맞춤기술찾기

홈으로 가기
맞춤기술찾기
이전대상기술
프린트하기

이전대상기술

대사 네트워크의 신 생합성 경로 탐색 시스템 및 방법

  • 기술번호 : KST2015118645
  • 담당센터 : 대전기술혁신센터
  • 전화번호 : 042-610-2279
상담신청 PDF 받기
요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 목적물질을 역추적하여, 알려진 물질로부터 해당 목적물질까지의 생합성 경로를 확인할 수 있는 대사 네트워크의 신 생합성 경로 탐색 시스템 및 방법이 개시된다. 본 발명에 따른 대사 네트워크의 신 생합성 경로 탐색 시스템은 현재까지 알려진 전체적인 대사 네트워크의 모든 반응에 대하여 시뮬레이션을 수행함으로써, 아직까지 알려지지 않은 새로운 합성 경로를 설계하는데 유용하다.대사 네트워크, 생합성 경로, 효소
Int. CL G06F 17/00 (2006.01) C12M 1/34 (2006.01) C12M 1/00 (2006.01)
CPC C12M 41/48(2013.01) C12M 41/48(2013.01)
출원번호/일자 1020070128461 (2007.12.11)
출원인 한국과학기술원
등록번호/일자 10-1151412-0000 (2012.05.23)
공개번호/일자 10-2009-0061445 (2009.06.16) 문서열기
공고번호/일자 (20120608) 문서열기
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보
법적상태 등록
심사진행상태 수리
심판사항
구분 신규
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2010.05.10)
심사청구항수 10

출원인

번호, 이름, 국적, 주소의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 인명정보 - 출원인 표입니다.
번호 이름 국적 주소
1 한국과학기술원 대한민국 대전광역시 유성구

발명자

번호, 이름, 국적, 주소의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 인명정보 - 발명자 표입니다.
번호 이름 국적 주소
1 이상엽 대한민국 대전광역시 유성구
2 박선원 대한민국 대전광역시 유성구
3 조아연 대한민국 경기도 의정부
4 윤홍석 대한민국 대전광역시 유성구

대리인

번호, 이름, 국적, 주소의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 인명정보 - 대리인 표입니다.
번호 이름 국적 주소
1 이처영 대한민국 서울특별시 강남구 언주로 ***, **층 (역삼동, 윤익빌딩)(*T국제특허법률사무소)

