맞춤기술찾기

홈으로 가기
맞춤기술찾기
이전대상기술
프린트하기

이전대상기술

특이 결합부위 자동추출을 이용한 리간드 검색 장치 및 그방법

  • 기술번호 : KST2015081871
  • 담당센터 : 대전기술혁신센터
  • 전화번호 : 042-610-2279
상담신청 PDF 받기
요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 1. 청구범위에 기재된 발명이 속한 기술분야본 발명은 특이 결합부위 자동추출을 이용한 리간드 검색 장치 및 그 방법에 관한 것임.2. 발명이 해결하려고 하는 기술적 과제본 발명은 단백질 결합부위들 간의 서열과 함께 구조를 탐색하거나 단백질 결합부위들 간의 구조를 탐색한 후에 자동으로 특이결합부위를 추출하여 리간드를 검색함으로써, 선택성이 높은 약을 설계할 수 있고, 단백질 구조 기반 신약 설계 과정을 좀더 편리하고 신속하게 수행할 수 있도록 하기 위한, 특이 결합부위 자동추출을 이용한 리간드 검색 장치 및 그 방법을 제공하는데 그 목적이 있음.3. 발명의 해결방법의 요지본 발명은, 리간드 검색 장치에 있어서, 입력 데이터를 처리하기 위한 입력 데이터 처리부; 상기 입력 데이터 처리부로부터의 데이터에서 결합부위를 추출하기 위한 결합부위 추출부; 비교 방식을 사용자가 선택할 수 있도록 지원하기 위한 사용자 선택 입력부; 상기 사용자 선택 입력부의 선택 정보에 따라 목표 단백질의 결합부위와 데이터베이스의 단백질의 유사결합부위를 비교하여 추출하기 위한 유사결합부위 비교부; 및 상기 유사결합부위 비교부로부터의 특이결합부위에 대하여 가상 스크리닝을 수행하여 리간드를 검색하기 위한 리간드 검색부를 포함함.4. 발명의 중요한 용도본 발명은 구조 기반 신약 설계(Structure based drug design) 등에 이용됨.리간드 검색, 특이 결합부위 자동추출, 유사결합부위 구조탐색
Int. CL G06F 17/30 (2011.01) G06F 19/28 (2011.01)
CPC
출원번호/일자 1020060121753 (2006.12.04)
출원인 한국전자통신연구원
등록번호/일자 10-0839600-0000 (2008.06.12)
공개번호/일자 10-2008-0050884 (2008.06.10) 문서열기
공고번호/일자 (20080619) 문서열기
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보
법적상태 소멸
심사진행상태 수리
심판사항
구분
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2006.12.04)
심사청구항수 16

출원인

번호, 이름, 국적, 주소의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 인명정보 - 출원인 표입니다.
번호 이름 국적 주소
1 한국전자통신연구원 대한민국 대전광역시 유성구

발명자

번호, 이름, 국적, 주소의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 인명정보 - 발명자 표입니다.
번호 이름 국적 주소
1 박성희 대한민국 대전 유성구
2 박찬용 대한민국 대전 유성구
3 김대희 대한민국 대전 서구
4 박수준 대한민국 서울 강남구
5 박선희 대한민국 대전 서구

대리인

번호, 이름, 국적, 주소의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 인명정보 - 대리인 표입니다.
번호 이름 국적 주소
1 신성특허법인(유한) 대한민국 서울특별시 송파구 중대로 ***, ID타워 ***호 (가락동)

