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주성분분석 및 자동상관을 이용한 단백질 구조 비교 장치및 그 방법

  • 기술번호 : KST2015093943
  • 담당센터 : 대전기술혁신센터
  • 전화번호 : 042-610-2279
요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 1. 청구범위에 기재된 발명이 속한 기술분야본 발명은 주성분분석(PCA) 및 자동상관(Autocorrelation)을 이용한 단백질 구조 비교 장치 및 그 방법에 관한 것임.2. 발명이 해결하려고 하는 기술적 과제본 발명은 입력 단백질의 좌표에 대해 주성분분석(PCA : Principal Components Analysis)을 이용하여 대략적인 주축방향을 설정하고, 세밀한 구조 정렬을 위하여 전체 영역을 그리드로 나눈 후 단백질을 해당 영역 안에 위치시켜 박셀(Voxel) 형태로 단백질을 만든 후 비교하려는 단백질과 자동상관(Autocorrelation) 연산을 수행하여 유사도를 산출하기 위한 단백질 구조 비교 장치 및 그 방법을 제공하는데 그 목적이 있음.3. 발명의 해결방법의 요지본 발명은, 단백질 구조 비교 장치에 있어서, 외부로부터 질의 단백질을 입력받아 주축을 추출하기 위한 주성분분석(PCA) 연산 수단; 상기 주성분분석(PCA) 연산 수단으로부터 주축 추출 결과를 입력받아 전체 영역을 그리드로 나누어 단백질 포함 여부를 판단하여 박셀(Voxel)을 생성하기 위한 박셀(Voxel) 생성 수단; 및 상기 박셀(Voxel) 생성 수단에서 생성한 단백질 박셀(Voxel) 간의 자동상관(Autocorrelation) 연산을 수행하여 유사도를 산출하기 위한 비교 연산 처리 수단을 포함함.4. 발명의 중요한 용도본 발명은 단백질 구조 비교 시스템 등에 이용됨.단백질 구조 비교, 주성분분석(PCA), 주축방향 추출, 박셀(Voxel) 생성, 자동상관(Autocorrelation), FFT 연산
Int. CL G06F 19/16 (2011.01) G01N 33/50 (2011.01) G06F 19/18 (2011.01)
CPC
출원번호/일자 1020060121752 (2006.12.04)
출원인 한국전자통신연구원
등록번호/일자 10-0797400-0000 (2008.01.17)
공개번호/일자
공고번호/일자 (20080128) 문서열기
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보
법적상태 소멸
심사진행상태 수리
심판사항
구분
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2006.12.04)
심사청구항수 14

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 한국전자통신연구원 대한민국 대전광역시 유성구

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 김대희 대한민국 대전 서구
2 박성희 대한민국 대전 유성구
3 박찬용 대한민국 대전 유성구
4 박수준 대한민국 서울 강남구
5 박선희 대한민국 대전 서구

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 신성특허법인(유한) 대한민국 서울특별시 송파구 중대로 ***, ID타워 ***호 (가락동)

