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아미노산 또는 핵산 서열로부터 중요부위를 예측하기 위한 예측장치 및 예측방법

  • 기술번호 : KST2015115163
  • 담당센터 : 대전기술혁신센터
  • 전화번호 : 042-610-2279
요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 본 발명은 아미노산 또는 핵산 서열로부터 중요부위를 예측하기 위한 장치 및 예측방법에 관한 것으로, 구체적으로 아미노산 또는 핵산 서열이 입력되는 입력수단; 상기 입력수단에서 입력된 아미노산 또는 핵산 서열과 진화적으로 관련 있는 서열들을 검색하고 이들을 서로 정렬하는 다중서열정렬 수단; 아미노산 또는 핵산 서열의 정보가 저장된 서열 데이터베이스; 상기 다중서열정렬에 기초하여 유사한 서열의 중복성을 조정하는 다중서열정렬 후처리수단; 상기 다중서열정렬 후처리수단에 기초하여 서열 프로파일을 계산해주는 서열프로파일 계산수단; 상기 다중서열정렬 후처리수단과 상기 서열프로파일 계산수단에 기초하여 아미노산 또는 핵산의 결합 확률을 계산해주는 결합확률 계산수단; 상기 결합확률 계산수단에 기초하여 서열상의 서로 다른 위치 사이의 연관성을 측정하는 공진화 분석수단; 상기 공진화 분석수단에 기초하여 미지 서열의 중요부위를 예측하는 중요부위 선택수단; 및 상기 예측된 중요부위를 출력하는 출력수단;을 포함하여 이루어지는 아미노산 또는 핵산 서열로부터 중요부위를 예측하는 예측장치에 관한 것이다.
Int. CL G06F 19/10 (2011.01)
CPC G06F 19/22(2013.01) G06F 19/22(2013.01) G06F 19/22(2013.01)
출원번호/일자 1020110043545 (2011.05.09)
출원인 한국과학기술원
등록번호/일자 10-1317470-0000 (2013.10.04)
공개번호/일자 10-2012-0125846 (2012.11.19) 문서열기
공고번호/일자 (20131011) 문서열기
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보
법적상태 소멸
심사진행상태 수리
심판사항
구분 신규
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2011.05.09)
심사청구항수 13

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 한국과학기술원 대한민국 대전광역시 유성구

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 김동섭 대한민국 대전광역시 유성구
2 정찬석 대한민국 대전광역시 유성구
3 조광현 대한민국 대전광역시 유성구

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 이원희 대한민국 서울특별시 강남구 테헤란로 ***, 성지하이츠빌딩*차 ***호 (역삼동)

