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TurboID를 이용한 바이러스 단백질-숙주세포 단백질의 상호작용 분석방법

  • 기술번호 : KST2022019418
  • 담당센터 : 서울동부기술혁신센터
  • 전화번호 : 02-2155-3662
요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 본 발명은 제1 결합 단백질과 제2 결합 단백질의 결합시스템 및 조작된 바이오틴화 효소인 TurboID를 이용한 바이러스 단백질-숙주세포 단백질의 상호작용 분석방법에 관한 것으로, 더욱 상세하게는 바이러스 단백질(viral protein of interest, vPOI)을 제1 결합 단백질로 태그하고, TurboID를 제2 결합 단백질로 태그한 후, 두 단백질을 살아있는 세포에서 동시에 발현시키면, 제1 결합 단백질과 제2 결합 단백질이 결합하여, 제2 결합 단백질로 태그된 TurboID가 제1 결합 단백질로 태그된 바이러스 단백질과 상호작용하는 단백질들을 바이오틴화 시킴으로써, 바이러스 단백질과 상호작용하는 숙주세포 단백질을 분석하는 방법에 관한 것이다.
Int. CL G01N 33/68 (2006.01.01) G01N 33/533 (2006.01.01) G01N 33/535 (2006.01.01) G01N 33/543 (2006.01.01) C07K 14/005 (2006.01.01)
CPC G01N 33/6848(2013.01) G01N 33/533(2013.01) G01N 33/535(2013.01) G01N 33/543(2013.01) C07K 14/005(2013.01) G01N 2333/165(2013.01) C07K 2319/60(2013.01) C12N 2770/20022(2013.01) C12N 2840/007(2013.01)
출원번호/일자 1020210039650 (2021.03.26)
출원인 서울대학교산학협력단
등록번호/일자
공개번호/일자 10-2022-0134241 (2022.10.05) 문서열기
공고번호/일자
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보
법적상태 공개
심사진행상태 수리
심판사항
구분 국내출원/신규
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2021.03.26)
심사청구항수 6

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 서울대학교산학협력단 대한민국 서울특별시 관악구

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 이현우 서울특별시 관악구
2 이윤빈 서울특별시 관악구

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 장제환 대한민국 서울특별시 강남구 언주로 ***, **층 (역삼동, 윤익빌딩)(*T국제특허법률사무소)
2 이처영 대한민국 서울특별시 강남구 언주로 ***, **층 (역삼동, 윤익빌딩)(*T국제특허법률사무소)

