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당단백질의 탈당화 검출을 통한 암 마커 스크리닝 방법 및 간세포암 마커

  • 기술번호 : KST2015136441
  • 담당센터 : 서울동부기술혁신센터
  • 전화번호 : 02-2155-3662
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요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 본원은 N-연결 당화 (N-linked glycosylation) 모티브를 포함하는 단백질에서 탈당화 펩타이드 단편 및 비당화 펩타이드 단편의 비율을 이용한 암 진단 마커의 스크리닝 방법, 이에 의해 선별된 마커, 및 상기 마커를 이용한 암 진단 또는 예후 분석용 조성물 및 키트를 개시한다. 본원의 방법은 기존 마커보다 정확도 및 특이도가 보다 높은 암관련 마커의 발굴이 가능하다. 또한 이를 통해서 발굴된 바이오마커는 높은 정확도와 민감도로 암의 조기진단, 모니터링 및 질병 정도를 혈액을 이용한 비침습성 검사로 간단하고 유효성 있는 암의 진단 또는 모니터링이 가능하여, 암 조기 발견은 물론 암의 치료 여부 및 치료 경과 확인에도 유용하게 사용될 수 있다.
Int. CL C12Q 1/68 (2018.01.01) G01N 33/68 (2006.01.01) G01N 33/48 (2006.01.01)
CPC C12Q 1/6886(2013.01)
출원번호/일자 1020130095978 (2013.08.13)
출원인 서울대학교산학협력단
등록번호/일자 10-1527283-0000 (2015.06.02)
공개번호/일자 10-2015-0020392 (2015.02.26) 문서열기
공고번호/일자 (20150610) 문서열기
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보
법적상태 등록
심사진행상태 수리
심판사항
구분 신규
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2013.08.13)
심사청구항수 21

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 서울대학교산학협력단 대한민국 서울특별시 관악구

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 김영수 대한민국 서울 강남구
2 윤정환 대한민국 서울특별시 종로구
3 김현수 대한민국 경기 부천시 원미구
4 김경곤 대한민국 경기도 고양시 일산서구
5 진종화 대한민국 서울 성북구

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 박원미 대한민국 서울특별시 강남구 논현로 ***, *층(역삼동, 메디빌딩)(두리암특허법률사무소)

