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다음의 단계를 포함하는, 약물 표적 효소 또는 그 유전자의 스크리닝 방법:(a) 대상 미생물을 선정하고, 선정된 미생물의 대사 네트워크 모델을 구축하는 단계; (b) 상기 구축된 미생물 대사 네트워크에서 특정 대사산물을 유일하게 소비하거나 생산하는 효소들인 쵸크포인트를 약물 표적 효소 후보들 (I)로 선정하는 단계;(c) 상기 미생물 대사 네트워크를 구성하고 있는 효소 반응식들에 대하여 상기 효소 반응식들을 한 개씩 차단시키면서 선형계획법을 적용하였을 때, 세포 성장이 일어나지 않는 경우의 차단된 효소 반응식을 약물 표적 효소 후보들(II)로 선정하는 단계; (d) 상기 (b)와 (c) 단계에서 얻은 결과인 약물 표적 효소 후보들 (I)과 (II)를 비교하여 중복되는 약물 표적 효소 후보들을 제1차 약물 표적 효소군으로 선정하는 단계;(e) 상기 (d)에서 선정된 제1차 약물 표적 효소군 중에서 숙주 단백질과 상동관계가 없고, 동질효소(isozyme)를 갖지 않는 것들을 제2차 약물 표적 효소군으로 선정하고, 상기 제2차 표적 효소들을 코딩하는 유전자들을 제1 약물 표적 유전자군으로 선정하는 단계; (f) 상기 (a) 단계에서 구축된 대사 네트워크 상에서 특정 대사산물들의 소비하는 모든 효소 반응식을 차단시켰을 때, 세포의 성장속도가 0인 경우의 상기 특정 대사산물들을 필수 대사산물들(I)로 결정하는 단계;(g) 상기 (f)에서 결정된 필수 대사산물들(I) 중 각각의 필수대사산물을 소비하는 모든 효소 반응식이 숙주 단백질과 상동관계가 없는 것들로만 이루어지는 경우의 필수 대사산물들을 추가로 선별하고, 상기 추가로 선별된 필수 대사산물들(II)을 소비하는 효소 반응식에 사용되는 효소들을 코딩하는 유전자들을 제2 약물 표적 유전자군으로 선정하는 단계; (h) 상기 (e)단계에서 선정된 제1 약물 표적 유전자군 및 상기 (g)단계에서 선정된 제2 약물 표적 유전자군으로 구성된 군에서 선택된 유전자의 다양한 조합을 만드는 단계; 및 (i) 상기 (h)단계에서 만든 조합들을 이루는 유전자들이 코딩하는 효소가 관여하는 반응식들에 대하여, 대사산물들 간의 반응을 나타내는 선에 해당 반응식의 노드를 추가로 만들어서, 이 반응식 노드들의 거리를 구하여 , 상기 대사 네트워크 상에서의 평균거리를 계산하여 상기 평균 거리가 다른 조합들의 평균거리와 비교하여 먼 경우들의 조합을 이루는 유전자들을 약물 표적 유전자로 선정하거나, 이에 의해 코딩되는 효소들을 약물 표적 효소로 선정하는 단계
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제1항에 있어서, 상기 (e)단계에서 선정된 제2차 약물 표적 효소군은 숙주 단백질과 상동관계가 없고, 동질효소(isozyme)를 갖지 않으면서, 상기 대사 네트워크를 구성하고 있는 한 개 이상의 효소 반응식에 관여하는 경우의 제1차 약물 표적 효소 후보들 중에서 선정되는 것을 특징으로 하는 방법
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다음의 단계를 포함하는, 약물 표적 효소 또는 그 유전자의 스크리닝 방법:(a) 대상 미생물을 선정하고, 선정된 미생물의 대사 네트워크 모델을 구축하는 단계; (b) 상기 구축된 미생물 대사 네트워크에서 특정 대사산물을 유일하게 소비하거나 생산하는 효소들인 쵸크포인트를 약물 표적 효소 후보들 (I)로 선정하는 단계;(c) 상기 미생물 대사 네트워크를 구성하고 있는 효소 반응식들에 대하여 상기 효소 반응식들을 한 개씩 차단시키면서 선형계획법을 적용하였을 때, 세포 성장이 일어나지 않는 경우의 차단된 효소 반응식을 약물 표적 효소 후보들(II)로 선정하는 단계; (d) 상기 (b)와 (c) 단계에서 얻은 결과인 약물 표적 효소 후보들 (I)과 (II)를 비교하여 중복되는 약물 표적 효소 후보들을 제1차 약물 표적 효소군으로 선정하는 단계;(e) 상기 (d)에서 선정된 제1차 약물 표적 효소군 중에서 숙주 단백질과 상동관계가 없고, 상기 대사 네트워크를 구성하고 있는 한 개 이상의 효소 반응식에 관여하는 것들을 제2차 약물 표적 효소군으로 선정하고, 상기 제2차 표적 효소들을 코딩하는 유전자들을 제1 약물 표적 유전자군으로 선정하는 단계;(f) 상기 (a) 단계에서 구축된 대사 네트워크 상에서 특정 대사산물들의 소비하는 모든 효소 반응식을 차단시켰을 때, 세포의 성장속도가 0인 경우의 상기 특정 대사산물들을 필수 대사산물들(I)로 결정하는 단계;(g) 상기 (f)에서 결정된 필수 대사산물들(I) 중 각각의 