ARHGEF3, PTGER4, ABCA8, ICAM2, HLA-DQB1, HSPA2, CD27, ARMCX1, POU2AF1, IGBP1, PDE4B, ADH1B, WLS, SUCLG2, PGR, STARD13, SORL1, ATP1B1, IFT46, SIK3, LIPT1, OMD, HBB, C3, FGL2, PECI, RAC2, PDZRN3, CXCL12, DPYD, TXNDC15, STOM, EMCN, SCGB2A2, FAM176B, HIGD1A, ACSL5, RPS24, RGS10, RAI2, CNN3, FBXW4, SEPP1, SLC44A4, MGP, ABCD3, SETBP1, APOBEC3G, LCP2, HLA-DRB1, SCUBE2, DEPDC6, RPL15, SH3BP4, MSX2, CLU, DPT, ZNF238, HBP1, GSTK1, ZBTB16, CCDC69, ALDH2, SLC1A1, ARMCX2, HMGCS2, TSPAN3, FTO, PON2, C16orf62, QDPR, LRP2, PSMB8, HCLS1, FXYD1, OAT, SLC38A1, MAOA, LPL, C10orf57, SPARCL1, ERAP2, PDGFRL, RBP4, LRRC17, LHFP, BLNK, HBA2, CST7, TRAT1, IL21R, IGHM, CTLA4, IL2RB, TNFRSF9, CTSW, CCR10, GPR18, CR2, DOCK10, GZMB, ITK, LTB, IGLJ3, IGLV1-44, AIM2, CXCL9, KIAA0125, IL2RG,CD69, CD55, TRAF3IP3, EVI2B, STAP1, KLRB1, PRKCB, GPR171, PPP1R16B, SH2D1A, TNFRSF1B, CD48, BANK1, LY9, VNN2, TCL1A, CYTIP, PTPRC, PDCD1LG2, LTA, IGHG1 및 CD19로 이루어지는 군에서 선택된 2개 이상의 것임을 특징으로 하는 방법
6 6
제1항에 있어서, 상기 유전자의 발현수준 측정은 상기 유전자의 mRNA 발현 수준 측정; 또는 상기 유전자가 코딩하는 단백질 발현수준을 측정하는 것인 방법
7 7
제6항에 있어서, 상기 유전자의 mRNA 발현수준을 측정하는 방법은 상기 유전자에 특이적으로 결합하는 프라이머쌍 또는 프로브에 의하여 발현수준이 측정되는 것인 방법
8 8
제6항에 있어서, 상기 단백질의 발현수준을 측정하는 방법은 상기 단백질에 특이적으로 결합하는 항체에 의해서 발현수준이 측정되는 것인 방법
9 9
제1항에 있어서, 상기 시료는 환자의 암세포를 포함하는 조직의 포르말린 고정 파라핀 포매(formalin-fixed paraffin-embedded, FFPE) 시료, 신선한 조직(fresh tissue) 및 동결 조직으로 이루어진 군에서 선택되는 것을 특징으로 하는 방법
10 10
제1항에 있어서, lymph node status를 추가적으로 포함하며, 상기 (c) 단계에서 LN이 1일 때 (림프절로의 전이가 일어남)예후가 좋지 않은 것으로 예측하는 것을 추가적으로 포함하는 방법
11 11
제1항에 있어서, 상기 (c) 단계는, 상기 (b) 단계에서 표준화된 면역 관련 유전자들의 발현값을 수학적으로 조합하여, 합계점수를 산출하고, 합계 점수는 유방암 환자의 예후를 나타내는 것인 방법
12 12
제11항에 있어서, 상기 수학적으로 조합은면역 관련 유전자가 n개일 때 하기 공식 1에 의한 것임을 특징으로 하는 방법:[공식 1] 합계점수 = (β1*χ1) + (β2*χ2) +
13 13
제11항에 있어서, 상기 수학적으로 조합은면역반응 관련 유전자가 n개일 때 하기 공식 2에 의하는 것을 특징으로 하는 방법:[공식 2] 합계점수 = {(β1*χ1) + (β2*χ2) +
14 14