최종권리자

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번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 [특허출원]특허출원서
[Patent Application] Patent Application
2021.03.26 수리 (Accepted) 1-1-2021-0359009-47
2 특허고객번호 정보변경(경정)신고서·정정신고서
2021.07.29 수리 (Accepted) 4-1-2021-5205564-29
3 선행기술조사의뢰서
Request for Prior Art Search
2022.03.15 수리 (Accepted) 9-1-9999-9999999-89
4 특허고객번호 정보변경(경정)신고서·정정신고서
2022.04.04 수리 (Accepted) 4-1-2022-5079741-71
5 선행기술조사보고서
Report of Prior Art Search
2022.06.08 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-6-2022-0136775-22
6 의견제출통지서
Notification of reason for refusal
2022.08.04 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2022-0588516-70
7 특허고객번호 정보변경(경정)신고서·정정신고서
2022.08.11 수리 (Accepted) 4-1-2022-5189083-38
8 [명세서등 보정]보정서
[Amendment to Description, etc.] Amendment
2022.10.04 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) 1-1-2022-1042544-75
9 [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견서·답변서·소명서
2022.10.04 수리 (Accepted) 1-1-2022-1042540-93
10 특허고객번호 정보변경(경정)신고서·정정신고서
2022.10.07 수리 (Accepted) 4-1-2022-5235636-01
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번호 청구항
1 1
바이러스 단백질(viral protein of interest, vPOI)을 암호화하는 핵산 및 제1 결합 단백질을 암호화하는 핵산을 함유하는 제1벡터; 및 TurboID를 암호화하는 핵산 및 상기 제1 결합 단백질에 결합하는 제2 결합 단백질을 암호화하는 핵산을 함유하는 제2벡터를 포함하는 바이러스 단백질-숙주세포 단백질의 상호작용 분석용 조성물
2 2
제1항에 있어서, 상기 바이러스 단백질은 NSP7, NSP8, NSP9, M, N, ORF3a, ORF3b, ORF6, ORF7b, ORF9b, 및 ORF9c로 구성된 군에서 선택되는 하나 이상의 단백질인 것을 특징으로 하는 조성물
3 3
제1항에 있어서, 상기 숙주세포 단백질은 CXADR, ZC3HAV1 또는 RNF5인 것을 특징으로 하는 조성물
4 4
제1항에 있어서, 상기 바이러스는 중증 급성 호흡기 증후군 코로나바이러스 2(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2; SARS-CoV-2)인 것을 특징으로 하는 조성물
5 5
제1항에 있어서, 상기 제1 결합 단백질은 GFP(green fluorescent protein), mCherry 또는 HA 에피토프 태그(Hemagglutinin epitope tag)이며, 상기 제1 결합 단백질에 결합하는 제2 결합 단백질은 GBP(GFP binding protein), 항-mCherry 나노바디(anti-mCherry nanobody) 또는 항-HA 나노바디(anti-HA nanobody)인 것을 특징으로 하는 조성물
6 6
바이러스 단백질(viral protein of interest, vPOI)을 암호화하는 핵산 및 제1 결합 단백질을 암호화하는 핵산 또는 그 핵산을 함유하는 제1벡터; 및 TurboID를 암호화하는 핵산 및 상기 제1 결합 단백질에 결합하는 제2 결합 단백질을 암호화하는 핵산 또는 그 핵산을 함유하는 제2벡터가 도입되어 있는 재조합 세포
7 7
제6항에 있어서, 상기 제1 결합 단백질은 GFP(green fluorescent protein), mCherry 또는 HA 에피토프 태그(Hemagglutinin epitope tag)이며, 상기 제1 결합 단백질에 결합하는 제2 결합 단백질은 GBP(GFP binding protein), 항-mCherry 나노바디(anti-mCherry nanobody) 또는 항-HA 나노바디(anti-HA nanobody)인 것을 특징으로 하는 재조합 세포
8 8
(a) 제1 결합 단백질로 태그된 바이러스 단백질(viral protein of interest, vPOI); 및 상기 제1 결합 단백질에 결합하는 제2 결합 단백질로 태그된 TurboID를 세포 내에서 동시에 발현시키는 단계; 및 (b) 상기 제2 결합 단백질로 태그된 TurboID가 제1 결합 단백질로 태그된 바이러스 단백질과 상호작용하는 단백질을 바이오틴화(biotinylation) 시키는 단계를 포함하는 바이러스 단백질-숙주세포 단백질의 상호작용 분석방법
9 9
제8항에 있어서, 상기 바이러스 단백질은 NSP7, NSP8, NSP9, M, N, ORF3a, ORF3b, ORF6, ORF7b, ORF9b, 및 ORF9c로 구성된 군에서 선택되는 하나 이상의 단백질인 것을 특징으로 하는 바이러스 단백질-숙주세포 단백질의 상호작용 분석방법
10 10
제8항에 있어서, 상기 숙주세포 단백질은 CXADR, ZC3HAV1 또는 RNF5인 것을 특징으로 하는 바이러스 단백질-숙주세포 단백질의 상호작용 분석방법
11 11
제8항에 있어서, 상기 바이러스는 중증 급성 호흡기 증후군 코로나바이러스 2(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2; SARS-CoV-2)인 것을 특징으로 하는 바이러스 단백질-숙주세포 단백질의 상호작용 분석방법
12 12
제8항에 있어서, 상기 (b) 단계의 바이러스 단백질과 상호작용하는 단백질은 TurboID의 반경 20nm 내지 50nm에 존재하는 것을 특징으로 하는 바이러스 단백질-숙주세포 단백질의 상호작용 분석방법
13 13
제8항에 있어서, 상기 (b) 단계의 바이오틴화된 단백질을 트립신 효소로 펩티드화한 후, 바이오틴화된 펩티드만 질량분석하는 단계를 추가로 포함하는 바이러스 단백질-숙주세포 단백질의 상호작용 분석방법
14 14
제13항에 있어서, 상기 질량분석은 스트렙타비딘(streptavidin) 비드를 이용하는 것을 특징으로 하는 바이러스 단백질-숙주세포 단백질의 상호작용 분석방법
15 15
제8항에 있어서, 상기 제1 결합 단백질은 GFP(green fluorescent protein), mCherry 또는 HA 에피토프 태그(Hemagglutinin epitope tag)이며, 상기 제1 결합 단백질에 결합하는 제2 결합 단백질은 GBP(GFP binding protein), 항-mCherry 나노바디(anti-mCherry nanobody) 또는 항-HA 나노바디(anti-HA nanobody)인 것을 특징으로 하는 바이러스 단백질-숙주세포 단백질의 상호작용 분석방법
지정국 정보가 없습니다
패밀리정보가 없습니다
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순번 연구부처 주관기관 연구사업 연구과제
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