최종권리자

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번호 이름 국적 주소
1 한국과학기술원 대전광역시 유성구
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번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 [특허출원]특허출원서
[Patent Application] Patent Application
2011.05.09 수리 (Accepted) 1-1-2011-0342407-73
2 선행기술조사의뢰서
Request for Prior Art Search
2012.08.17 수리 (Accepted) 9-1-9999-9999999-89
3 선행기술조사보고서
Report of Prior Art Search
2012.09.19 수리 (Accepted) 9-1-2012-0072191-83
4 의견제출통지서
Notification of reason for refusal
2012.10.29 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2012-0646000-27
5 [지정기간연장]기간연장(단축, 경과구제)신청서
[Designated Period Extension] Application of Period Extension(Reduction, Progress relief)
2012.12.28 수리 (Accepted) 1-1-2012-1092097-27
6 [지정기간연장]기간연장(단축, 경과구제)신청서
[Designated Period Extension] Application of Period Extension(Reduction, Progress relief)
2013.01.29 수리 (Accepted) 1-1-2013-0085366-51
7 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2013.02.01 수리 (Accepted) 4-1-2013-5019983-17
8 [지정기간연장]기간연장(단축, 경과구제)신청서
[Designated Period Extension] Application of Period Extension(Reduction, Progress relief)
2013.02.28 수리 (Accepted) 1-1-2013-0182536-14
9 [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견(답변, 소명)서
[Opinion according to the Notification of Reasons for Refusal] Written Opinion(Written Reply, Written Substantiation)
2013.03.29 수리 (Accepted) 1-1-2013-0276504-91
10 [명세서등 보정]보정서
[Amendment to Description, etc.] Amendment
2013.03.29 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) 1-1-2013-0276506-82
11 등록결정서
Decision to grant
2013.07.31 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2013-0528906-77
12 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2014.12.24 수리 (Accepted) 4-1-2014-5157968-69
13 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2014.12.24 수리 (Accepted) 4-1-2014-5157993-01
14 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2014.12.24 수리 (Accepted) 4-1-2014-5158129-58
15 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2019.04.24 수리 (Accepted) 4-1-2019-5081392-49
16 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2020.05.15 수리 (Accepted) 4-1-2020-5108396-12
17 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2020.06.12 수리 (Accepted) 4-1-2020-5131486-63
번호, 청구항의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 청구항 표입니다.
번호 청구항
1 1