최종권리자

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번호 이름 국적 주소
1 한국전자통신연구원 대한민국 대전광역시 유성구
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번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 특허출원서
Patent Application
2006.12.04 수리 (Accepted) 1-1-2006-0899140-23
2 선행기술조사의뢰서
Request for Prior Art Search
2007.11.05 수리 (Accepted) 9-1-9999-9999999-89
3 선행기술조사보고서
Report of Prior Art Search
2007.12.05 수리 (Accepted) 9-1-2007-0073987-14
4 등록결정서
Decision to grant
2008.01.14 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2008-0015631-66
5 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2009.08.04 수리 (Accepted) 4-1-2009-5150899-36
6 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2015.02.02 수리 (Accepted) 4-1-2015-0006137-44
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번호 청구항
1 1
단백질 구조 비교 장치에 있어서,외부로부터 질의 단백질을 입력받아 주축을 추출하기 위한 주성분분석(PCA) 연산 수단;상기 주성분분석(PCA) 연산 수단으로부터 주축 추출 결과를 입력받아 전체 영역을 그리드로 나누어 단백질 포함 여부를 판단하여 박셀(Voxel)을 생성하기 위한 박셀(Voxel) 생성 수단; 및상기 박셀(Voxel) 생성 수단에서 생성한 단백질 박셀(Voxel) 간의 자동상관(Autocorrelation) 연산을 수행하여 유사도를 산출하기 위한 비교 연산 처리 수단을 포함하는 주성분분석 및 자동상관을 이용한 단백질 구조 비교 장치
2 2
제 1 항에 있어서,상기 비교 연산 처리 수단은,FFT(Fast Fourier Transform) 연산을 사용하여 자동상관(Autocorrelation) 연산을 수행하는 것을 특징으로 하는 주성분분석 및 자동상관을 이용한 단백질 구조 비교 장치
3 3
제 2 항에 있어서,상기 비교 연산 처리 수단은,FFT(Fast Fourier Transform) 연산을 사용하여 아래의 [수학식 a]와 같이 자동상관(Autocorrelation) 결과를 얻는 것을 특징으로 하는 주성분분석 및 자동상관을 이용한 단백질 구조 비교 장치
4 4
제 1 항 내지 제 3 항 중 어느 한 항에 있어서,상기 주성분분석(PCA) 연산 수단은,외부로부터 비교를 원하는 두 단백질을 입력받아 상기 입력 단백질에 대한 정보를 이용하여 각 단백질의 주축을 추출하여 기본 모양을 생성하여 상기 박셀(Voxel) 생성 수단으로 출력하는 것을 특징으로 하는 주성분분석 및 자동상관을 이용한 단백질 구조 비교 장치
5 5
제 4 항에 있어서,상기 주성분분석(PCA) 연산 수단은,8가지 방향을 고려한 기본 모양을 생성하여 상기 박셀(Voxel) 생성 수단으로 출력하는 것을 특징으로 하는 주성분분석 및 자동상관을 이용한 단백질 구조 비교 장치
6 6
제 4 항에 있어서,상기 박셀(Voxel) 생성 수단은,상기 주성분분석(PCA) 연산 수단으로부터의 각 단백질을 포함하는 전체 영역을 그리드로 나눈 후에 단백질의 포함 여부에 따라 각 그리드에 값을 할당하여 박셀(Voxel)을 생성하여 상기 비교 연산 처리 수단으로 출력하는 것을 특징으로 하는 주성분분석 및 자동상관을 이용한 단백질 구조 비교 장치
7 7
제 6 항에 있어서,상기 비교 연산 처리 수단은,아래의 [수학식 b]와 같이 두 단백질(P,Q)의 유사도를 산출하는 것을 특징으로 하는 주성분분석 및 자동상관을 이용한 단백질 구조 비교 장치
8 8
단백질 구조 비교 방법에 있어서,입력받은 질의 단백질에 대해 주성분분석(PCA)을 통해 주축을 추출하는 주축 추출 단계;상기 주축 추출 결과에 대한 전체 영역을 그리드로 나누어 단백질 포함 여부를 판단하여 박셀(Voxel)을 생성하는 박셀(Voxel) 생성 단계; 및상기 생성한 단백질 박셀(Voxel) 간의 자동상관(Autocorrelation) 연산을 수행하여 유사도를 산출하는 유사도 산출 단계를 포함하는 주성분분석 및 자동상관을 이용한 단백질 구조 비교 방법
9 9
제 8 항에 있어서,상기 유사도 산출 단계는,FFT(Fast Fourier Transform) 연산을 사용하여 자동상관(Autocorrelation) 연산을 수행하는 것을 특징으로 하는 주성분분석 및 자동상관을 이용한 단백질 구조 비교 방법
10 10
제 9 항에 있어서,상기 유사도 산출 단계는,FFT(Fast Fourier Transform) 연산을 사용하여 아래의 [수학식 a]와 같이 자동상관(Autocorrelation) 결과를 얻는 것을 특징으로 하는 주성분분석 및 자동상관을 이용한 단백질 구조 비교 방법
11 11
제 8 항 내지 제 10 항 중 어느 한 항에 있어서,상기 주축 추출 단계는,비교를 원하는 두 단백질에 대한 정보를 이용하여 각 단백질의 주축을 추출하여 기본 모양을 생성하는 것을 특징으로 하는 주성분분석 및 자동상관을 이용한 단백질 구조 비교 방법
12 12
제 11 항에 있어서,상기 주축 추출 단계는,8가지 방향을 고려한 기본 모양을 생성하는 것을 특징으로 하는 주성분분석 및 자동상관을 이용한 단백질 구조 비교 방법
13 13
제 11 항에 있어서,상기 박셀(Voxel) 생성 단계는,상기 주축 추출 결과에 따른 각 단백질을 포함하는 전체 영역을 그리드로 나눈 후에 단백질의 포함 여부에 따라 각 그리드에 값을 할당하여 박셀(Voxel)을 생성하는 것을 특징으로 하는 주성분분석 및 자동상관을 이용한 단백질 구조 비교 방법
14 14
제 13 항에 있어서,상기 유사도 산출 단계는,아래의 [수학식 b]와 같이 두 단백질(P,Q)의 유사도를 산출하는 것을 특징으로 하는 주성분분석 및 자동상관을 이용한 단백질 구조 비교 방법
지정국 정보가 없습니다
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순번 패밀리번호 국가코드 국가명 종류
1 US20080133632 US 미국 FAMILY

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순번 패밀리번호 국가코드 국가명 종류
1 US2008133632 US 미국 DOCDBFAMILY
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