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질량 변화량 목록을 이용한 상향식 단백질 변형 탐색 방법및 프로그램 저장 매체

  • 기술번호 : KST2015213053
  • 담당센터 : 대전기술혁신센터
  • 전화번호 : 042-610-2279
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요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 본 발명은 질량 변화량 목록을 이용한 상향식 단백질 변형 탐색 방법에 관한 것으로서, 본 발명에 의한 방법은 질량/질량 실험을 통해 측정된 단편 이온들의 질량과 이론적으로 계산된 단편 이온들의 질량을 비교하여 질량 변화량 목록을 제작하는 단계(a); 상기 (a) 단계에서 생성된 목록들을 단백질의 서열 순서대로 탐색해가며 단백질의 변형이 일어난 지점을 탐색하는 단계(b); 단백질의 변형으로 인한 질량 변화와 변형이 일어난 지점의 아미노산의 특성을 이용하여 단백질 변형 데이터베이스를 탐색하여 오차범위 내의 실제로 존재 가능한 단백질 변형 후보군을 수집하는 단계(c); 상기 (c) 단계에서 선택된 단백질 변형 후보를 보여주는 단계(d)를 포함한다. 단백질, 질량분석, 변형, 이온, 목록, 서열, 아미노산, 데이터베이스, 알고리즘
Int. CL G06F 17/00 (2006.01) G06F 17/30 (2006.01)
CPC G06F 19/22(2013.01) G06F 19/22(2013.01)
출원번호/일자 1020060120152 (2006.11.30)
출원인 한국정보통신대학교 산학협력단
등록번호/일자 10-0698466-0000 (2007.03.15)
공개번호/일자
공고번호/일자 (20070321) 문서열기
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보
법적상태 소멸
심사진행상태 수리
심판사항
구분
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2006.11.30)
심사청구항수 5

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 한국정보통신대학교 산학협력단 대한민국 대전광역시 유성구

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 이관수 대한민국 대전 유성구
2 강지용 대한민국 전북 군산시
3 김동주 대한민국 서울 강남구

대리인

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번호 이름 국적 주소
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최종권리자

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번호 이름 국적 주소
1 한국과학기술원 대전광역시 유성구
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번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 특허출원서
Patent Application		 2006.11.30 수리 (Accepted) 1-1-2006-0891959-12
2 우선심사신청서
Request for Accelerated Examination		 2006.11.30 수리 (Accepted) 1-1-2006-0892082-65
3 선행기술조사의뢰서
Request for Prior Art Search		 2007.01.19 수리 (Accepted) 9-1-9999-9999999-89
4 선행기술조사보고서
Report of Prior Art Search		 2007.02.09 수리 (Accepted) 9-1-2007-0008603-06
5 등록결정서
Decision to grant		 2007.02.27 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2007-0120595-16
6 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2007.03.21 수리 (Accepted) 4-1-2007-5043304-47
7 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2007.12.24 수리 (Accepted) 4-1-2007-5193163-24
번호, 청구항의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 청구항 표입니다.
번호 청구항
1 1
질량 변화량 목록을 이용한 상향식 단백질 변형 탐색 방법에 있어서,(a) 질량/질량 실험을 통해 측정된 단편 이온들의 질량과 이론적으로 계산된 단편 이온들의 질량을 비교하여 질량 변화량 목록을 제작하는 단계;(b) 상기 (a) 단계에서 생성된 목록들을 단백질의 서열 순서대로 탐색해가며 단백질의 변형이 일어난 지점을 탐색하는 단계;(c) 단백질의 변형으로 인한 질량 변화와 변형이 일어난 지점의 아미노산의 특성을 이용하여 단백질 변형 데이터베이스를 탐색하여 오차범위 내의 실제로 존재 가능한 단백질 변형 후보군을 수집하는 단계; 및(d) 상기 (c) 단계에서 선택된 상기 단백질 변형 후보군을 보여주는 단계를 포함하여 이루어진 것을 특징으로 하는 질량 변화량 목록을 이용한 상향식 단백질 변형 탐색 방법
2 2
제 1항에 있어서, 상기 단계 (a)는, (a1) 단백질 서열정보로부터 생성 가능한 모든 질량/질량 단편 이온들을 결정하고, 그 이온들의 이론적 질량을 계산하는 단계;(a2) 질량/질량 실험으로 얻어진 모든 단편 이온들의 실측 질량과 상기 (a1) 단계에서 계산된 모든 단편 이온들의 이론적 질량의 차이를 계산하는 단계;(a3) 상기 (a2) 단계에서 계산된 각각의 결과들에 대하여, 질량의 차이, 실측 질량, 실측 질량과 비교된 단편 이온의 이름을 저장하는 단계; 및(a4) 상기 (a3) 단계에서 저장된 정보를 질량의 차이가 같은 정보끼리 묶어 다수개의 소목록으로 구성하는 단계를 포함하여 이루어지는 것을 특징으로 하는 질량 변화량 목록을 이용한 상향식 단백질 변형 탐색 방법
3 3
제 2항에 있어서, 상기 단계 (b)는, (b1) 상기 소목록의 크기, 즉 동일한 질량의 차이를 가지는 정보들의 개수를 측정하는 단계; 및(b2) 상기 (b1) 에서 소목록의 크기가 일정 값 이상이면 해당 소목록이 가지고 있는 질량의 차이와 해당 소목록의 처음에 저장되어 있는 단편 이온의 이름으로부터 얻어진 아미노산을 저장하는 단계를 포함하여 이루어지는 것을 특징으로 하는 질량 변화량 목록을 이용한 상향식 단백질 변형 탐색 방법
4 4
제 3항에 있어서, 상기 단계 (c)는,(c1) 공개된 단백질 변형 데이터베이스로부터 변형의 질량 정보와 단백질 변형이 존재 가능한 아미노산을 취득하여 개별 데이터베이스를 구축하는 단계; 및(c2) 상기 (b2) 단계에서 저장된 질량의 차이와 아미노산 이름으로 상기 (c1) 단계에서 제작한 개별 데이터베이스에서 단백질 변형을 검색하여 가능한 단백질 변형 후보군을 수집하는 것을 특징으로 하는 질량 변화량 목록을 이용한 상향식 단백질 변형 탐색 방법
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제 1항 내지 제 4항에 중 하나의 항에 있는 방법을 실행하기 위한 프로그램이 저장된 프로그램 저장 매체
지정국 정보가 없습니다
패밀리정보가 없습니다
국가 R&D 정보가 없습니다.