| 1 |
1
유전자 서열 및 상기 유전자의 정보를 입력받는 정보 입력부;
상기 정보 입력부를 통하여 획득한 정보를 활용하여 기설정된 목표 번역 초기 단계 효율 수치에 따라 유전자 서열을 생성하는 유전자 서열 생성부;
상기 유전자 서열 생성부에서 생성된 유전자 서열의 번역 초기 단계 효율 수치를 계산하는 번역 초기 단계 효율 추론부;
상기 유전자 서열 생성부로부터 생성된 유전자 서열 및 그에 대응되는 번역 초기 단계 효율을 출력하는 정보 출력부; 및
상기 정보 출력부를 통해 출력된 유전자 서열의 실제 유전자 발현량을 확인하기 위해 유전자 발현량을 측정하는 검증부를 포함하는 것을 특징으로 하는 유전자 번역 효율 추론에 기반을 둔 맞춤형 유전자 서열 제작 시스템
|
| 2 |
2
청구항 1에 있어서,
상기 정보 입력부는 유전자 서열 정보, 생체 정보 및 제작하고자 하는 유전자의 목표 번역 초기 단계 효율 수치를 입력받는 것을 특징으로 하는 유전자 번역 효율 추론에 기반을 둔 맞춤형 유전자 서열 제작 시스템
|
| 3 |
3
청구항 2에 있어서,
상기 유전자 서열 정보는 번역 초기 단계 효율 추론에 필요한 전사체 5´말단 쪽 서열, Shine-Dalgarno(SD) 서열 및 코딩 서열(coding sequence, CDS) 중 하나 이상의 정보를 포함하는 것을 특징으로 하는 유전자 번역 효율 추론에 기반을 둔 맞춤형 유전자 서열 제작 시스템
|
| 4 |
4
청구항 2에 있어서,
상기 생체 정보는 번역 단계에 관련된 시작 코돈의 유전자 내의 위치 정보, 생체 내 전사체 개수 및 생체 내 전체 리보솜 개수 중 하나 이상의 정보를 포함하는 것을 특징으로 하는 유전자 번역 효율 추론에 기반을 둔 맞춤형 유전자 서열 제작 시스템
|
| 5 |
5
청구항 1에 있어서,
상기 유전자 서열 생성부는 상기 정보 입력부로부터 입력받은 유전자 서열 정보와 유전자 제작 부위에 무작위로 생성한 서열을 사용하여 생성한 전체 유전자 서열을 통해 상기 번역 초기 단계 효율 추론부를 통해 적합도를 판단하고, 적합도를 만족하는 서열을 선택 저장하는 방법으로 유전자 서열을 생성하는 것을 특징으로 하는 유전자 번역 추론에 기반을 둔 맞춤형 유전자 서열 제작 시스템
|
| 6 |
6
청구항 1에 있어서,
상기 번역 초기 단계 효율 추론부는 유전자로부터 만들어지는 전사체의 2차 구조 형성 및 각 구조에 따른 존재 확률과 그에 따른 리보솜 결합 부위의 국소 구조 확률을 계산하는 제 1모듈과, 생성된 전사체의 2차 구조에 따른 번역 단계를 관장하는 리보솜과 결합하여 전사체-리보솜 복합체를 이루는 비율을 추론하는 제 2모듈, 개시 tRNA가 전사체-리보솜 복합체 내로 들어와 시작 코돈과 결합하고 번역 연장 단계로 전환되는 효율을 추론하여 최종 번역 초기 단계 효율을 추론하는 제 3모듈을 포함하는 것을 특징으로 하는 유전자 번역 추론에 기반을 둔 맞춤형 유전자 서열 제작 시스템
|
| 7 |
7
청구항 1에 있어서,
상기 정보 출력부는 기설정된 적합도 기준을 통과하여 선택되어진 유전자 서열 및 그에 따른 번역 초기 단계 효율을 출력하는 것을 특징으로 하는 유전자 번역 추론에 기반을 둔 맞춤형 유전자 서열 제작 시스템
|
| 8 |
8
청구항 1에 있어서,
상기 검증부는 상기 정보 출력부로부터 출력된 유전자 서열을 검증하기 위하여 실제 유전자 발현량을 측정하는 것을 특징으로 하는 유전자 번역 추론에 기반을 둔 맞춤형 유전자 서열 제작 시스템
|
| 9 |
9
유전자 서열 및 상기 유전자의 정보를 입력하는 제 1단계;
사용자가 원하는 유전자 서열을 제작하기 위해 무작위로 서열을 생성하는 제 2단계;
상기 제 2단계에서 생성된 유전자 서열의 번역 초기 단계 효율을 추론하는 제 3단계;
상기 제 3단계에서 생성된 유전자 서열과 상기 제 3단계에서 계산된 번역 초기 단계 효율 수치를 통해 상기 제 1단계에서 입력된 사용자의 목표 번역 초기 단계 효율에 부합되는지 적합도를 판단하는 제 4단계;
상기 제 4단계의 적합도 판단을 통하여 사용자의 목표 번역 초기 단계 효율 수치에 부합하는 유전자 서열을 선택하고 저장하는 제 5단계;
상기 제 5단계를 통해 선택되어 저장된 유전자 서열 후보군들과 그에 따른 번역 초기 단계 효율 정보를 출력하는 제 6단계; 및
상기 제 6단계를 통해 출력된 유전자 서열을 검증하기 위하여 유전자 서열을 실제로 발현시켜 측정하는 제 7단계를 포함하는 것을 특징으로 하는 유전자 번역 효율 추론에 기반을 둔 맞춤형 유전자 서열 제작 방법
|
| 10 |
10
청구항 9에 있어서,
상기 제 1단계는 유전자 서열 정보, 생체 정보 및 제작하고자 하는 유전자의 목표 번역 초기 단계 효율 수치를 입력받는 것을 특징으로 하는 유전자 번역 효율 추론에 기반을 둔 맞춤형 유전자 서열 제작 방법
|
| 11 |
11
청구항 10에 있어서,
상기 유전자 서열 정보는 번역 초기 단계 효율 추론에 필요한 전사체 5´말단 쪽 서열, Shine-Dalgarno(SD) 서열 및 코딩 서열(coding sequence, CDS) 중 하나 이상의 정보를 포함하는 것을 특징으로 하는 유전자 번역 효율 추론에 기반을 둔 맞춤형 유전자 서열 제작 방법
|
| 12 |
12
청구항 10에 있어서,
상기 생체 정보는 번역 단계에 관련된 시작 코돈의 유전자 내의 위치 정보, 생체 내 전사체 개수 및 생체 내 전체 리보솜 개수 중 하나 이상의 정보를 포함하는 것을 특징으로 하는 유전자 번역 효율 추론에 기반을 둔 맞춤형 유전자 서열 제작 방법
|
| 13 |
13
청구항 9 내지 12에 기재된 유전자 번역 효율 추론에 기반을 둔 맞춤형 유전자 서열 제작 방법을 수행하는 컴퓨터 프로그램이 저장된 컴퓨터로 읽을 수 있는 기록 매체
|
