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자기주의 기반 심층 신경망 모델을 이용한 약물-표적 상호작용 예측 장치 및 그 방법

  • 기술번호 : KST2022004094
  • 담당센터 : 광주기술혁신센터
  • 전화번호 : 062-360-4654
요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 본 발명은 딥 러닝을 이용한 약물-표적 단백질 상호작용 예측에 관한 것으로 본 발명에 따른 약물-표적 상호작용 예측 장치 및 방법은 약물과 단백질 사이의 상호작용 여부 뿐 아니라 약물과 단백질의 바인딩 영역을 함께 이용하여 트랜스포머 네트워크를 학습하고 어텐션 스코어를 사용하는 트랜스포머 네트워크를 이용하여 DTI와 바인딩 영역을 예측함으로써 DTI 예측 성능을 높일 수 있는 효과가 있다.
Int. CL G16C 20/30 (2019.01.01) G16C 20/70 (2019.01.01) G16C 20/50 (2019.01.01) G16B 35/00 (2019.01.01) G16C 20/60 (2019.01.01) G06N 20/00 (2019.01.01) G06N 3/08 (2006.01.01)
CPC G16C 20/30(2013.01) G16C 20/70(2013.01) G16C 20/50(2013.01) G16B 35/00(2013.01) G16C 20/60(2013.01) G06N 20/00(2013.01) G06N 3/08(2013.01)
출원번호/일자 1020210014357 (2021.02.01)
출원인 광주과학기술원
등록번호/일자 10-2388215-0000 (2022.04.14)
공개번호/일자
공고번호/일자 (20220419) 문서열기
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보
법적상태 등록
심사진행상태 수리
심판사항
구분 국내출원/신규
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2021.02.01)
심사청구항수 8

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 광주과학기술원 대한민국 광주광역시 북구

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 남호정 광주광역시 북구
2 이인구 광주광역시 북구

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 특허법인이룸리온 대한민국 서울특별시 서초구 사평대로 ***, *층 (반포동)