최종권리자

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번호 이름 국적 주소
1 서울대학교산학협력단 대한민국 서울특별시 관악구
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번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 [특허출원]특허출원서
[Patent Application] Patent Application		 2013.08.13 수리 (Accepted) 1-1-2013-0733890-31
2 [출원서등 보정]보정서
[Amendment to Patent Application, etc.] Amendment		 2013.08.20 수리 (Accepted) 1-1-2013-0753467-00
3 선행기술조사의뢰서
Request for Prior Art Search		 2014.04.06 수리 (Accepted) 9-1-9999-9999999-89
4 선행기술조사보고서
Report of Prior Art Search		 2014.05.13 수리 (Accepted) 9-1-2014-0038684-62
5 의견제출통지서
Notification of reason for refusal		 2014.11.12 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2014-0771386-03
6 [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견(답변, 소명)서
[Opinion according to the Notification of Reasons for Refusal] Written Opinion(Written Reply, Written Substantiation)		 2014.12.01 수리 (Accepted) 1-1-2014-1165318-93
7 [명세서등 보정]보정서
[Amendment to Description, etc.] Amendment		 2014.12.01 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) 1-1-2014-1165335-69
8 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2015.03.17 수리 (Accepted) 4-1-2015-5033829-92
9 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2015.05.13 수리 (Accepted) 4-1-2015-5062924-01
10 등록결정서
Decision to grant		 2015.05.28 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2015-0355863-68
11 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2019.05.13 수리 (Accepted) 4-1-2019-5093546-10
12 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2019.05.23 수리 (Accepted) 4-1-2019-5101798-31
13 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2019.08.02 수리 (Accepted) 4-1-2019-5154561-59
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번호 청구항
1 1
N-연결 당화 (N-linked glycosylation) 모티브를 포함하는 단백질을 탈당화시키는 단계: 상기 탈당화 단계가 수행된 단백질을 단편화하는 단계; 상기 탈당화 및 단편화에 의해 생성된 펩타이드에 대하여, 상기 N-연결 당화 모티브에서 탈당화가 된 펩타이드 단편의 양 및 상기 N-연결 당화 모티브를 포함하지 않는 비당화 펩타이드 단편의 양을 결정하는 단계; 및상기 결정된 양을 근거로 상기 탈당화 단편에 대한 비당화 단편의 비를 결정하고, 이를 대조군의 수치와 비교하여, 그 비가 변동한 단백질을 암 마커로 선별하는 단계를 포함하는, 암 검출 또는 진단용 마커의 스크리닝 방법
2 2
제 1 항에 있어서 상기 N-연결 당화 모티브는 AsnXxxSer, AsnXxxThr 또는 AsnXxxCys인, 방법
3 3
제 2 항에 있어서, 상기 N-연결 당화 모티브에서 탈당화는 Asn 잔기에서 발생되며, 그 결과가 생성된 펩타이드 단편은 AspXxxSer, AspXxxThr 또는 AspXxxCys인, 방법
4 4
제 1 항에 있어서, 상기 N-연결 당화 모티브 및 상기 N-연결 당화 모티브를 포함하지 않는 비당화 펩타이드 단편의 서열은 상기 각 펩타이드 단편에 특이적인 것으로, 소정의 당화 단백질 군으로부터 선택되는 것인, 방법
5 5
제 1 항에 있어서, 상기 탈당화는 PNGase-F 처리에 의해 수행되는 것인, 방법
6 6
제 1 항에 있어서, 상기 단편화는 트립신, 라이신-C 또는 알지닌-C 또는 아스파르트산 N을 이용하여 수행되는 것인, 방법
7 7
제 1 항에 있어서, 상기 N-연결 당화 (N-linked glycosylation) 모티브를 포함하는 단백질은 이를 포함하는 시료로 제공되며, 상기 시료는 세포, 전혈, 혈청, 혈장, 타액, 소변, 뇌척수액, 난포액, 모유 및 췌장액으로 구성된 군으로부터 선택되는 것인, 방법
