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유전자 상동성 정보를 이용한 유전자 리스트의 생체패스웨이 할당 장치 및 그 방법

  • 기술번호 : KST2015082792
  • 담당센터 : 대전기술혁신센터
  • 전화번호 : 042-610-2279
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요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 1. 청구범위에 기재된 발명이 속한 기술분야 본 발명은, 유전자 상동성 정보를 이용한 유전자 리스트의 생체 패스웨이 할당 장치 및 그 방법에 관한 것임. 2. 발명이 해결하려고 하는 기술적 과제 본 발명은, 대상 종의 유전자 리스트 중에서 비교 종과 상동성(HomoloGene) 정보를 갖는 유전자들, 또는 비교 종에는 존재하지 않고 대상 종에만 존재하는 유전자들을 선별한 후, 상기 유전자들과 GO(Gene Ontology) 및 KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes) 용어 사이의 통계적인 유의성을 갖는 용어를 검출하여, 유전자 리스트들이 참여하고 있는 생체 패스웨이로 할당하기 위한, 유전자 상동성 정보를 이용한 유전자 리스트의 생체 패스웨이 할당 장치 및 그 방법을 제공하는데 그 목적이 있음. 3. 발명의 해결방법의 요지 본 발명은, 유전자 상동성 정보를 이용한 유전자 리스트의 생체 패스웨이 할당 장치에 있어서, 대상 종의 유전자 리스트 중에서 비교 종과 상동성(HomoloGene)을 갖는 유전자들 또는 상기 비교 종에는 포함되어 있지 않은 유전자들을 선별하여 상동성 및 유일성 유전자 리스트를 생성하기 위한 상동성 및 유일성 유전자 리스트 생성수단; 상기 상동성 및 유일성 유전자 리스트 생성수단에서 생성한 상동성 및 유일성 유전자 리스트에 GO(Gene Ontology) 용어 및 KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes) 용어를 각각 할당하기 위한 용어 할당수단; 상기 용어 할당수단을 통해 해당 GO 용어 및 KEGG 용어를 할당한 상동성 및 유일성 유전자 리스트에서 GO 용어 및 KEGG 용어별로 초 기하 분포(hyper-geometric distribution) 유의 확률을 계산하기 위한 통계적 유의 확률 계산수단; 및 상기 초 기하 분포 유의 확률이 계산된 상동성 및 유일성 유전자 리스트 별로 최소의 초 기하 분포 유의 확률값을 갖는 GO 용어 및 KEGG 용어를 선별하여 해당 유전자 리스트의 생체 패스웨이로 할당하기 위한 생체 패스웨이 할당수단을 포함함. 4. 발명의 중요한 용도 본 발명은 유전자 칩 분석 등에 이용됨. 유전자 칩, 상동성(HomoloGene), 유일성, GO 용어, KEGG 용어, 통계적 유의 확률, 생체 패스웨이
Int. CL G06F 9/455 (2006.01) G01N 33/48 (2006.01)
CPC G06F 19/18(2013.01) G06F 19/18(2013.01) G06F 19/18(2013.01)
출원번호/일자 1020070046719 (2007.05.14)
출원인 한국전자통신연구원
등록번호/일자 10-0897523-0000 (2009.05.07)
공개번호/일자 10-2008-0052193 (2008.06.11) 문서열기
공고번호/일자 (20090515) 문서열기
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보 대한민국  |   1020060122475   |   2006.12.05
법적상태 소멸
심사진행상태 수리
심판사항
구분
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2007.05.14)
심사청구항수 6

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 한국전자통신연구원 대한민국 대전광역시 유성구

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 김보라 대한민국 대전 유성구
2 정호열 대한민국 대전 유성구
3 김민호 대한민국 대전 유성구
4 정명근 대한민국 인천 동구
5 박수준 대한민국 서울 강남구
6 박선희 대한민국 대전 서구

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 신성특허법인(유한) 대한민국 서울특별시 송파구 중대로 ***, ID타워 ***호 (가락동)