최종권리자

번호, 이름, 국적, 주소의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 인명정보 - 최종권리자 표입니다.
번호 이름 국적 주소
1 한국전자통신연구원 대한민국 대전광역시 유성구
번호, 서류명, 접수/발송일자, 처리상태, 접수/발송일자의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 행정처리 표입니다.
번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 특허출원서
Patent Application		 2006.12.04 수리 (Accepted) 1-1-2006-0899141-79
2 선행기술조사의뢰서
Request for Prior Art Search		 2007.08.03 수리 (Accepted) 9-1-9999-9999999-89
3 선행기술조사보고서
Report of Prior Art Search		 2007.09.17 수리 (Accepted) 9-1-2007-0056893-88
4 의견제출통지서
Notification of reason for refusal		 2007.12.05 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2007-0660864-14
5 [명세서등 보정]보정서
[Amendment to Description, etc.] Amendment		 2008.01.10 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) 1-1-2008-0022367-24
6 [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견(답변, 소명)서
[Opinion according to the Notification of Reasons for Refusal] Written Opinion(Written Reply, Written Substantiation)		 2008.01.10 수리 (Accepted) 1-1-2008-0022369-15
7 등록결정서
Decision to grant		 2008.06.04 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2008-0307915-43
8 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2009.08.04 수리 (Accepted) 4-1-2009-5150899-36
9 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2015.02.02 수리 (Accepted) 4-1-2015-0006137-44
번호, 청구항의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 청구항 표입니다.
번호 청구항
1 1
리간드 검색 장치에 있어서,입력 데이터를 처리하기 위한 입력 데이터 처리부;상기 입력 데이터 처리부로부터의 데이터에서 결합부위를 추출하기 위한 결합부위 추출부;비교 방식을 사용자가 선택할 수 있도록 지원하기 위한 사용자 선택 입력부;상기 사용자 선택 입력부의 선택 정보에 따라 목표 단백질의 결합부위와 데이터베이스의 단백질의 유사결합부위를 비교하여 추출하기 위한 유사결합부위 비교부; 및상기 유사결합부위 비교부로부터의 특이결합부위에 대하여 가상 스크리닝을 수행하여 리간드를 검색하기 위한 리간드 검색부를 포함하는 특이 결합부위 자동추출을 이용한 리간드 검색 장치
2 2
제 1 항에 있어서,상기 유사결합부위 비교부는,상기 결합부위 추출부에서 추출한 결합부위를 이용하여 외부의 단백질 구조 데이터베이스에 있는 단백질들을 구조적으로 검색하면서 목표 단백질(target protein)의 결합부위와 유사한 결합부위를 탐색하기 위한 유사결합부위 구조탐색부;상기 결합부위 추출부에서 추출한 결합부위와 상기 유사결합부위 구조탐색부에서 탐색한 유사결합부위에 대하여 특이결합부위를 추출하기 위한 특이결합부위 추출부;외부의 단백질 서열 데이터베이스와 자동 서열 알고리즘을 이용하여 결합부위들을 자동으로 비교하여 서열 간의 차이를 탐색하기 위한 유사결합부위 서열탐색부; 및상기 유사결합부위 서열탐색부에서 탐색한 서열 간의 차이를 사용자에게 제공하여 특이결합부위를 탐색할 수 있도록 지원하기 위한 특이결합부위 탐색부를 포함하는 특이 결합부위 자동추출을 이용한 리간드 검색 장치
