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게놈 정보 및 인실리코 분석을 이용한 배양배지의 제조방법

  • 기술번호 : KST2014007689
  • 담당센터 : 대전기술혁신센터
  • 전화번호 : 042-610-2279
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요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 본 발명은 게놈정보 및 인실리코 분석을 이용한 배양배지의 제조방법에 관한 것으로, 보다 구체적으로는, 진핵세포 또는 원핵세포의 게놈정보를 이용하여 대사회로를 구축하고, 상기 구축된 대사회로로부터 대사산물 중 하나를 제거하여 인실리코(in silco) 시뮬레이션을 이용한 대사흐름 분석을 수행함으로써 최소 합성 배양배지 성분을 선별한 후, 실제 배양을 통해 최종 배양배지를 결정하는 최소 합성 배양배지의 제조방법에 관한 것이다. 본 발명에 따른 배양배지의 제조방법은 종래 배양배지 제조방법에 비하여 체계적이고 정확하면서도, 제조에 소요되는 시간, 노력 및 비용을 획기적으로 줄일 수 있다. 또한, 본 발명에 따른 배양배지는 숙신산 생성 미생물 성장 및 숙신산을 생산하는데 유용하다. 따라서, 게놈 정보를 바탕으로 만들어진 대사회로를 이용하여 다양한 목적 대사산물 생산을 위한 각종 미생물의 배양배지 개발에 유용하게 사용될 수 있다. 배양배지, 대사산물, 대사흐름, 맨하이미아
Int. CL G06F 19/18 (2011.01) C12N 5/02 (2011.01) G06F 19/00 (2011.01)
CPC
출원번호/일자 1020060040581 (2006.05.04)
출원인 한국과학기술원
등록번호/일자 10-0762962-0000 (2007.09.21)
공개번호/일자
공고번호/일자 (20071004) 문서열기
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보
법적상태 소멸
심사진행상태 발송
심판사항
구분
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2006.05.04)
심사청구항수 19

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 한국과학기술원 대한민국 대전광역시 유성구

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 이상엽 대한민국 대전광역시 유성구
2 장호남 대한민국 대전광역시 유성구
3 송효학 대한민국 대전광역시 서구
4 김태용 대한민국 대전광역시 유성구
5 최보경 대한민국 경남 마산시 합포구

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 이처영 대한민국 서울특별시 강남구 언주로 ***, **층 (역삼동, 윤익빌딩)(*T국제특허법률사무소)