최종권리자

번호, 이름, 국적, 주소의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 인명정보 - 최종권리자 표입니다.
번호 이름 국적 주소
1 한국과학기술원 대전광역시 유성구
번호, 서류명, 접수/발송일자, 처리상태, 접수/발송일자의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 행정처리 표입니다.
번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 [특허출원]특허출원서
[Patent Application] Patent Application		 2007.12.11 수리 (Accepted) 1-1-2007-0890722-76
2 [심사청구]심사청구(우선심사신청)서
[Request for Examination] Request for Examination (Request for Preferential Examination)		 2010.05.10 수리 (Accepted) 1-1-2010-0297182-15
3 선행기술조사의뢰서
Request for Prior Art Search		 2011.08.18 수리 (Accepted) 9-1-9999-9999999-89
4 선행기술조사보고서
Report of Prior Art Search		 2011.09.15 수리 (Accepted) 9-1-2011-0072740-15
5 의견제출통지서
Notification of reason for refusal		 2011.10.17 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2011-0596150-15
6 [명세서등 보정]보정서
[Amendment to Description, etc.] Amendment		 2011.11.21 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) 1-1-2011-0919463-97
7 [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견(답변, 소명)서
[Opinion according to the Notification of Reasons for Refusal] Written Opinion(Written Reply, Written Substantiation)		 2011.11.21 수리 (Accepted) 1-1-2011-0919464-32
8 등록결정서
Decision to grant		 2012.05.21 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2012-0294920-05
9 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2013.02.01 수리 (Accepted) 4-1-2013-5019983-17
10 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2014.12.24 수리 (Accepted) 4-1-2014-5158129-58
11 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2014.12.24 수리 (Accepted) 4-1-2014-5157993-01
12 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2014.12.24 수리 (Accepted) 4-1-2014-5157968-69
13 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2019.04.24 수리 (Accepted) 4-1-2019-5081392-49
14 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2020.05.15 수리 (Accepted) 4-1-2020-5108396-12
15 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2020.06.12 수리 (Accepted) 4-1-2020-5131486-63
번호, 청구항의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 청구항 표입니다.
번호 청구항
1 1
다음을 포함하는 대사 네트워크의 신 생합성 경로 탐색 장치: (a) 대사물질 및 대사경로 정보가 수록된 바이오실리코(Biosilico) 데이터베이스;(b) 대사물질의 작용기 정보가 수록된 작용기(Fn Group) DB, 대사 네트워크의 생합성 반응 메커니즘 및 상기 메커니즘에 관여하는 작용기 정보가 수록된 반응 메커니즘(Rxn Info) DB 및 생합성 경로 탐색을 위하여 대사 네트워크의 신 생합성 경로 탐색 장치에서 수행된 연산결과가 수록된 결과(Result) DB를 포함하는 장치 데이터베이스; (c) 상기 장치 데이터베이스를 이용하여 생합성 경로를 설계하는 반응관리(Reaction Manager) 모듈, 상기 설계된 생합성 경로에 관여하는 대사물질의 구조적 연산을 담당하는 대사물질 관리(Fragment Manager) 모듈 및 상기 설계된 생합성 경로들의 우선순위 산출 및 대사 네트워크의 신 생합성 경로 탐색 장치를 제어하는 메인(Main) 모듈을 포함하는 프로그램 모듈; 및(d) 상기 대사물질의 구조를 핸들링하기 위한 JChem 모듈
