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특정 조건에서 특정 화합물이 반응을 나타내는 정도를 의미하는 활성도가 정량화되어 입력되어 있어서 특정 화합물에 대한 활성화 여부가 확인 가능한 활성화 데이터를 이용하는, 화합물 네트워크 데이터베이스 구축 방법으로서, (a) 식별 모듈이, 입력 모듈을 통해 입력된 한 쌍의 화합물의 식별자(ID1, ID2)를 각각 식별하는 단계; (b) 바이오어세이 선택 모듈이, 바이오어세이 데이터베이스에서 상기 식별자(ID1, ID2)에 해당하는 화합물이 포함된 각각의 다수의 바이오어세이들을 선택하는 단계; (c) 활성화 여부 확인 모듈이, 상기 활성화 데이터를 이용하여, 상기 선택된 각각의 다수의 바이오어세이들 각각에서 이에 대응하는 화합물에 대한 활성화 여부를 확인하는 단계; (d) 활성화 프로파일 연산 모듈이, 상기 선택된 각각의 다수의 바이오어세이들 중에서 여기에 각각 포함되는 상기 한 쌍의 화합물에 대하여 상기 (c) 단계에서 확인된 활성화 여부의 결과가 활성화인 것으로 확인된 바이오어세이들을 이용함으로써, 상기 입력된 한 쌍의 화합물의 유사도 점수(similarity score)를 연산하는 단계; (e) 상기 활성화 프로파일 연산 모듈이, 상기 연산된 유사도 점수가 기 설정된 기준값(cut-off value) 이상인 경우, 상기 한 쌍의 화합물이 유사한 것으로 판단하는 단계; 및(f) 상기 (e) 단계에서 판단된 유사 여부 및 상기 (d) 단계에서 연산된 유사도 점수가 화합물 네트워크 데이터베이스에 저장되는 단계를 포함하는, 화합물 네트워크 데이터베이스 구축 방법
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제 1 항에 있어서, 상기 (f) 단계 이후, (g) 다른 한 쌍의 화합물이 추가로 선택된 경우, 상기 선택된 다른 한 쌍의 화합물에 대하여 상기 (a) 내지 상기 (f) 단계가 반복되는 단계를 더 포함하는, 화합물 네트워크 데이터베이스 구축 방법
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제 2 항에 있어서, 상기 (g) 단계 이후, 반복된 상기 (a) 내지 상기 (f) 단계의 결과에 따라, 어느 하나의 화합물마다 각각 유사한 것으로 판단된 다른 하나 이상의 화합물과 비유사한 것으로 판단된 다른 하나 이상의 화합물이 상기 화합물 네트워크 데이터베이스에 저장되는, 화합물 네트워크 데이터베이스 구축 방법
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제 1 항에 있어서, 상기 (d) 단계는, 코사인 유사도(cosine similarity), 유클리디안 거리(Euclidean distance), 스칼라의 곱(inner product), 피어슨 계수(Pearson coefficient), 스피어만 계수(spearman coefficient), 상호 정보(mutual information), 자카드 유사도(Jaccard similarity), 및 타니모토 계수(Tanimoto coefficient) 중 어느 하나의 방법을 이용하여 수행되는,화합물 네트워크 데이터베이스 구축 방법
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제 1 항 내지 제 4 항 중 어느 한 항에 따른 화합물 네트워크 데이터베이스 구축 방법을 실행시키기 위한 프로그램을 기록한 컴퓨터로 읽을 수 있는 기록매체
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제 1 항 내지 제 4 항 중 어느 한 항에 따른 방법에 따라 구축된 상기 화합물 네트워크 데이터베이스를 이용한 약물 가상 탐색 방법으로서, (h) 상기 식별 모듈이, 상기 입력 모듈을 통해 입력된 화합물의 식별자(ID)를 식별하는 단계; 및(i) 탐색 모듈이, 상기 화합물 네트워크 데이터베이스에서 상기 식별자(ID)에 해당하는 화합물과 유사한 것으로 저장된 유사 화합물들을 탐색하는 단계를 포함하는, 약물 가상 탐색 방법
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제 6 항에 따른 약물 가상 탐색 방법을 실행시키기 위한 프로그램을 기록한 컴퓨터로 읽을 수 있는 기록매체
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제 1 항 내지 제 4 항 중 어느 한 항에 따른 방법에 따라 구축된 상기 화합물 네트워크 데이터베이스를 이용한 약물 가상 탐색 방법으로서, (h') 상기 식별 모듈이, 상기 입력 모듈을 통해 입력된 다수의 화합물의 식별자들(ID1~IDn)을 식별하는 단계; 및(i') 탐색 모듈이, 상기 화합물 네트워크 데이터베이스에서 상기 식별자들(ID1~IDn)에 해당하는 화합물들과 유사한 것으로 저장된 유사 화합물들을 모두 탐색하는 단계를 포함하는, 약물 가상 탐색 방법