최종권리자

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번호 이름 국적 주소
1 한국과학기술원 대한민국 대전 유성구
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번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 특허출원서
Patent Application		 2006.05.04 수리 (Accepted) 1-1-2006-0317867-13
2 선행기술조사의뢰서
Request for Prior Art Search		 2007.01.19 수리 (Accepted) 9-1-9999-9999999-89
3 선행기술조사보고서
Report of Prior Art Search		 2007.02.13 수리 (Accepted) 9-1-2007-0010074-45
4 의견제출통지서
Notification of reason for refusal		 2007.03.29 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2007-0170275-16
5 의견서
Written Opinion		 2007.05.02 수리 (Accepted) 1-1-2007-0330240-92
6 명세서등보정서
Amendment to Description, etc.		 2007.05.02 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) 1-1-2007-0330239-45
7 등록결정서
Decision to grant		 2007.09.19 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2007-0505606-05
8 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2013.02.01 수리 (Accepted) 4-1-2013-5019983-17
9 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2014.12.24 수리 (Accepted) 4-1-2014-5157968-69
10 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2014.12.24 수리 (Accepted) 4-1-2014-5157993-01
11 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2014.12.24 수리 (Accepted) 4-1-2014-5158129-58
12 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2019.04.24 수리 (Accepted) 4-1-2019-5081392-49
13 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2020.05.15 수리 (Accepted) 4-1-2020-5108396-12
14 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2020.06.12 수리 (Accepted) 4-1-2020-5131486-63
번호, 청구항의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 청구항 표입니다.
번호 청구항
1 1
다음 단계를 포함하는 게놈정보 및 인실리코(in silico) 분석을 이용한 배양배지의 제조방법:(a) 대상 진핵세포 또는 원핵세포의 게놈 정보를 이용하여 대사회로를 구축하는 단계;(b) 상기 구축된 대사회로로부터 대사산물 중 하나를 제거하고, 인실리코(in silco) 시뮬레이션을 이용하여 대사 흐름 분석을 수행하는 단계;(c) 상기 인실리코 시뮬레이션 결과 목적 함수값이 0인 경우(여기서, 상기 목적함수는 상기 진핵세포 또는 원핵세포가 요구하는 구성성분을 어느 하나라도 생성하지 못하면 그 값을 0으로 함), 상기 제거된 대사산물을 최소 합성 배양배지 성분으로 결정하고, 목적 함수값이 0이 아니면 (b)단계로 회귀하는 단계;(d) 상기 대사산물을 스스로 합성하는 다른 생물종과의 비교를 통해 결실된 효소 및 해당 대사 반응식을 조사하여 해당 반응식이 존재하는 경우, 해당 대사산물을 외부에서 공급하지 않고도 내부적으로 생성 및 사용 가능한지 확인하는 단계; (e) 상기 (b) 내지 (d) 단계를 반복하여 결정된 최소 합성 배양배지 성분들을 인실리코 최소 합성 배양배지로 결정하는 단계; 및(f) 상기 결정된 인실리코 최소 합성 배양배지에 상기 진핵세포 또는 원핵세포를 실제 배양한 다음, 최종 배양배지를 결정하는 단계
2 2
제1항에 있어서, 상기 (f)단계는 상기 인실리코 최소 합성 배양배지에 특정 영양성분을 하나씩 추가하여 실제 배양함으로써 상기 진핵세포 또는 원핵세포의 최소 영양요구성을 확인한 다음, 최종 배양배지를 결정하는 것을 특징으로 하는 방법
3 3
제1항에 있어서, 상기 (f)단계 다음에 상기 진핵세포 또는 원핵세포의 성장에 필수적이지는 않으나 성장을 촉진하는 성분을 상기 배지에 추가하여 최종 배양배지를 결정하는 단계를 더 포함하는 것을 특징으로 하는 방법
4 4
제1항에 있어서, 상기 (b)단계의 인실리코 시뮬레이션은 포도당 또는 그 외의 탄소원을 포함하는 조건에서 수행하는 것을 특징으로 하는 방법
