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대용량 ＤＮＡ 시퀀스에서 반복적 인자 배열을 추출하는 시스템 및 방법

  • 기술번호 : KST2015115897
  • 담당센터 : 대전기술혁신센터
  • 전화번호 : 042-610-2279
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요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 반복 인자 배열을 추출하기 위하여, 입력되는 배열을 전처리하여 순방향 정보인 제1 정보와 역방향 정보인 제2 정보가 하나의 쌍으로 이루어진 복수의 입력 정보를 추출하는 전처리부; 전처리부가 추출한 입력 정보를 통해 반복 배열 인자에 대한 시드를 생성하는 시딩부; 및 시딩부가 생성한 시드를 이용하여 반복 인자 배열을 추출하는 확장부를 포함한다. 여기서 시딩부는, 미리 설정된 워드 길이에 따라 생성된 워드를 이용하여, 추출한 입력 정보로부터 룩업 테이블을 생성하는 워드 매칭부; 및 워드 매칭부에서 생성한 룩업 테이블의 워드를 이용하여 시드를 생성하는 시드 생성부를 포함한다.
Int. CL C12Q 1/68 (2006.01) G06F 19/10 (2011.01)
CPC G16B 40/00(2013.01) G16B 40/00(2013.01) G16B 40/00(2013.01)
출원번호/일자 1020120044901 (2012.04.27)
출원인 한국과학기술원
등록번호/일자 10-1400229-0000 (2014.05.21)
공개번호/일자 10-2013-0121576 (2013.11.06) 문서열기
공고번호/일자 (20140530) 문서열기
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보
법적상태 소멸
심사진행상태 수리
심판사항
구분 신규
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2012.04.27)
심사청구항수 9

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 한국과학기술원 대한민국 대전광역시 유성구

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 조동호 대한민국 대전 유성구
2 김우찬 대한민국 대전 유성구
3 신경섭 대한민국 대전 유성구

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 유미특허법인 대한민국 서울특별시 강남구 테헤란로 ***, 서림빌딩 **층 (역삼동)

