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단백질 변형 탐색 장치 및 방법

  • 기술번호 : KST2015116020
  • 담당센터 : 대전기술혁신센터
  • 전화번호 : 042-610-2279
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요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 단백질 변형을 탐색하는 단백질 변형 탐색 장치로서, 펩티드 기반 단백질 변형 서열을 가상 효소로 절단하여 가상 조각 이온들을 생성하고, 가상 조각 이온들의 질량 정보를 포함하는 조각 이온 질량 패턴을 생성하는 조각 이온 질량 패턴 생성부, 단백질 변형의 종류와 질량을 포함하는 단백질 변형 정보를 저장하는 단백질 변형 데이터베이스, 그리고 분석 대상 단백질에서 추출된 조각 이온들의 질량 변화를 기초로 질량 변화가 유사한 조각 이온들을 포함하는 복수의 군집을 추출하고, 복수의 군집을 조합하여 복수의 군집 조합을 생성하며, 상기 조각 이온 질량 패턴과 상기 단백질 변형 정보를 기초로 상기 복수의 군집 조합 중 적어도 하나의 군집 조합에 포함된 적어도 하나의 단백질 변형을 탐색하는 질량변화탐색부를 포함한다.
Int. CL C40B 40/10 (2006.01) G06F 19/22 (2011.01) G06F 19/28 (2011.01) B01D 59/44 (2006.01)
CPC C40B 40/10(2013.01) C40B 40/10(2013.01) C40B 40/10(2013.01) C40B 40/10(2013.01) C40B 40/10(2013.01)
출원번호/일자 1020120110597 (2012.10.05)
출원인 한국과학기술원
등록번호/일자 10-1427865-0000 (2014.08.01)
공개번호/일자 10-2013-0063453 (2013.06.14) 문서열기
공고번호/일자 (20140808) 문서열기
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보 대한민국  |   1020110129790   |   2011.12.06
법적상태 등록
심사진행상태 수리
심판사항
구분 신규
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2012.10.05)
심사청구항수 11

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 한국과학기술원 대한민국 대전광역시 유성구

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 이관수 대한민국 대전 유성구
2 강지용 대한민국 대전 유성구
3 한영웅 대한민국 대전 유성구

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 유미특허법인 대한민국 서울특별시 강남구 테헤란로 ***, 서림빌딩 **층 (역삼동)