3 3
제 2 항에 있어서,상기 특이결합부위 추출부는,상기 결합부위 추출부에서 추출한 결합부위와 상기 유사결합부위 구조탐색부에서 탐색한 유사결합부위들을 먼저 정렬한 다음에, 상기 정렬한 구조에서 공통된 부분과 차이나는 부분을 찾아서 결합부위의 특이적인 위치를 추출하는 것을 특징으로 하는 특이 결합부위 자동추출을 이용한 리간드 검색 장치
4 4
삭제
5 5
제 1 항 내지 제 3 항 중 어느 한 항에 있어서,상기 리간드 검색부에서 검색한 리간드와 목표 단백질에 대하여 모의결합 실험을 수행하기 위한 모의결합 실험부;상기 모의결합 실험부에서 실험을 수행한 모의결합에 의한 결합 정도를 계산하기 위한 결합력 계산부; 및사용자가 원하는 형태로 결과를 출력하기 위한 결과 출력부를 더 포함하는 특이 결합부위 자동추출을 이용한 리간드 검색 장치
6 6
리간드 검색 방법에 있어서,입력 처리한 단백질로부터 결합부위를 추출하는 결합부위 추출 단계;수동 비교 방식 또는 자동 비교 방식을 선택하였는지를 확인하는 확인 단계;상기 확인한 비교 방식에 따라 목표 단백질의 결합부위와 데이터베이스의 단백질의 유사결합부위를 비교하여 추출하는 유사결합부위 비교 단계; 및상기 유사결합부위 비교 단계에서 추출한 특이결합부위에 대하여 가상 스크리닝을 수행하여 리간드를 검색하는 리간드 검색 단계를 포함하는 특이 결합부위 자동추출을 이용한 리간드 검색 방법
7 7
제 6 항에 있어서,상기 유사결합부위 비교 단계는,상기 결합부위 추출 단계에서 추출한 결합부위를 이용하여 외부의 단백질 구조 데이터베이스에 있는 단백질들을 구조적으로 검색하면서 목표 단백질(target protein)의 결합부위와 유사한 결합부위를 탐색하는 유사결합부위 구조탐색 단계;상기 결합부위 추출 단계에서 추출한 결합부위와 상기 유사결합부위 구조탐색 단계에서 탐색한 유사결합부위에 대하여 특이결합부위를 추출하는 특이결합부위 추출 단계;외부의 단백질 서열 데이터베이스와 자동 서열 알고리즘을 이용하여 결합부위들을 비교하여 서열 간의 차이를 탐색하는 유사결합부위 서열탐색 단계; 및상기 유사결합부위 서열탐색 단계에서 탐색한 서열 간의 차이를 사용자에게 제공하여 특이결합부위를 탐색할 수 있도록 지원하는 특이결합부위 탐색 단계를 포함하는 특이 결합부위 자동추출을 이용한 리간드 검색 방법
8 8
제 7 항에 있어서,상기 특이결합부위 추출 단계는,상기 결합부위 추출 단계에서 추출한 결합부위와 상기 유사결합부위 구조탐색 단계에서 탐색한 유사결합부위들을 먼저 정렬한 다음에, 상기 정렬한 구조에서 공통된 부분과 차이나는 부분을 찾아서 결합부위의 특이적인 위치를 추출하는 것을 특징으로 하는 특이 결합부위 자동추출을 이용한 리간드 검색 방법
9 9
삭제
10 10
제 6 항 내지 제 8 항 중 어느 한 항에 있어서,상기 리간드 검색 단계에서 검색한 리간드와 목표 단백질에 대하여 모의결합 실험을 수행하는 모의결합 실험 단계;상기 모의결합 실험 단계에서 실험을 수행한 모의결합에 의한 결합 정도를 계산하는 결합력 계산 단계; 및사용자가 원하는 형태로 결과를 출력하기 위한 결과 출력 단계를 더 포함하는 특이 결합부위 자동추출을 이용한 리간드 검색 방법
11 11
제 10 항에 있어서,다른 결합부위에 대하여 상기 확인 단계부터 반복 수행하는 단계를 더 포함하는 특이 결합부위 자동추출을 이용한 리간드 검색 방법
12 12