필수대사산물을 소비하는 모든 효소 반응식이 숙주 단백질과 상동관계가 없는 것들로만 이루어지는 경우의 필수 대사산물들을 추가로 선별하고, 상기 추가로 선별된 필수 대사산물들(II)을 소비하는 효소 반응식에 사용되는 효소들을 코딩하는 유전자들을 제2 약물 표적 유전자군으로 선정하는 단계; (h) 상기 (e)단계에서 선정된 제1 약물 표적 유전자군 및 상기 (g)단계에서 선정된 제2 약물 표적 유전자군으로 구성된 군에서 선택된 유전자의 다양한 조합을 만드는 단계; 및 (i) 상기 (h)단계에서 만든 조합들을 이루는 유전자들이 코딩하는 효소가 관여하는 반응식들에 대하여, 대사산물들 간의 반응을 나타내는 선에 해당 반응식의 노드를 추가로 만들어서, 이 반응식 노드들의 거리를 구하여 , 상기 대사 네트워크 상에서의 평균거리를 계산하여 상기 평균 거리가 다른 조합들의 평균거리와 비교하여 먼 경우들의 조합을 이루는 유전자들을 약물 표적 유전자로 선정하거나, 이에 의해 코딩되는 효소들을 약물 표적 효소로 선정하는 단계
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제1항 내지 제3항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 미생물은 병원성 및/또는 전염성인 원핵 또는 진핵생물인 것을 특징으로 하는 방법
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제1항 내지 제3항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 (b) 단계에서 쵸크포인트의 선정은 상기 구축된 대사 네트워크 모델을 구성하고 있는 모든 대사산물에 대하여 정립된 질량 보존식들을 이용하는 것을 특징으로 하는 방법
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제5항에 있어서, 상기 쵸크 포인트의 선정은 MetaFluxNet 프로그램을 이용하는 것을 특징으로 하는 방법
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제1항 내지 제3항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 선형계획법을 적용할 때, 목적함수를 세포 성장 속도를 최대화하는 것으로 설정하는 것을 특징으로 하는 방법
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제7항에 있어서, 상기 선형계획법의 적용은 세포의 성장에 필요한 모든 영양분 조건을 반영하여 하는 것을 특징으로 하는 방법
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제1항 내지 제3항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 숙주 단백질은 인간 단백질인 것을 특징으로 하는 방법
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제1항 내지 제3항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 (e)단계 및 (g)단계에서, 상동관계의 검토는 아미노산 서열 또는 유전자 서열을 이용하는 것을 특징으로 하는 방법
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제10항에 있어서, 상기 상동관계의 검토는 BLASTP 프로그램 또는 BLAST 프로그램을 이용하여 이루어지는 것을 특징으로 하는 방법
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제1항 내지 제3중 어느 한 항에 있어서, 상기 (h)단계에서 유전자의 조합을 만들 때, 제2 약물 표적 유전자군을 이루는 유전자들 중에서 비필수 반응식(nonessential reaction)에 관여하는 효소들을 코딩하는 유전자는 동일한 조합에 속하도록 구성되는 것을 특징으로 하는 방법
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제1항 내지 제3중 어느 한 항에 있어서, 상기 (h)단계에서 유전자의 조합을 만들 때, 제2 약물 표적 유전자군에서 선택되는 유전자는 동일한 조합에 속하도록 구성되는 것을 특징으로 하는 방법
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제1항 내지 제3항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 대사 네트워크 상에서의 평균거리는 각 효소 반응식을 나타내는 선 및 반응식 노드를 이용하는 것을 특징으로 하는 방법