최종권리자

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번호 이름 국적 주소
1 한국과학기술원 대전광역시 유성구
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번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 [특허출원]특허출원서
[Patent Application] Patent Application		 2012.10.05 수리 (Accepted) 1-1-2012-0807908-09
2 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2013.02.01 수리 (Accepted) 4-1-2013-5019983-17
3 [출원서등 보정]보정서
[Amendment to Patent Application, etc.] Amendment		 2013.03.27 수리 (Accepted) 1-1-2013-0265347-61
4 선행기술조사의뢰서
Request for Prior Art Search		 2013.10.02 수리 (Accepted) 9-1-9999-9999999-89
5 선행기술조사보고서
Report of Prior Art Search		 2013.11.13 수리 (Accepted) 9-1-2013-0092055-85
6 의견제출통지서
Notification of reason for refusal		 2014.01.02 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2014-0004653-10
7 [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견(답변, 소명)서
[Opinion according to the Notification of Reasons for Refusal] Written Opinion(Written Reply, Written Substantiation)		 2014.02.24 수리 (Accepted) 1-1-2014-0178227-17
8 [명세서등 보정]보정서
[Amendment to Description, etc.] Amendment		 2014.02.24 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) 1-1-2014-0178229-08
9 등록결정서
Decision to grant		 2014.07.25 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2014-0505851-16
10 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2014.12.24 수리 (Accepted) 4-1-2014-5157993-01
11 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2014.12.24 수리 (Accepted) 4-1-2014-5158129-58
12 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2014.12.24 수리 (Accepted) 4-1-2014-5157968-69
13 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2019.04.24 수리 (Accepted) 4-1-2019-5081392-49
14 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2020.05.15 수리 (Accepted) 4-1-2020-5108396-12
15 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2020.06.12 수리 (Accepted) 4-1-2020-5131486-63
번호, 청구항의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 청구항 표입니다.
번호 청구항
1 1
단백질 변형을 탐색하는 단백질 변형 탐색 장치로서,펩티드 기반 단백질 변형 서열을 가상 효소로 절단하여 가상 조각 이온들을 생성하고, 가상 조각 이온들의 질량 정보를 포함하는 조각 이온 질량 패턴을 생성하는 조각 이온 질량 패턴 생성부,단백질 변형의 종류와 질량을 포함하는 단백질 변형 정보를 저장하는 단백질 변형 데이터베이스, 그리고분석 대상 단백질에서 추출된 조각 이온들의 질량 변화를 기초로 질량 변화가 유사한 조각 이온들을 포함하는 복수의 군집을 추출하고, 복수의 군집을 조합하여 복수의 군집 조합을 생성하며, 상기 조각 이온 질량 패턴과 상기 단백질 변형 정보를 기초로 상기 복수의 군집 조합 중 적어도 하나의 군집 조합에 포함된 적어도 하나의 단백질 변형을 탐색하는 단백질변형탐색부를 포함하며,상기 펩티드 기반 단백질 변형 서열은 유비퀴틴 그리고 유비퀴틴 유사 단백질을 포함하는 단백질 변형의 아미노산 서열이고,상기 가상 효소는 단백질 분해 법칙에 따라 상기 펩티드 기반 단백질 변형 서열을 가상으로 절단하는 효소이고,상기 가상 조각 이온은 상기 펩티드 기반 단백질 변형 서열이 상기 가상 효소에 의해 절단된 조각 이온이며,상기 조각 이온 질량 패턴은 단백질 변형에 의한 조각 이온들의 질량 변화를 나타내는 정보로서, 단백질 변형으로 측정되는 단백질 변형의 b 이온 질량들, 그리고 단백질 변형의 y 이온에 의하여 생성되는 질량 변화들을 포함하고, 상기 b 이온은 단백질 서열의 N 말단(N-terminal)에서부터 시작되는 이온이고, 상기 y 이온은 단백질 서열의 C 말단(C-terminal)에서부터 시작되는 이온인 단백질 변형 탐색 장치
2 2
제1항에서,상기 조각 이온 질량 패턴 생성부는가상 효소로 상기 펩티드 기반 단백질 변형 서열을 절단하는 가상효소처리부,상기 가상효소처리부에서 절단된 서열을 기초로 단백질 변형 서열에서 생성될 수 있는 가상 조각 이온들을 생성하는 가상 조각 이온 생성부, 그리고가상 조각 이온들의 질량을 계산하여, 가상 조각 이온들의 질량 정보를 포함하는 조각 이온 질량 패턴을 생성하는 조각 이온 질량 계산부를 포함하는 단백질 변형 탐색 장치
3 3
삭제
4 4
