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온톨로지 매핑을 이용한 단백질 이름 정규화 방법

  • 기술번호 : KST2015093032
  • 담당센터 : 대전기술혁신센터
  • 전화번호 : 042-610-2279
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요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 본 발명은 단백질 이름 정규화 방법에 관한 것으로, 보다 상세하게는 온톨로지 매핑을 이용한 단백질 이름 정규화 방법 및 장치에 관한 것이다.본 발명은 생물학 문헌을 입력받아 단백질 개체명을 추출하는 단계; 상기 추출된 단백질 개체명과 온톨로지를 통해서 구축된 동의어 사전과의 유사도를 계산하여 단백질 코드를 분석하는 단계; 소정 종분류 학습모델을 이용하여 상기 생물학 문헌에 포함된 단백질의 종 정보를 분류하는 단계; 및 상기 분석된 단백질 코드 및 상기 분류된 종 정보를 통합하여 온톨로지 ID를 할당하는 단계를 포함하는 온톨로지 매핑을 이용한 단백질 이름 정규화 방법을 개시한다. 단백질 이름 정규화, 온톨로지, 생물학 문헌
Int. CL G06F 17/00 (2011.01) G06F 17/30 (2011.01) G06F 19/28 (2011.01)
CPC
출원번호/일자 1020060095817 (2006.09.29)
출원인 한국전자통신연구원
등록번호/일자 10-0849497-0000 (2008.07.24)
공개번호/일자 10-2008-0030138 (2008.04.04) 문서열기
공고번호/일자 (20080731) 문서열기
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보
법적상태 소멸
심사진행상태 수리
심판사항 심판사항
구분
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2006.09.29)
심사청구항수 5

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 한국전자통신연구원 대한민국 대전광역시 유성구

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 임준호 대한민국 대전광역시 유성구
2 장현철 대한민국 대전광역시 서구
3 임재수 대한민국 대전광역시 유성구
4 박수준 대한민국 서울특별시 강남구
5 박선희 대한민국 대전광역시 서구

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 신성특허법인(유한) 대한민국 서울특별시 송파구 중대로 ***, ID타워 ***호 (가락동)

최종권리자

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번호 이름 국적 주소
1 아이티지에스 주식회사 서울특별시 금천구
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번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 특허출원서
Patent Application		 2006.09.29 수리 (Accepted) 1-1-2006-0715745-76
2 선행기술조사의뢰서
Request for Prior Art Search		 2007.06.07 수리 (Accepted) 9-1-9999-9999999-89
3 선행기술조사보고서
Report of Prior Art Search		 2007.07.11 수리 (Accepted) 9-1-2007-0040073-47
4 의견제출통지서
Notification of reason for refusal		 2007.10.30 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2007-0586924-30
5 [명세서등 보정]보정서
[Amendment to Description, etc.] Amendment		 2007.12.26 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) 1-1-2007-0931181-71
6 [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견(답변, 소명)서
[Opinion according to the Notification of Reasons for Refusal] Written Opinion(Written Reply, Written Substantiation)		 2007.12.26 수리 (Accepted) 1-1-2007-0931184-18
7 거절결정서
Decision to Refuse a Patent		 2008.04.29 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2008-0230266-36
8 명세서 등 보정서(심사전치)
Amendment to Description, etc(Reexamination)		 2008.05.26 보정승인 (Acceptance of amendment) 7-1-2008-0022323-11
9 등록결정서
Decision to grant		 2008.07.21 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2008-0381704-30
10 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2009.08.04 수리 (Accepted) 4-1-2009-5150899-36
11 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2015.02.02 수리 (Accepted) 4-1-2015-0006137-44
번호, 청구항의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 청구항 표입니다.
번호 청구항
1 1
온톨로지 매핑을 이용한 단백질 이름 정규화 방법으로서,생물학 문헌을 입력받아 단백질 개체명을 추출하는 단계;상기 추출된 단백질 개체명과 온톨로지를 통해서 구축된 동의어 사전과의 유사도를 계산하여 단백질 코드를 분석하는 단계;단백질 종분류 학습모델을 이용하여 상기 생물학 문헌에 포함된 단백질의 종 정보를 분류하는 단계; 및상기 분석된 단백질 코드 및 상기 분류된 종 정보를 통합하여 온톨로지 ID를 할당하는 단계를 포함하는 온톨로지 매핑을 이용한 단백질 이름 정규화 방법
2 2
제1항에 있어서, 상기 단백질 코드를 분석하는 단계는,상기 추출된 단백질 개체명이 약어인 경우 원 단백질 이름을 복원하는 과정을 거친 후에 수행되는 것을 특징으로 하는 온톨로지 매핑을 이용한 단백질 이름 정규화 방법
3 3
제 1항에 있어서, 상기 단백질 코드를 분석하는 단계는,단백질 코드와 각 단백질 코드별로의 동의어 리스트를 갖는 동의어 사전을 구축하는 과정과,상기 동의어별 텀리스트를 생성하는 과정과,상기 텀리스트를 이용하여 상기 동의어 사전의 역색인 구조를 생성하는 과정과,상기 문헌에서 인식된 단백질 개체명과 상기 동의어 사전의 역색인 구조를 비교하여 가장 유사도가 높은 단백질 코드를 할당하는 과정을 포함하는 것을 특징으로 하는 온톨로지 매핑을 이용한 단백질 이름 정규화 방법
4 4
제3항에 있어서, 가장 유사도가 높은 단백질 코드가 복수인 경우, 단백질 개체명에 필수적으로 이용되는 단어를 포함하고 있는 단백질 코드를 우선 할당하거나, 상기 생물학 문헌내의 타 단백질 코드로 분석된 단백질 코드를 우선순위로 할당하는 것을 특징으로 하는 온톨로지 매핑을 이용한 단백질 이름 정규화 방법
5 5
제1항 내지 제4항 중 어느 한 항에 있어서, 단백질의 종 정보를 분류하는 단계는,온톨로지에 등록된 문헌을 종 별로 구축하여 기계학습 기법의 학습집합으로 사용하여 문헌단위 종 분류를 수행함을 특징으로 하는 온톨로지 매핑을 이용한 단백질 이름 정규화 방법
6 6
삭제
7 7
삭제
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순번 패밀리번호 국가코드 국가명 종류
1 US20080082483 US 미국 FAMILY

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순번 패밀리번호 국가코드 국가명 종류
1 US2008082483 US 미국 DOCDBFAMILY
국가 R&D 정보가 없습니다.