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다음의 단계를 포함하는, 약물 표적 효소 또는 그 유전자의 스크리닝 방법:(a) 대상 미생물을 선정하고, 선정된 미생물의 대사 네트워크 모델을 구축하는 단계; (b) 상기 구축된 미생물 대사 네트워크에서 특정 대사산물을 유일하게 소비하거나 생산하는 효소들인 쵸크포인트를 제1차 약물 표적 효소군으로 선정하는 단계;(c) 상기 (b)에서 선정된 제1차 약물 표적 효소군 중에서 숙주 단백질과 상동관계가 없고, 동질효소(isozyme)를 갖지 않으면서, 상기 대사 네트워크를 구성하고 있는 한 개 이상의 효소 반응식에 관여하는 경우의 것들을 제2차 약물 표적 효소군으로 선정하고, 상기 제2차 표적 효소들을 코딩하는 유전자들을 제1 약물 표적 유전자군으로 선정하는 단계; (d) 상기 (a) 단계에서 구축된 대사 네트워크 상에서 특정 대사산물들의 소비하는 모든 효소 반응식을 차단시켰을 때, 세포의 성장속도가 0인 경우의 상기 특정 대사산물들을 필수 대사산물들(I)로 결정하는 단계;(e) 상기 (d)에서 결정된 필수 대사산물들(I) 중 각각의 필수대사산물을 소비하는 모든 효소 반응식이 숙주 단백질과 상동관계가 없는 것들로만 이루어지는 경우의 필수 대사산물들을 추가로 선별하고, 상기 추가로 선별된 필수 대사산물들(II)을 소비하는 효소 반응식에 사용되는 효소들을 코딩하는 유전자들을 제2 약물 표적 유전자군으로 선정하는 단계; (f) 상기 (c)단계에서 선정된 제1 약물 표적 유전자군 및 상기 (e)단계에서 선정된 제2 약물 표적 유전자군으로 구성된 군에서 선택된 유전자의 다양한 조합을 만드는 단계; 및 (g) 상기 (f)단계에서 만든 조합들을 이루는 유전자들이 코딩하는 효소가 관여하는 반응식들에 대하여, 대사산물들 간의 반응을 나타내는 선에 해당 반응식의 노드를 추가로 만들어서, 이 반응식 노드들의 거리를 구하여 , 상기 대사 네트워크 상에서의 평균거리를 계산하여 상기 평균 거리가 다른 조합들의 평균거리와 비교하여 먼 경우들의 조합을 이루는 유전자들을 약물 표적 유전자로 선정하거나, 이에 의해 코딩되는 효소들을 약물 표적 효소로 선정하는 단계
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다음의 단계를 포함하는, 약물 표적 효소 또는 그 유전자의 스크리닝 방법:(a) 대상 미생물을 선정하고, 선정된 미생물의 대사 네트워크 모델을 구축하는 단계; (b) 상기 미생물 대사 네트워크를 구성하고 있는 효소 반응식들에 대하여 상기 효소 반응식들을 한 개씩 차단시키면서 선형계획법을 적용하였을 때, 세포 성장이 일어나지 않는 경우의 차단된 효소 반응식을 약물 표적 효소 후보들(II)로 선정하는 단계; (c) 상기 (b)에서 선정된 제1차 약물 표적 효소군 중에서 숙주 단백질과 상동관계가 없고, 동질효소(isozyme)를 갖지 않으면서, 상기 대사 네트워크를 구성하고 있는 한 개 이상의 효소 반응식에 관여하는 경우의 것들을 제2차 약물 표적 효소군으로 선정하고, 상기 제2차 표적 효소들을 코딩하는 유전자들을 제1 약물 표적 유전자군으로 선정하는 단계; (d) 상기 (a) 단계에서 구축된 대사 네트워크 상에서 특정 대사산물들의 소비하는 모든 효소 반응식을 차단시켰을 때, 세포의 성장속도가 0인 경우의 상기 특정 대사산물들을 필수 대사산물들(I)로 결정하는 단계;(e) 상기 (d)에서 결정된 필수 대사산물들(I) 중 각각의 필수대사산물을 소비하는 모든 효소 반응식이 숙주 단백질과 상동관계가 없는 것들로만 이루어지는 경우의 필수 대사산물들을 추가로 선별하고, 상기 추가로 선별된 필수 대사산물들(II)을 소비하는 효소 반응식에 사용되는 효소들을 코딩하는 유전자들을 제2 약물 표적 유전자군으로 선정하는 단계; (f) 상기 (c)단계에서 선정된 제1 약물 표적 유전자군 및 상기 (e)단계에서 선정된 제2 약물 표적 유전자군으로 구성된 군에서 선택된 유전자의 다양한 조합을 만드는 단계; 및 (g) 상기 (f)단계에서 만든 조합들을 이루는 유전자들이 코딩하는 효소가 관여하는 반응식들에 대하여, 대사산물들 간의 반응을 나타내는 선에 해당 반응식의 노드를 추가로 만들어서, 이 반응식 노드들의 거리를 구하여 , 상기 대사 네트워크 상에서의 평균거리를 계산하여 상기 평균 거리가 다른 조합들의 평균거리와 비교하여 먼 경우들의 조합을 이루는 유전자들을 약물 표적 유전자로 선정하거나, 이에 의해 코딩되는 효소들을 약물 표적 효소로 선정하는 단계
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