5 5
다음 단계를 포함하는 게놈정보 및 인실리코 분석을 이용한 숙신산 생산용 배양배지의 제조방법:(a) 숙신산 생성능을 가지는 진핵세포 또는 원핵세포의 게놈정보를 이용하여 대사회로를 구축하는 단계;(b) 상기 구축된 대사회로로부터 대사산물 중 하나를 제거하고, 인실리코(in silico) 시뮬레이션을 이용하여 대사 흐름 분석을 수행하는 단계;(c) 상기 인실리코 시뮬레이션 결과 목적 함수값이 0인 경우(여기서, 상기 목적함수는 상기 진핵세포 또는 원핵세포가 요구하는 구성성분을 어느 하나라도 생성하지 못하면 그 값을 0으로 함), 상기 제거된 대사산물을 최소 합성 배양배지 성분으로 결정하고, 목적 함수값이 0이 아니면 (b)단계로 회귀하는 단계;(d) 상기 대사산물을 스스로 합성하는 다른 생물종과의 비교를 통해 결실된 효소 및 해당 대사 반응식을 조사하여 해당 반응식이 존재하는 경우, 해당 대사산물을 외부에서 공급하지 않고도 내부적으로 생성 및 사용 가능한지 확인하는 단계; (e) 상기 (b) 내지 (d) 단계를 반복하여 결정된 최소 합성 배양배지 성분들을 인실리코 최소 합성 배양배지로 결정하는 단계; 및(f) 상기 결정된 인실리코 최소 합성 배양배지에 상기 숙신산 생성능을 가지는 진핵세포 또는 원핵세포를 실제 배양한 다음, 최종 배양배지를 결정하는 단계
6 6
제5항에 있어서, 상기 (f)단계는 상기 인실리코(in silico) 최소 합성 배양배지에 특정 영양성분을 하나씩 추가하여 실제 배양함으로써 상기 진핵세포 또는 원핵세포의 최소 영양요구성을 확인한 다음, 최종 배양배지를 결정하는 것을 특징으로 하는 방법
7 7
제5항에 있어서, 상기 (f)단계 다음에 상기 진핵세포 또는 원핵세포의 성장에 필수적이지는 않으나 성장을 촉진하는 성분을 상기 배지에 추가하여 최종 배양배지를 결정하는 단계를 더 포함하는 것을 특징으로 하는 방법
8 8
제5항에 있어서, (b)단계의 인실리코 시뮬레이션은 포도당 또는 그 외의 탄소원을 포함하는 조건에서 수행하는 것을 특징으로 하는 방법
9 9
제5항에 있어서, (a)단계의 숙신산 생성능을 가지는 원핵세포는 맨하이미아(Mannheimia) 속인 것을 특징으로 하는 방법
10 10
제9항에 있어서, 상기 맨하이미아(Mannheimia) 속은 맨하이미아 숙시니시프로듀슨스(Mannheimia succiniciproduces MBEL55E: KCTC 0769BP)인 것을 특징으로 하는 방법
11 11
제5항에 있어서, (b) 단계의 대사산물은 아미노산 또는 비타민인 것을 특징으로 하는 방법
12 12
제11항에 있어서, 상기 아미노산은 메티오닌(methionine) 또는 시스테인(cysteine)인 것을 특징으로 하는 방법
13 13
제11항에 있어서, 상기 비타민은 니코틴산(nicotinic acid), 판토테네이트(pantothenate), 피리독신(pyridoxine) 및 티아민(thiaimine)으로 구성된 군에서 선택된 하나 이상인 것을 특징으로 하는 방법
14 14
제7항에 있어서, 상기 성장을 촉진하는 성분은 아미노산, 비타민 및 핵산으로 구성된 군에서 선택된 어느 하나 이상인 것을 특징으로 하는 방법
15 15
제14항에 있어서, 상기 아미노산은 알라닌(alanine), 아스파라긴(asparagine), 글루타민산(glutamic acid), 히스티딘(histidine), 이소루신(isoleucine), 루신(leucine), 페닐알라닌(phenylalanine), 프롤린(proline), 트레오닌(threonine) 및 트립토판(tryptophane)으로 구성된 군에서 선택된 어느 하나 이상인 것을 특징으로 하는 방법
16 16
제14항에 있어서, 상기 비타민은 아스코빈산(ascorbic acid), 바이오틴(biotin) 및 폴산(folic acid)으로 구성된 군에서 선택된 어느 하나 이상인 것을 특징으로 하는 방법
17 17
제16항에 있어서, 상기 핵산은 우라실(uracil) 및 크산틴(xanthine)으로 구성된 군에서 선택되는 어느 하나 이상인 것을 특징으로 하는 방법
18 18
제5항 내지 제17항 중 어느 한 항의 방법으로 제조되고, 포도당 또는 포도당 이외의 탄소원, 메티오닌(methionine) 또는 시스테인(cysteine), 니코틴산(nicotinic acid), 판토테네이트(pantothenate), 피리독신(pyridoxine) 및 티아민(thiaimine)으로 구성된 군에서 선택되는 하나 이상의 비타민 및 핵산을 함유하는 숙신산 생산용 배양배지
19 19
제18항의 숙신산 생산용 배양배지를 이용하여 숙신산 생성능을 가지는 균주를 배양하고, 그 배양액으로부터 숙신산을 회수하는 것을 특징으로 하는 숙신산의 제조방법
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순번 패밀리번호 국가코드 국가명 종류
1 US07803587 US 미국 FAMILY
2 US20080003661 US 미국 FAMILY

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순번 패밀리번호 국가코드 국가명 종류
1 US2008003661 US 미국 DOCDBFAMILY
2 US7803587 US 미국 DOCDBFAMILY
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