최종권리자

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번호 이름 국적 주소
1 한국전자통신연구원 대한민국 대전광역시 유성구
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번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 특허출원서
Patent Application		 2007.05.14 수리 (Accepted) 1-1-2007-0355057-62
2 선행기술조사의뢰서
Request for Prior Art Search		 2007.11.06 수리 (Accepted) 9-1-9999-9999999-89
3 선행기술조사보고서
Report of Prior Art Search		 2007.12.05 수리 (Accepted) 9-1-2007-0074209-01
4 의견제출통지서
Notification of reason for refusal		 2008.10.28 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2008-0547460-33
5 [명세서등 보정]보정서
[Amendment to Description, etc.] Amendment		 2008.12.10 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) 1-1-2008-0850030-08
6 [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견(답변, 소명)서
[Opinion according to the Notification of Reasons for Refusal] Written Opinion(Written Reply, Written Substantiation)		 2008.12.10 수리 (Accepted) 1-1-2008-0850032-99
7 등록결정서
Decision to grant		 2009.04.28 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2009-0179220-40
8 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2009.08.04 수리 (Accepted) 4-1-2009-5150899-36
9 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2015.02.02 수리 (Accepted) 4-1-2015-0006137-44
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번호 청구항
1 1
유전자 상동성 정보를 이용한 유전자 리스트의 생체 패스웨이 할당 장치에 있어서, 대상 종의 유전자 리스트 중에서 비교 종과 상동성(HomoloGene)을 갖는 유전자들 또는 상기 비교 종에는 포함되어 있지 않은 유전자들을 선별하여 상동성 및 유일성 유전자 리스트를 생성하기 위한 상동성 및 유일성 유전자 리스트 생성수단; 상기 상동성 및 유일성 유전자 리스트 생성수단에서 생성한 상동성 및 유일성 유전자 리스트에 GO(Gene Ontology) 용어 및 KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes) 용어를 각각 할당하기 위한 용어 할당수단; 상기 용어 할당수단을 통해 해당 GO 용어 및 KEGG 용어를 할당한 상동성 및 유일성 유전자 리스트에서 GO 용어 및 KEGG 용어별로 초 기하 분포(hyper-geometric distribution) 유의 확률을 계산하기 위한 통계적 유의 확률 계산수단; 및 상기 통계적 유의 확률 계산수단에 의해 상기 초 기하 분포 유의 확률이 계산된 상동성 및 유일성 유전자 리스트별로 최소의 초 기하 분포 유의 확률값을 갖는 GO 용어 및 KEGG 용어를 선별하여 해당 유전자 리스트의 생체 패스웨이로 할당하기 위한 생체 패스웨이 할당수단 을 포함하는 유전자 상동성 정보를 이용한 유전자 리스트의 생체 패스웨이 할당 장치
2 2
제 1 항에 있어서, 상기 상동성 및 유일성 유전자 리스트 생성수단은, 18개의 종에 대한 상동성(HomoloGene) 데이터를 이용하여 상동성 유전자 리스트 또는 유일성 유전자 리스트를 생성하는 것을 특징으로 하는 유전자 상동성 정보를 이용한 유전자 리스트의 생체 패스웨이 할당 장치
3 3
제 1 항 또는 제 2 항에 있어서, 상기 통계적 유의 확률 계산수단은, 하기의 [수학식 A]를 통해 n개의 유전자로 이루어진 클러스터 내에서 주어진 GO 용어 및 KEGG 용어를 주석으로 가지는 유전자의 개수가 k개 이상인 경우의 확률(p)을 계산하는 것을 특징으로 하는 유전자 상동성 정보를 이용한 유전자 리스트의 생체 패스웨이 할당 장치
4 4
유전자 상동성 정보를 이용한 유전자 리스트의 생체 패스웨이 할당 방법에 있어서, 대상 종의 유전자 리스트 중에서 비교 종과 상동성(HomoloGene)을 갖는 유전자들을 선별하거나, 비교 종에는 포함되어 있지 않은 유전자들을 선별하여 유전자 리스트를 생성하는 유전자 리스트 생성단계; 상기 생성한 유전자 리스트에 GO(Gene Ontology) 용어 및 KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes) 용어를 각각 할당하는 단계; 상기 GO 용어 및 KEGG 용어가 할당된 유전자 리스트에서 GO 용어 및 KEGG 용어별로 초 기하 분포(hyper-geometric distribution) 유의 확률을 계산하는 통계적 유의 확률 계산단계; 및 상기 초 기하 분포 유의 확률이 계산된 상동성 및 유일성 유전자 리스트 별로 최소의 초 기하 분포 유의 확률값을 갖는 GO 용어 및 KEGG 용어를 선별하여 해당 유전자 리스트의 생체 패스웨이로 할당하는 단계 를 포함하는 유전자 상동성 정보를 이용한 유전자 리스트의 생체 패스웨이 할당 방법
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제 4 항에 있어서, 상기 유전자 리스트 생성단계는, 18개의 종에 대한 상동성(HomoloGene) 데이터를 이용하여 유전자 리스트를 생성하는 것을 특징으로 하는 유전자 상동성 정보를 이용한 유전자 리스트의 생체 패스웨이 할당 방법
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제 4 항 또는 제 5 항에 있어서, 상기 통계적 유의 확률 계산단계는, 하기의 [수학식 B]를 통해 n개의 유전자로 이루어진 클러스터 내에서 주어진 GO 용어 및 KEGG 용어를 주석으로 가지는 유전자의 개수가 k개 이상인 경우의 확률(p)을 계산하는 것을 특징으로 하는 유전자 상동성 정보를 이용한 유전자 리스트의 생체 패스웨이 할당 방법
지정국 정보가 없습니다
패밀리정보가 없습니다
국가 R&D 정보가 없습니다.