2 2
제1항에 있어서, 상기 바이오실리코(Biosilico) 데이터베이스는 KEGG LIGAND, ENZYME, EcoCyc 및 MetaCyc로 이루어진 군에서 선택되는 대사 네트워크 관련 공개 데이터베이스가 통합된 것을 특징으로 하는 대사 네트워크의 신 생합성 경로 탐색 장치
3 3
제1항 또는 제2항의 대사 네트워크의 신 생합성 경로 탐색 장치를 이용하는 것을 특징으로 하는 대사 네트워크의 신 생합성 경로 탐색방법
4 4
다음의 단계를 포함하는 대사 네트워크의 신 생합성 경로 탐색방법:(a) 목적물질의 2차원 화학 구조 및 최대 생합성 경로의 반응단계 수를 입력하는 단계;(b) 상기 (a) 단계에서 입력된 목적물질을 구성하는 작용기를 작용기(Fn Group) DB에서 검색하고, 상기 검색된 작용기가 관여하는 반응 메커니즘을 반응 메커니즘(Rxn Info) DB에서 검색하는 단계;(c) 상기 (b) 단계에서 검색된 반응 메커니즘을 통하여, 목적물질의 대사 전 물질인 기질을 확인한 후, 상기 확인된 기질을 또 다른 목적물질로 지정하고, 상기 지정된 또 다른 목적물질에 대한 기질을 반응 메커니즘을 통하여 확인하는 것을 반복하는 단계; (d) 상기 (c) 단계에서 확인된 기질로부터 (a) 단계에서 입력된 최초 목적물질까지의 신 생합성경로를 설계하는 단계; (e) 상기 설계된 신 생합성경로를 구성하는 각각의 반응단계에 대하여 동일한 메커니즘을 나타내는 생화학 반응 목록을 반응 메커니즘(Rxn Info) DB에서 검색하여, 각 생합성 반응을 촉매하는 효소와 매핑시켜, 상기 생화학 반응 효소목록을 획득한 다음, 상기 생화학 반응 효소목록을 기준으로 생합성 경로 후보군을 작성하는 단계;(f) 상기 (d) 단계에서 설계된 신 생합성경로에 대한 열역학적 적합도를 산출하고, 상기 산출된 값을 상기 생합성 경로 후보군에 매칭하는 단계;(g) 상기 (e) 단계에서 획득된 효소가 매핑된 생화학 반응 목록과 이에 상응하는 신 생합성경로를 대상으로 생화학반응의 양변에 존재하는 기질 및 생성물의 2차원 화학 구조적 유사도 값을 산출하고, 상기 산출된 값을 상기 생합성 경로 후보군에 매칭하는 단계;(h) 상기 (e) 단계에서 획득된 생화학 반응 효소목록을 구성하는 각각의 효소와 관련된 대사경로를 바이오실리코(Biosilico) 데이터베이스에서 검색하고, 상기 생합성 경로 후보군과 검색된 대사경로에 동일하게 관여하는 효소들의 공유도를 산출하는 단계;(i) 상기 (e) 단계에서 획득된 생화학 반응 효소목록을 구성하는 각각의 효소를 발현시키는 유기체를 바이오실리코(Biosilico) 데이터베이스에서 검색하고, 상기 생합성 경로 후보군의 관련 효소들이 동일한 유기체에서 발현되는 정도를 산출하는 단계; 및(j) 상기 (f)~(i)단계에서 산출된 값을 하기 수학식 1에 적용하여 상기 생합성 경로 후보군들의 우선순위를 산출하는 단계:[수학식 1]A : 화학 구조적 유사도의 합B : 열역학적 적합도C : 효소들의 대사경로 공유도D : 효소들이 동일한 유기체에서 발현되는 정도n(Rx): 생합성 경로의 반응단계 수
5 5
제4항에 있어서, 상기 (a)단계의 목적물질의 2차원 화학 구조의 입력은 JChem 모듈을 이용하는 것을 특징으로 하는 것인 대사 네트워크의 신 생합성 경로 탐색방법
6 6
제4항에 있어서, 상기 (c)단계의 반복은 상기 (a)단계에서 입력된 최대 생합성 경로의 반응단계 수를 만족시키도록 수행되는 것을 특징으로 하는 대사 네트워크의 신 생합성 경로 탐색방법
7 7
제4항에 있어서, 상기 (c)단계에서 확인된 기질은 바이오실리코 데이터베이스중, 동일한 분자식을 갖는 구조 이성질체에 한하여 구조 비교를 수행하는 것을 특징으로 하는 대사 네트워크의 신 생합성 경로 탐색방법
8 8
제4항에 있어서, 상기 (f)단계의 열역학적 적합도는 하기 수학식 2로 계산되는 반응의 깁스 에너지차(△G)로 산출되는 것을 특징으로 하는 대사 네트워크의 신 생합성 경로 탐색방법:[수학식 2]Q: 반응지수
9 9
제4항에 있어서, 상기 (g)단계의 2차원 화학 구조적 유사도는 하기 수학식 3 또는 4로 계산되는 타니모토 계수(Tanimoto coefficient; T)로 산출되는 것을 특징으로 하는 대사 네트워크의 신 생합성 경로 탐색방법:[수학식 3]A와 B라는 분자를 비교할 때,a: A분자에는 존재하나 B분자에는 존재하지 않는 작용기의 수b: A분자에는 존재하지 않지만 B분자에는 존재하는 작용기의 수c: A 및 B분자에 모두 존재하는 작용기의 수[수학식 4]A: A분자에 존재하는 작용기B: B분자에 존재하는 작용기
10 10
제4항에 있어서, 상기 (a), (e), (h), (i) 및 (j) 단계는 메인 모듈에서 수행되며, 상기 (b), (c) 및 (d) 단계는 반응관리 모듈에서 수행되고, 상기 (f) 단계는 대사물질 관리 모듈 및 메인 모듈에서 수행되며, 상기 (g) 단계는 대사물질 관리 모듈에서 수행되는 것을 특징으로 하는 대사 네트워크의 신 생합성 경로 탐색방법
지정국 정보가 없습니다
패밀리정보가 없습니다
국가 R&D 정보가 없습니다.