8 8
제 1 항에 있어서, 상기 N-연결 당화 모티브에서 탈당화가 된 펩타이드 단편의 양 및 상기 N-연결 당화 모티브를 포함하지 않는 비당화 펩타이드 단편의 양은 질량분석법 (Mass spectrometry)을 이용하여 수행되는 것인, 방법
9 9
제 8 항에 있어서, 상기 질량분석법은 액체크로마토그래피 질량분석법 (Liquid chromatography spectrometry, LC-MS) 인, 방법
10 10
제 9 항에 있어서, 상기 액체크로마토그래피 질량분석법의 데이터는 SIM (Selected Ion Monitoring) 또는 MRM (Multiple reaction monitoring)을 이용하여 수득되는 것인, 방법
11 11
Plexin-A1 (PLXNA1), Plasma kallikrein (KLKB1) 또는 Apolipoprotein B-100 (APOB) 중 하나 이상의 마커의 당화 검출용 시약을 포함하는, 간세포암 진단 또는 예후 분석용 조성물
12 12
제 11 항에 있어서, 상기 조성물은 하기 마커로 구성되는 군으로부터 선택되는 하나 이상의 마커의 당화 검출용 시약을 추가로 포함하는 것인, 간세포암 진단 또는 예후 분석용 조성물: Alpha-2-antiplasmin (SERPINF2), Alpha-2-macroglobulin (A2M), Beta-galactosidase (GLB1), Bone morphogenetic protein 1 (BMP1), Corticosteroid-binding globulin (SERPINA6), Complement factor H (CFH), Cholinesterase (BCHE), Clusterin (CLU), Collagen alpha-1(XII) chain (COL12A1), Carboxypeptidase N subunit 2 (CPN2), Versican core protein (VCAN), Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3 (ERBB3), Coagulation factor V (F5), Coagulation factor XI (F11), Follistatin-related protein 1 (FSTL1), N-acetylglucosamine-6-sulfatase (GNS), G-protein coupled receptor 126 (GPR126), Heparin cofactor 2 (SERPIND1), Hypoxia up-regulated protein 1 (HYOU1), Integrin alpha-2 (ITGA2), Integrin alpha-3 (ITGA3), Integrin alpha-6 (ITGA6), Integrin alpha-M (ITGAM), Integrin beta-2 (ITGB2), Kinectin (KTN1), Lysosome-associated membrane glycoprotein 2 (LAMP2), Galectin-3-binding protein (LGALS3BP), Periostin (POSTN), Inactive tyrosine-protein kinase 7 (PTK7), Roundabout homolog 4 (ROBO4), Tenascin (TNC) 및 Vitronectin (VTN)
13 13
삭제
14 14
제 11 항 또는 제 12 항에 있어서, 상기 각 마커의 당화 검출용 시약은 상기 각 마커의 탈당화 및 비당화 펩타이드의 질량분석에 사용되는 시약인, 간세포암 진단 또는 예후 분석용 조성물
15 15
제 11 항 또는 제 12 항에 있어서, 상기 각 마커는 표 17-1 내지 17-3에 개시된 탈당화 및 비당화펩타이드를 포함하며, 상기 검출은 상기 탈당화펩타이드의 양, 상기 비당화펩타이드 양 또는 상기 탈당화 펩타이드 대 비당화펩타이드 양의 비 중 하나 이상의 검출인 것인, 간세포암 진단 또는 예후 분석용 조성물
16 16
제 15 항에 있어서, 상기 마커 중 SERPINF2, SERPINA6, CLU, COL12A1, ERBB3, F11, FSTL1, ITGA2, KLKB1, LAMP2, LGALS3BP, PLXNA1은 탈당화펩타이드의 양으로 검출되고, 상기 마커 중 AM2, GLB1, BMP1, BCHE, GNS, GPR126, SERPIND1, ITGA6, ITGAM, ITGB2, KTN1, PTK7, ROBO4 및 VTN은 비당화펩타이드의 양으로 검출되고, 상기 마커 중 APOB, CFH, CPN2, VCAN, F5, HYOU1, ITGA3, POSTN 및 TNC는 탈당화 펩타이드 대 비당화펩타이드 양의 비로 검출되는 것인, 간세포암 진단 또는 예후 분석용 조성물
17 17
제 11 항 또는 제 12 항에 있어서, 상기 조성물은 ELISA 분석용, 딥스틱 래피드 키트(dip stick rapid kit) 분석용, 질량분석 및 MRM 분석용, 마이크로어레이용, 또는 면역분석용인, 간세포암 진단 또는 예후 분석용 조성물
18 18