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제 8 항에 있어서, 상기 (i') 단계 이후, (j) 네트워크 점수 연산 모듈이, 상기 유사 화합물들을 기준으로 상기 식별자들(ID1~IDn)에 해당하는 화합물들 각각과의 유사도 점수를 통합함으로써, 상기 유사 화합물들에 대한 네트워크 점수(network score)를 각각 연산하는 단계; 및(k) 출력 모듈이, 상기 유사 화합물들을 상기 연산된 네트워크 점수가 높은 순서에 따라 정렬하여, 정렬된 순서에 따라 상기 유사 화합물이 상기 (h') 단계에서 입력된 다수의 화합물과 더 유사한 화합물인 것으로 출력하는 단계를 더 포함하는, 약물 가상 탐색 방법
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제 9 항에 따른 약물 가상 탐색 방법을 실행시키기 위한 프로그램을 기록한 컴퓨터로 읽을 수 있는 기록매체
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특정 조건에서 특정 화합물이 반응을 나타내는 정도를 의미하는 활성도가 정량화되어 입력되어 있어서 특정 화합물에 대한 활성화 여부가 확인 가능한 활성화 데이터를 이용하는, 화합물 네트워크 데이터베이스 구축 시스템으로서, 화합물이 입력되는 입력 모듈; 상기 입력 모듈을 통해 입력된 화합물의 식별자를 식별하는 식별 모듈;바이오어세이 데이터베이스에서 식별자에 해당하는 화합물이 포함된 바이오어세이들을 각각 다수 선택하는 바이오어세이 선택 모듈; 상기 활성화 데이터를 이용하여, 상기 선택된 바이오어세이들이 해당 화합물에 대하여 활성화인지 여부를 확인하는 활성화 여부 확인 모듈; 한 쌍의 화합물이 상기 입력 모듈을 통하여 입력된 경우, 상기 바이오어세이 선택 모듈에서 이에 대응되게 선택된 각각의 다수의 바이오어세이들 중에서 여기에 각각 포함된 상기 한 쌍의 화합물에 대한 활성화 여부를 이용하여 상기 입력된 한 쌍의 화합물의 유사도 점수(similarity score)를 연산하고, 상기 연산된 유사도 점수가 기 설정된 기준값 이상인 경우 상기 입력된 한 쌍의 화합물이 유사한 것으로 판단하는, 활성화 프로파일 연산 모듈; 및상기 활성화 프로파일 연산 모듈에서 연산된 유사도 점수와 판단된 유사 여부가 저장되는 화합물 네트워크 데이터베이스를 포함하는, 화합물 네트워크 데이터베이스 구축 시스템
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제 11 항에 있어서, 상기 활성화 프로파일 연산 모듈은, 코사인 유사도(cosine similarity), 유클리디안 거리(Euclidean distance), 스칼라의 곱(inner product), 피어슨 계수(Pearson coefficient), 스피어만 계수(spearman coefficient), 상호 정보(mutual information), 자카드 유사도(Jaccard similarity), 및 타니모토 계수(Tanimoto coefficient) 중 어느 하나의 방법을 이용하여 유사도 점수를 연산하는,화합물 네트워크 데이터베이스 구축 시스템
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제 11 항 또는 제 12 항에 따른 화합물 네트워크 데이터베이스 구축 시스템에서 구축된 상기 화합물 네트워크 데이터베이스; 및어느 하나의 화합물이 상기 입력 모듈을 통하여 입력된 경우, 상기 화합물 네트워크 데이터베이스에서 상기 입력된 화합물과 유사한 것으로 저장된 유사 화합물들을 탐색하는 탐색 모듈을 포함하는, 약물 가상 탐색 시스템
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제 11 항 또는 제 12 항에 따른 화합물 네트워크 데이터베이스 구축 시스템에서 구축된 상기 화합물 네트워크 데이터베이스; 및다수의 화합물이 상기 입력 모듈을 통하여 입력된 경우, 상기 화합물 네트워크 데이터베이스에서 상기 입력된 다수의 화합물과 유사한 것으로 저장된 유사 화합물들을 탐색하는 탐색 모듈을 포함하는, 약물 가상 탐색 시스템
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제 14 항에 있어서, 상기 유사 화합물들을 기준으로 상기 식별자들(ID1~IDn)에 해당하는 화합물들 각각과의 유사도 점수를 통합함으로써, 상기 유사 화합물들에 대한 네트워크 점수를 각각 연산하는, 네트워크 점수 연산 모듈; 및상기 유사 화합물들을 상기 연산된 네트워크 점수가 높은 순서에 따라 정렬하여, 정렬된 순서에 따라 상기 유사 화합물이 상기 입력 모듈에 입력된 다수의 화합물과 더 유사한 화합물인 것으로 출력하는 출력 모듈을 더 포함하는, 약물 가상 탐색 시스템
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