최종권리자

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번호 이름 국적 주소
1 한국과학기술원 대전광역시 유성구
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번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 [특허출원]특허출원서
[Patent Application] Patent Application		 2012.04.27 수리 (Accepted) 1-1-2012-0341136-61
2 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2013.02.01 수리 (Accepted) 4-1-2013-5019983-17
3 선행기술조사의뢰서
Request for Prior Art Search		 2013.02.04 수리 (Accepted) 9-1-9999-9999999-89
4 선행기술조사보고서
Report of Prior Art Search		 2013.03.08 수리 (Accepted) 9-1-2013-0014727-41
5 의견제출통지서
Notification of reason for refusal		 2013.07.01 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2013-0455815-20
6 [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견(답변, 소명)서
[Opinion according to the Notification of Reasons for Refusal] Written Opinion(Written Reply, Written Substantiation)		 2013.08.30 수리 (Accepted) 1-1-2013-0794621-30
7 [명세서등 보정]보정서
[Amendment to Description, etc.] Amendment		 2013.08.30 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) 1-1-2013-0794622-86
8 의견제출통지서
Notification of reason for refusal		 2014.01.22 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2014-0050544-54
9 [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견(답변, 소명)서
[Opinion according to the Notification of Reasons for Refusal] Written Opinion(Written Reply, Written Substantiation)		 2014.03.18 수리 (Accepted) 1-1-2014-0260536-67
10 [명세서등 보정]보정서
[Amendment to Description, etc.] Amendment		 2014.03.18 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) 1-1-2014-0260550-07
11 등록결정서
Decision to grant		 2014.05.19 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2014-0336299-92
12 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2014.12.24 수리 (Accepted) 4-1-2014-5157968-69
13 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2014.12.24 수리 (Accepted) 4-1-2014-5157993-01
14 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2014.12.24 수리 (Accepted) 4-1-2014-5158129-58
15 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2019.04.24 수리 (Accepted) 4-1-2019-5081392-49
16 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2020.05.15 수리 (Accepted) 4-1-2020-5108396-12
17 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2020.06.12 수리 (Accepted) 4-1-2020-5131486-63
번호, 청구항의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 청구항 표입니다.
번호 청구항
1 1
반복 인자 배열을 추출하는 시스템에 있어서,입력되는 배열을 전처리하여, 순방향 정보인 제1 정보와 역방향 정보인 제2 정보가 하나의 쌍으로 이루어진 복수의 입력 정보를 추출하는 전처리부;상기 전처리부가 추출한 입력 정보를 통해 반복 배열 인자에 대한 시드를 생성하는 시딩부; 및상기 시딩부가 생성한 시드를 이용하여 반복 인자 배열을 추출하는 확장부를 포함하며, 상기 시딩부는,미리 설정된 워드 길이에 따라 생성된 워드를 이용하여, 상기 추출한 입력 정보로부터 룩업 테이블을 생성하는 워드 매칭부; 및상기 워드 매칭부에서 생성한 룩업 테이블의 워드를 이용하여 시드를 생성하는 시드 생성부를 포함하며,상기 시드 생성부는,제1 위치 데이터 및 상기 제1 위치 데이터와 상이한 위치에 존재하는 제2 위치 데이터에 동일한 워드가 발생하며, 상기 제1 위치 데이터와 제2 위치 데이터에 각각 제1 워드와 제2 워드가 동일하게 나타나고, 상기 제1 워드 및 제2 워드가 일부 겹치는 경우, 상기 제1 워드 및 제2 워드를 하나의 시드로 생성하고, 상기 제1 워드와 상기 제2 워드 사이에 삽입된 워드의 워드 수가 미리 설정한 임계값 보다 작은 경우 상기 제1 워드, 제2 워드 및 상기 삽입된 워드를 포함하여 하나의 시드로 생성하고, 상기 삽입된 워드 수가 미리 설정한 임계값 보다 크나, 삽입된 워드의 변경된 개수가 미리 설정한 변화 허용 임계값 보다 작은 경우 상기 제1 워드, 제2 워드 및 상기 삽입된 워드를 포함하여 하나의 시드로 생성하는 반복 인자 배열 추출 시스템
2 2
제1항에 있어서,상기 시딩부는,상기 시드 생성부에서 생성한 시드 및 상기 시드가 발생한 위치 정보를 저장하는 시드 저장부를 더 포함하는 반복 인자 배열 추출 시스템
3 3
제1항에 있어서,상기 시드 생성부는,상기 제1 정보에 대한 시드를 생성하는 제1 시드 생성부; 및상기 제2 정보에 대한 시드를 생성하는 제2 시드 생성부를 포함하는 반복 인자 배열 추출 시스템
4 4
삭제
5 5
제1항에 있어서,상기 룩업 테이블은 제1 룩업 테이블 및 제2 룩업 테이블을 포함하며,상기 제1 룩업 테이블은 임의의 워드와 동일한 형태를 나타내는 워드가 상기 입력 정보에 마지막으로 나타난 인덱스를 표시, 저장하며,상기 제2 룩업 테이블은 상기 임의의 워드와 동일한 형태를 나타내는 워드가 상기 제1 룩업 테이블에 저장한 마지막으로 나타난 인덱스 이전에 나타나는 인덱스를 표시, 저장하는 반복 인자 배열 추출 시스템
6 6
제1항에 있어서,상기 입력되는 배열은 염기 서열인 반복 인자 배열 추출 시스템
7 7
반복 인자 배열 추출 시스템이 입력되는 염기 서열로부터 반복 인자를 추출하는 방법에 있어서,입력되는 염기 서열로부터 입력 정보를 추출하는 단계;상기 추출한 입력 정보를 이용하여 룩업 테이블을 생성하는 단계;제1 위치 데이터와 제2 위치 데이터에 동일한 워드가 발생하고, 상기 워드는 제1 워드 및 제2 워드를 포함하며,상기 제1 워드와 제2 워드 간 간격이 발생하는지 판단하는 단계;상기 제1 워드와 제2 워드 사이에 간격이 발생하지 않으면, 상기 제1 워드와 제2 워드가 일부 중첩되는지 확인하는 단계;상기 제1 워드와 제2 워드가 일부 중첩되면 상기 제1 워드와 상기 제2 워드를 합쳐 시드로 생성하는 단계;상기 생성한 시드와 상기 시드가 발생한 상기 제1 위치 데이터 및 상기 제2 위치 데이터의 위치 정보를 저장하는 단계; 및상기 생성한 시드를 이용하여 반복 인자를 추출하는 단계를 포함하는 반복 인자 배열 추출 방법
8 8
제7항에 있어서,상기 룩업 테이블을 생성하는 단계는,임의의 워드가 상기 입력 정보에서 가장 마지막으로 나타나는 인덱스를 기재하는 제1 룩업 테이블을 생성하는 단계; 및상기 제1 룩업 테이블에 기재된 인덱스에 앞서 상기 임의의 워드가 나타나는 인덱스를 나타내는 제2 룩업 테이블을 생성하는 단계를 포함하는 반복 인자 배열 추출 방법
9 9
삭제
10 10
제7항에 있어서,상기 제1 워드와 제2 워드 간 간격이 발생하면,상기 발생한 간격이 미리 설정한 임계값 보다 작은지 판단하는 단계;상기 간격이 상기 임계값 보다 작으면, 상기 제1 워드, 제2 워드 및 상기 발생한 간격을 포함하여 시드로 생성하는 단계; 및상기 생성한 시드와 상기 시드가 발생한 상기 제1 위치 데이터 및 상기 제2 위치 데이터의 위치 정보를 저장하는 단계를 포함하는 반복 인자 배열 추출 방법
11 11
제10항에 있어서,상기 발생한 간격이 상기 임계값 보다 작은지 판단하는 단계에서,상기 간격이 상기 임계값 보다 크면, 상기 제1 위치 데이터에 존재하는 워드와 상기 제2 위치 데이터에 존재하는 워드의 차이가 미리 설정한 염기 변화를 허용할 임계값보다 작은지 판단하는 단계;상기 워드의 차이가 상기 임계값 보다 작으면, 상기 제1 워드, 제2 워드 및 상기 발생한 간격을 포함하여 시드로 생성하는 단계; 및상기 생성한 시드와 상기 시드가 발생한 상기 제1 위치 데이터 및 상기 제2 위치 데이터의 위치 정보를 저장하는 단계를 포함하는 반복 인자 배열 추출 방법
지정국 정보가 없습니다
패밀리정보가 없습니다
국가 R&D 정보가 없습니다.