최종권리자

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번호 이름 국적 주소
1 광주과학기술원 광주광역시 북구
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번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 [특허출원]특허출원서
[Patent Application] Patent Application
2021.02.01 수리 (Accepted) 1-1-2021-0130726-17
2 보정요구서
Request for Amendment
2021.02.04 발송처리완료 (Completion of Transmission) 1-5-2021-0021318-51
3 [출원서 등 보정]보정서
[Amendment to Patent Application, etc.] Amendment
2021.02.05 수리 (Accepted) 1-1-2021-0154068-23
4 [우선심사신청]심사청구서·우선심사신청서
2021.06.21 수리 (Accepted) 1-1-2021-0714643-57
5 [우선심사신청]선행기술조사의뢰서
[Request for Preferential Examination] Request for Prior Art Search
2021.06.24 수리 (Accepted) 9-1-9999-9999999-89
6 [우선심사신청]선행기술조사보고서
[Request for Preferential Examination] Report of Prior Art Search
2021.06.30 수리 (Accepted) 9-1-2021-0009547-88
7 의견제출통지서
Notification of reason for refusal
2021.11.03 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2021-0869831-71
8 [명세서등 보정]보정서
[Amendment to Description, etc.] Amendment
2021.12.15 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) 1-1-2021-1455102-49
9 [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견서·답변서·소명서
2021.12.15 수리 (Accepted) 1-1-2021-1455103-95
10 등록결정서
Decision to grant
2022.03.07 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2022-0180396-29
11 [분할출원]특허출원서
[Divisional Application] Patent Application
2022.04.13 접수중 (On receiving) 1-1-2022-0393055-69
번호, 청구항의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 청구항 표입니다.
번호 청구항
1 1
하나 이상의 프로세서 및 메모리를 포함하는 제어부에 의해 수행되는 약물-표적 상호작용 예측 방법에 있어서:(a) 약물 지문과 상기 약물 지문이 결합하는 단백질 서열의 바인딩 영역에 관한 정보를 포함하는 단백질 서열 데이터베이스에 의해 자기주의 기반 심층 신경망을 이용하여 트랜스포머(Transformer) 네트워크를 학습하는 단계;(b) 약물 지문을 덴스(Dense) 레이어에 통과시켜 약물 토큰으로 변환하는 단계;(c) 단백질 서열을 컨벌루션 연산한 후 일정한 단위 그리드로 나누어 맥스 풀링(Max Pooling)하여 단백질 그리드 인코딩으로 변환하는 단계;(d) 상기 약물 토큰과 단백질 그리드 인코딩을 연결하는 단계;(e) 상기 연결된 약물 토큰과 단백질 그리드 인코딩을 상기 트랜스포머 네트워크에 입력하는 단계; 및(f) 상기 트랜스포머 네트워크의 출력에 의해 상기 약물 지문이 결합하는 상기 단백질 서열의 바인딩 영역의 중심, 바인딩 영역의 폭, 바인딩 영역에서의 바인딩 확률을 포함하는 바인딩 영역에 관한 정보를 예측하는 단계; 및 (g) 상기 예측된 바인딩 영역에 관한 정보에 기반하여 약물과 표적 단백질의 상호작용을 예측하는 단계;를 포함하는, 자기주의 기반 심층 신경망을 이용한 약물-표적 상호작용 예측 방법
2 2
제1항에 있어서,상기 약물 지문은 모르간(Morgan) 알고리즘에 의해 해쉬된 모르간 지문인 것을 특징으로 하는, 자기주의 기반 심층 신경망을 이용한 약물-표적 상호작용 예측 방법
3 3
삭제
4 4
제1항에 있어서,상기 (a)단계에서 상기 바인딩 영역에 관한 정보 중 바인딩 사이트(Site)를 상기 바인딩 사이트의 인근 서열까지 포함하는 바인딩 영역(Region)으로 변환하여 상기 트랜스포머(Transformer) 네트워크를 학습하는 것을 특징으로 하는, 자기주의 기반 심층 신경망을 이용한 약물-표적 상호작용 예측 방법
5 5
제1항에 있어서,상기 (c)단계는 CNN(Convolution Neural Network)을 이용하여 단백질 서열을 컨벌루션 연산하는 것을 특징으로 하는, 자기주의 기반 심층 신경망을 이용한 약물-표적 상호작용 예측 방법
6 6
제1항에 있어서,상기 약물 토큰과 상기 단위 그리드는 동일한 길이를 가지는 것을 특징으로 하는, 자기주의 기반 심층 신경망을 이용한 약물-표적 상호작용 예측 방법
7 7
제1항에 있어서,상기 (e)단계는 상기 연결된 약물 토큰과 단백질 그리드 인코딩을 각각 Q(Query), K(Key), V(Value) 벡터로 변환하여 상기 트랜스포머 네트워크에 입력하는 것을 특징으로 하는, 자기주의 기반 심층 신경망을 이용한 약물-표적 상호작용 예측 방법
8 8
제1항에 있어서,상기 트랜스포머 네트워크는 둘 이상의 트랜스포머 네트워크로 구성되는 것을 특징으로 하는, 자기주의 기반 심층 신경망을 이용한 약물-표적 상호작용 예측 방법
9 9
제1항에 있어서,상기 (g)단계는 상기 약물과 상기 단백질 그리드 인코딩 사이의 어텐션 스코어를 이용하여 상기 약물과 상기 단백질 사이의 관련성을 예측하는 것을 특징으로 하는, 자기주의 기반 심층 신경망을 이용한 약물-표적 상호작용 예측 방법
지정국 정보가 없습니다
패밀리정보가 없습니다
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1 과학기술정보통신부 광주과학기술원 중견연구 설명가능 인공지능 기반 약물 후보의 독성 및 부작용 예측 시스템 개발