리간드 검색 장치에 있어서,입력 데이터를 처리하기 위한 입력 데이터 처리부;상기 입력 데이터 처리부로부터의 데이터에서 결합부위를 추출하기 위한 결합부위 추출부;상기 결합부위 추출부에서 추출한 결합부위를 이용하여 외부의 단백질 구조 데이터베이스에 있는 단백질들을 구조적으로 검색하면서 목표 단백질(target protein)의 결합부위와 유사한 결합부위를 탐색하기 위한 유사결합부위 구조탐색부;상기 결합부위 추출부에서 추출한 결합부위와 상기 유사결합부위 구조탐색부에서 탐색한 유사결합부위에 대하여 자동으로 특이결합부위를 추출하기 위한 자동 특이결합부위 추출부; 및상기 자동 특이결합부위 추출부에서 추출한 특이결합부위에 대하여 가상 스크리닝을 수행하여 리간드를 검색하기 위한 리간드 검색부를 포함하는 특이 결합부위 자동추출을 이용한 리간드 검색 장치
13 13
제 12 항에 있어서,상기 자동 특이결합부위 추출부는,상기 결합부위 추출부에서 추출한 결합부위와 상기 유사결합부위 구조탐색부에서 탐색한 유사결합부위들을 먼저 정렬한 다음에, 상기 정렬한 구조에서 공통된 부분과 차이나는 부분을 찾아서 결합부위의 특이적인 위치를 추출하는 것을 특징으로 하는 특이 결합부위 자동추출을 이용한 리간드 검색 장치
14 14
제 12 항 또는 제 13 항에 있어서,상기 리간드 검색부에서 검색한 리간드와 목표 단백질에 대하여 모의결합 실험을 수행하기 위한 모의결합 실험부;상기 모의결합 실험부에서 실험을 수행한 모의결합에 의한 결합 정도를 계산하기 위한 결합력 계산부; 및사용자가 원하는 형태로 결과를 출력하기 위한 결과 출력부를 더 포함하는 특이 결합부위 자동추출을 이용한 리간드 검색 장치
15 15
리간드 검색 방법에 있어서,입력 처리한 단백질로부터 결합부위를 추출하는 결합부위 추출 단계;상기 결합부위 추출 단계에서 추출한 결합부위를 이용하여 외부의 단백질 구조 데이터베이스에 있는 단백질들을 구조적으로 검색하면서 목표 단백질(target protein)의 결합부위와 유사한 결합부위를 탐색하는 유사결합부위 구조탐색 단계;상기 결합부위 추출 단계에서 추출한 결합부위와 상기 유사결합부위 구조탐색 단계에서 탐색한 유사결합부위에 대하여 자동으로 특이결합부위를 추출하는 자동 특이결합부위 추출 단계; 및상기 자동 특이결합부위 추출 단계에서 추출한 특이결합부위에 대하여 가상 스크리닝을 수행하여 리간드를 검색하는 리간드 검색 단계를 포함하는 특이 결합부위 자동추출을 이용한 리간드 검색 방법
16 16
제 15 항에 있어서,상기 자동 특이결합부위 추출 단계는,상기 결합부위 추출 단계에서 추출한 결합부위와 상기 유사결합부위 구조탐색 단계에서 탐색한 유사결합부위들을 먼저 정렬한 다음에, 상기 정렬한 구조에서 공통된 부분과 차이나는 부분을 찾아서 결합부위의 특이적인 위치를 추출하는 것을 특징으로 하는 특이 결합부위 자동추출을 이용한 리간드 검색 방법
17 17
제 15 항 또는 제 16 항에 있어서,상기 리간드 검색 단계에서 검색한 리간드와 목표 단백질에 대하여 모의결합 실험을 수행하는 모의결합 실험 단계;상기 모의결합 실험 단계에서 실험을 수행한 모의결합에 의한 결합 정도를 계산하는 결합력 계산 단계; 및사용자가 원하는 형태로 결과를 출력하기 위한 결과 출력 단계를 더 포함하는 특이 결합부위 자동추출을 이용한 리간드 검색 방법
18 18
제 17 항에 있어서,다른 결합부위에 대하여 상기 결합부위 추출 단계의 결합부위 추출 과정부터 반복 수행하는 단계를 더 포함하는 특이 결합부위 자동추출을 이용한 리간드 검색 방법
지정국 정보가 없습니다
순번, 패밀리번호, 국가코드, 국가명, 종류의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 패밀리정보 - 패밀리정보 표입니다.
순번 패밀리번호 국가코드 국가명 종류
1 US20080133199 US 미국 FAMILY

DOCDB 패밀리 정보

순번, 패밀리번호, 국가코드, 국가명, 종류의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 패밀리정보 - DOCDB 패밀리 정보 표입니다.
순번 패밀리번호 국가코드 국가명 종류
1 US2008133199 US 미국 DOCDBFAMILY
국가 R&D 정보가 없습니다.