간세포암의 진단 또는 예후에 필요한 정보를 제공하기 위하여, 대상체의 생물학적 시료로부터 Plexin-A1 (PLXNA1), Plasma kallikrein (KLKB1) 또는 Apolipoprotein B-100 (APOB) 중 하나 이상의 마커의 당화수준을 결정하는 단계;상기 당화수준의 검출 결과를 대조군 시료의 해당 마커의 상응하는 결과와 비교하는 단계; 및상기 대조군 시료와 비교하여, 상기 대상체 시료의 검출결과에 변동이 있는 경우, 이를 간세포암으로 판정하는 단계를 포함하는, 간세포암 마커를 검출하는 방법
19 19
제 18 항에 있어서, 상기 방법은 하기로 구성되는 군으로부터 선택되는 하나 이상 마커의 당화수준을 결정하는 단계를 추가로 포함하는 것인, 방법: Alpha-2-antiplasmin (SERPINF2), Alpha-2-macroglobulin (A2M), Beta-galactosidase (GLB1), Bone morphogenetic protein 1 (BMP1), Corticosteroid-binding globulin (SERPINA6), Complement factor H (CFH), Cholinesterase (BCHE), Clusterin (CLU), Collagen alpha-1(XII) chain (COL12A1), Carboxypeptidase N subunit 2 (CPN2), Versican core protein (VCAN), Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3 (ERBB3), Coagulation factor V (F5), Coagulation factor XI (F11), Follistatin-related protein 1 (FSTL1), N-acetylglucosamine-6-sulfatase (GNS), G-protein coupled receptor 126 (GPR126), Heparin cofactor 2 (SERPIND1), Hypoxia up-regulated protein 1 (HYOU1), Integrin alpha-2 (ITGA2), Integrin alpha-3 (ITGA3), Integrin alpha-6 (ITGA6), Integrin alpha-M (ITGAM), Integrin beta-2 (ITGB2), Kinectin (KTN1), Lysosome-associated membrane glycoprotein 2 (LAMP2), Galectin-3-binding protein (LGALS3BP), Periostin (POSTN), Inactive tyrosine-protein kinase 7 (PTK7), Roundabout homolog 4 (ROBO4), Tenascin (TNC) 및 Vitronectin (VTN)
20 20
제 18 항 또는 제 19 항에 있어서, 상기 각 마커는 표 17-1 내지 17-3에 개시된 탈당화 및 비당화펩타이드를 포함하며, 상기 검출은 상기 탈당화펩타이드의 양, 상기 비당화펩타이드 양 또는 상기 탈당화 펩타이드 대 비당화펩타이드 양의 비 중 하나 이상의 검출인 것인, 간세포암 마커를 검출하는 방법
21 21
제 20 항에 있어서, 상기 마커 중 SERPINF2, SERPINA6, CLU, COL12A1, ERBB3, F11, FSTL1, ITGA2, KLKB1, LAMP2, LGALS3BP, PLXNA1은 탈당화펩타이드의 양으로 검출되고, 상기 마커 중 AM2, GLB1, BMP1, BCHE, GNS, GPR126, SERPIND1, ITGA6, ITGAM, ITGB2, KTN1, PTK7, ROBO4 및 VTN은 비당화펩타이드의 양으로 검출되고, 상기 마커 중 APOB, CFH, CPN2, VCAN, F5, HYOU1, ITGA3, POSTN 및 TNC는 탈당화 펩타이드 대 비당화펩타이드 양의 비로 검출되는 것인, 간세포암 마커를 검출하는 방법
22 22
제 20 항에 있어서, 상기 탈당화 펩타이드 또는 상기 비당화 펩타이드의 양은 MRM (Multiple Reaction Monitoring)을 이용한 액체크로마토그래피 질량분석법으로 측정되는 것인, 간세포암 마커를 검출하는 방법
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순번 패밀리번호 국가코드 국가명 종류
1 EP03035058 EP 유럽특허청(EPO) FAMILY
2 EP03035058 EP 유럽특허청(EPO) FAMILY
3 WO2015023068 WO 세계지적재산권기구(WIPO) FAMILY

DOCDB 패밀리 정보

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순번 패밀리번호 국가코드 국가명 종류
1 EP3035058 EP 유럽특허청(EPO) DOCDBFAMILY
2 EP3035058 EP 유럽특허청(EPO) DOCDBFAMILY
3 EP3035058 EP 유럽특허청(EPO) DOCDBFAMILY
4 WO2015023068 WO 세계지적재산권기구(WIPO) DOCDBFAMILY
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순번 연구부처 주관기관 연구사업 연구과제
1 교육과학기술부 서울대학교 다중오믹스신기술개발 생분자 시그니처 검증을 위한 Clinical MRM 및 Immunoassay 기술개발
2 산업통상자원부 서울대학교병원 산업융합원천기술개발사업 간암 조기진단, 소라페닙 반응예측 및 TACE 예후진단 위한 다중 마커 검지 플랫폼 개발