아미노산 또는 핵산 서열에 대한 미지서열이 입력되는 입력수단;아미노산 또는 핵산 서열의 정보가 저장된 서열 데이터베이스;상기 입력수단에서 입력된 아미노산 또는 핵산 서열을 상기 서열 데이터베이스에서 상동서열 검색하고 이들을 서로 정렬하는 다중서열정렬 수단;상기 다중서열정렬에 의해 정렬된 다중서열정렬에 기초하여 각 서열들 사이의 중복성을 처리하는 다중서열정렬 후처리수단;상기 다중서열정렬 후처리수단에 기초하여 서열 프로파일을 계산해주는 서열 프로파일 계산수단;상기 다중서열정렬 후처리수단과 서열 프로파일 계산수단에 기초하여 아미노산 또는 핵산의 결합확률을 계산해주는 결합확률 계산수단;상기 결합확률 계산수단에 기초하여 서열상의 서로 다른 위치 사이의 연관성을 측정하는 공진화 분석수단;상기 공진화 분석수단에 기초하여 미지서열의 중요부위를 예측하는 중요부위 선택수단; 및상기 중요부위 선택수단에 의해 예측된 중요부위를 출력하는 출력수단;을 포함하고, 상기 결합확률 계산수단은 서열프로파일에 기초하는 수도카운트와 가중치 합을 취하는 방법과 서열프로파일에 기초하는 주변확률을 제한조건으로 결합확률을 계산하는 방법으로 이루어진 군으로부터 선택되는 적어도 어느 하나의 방법을 취하는 것을 특징으로 하는 아미노산 또는 핵산 서열로부터 중요부위를 예측하기 위한 예측장치
2 2
삭제
3 3
제 1 항에 있어서,상기 다중서열정렬 후처리수단은 다중서열정렬에 포함된 각 서열들 사이의 중복성을 처리함에 있어서 각 서열의 가중치를 계산하거나 다중서열정렬의 독립적인 서열 수를 계산하는 것으로 이루어지는 군으로부터 선택되는 적어도 하나의 계산을 수행하는 것을 특징으로 하는 아미노산 또는 핵산 서열로부터 중요부위를 예측하기 위한 예측장치
4 4
제 1 항에 있어서,상기 서열프로파일 계산수단은 다중서열정렬로부터 각 위치의 아미노산 또는 핵산의 진화적 출현빈도를 통계확률적으로 나타내는 것을 특징으로 하는 아미노산 또는 핵산 서열로부터 중요부위를 예측하기 위한 예측장치
5 5
삭제
6 6
제 1 항에 있어서,아미노산 또는 핵산의 결합확률의 계산은 다음의 수학식에 의해 정의되는 것을 특징으로 하는 아미노산 또는 핵산 서열로부터 중요부위를 예측하기 위한 예측장치
7 7
제 1 항에 있어서,상기 주변확률을 제한조건은 다음의 수학식으로 정의되는 것을 특징으로 하는 아미노산 또는 핵산 서열로부터 중요부위를 예측하기 위한 예측장치
8 8
제 1 항에 있어서,상기 서열프로파일에 기초하는 주변확률을 제한조건으로 결합 확률을 계산하는 방법은 다음의 수학식에 의해 정의되는 것을 특징으로 하는 아미노산 또는 핵산 서열로부터 중요부위를 예측하기 위한 예측장치
9 9
입력수단을 통해 아미노산 또는 핵산 서열에 대한 미지서열을 입력하는 제 1 단계;상기 제 1 단계에서 입력된 상기 미지서열로부터 다중서열정렬 수단을 통해서 서열 데이터베이스를 검색하여 상동서열을 검색하고 다중서열정렬을 구성하는 제 2 단계;다중서열정렬 후처리수단을 통해 상기 다중서열정렬에 포함된 서열들 사이의 중복성을 제외시키기 위한 다중서열정렬 후처리 하는 제 3 단계;서열프로 파일계산수단을 통해 상기 다중서열정렬로부터 상기 제 3 단계의 결과에 기초하여 서열프로파일을 계산하는 제 4 단계;결합확률 계산수단을 통해 상기 제 3 단계 및 제 4 단계의 결과에 기초하여 아미노산 또는 핵산의 결합확률을 계산하는 제 5 단계;공진화 분석수단을 통해 상기 제 5 단계의 결합확률의 계산 결과에 기초하여 서열상의 각 위치 사이의 연관성을 계산하는 제 6 단계; 및중요부위 선택수단을 통해 상기 제 6 단계의 결과에 기초하여 서열상의 중요부위를 예측한 뒤 출력수단을 통해 상기 예측된 중요부위를 출력하는 제 7 단계;를 포함하고, 상기 제 4 단계의 결합확률 계산은 서열프로파일에 기초하는 수도카운트와 가중치 합을 취하는 방법과 서열프로파일에 기초하는 주변확률을 제한조건으로 결합 확률을 계산하는 방법으로 이루어지는 군으로부터 선택되는 적어도 하나의 방법을 취하는 것을 특징으로 하는 아미노산 또는 핵산 서열로부터 중요부위를 예측하는 예측방법
10 10
삭제
11 11
제 9 항에 있어서,상기 제 2 단계의 다중서열정렬 후처리는 다중서열정렬에 포함된 각 서열들 사이의 중복성을 처리함에 있어서 각 서열의 가중치를 계산하거나 다중서열정렬의 독립적인 서열 수를 계산하는 것으로 이루어지는 군으로부터 선택되는 적어도 하나의 계산을 수행하는 것을 특징으로 하는 아미노산 또는 핵산 서열로부터 중요부위를 예측하는 예측방법
12 12
제 9 항에 있어서,상기 제 3 단계의 서열 프로파일계산은 다중서열정렬로부터 각 위치의 아미노산 또는 핵산의 진화적 출현빈도를 통계확률적으로 나타내는 것을 특징으로 하는 아미노산 또는 핵산 서열로부터 중요부위를 예측하는 예측방법
13 13
삭제
14 14
제 9 항에 있어서,상기 제 4 단계에서, 아미노산 또는 핵산의 결합확률의 계산은 다음의 수학식에 의해 정의되는 것을 특징으로 하는 아미노산 또는 핵산 서열로부터 중요부위를 예측하는 예측방법
15 15
제 9 항에 있어서,상기 주변확률을 제한조건은 다음의 수학식으로 정의되는 것을 특징으로 하는 아미노산 또는 핵산 서열로부터 중요부위를 예측하는 예측방법
16 16
제 9 항에 있어서,상기 서열프로파일에 기초하는 주변확률을 제한조건으로 결합 확률을 계산하는 방법은 다음의 수학식에 의해 정의되는 것을 특징으로 하는 아미노산 또는 핵산 서열로부터 중요부위를 예측하는 예측방법
17 17
제 9 항, 제11항, 제 12항 또는 제 14항 내지 제 16 항 중 어느 한 항의 예측방법을 컴퓨터에서 실행시키기 위해 컴퓨터로 읽을 수 있는 기록매체
지정국 정보가 없습니다
패밀리정보가 없습니다
순번, 연구부처, 주관기관, 연구사업, 연구과제의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 국가R&D 연구정보 정보 표입니다.
순번 연구부처 주관기관 연구사업 연구과제
1 한국과학기술정보연구원 한국과학기술원 e-Science 연구환경 구축 바이오메디컬 응용을 위한 생체회로 시뮬레이션 IT융합플랫폼기술 개발