제1항에서,상기 단백질변형탐색부는화학적 단백질 변형 그리고 펩티드 기반 단백질 변형을 포함하는 단백질 변형을 탐색하는 단백질 변형 탐색 장치
5 5
단백질 변형을 탐색하는 단백질 변형 탐색 장치로서,분석 대상 단백질의 질량 분석 정보를 기초로 실측 조각 이온 질량과 이론 조각 이온 질량의 질량 변화를 계산하고, 질량 변화가 유사한 조각 이온들을 묶어 복수의 군집을 생성하는 질량 변화 군집 추출부,복수의 군집을 조합하여 복수의 군집 조합을 생성하고, 각 군집 조합 내의 군집간 질량 변화 차이를 계산하는 질량 변화 군집 조합부, 그리고단백질 변형 탐색 정보를 이용하여, 각 군집 간 질량 변화 차이에 해당하는 적어도 하나의 단백질 변형을 탐색하는 탐색부를 포함하고,상기 단백질 변형 탐색 정보는 펩티드 기반 단백질 변형 서열을 기초로 생성된 가상 조각 이온들의 질량 정보를 포함하는 조각 이온 질량 패턴, 그리고 각종 단백질 변형의 종류와 질량을 포함하는 단백질 변형 정보를 포함하며,상기 실측 조각 이온 질량은 상기 분석 대상 단백질을 질량 분석기에 적용하여 실측한 조각 이온 질량이고,상기 이론 조각 이온 질량은 상기 분석 대상 단백질의 아미노산 서열 정보로부터 이론적으로 계산하여 획득한 조각 이온 질량이고,상기 펩티드 기반 단백질 변형 서열은 유비퀴틴 그리고 유비퀴틴 유사 단백질을 포함하는 단백질 변형의 아미노산 서열이고,상기 가상 조각 이온은 상기 펩티드 기반 단백질 변형 서열이 가상 효소에 의해 절단되어 생성된 조각 이온이며,상기 가상 효소는 단백질 분해 법칙에 따라 상기 펩티드 기반 단백질 변형 서열을 가상으로 절단하는 효소이고,상기 조각 이온 질량 패턴은 단백질 변형에 의한 조각 이온들의 질량 변화를 나타내는 정보로서, 단백질 변형으로 측정되는 단백질 변형의 b 이온 질량들, 그리고 단백질 변형의 y 이온에 의하여 생성되는 질량 변화들을 포함하고, 상기 b 이온은 단백질 서열의 N 말단(N-terminal)에서부터 시작되는 이온이고, 상기 y 이온은 단백질 서열의 C 말단(C-terminal)에서부터 시작되는 이온인 단백질 변형 탐색 장치
6 6
삭제
7 7
제5항에서,상기 탐색부는복수의 군집 조합 중에서, 상기 단백질 변형 탐색 정보와 유사한 군집 간 질량 변화 차이를 가지는 적어도 하나의 후보 군집 조합을 선정하는 단백질 변형 탐색 장치
8 8
제7항에서,상기 탐색부는각 후보 군집 조합의 군집 간 질량 변화 차이를 기초로 각 후보 군집 조합의 단백질 변형 정보를 탐색하는 단백질 변형 탐색 장치
9 9
제8항에서,적어도 하나의 후보 군집 조합 중에서, 상기 분석 대상 단백질의 질량 분석 정보에 유사한 최종 군집 조합을 선정하고, 상기 최종 군집 조합에 해당하는 적어도 하나의 단백질 변형을 출력하는 출력부를 더 포함하는 단백질 변형 탐색 장치
10 10
단백질 변형 탐색 장치가 단백질 변형을 탐색하는 방법으로서,분석 대상 단백질의 질량 분석 정보를 기초로 분석 대상 단백질을 구성하는 조각 이온들의 질량 변화를 계산하는 단계,일정 범위 이내에의 질량 변화를 보이는 조각 이온끼리 묶어서 복수의 군집을 추출하는 단계,복수의 군집을 조합하여 복수의 군집 조합을 생성하는 단계, 그리고단백질 변형 탐색 정보를 이용하여, 적어도 하나의 군집 조합에 포함된 적어도 하나의 단백질 변형을 탐색하는 단계를 포함하고,상기 단백질 변형 탐색 정보는 펩티드 기반 단백질 변형으로 생성된 가상 조각 이온들의 질량 정보를 포함하는 조각 이온 질량 패턴, 그리고 각종 단백질 변형의 종류와 질량을 포함하는 단백질 변형 정보를 포함하며,상기 조각 이온은 상기 분석 대상 단백질이 절단되어 생성된 이온이고,상기 펩티드 기반 단백질 변형 서열은 유비퀴틴 그리고 유비퀴틴 유사 단백질을 포함하는 단백질 변형의 아미노산 서열이고,상기 가상 조각 이온은 상기 펩티드 기반 단백질 변형 서열이 가상 효소에 의해 절단되어 생성된 조각 이온이며,상기 가상 효소는 단백질 분해 법칙에 따라 상기 펩티드 기반 단백질 변형 서열을 가상으로 절단하는 효소이고,상기 조각 이온 질량 패턴은 단백질 변형에 의한 조각 이온들의 질량 변화를 나타내는 정보로서, 단백질 변형으로 측정되는 단백질 변형의 b 이온 질량들, 그리고 단백질 변형의 y 이온에 의하여 생성되는 질량 변화들을 포함하고, 상기 b 이온은 단백질 서열의 N 말단(N-terminal)에서부터 시작되는 이온이고, 상기 y 이온은 단백질 서열의 C 말단(C-terminal)에서부터 시작되는 이온인 단백질 변형 탐색 방법
11 11
제10항에서,상기 적어도 하나의 단백질 변형을 탐색하는 단계는화학적 단백질 변형 그리고 펩티드 기반 단백질 변형 중 적어도 하나의 단백질 변형을 탐색하는 단백질 변형 탐색 방법
12 12
제10항에서,상기 적어도 하나의 단백질 변형을 탐색하는 단계는각 군집 조합 내의 군집간 질량 변화 차이를 계산하고, 상기 단백질 변형 탐색 정보를 기초로 각 군집 간 질량 변화 차이에 해당하는 적어도 하나의 단백질 변형을 탐색하는 단백질 변형 탐색 방법
13 13
삭제
14 14
제12항에서,상기 적어도 하나의 단백질 변형을 탐색하는 단계는복수의 군집 조합 중에서, 상기 단백질 변형 탐색 정보와 유사한 군집 간 질량 변화 차이를 가지는 적어도 하나의 후보 군집 조합을 선정하는 단계, 각 후보 군집 조합의 군집 간 질량 변화 차이를 기초로 각 후보 군집 조합의 단백질 변형 정보를 탐색하는 단계, 그리고적어도 하나의 후보 군집 조합 중에서, 상기 분석 대상 단백질의 질량 분석 정보에 유사한 최종 군집 조합을 선정하고, 상기 최종 군집 조합에 해당하는 적어도 하나의 단백질 변형을 출력하는 단계를 포함하는 단백질 변형 탐색 방법
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순번 연구부처 주관기관 연구사업 연구과제
1 교육과학기술부 KAIST 학제간융합 분야 (NCRC) 모바일 스마트폰 환경에서 개인화된 상황인지형 헬스케어 서비스 에이전트
2 교육과학기술부 KAIST 신기술융합형 성장동력사업 CTC 활성유지 선별 및 다중특성 분석기술 개발
3 교육과학기술부 KAIST 전통천연물기반유전자-동의보감사업 인체 가상세포 모델 기반 분자 및 세포수준의 전통천연물 MC/MT 통합 시뮬레이션 방법론 개발