제1항에 있어서, 상기 면역 관련 유전자는 TRAT1(T Cell Receptor Associated Transmembrane Adaptor 1), IL21R(Interleukin 21 Receptor), IGHM(Immunoglobulin Heavy Constant Mu), CTLA4(Cytotoxic T-Lymphocyte Associated Protein 4) 및 IL2RB(Interleukin 2 Receptor Subunit Beta)로 이루어진 것인 방법
15 15
제1항에 있어서, 상기 면역 관련 유전자는 TRAT1, IL21R 및 CTLA4로 이루어진 것인 방법
16 16
유방암 환자의 예후 예측에 필요한 정보를 제공하기 위하여, 하기 단계를 포함하는 유방암 예후 위험 지수를 산출하는 방법:(i) 유방암 환자로부터 수득한 생물학적 시료로부터 TRAT1, IL21R, IGHM, CTLA4 및 IL2RB 유전자의 mRNA 발현수준과 유방암 환자의 LN-여부 값을 측정하는 단계;(ii) 상기 유전자의 mRNA 발현 수준을 표준화하는 단계; 및(iii) 상기 (ii) 단계의 표준화값 및 상기 (i) 단계의 LN-여부 값을 하기 공식 2-1에 대입하여 유방암 예후 위험 지수(risk score)를 계산하는 단계:[공식 2-1]risk score = {(βTRAT1*χTRAT1) + (βIL21R*χIL21R) + (βIGHM*χIGHM) + (βCTLA4*χCTLA4) + (βIL2RB*χIL2RB)}+ F*2*LN(상기 공식 2-1에서 χ는 아래첨자(subscript)로 표시된 유전자의 발현 수준의 표준화 값이며,βTRAT1는 -0
17 17
유방암 환자의 예후 예측에 필요한 정보를 제공하기 위하여, 하기 단계를 포함하는 유방암 예후 위험 지수를 산출하는 방법:(i) 유방암 환자로부터 수득한 생물학적 시료로부터 TRAT1, IL21R 및CTLA4 유전자의 mRNA 발현수준과 유방암 환자의 LN-여부 값을 측정하는 단계;(ii) 상기 유전자의 mRNA 발현 수준을 표준화하는 단계; 및(iii) 상기 (ii) 단계의 표준화값 및 상기 (i) 단계의 LN-여부 값을 하기 공식 2-2에 대입하여 유방암 예후 위험 지수(risk score)를 계산하는 단계:[공식 2-2]risk score = {(βTRAT1*χTRAT1) + (βIL21R*χIL21R) + (βCTLA4*χCTLA4) + F*LN(상기 공식 2-2에서 χ는 아래첨자(subscript)로 표시된 유전자의 발현 수준의 표준화 값이며,βTRAT1는 -1
18 18
제16항에 있어서, 상기 유전자의 mRNA 발현수준을 측정하기 위한 방법은 마이크로어레이, PCR(polymerase chain reaction), RT-PCR, 정량적 RT-PCR(qRT-PCR), 실시간 중합효소 연쇄반응(real-time PCR), 노던 블롯(northern blot), DNA 칩 및 RNA 칩으로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나의 방법인 것을 특징으로 하는 방법
19 19
제17항에 있어서, 상기 유전자의 mRNA 발현수준을 측정하기 위한 방법은 마이크로어레이, PCR(polymerase chain reaction), RT-PCR, 정량적 RT-PCR(qRT-PCR), 실시간 중합효소 연쇄반응(real-time PCR), 노던 블롯(northern blot), DNA 칩 및 RNA 칩으로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나의 방법인 것을 특징으로 하는 방법
20 20
ⅰ) TRAT1, IL21R, IGHM, CTLA4 및 IL2RB 유전자; 또는 ⅱ) TRAT1, IL21R 및 CTLA4 유전자의 발현량을 측정하는 제제를 포함하는 유방암 환자의 예후 예측용 조성물
21 21
제20항에 있어서, 상기 제제는 유전자의 mRNA 발현수준을 측정하는 제제; 또는 유전자가 코딩하는 단백질 발현수준을 측정하는 제제인 것을 특징으로 하는 조성물
22 22
제20항의 조성물을 포함하는, 유방암 환자의 예후 예측용 키트
지정국 정보가 없습니다
패밀리정보가 없습니다
국가 R&D 정보가 없습니다.