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1) EST, SAGE 및 마이크로어레이 데이터 세트에서 유전자의 발현량을 수치화하는 단계; 및,
2) 단계 1)의 유전자 발현량과 제로비율을 이용하여 여러 조직에서 항상 발현되는 유전자를 선별하는 단계를 포함하는 후보 표준 발현 유전자(Endogenous Reference Genes; ERG)의 선별방법
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제 1항에 있어서, 단계 1)의 유전자 발현량 수치화는 하기 수학식 1 및 2를 이용하는 것을 특징으로 하는 방법
003c#수학식 1003e#
003c#수학식 2003e#
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3
제 1항에 있어서, 단계 1)의 데이터 세트는 CGAP EST(Hs_ExprData
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제 1항에 있어서, 단계 2)의 제로비율은 하기 수학식 3으로 기재되는 것을 특징으로 하는 방법
003c#수학식 3003e#
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5
제 1항의 방법에 의하여 선별된 후보 표준 발현 유전자를 검출할 수 있는 검출 시약을 포함하는 상기 후보 표준 발현 유전자의 검출용 조성물
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6
제 5항에 있어서, 선별된 후보 표준 발현 유전자는 Accession No
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7
제 5항에 있어서, 검출 시약은 후보 표준 발현 유전자를 특이적으로 증폭할 수 있는 프라이머쌍 및/또는 프로브인 것을 특징으로 하는 조성물
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8
제 7항에 있어서, 프라이머쌍은 상기 유전자의 센스 서열에서 선택되는 10 ~ 50 bp 길이의 센스 프라이머 및 유전자의 안티센스 서열에서 선택되는 10 ~ 50 bp 길이의 안티센스 프라이머인 것을 특징으로 하는 조성물
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9
제 8항에 있어서, 센스 프라이머의 길이는 12 ~ 30 bp인 것을 특징으로 하는 조성물
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10
제 8항에 있어서, 안티센스 프라이머의 길이는 12 ~ 30 bp인 것을 특징으로 하는 조성물
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제 5항에 있어서, 유전자 검출은 마이크로어레이, SAGE(Serial Analysis of Gene Expression) 또는 qRT-PCR(quantitative real time PCR) 방법으로 측정되는 것을 특징으로 하는 조성물
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12
제 1항의 방법으로 선별된 후보 표준 발현 유전자의 변동계수(coefficient of variation, CV)를 측정하여 변동계수가 낮은 순으로 표준 발현 유전자를 선별하는 단계를 포함하는 유전자 발현량 측정 시 참고용 유전자의 선별방법
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13
제 12항에 있어서, 참고용 유전자는 인체의 대부분 조직에서 발현하는 유전자인 것을 특징으로 하는 방법
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제 12항에 있어서, 참고용 유전자는 유전자 발현량의 상대적 정량 분석 시, 시료 간 발현량의 표준화에 사용할 수 있는 것을 특징으로 하는 방법
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15
제 12항에 있어서, 변동계수는 유전자 발현량의 변화가 클수록 값이 커지는 것을 특징으로 하는 방법
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제 12항의 방법에 의하여 선별된 참고용 유전자를 검출할 수 있는 검출 시약을 포함하는 상기 참고용 유전자의 검출용 조성물
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17
제 16항에 있어서, 참고용 유전자는 Accession No
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제 16항에 있어서, 검출 시약은 참고용 유전자를 특이적으로 증폭할 수 있는 프라이머쌍 및/또는 프로브인 것을 특징으로 하는 조성물
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제 16항에 있어서, 참고용 유전자는 세포 내 존재하는 대부분의 전사체의 낮은 발현량과 비슷한 발현량을 나타내는 것을 특징으로 하는 조성물
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20
제 18항에 있어서, 프라이머쌍은 상기 유전자의 센스 서열에서 선택되는 10 ~ 50 bp 길이의 센스 프라이머 및 유전자의 안티센스 서열에서 선택되는 10 ~ 50 bp 길이의 안티센스 프라이머인 것을 특징으로 하는 조성물
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21
제 20항에 있어서, 센스 프라이머의 길이는 12 ~ 30 bp인 것을 특징으로 하는 조성물
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제 20항에 있어서, 안티센스 프라이머의 길이는 12 ~ 30 bp인 것을 특징으로 하는 조성물
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제 20항에 있어서, 유전자 검출은 마이크로어레이, SAGE(Serial Analysis of Gene Expression) 또는 qRT-PCR(quantitative real time PCR) 방법으로 측정되는 것을 특징으로 하는 조성물
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1) 피검체로부터 수득된 RNA로부터 cDNA를 수득하는 단계;
2) 단계 1)의 cDNA를 주형 DNA로 하여 대상 유전자를 증폭할 수 있는 프라이머쌍 및/또는 프로브를 이용하여 상기 대상 유전자를 실시간 PCR로 증폭하고, 제 5 항의 조성물을 이용하여 시료에 포함되어 있는 후보 표준 발현 유전자를 실시간 PCR로 증폭하는 단계; 및,
3) 단계 2)의 대상 유전자의 발현 정도 및 후보 표준 발현 유전자의 발현 정도를 표준화하는 단계를 포함하는 대상 유전자의 발현량 정량 방법
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1) 피검체로부터 수득된 RNA로부터 cDNA를 수득하는 단계;
2) 단계 1)의 cDNA를 주형 DNA로 하여 대상 유전자를 증폭할 수 있는 프라이머쌍 및/또는 프로브를 이용하여 상기 대상 유전자를 실시간 PCR로 증폭하고, 제 16 항의 조성물을 이용하여 시료에 포함되어 있는 후보 표준 발현 유전자를 실시간 PCR로 증폭하는 단계; 및,
3) 단계 2)의 대상 유전자의 발현 정도 및 후보 표준 발현 유전자의 발현 정도를 표준화하는 단계를 포함하는 대상 유전자의 발현량 정량 방법
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1) 피검체로부터 수득된 게놈 DNA를 주형 DNA로 하여 대상 유전자를 증폭할 수 있는 프라이머쌍 및/또는 프로브를 이용하여 상기 대상 유전자를 실시간 PCR로 증폭하고, 제 5 항의 조성물을 이용하여 시료에 포함되어 있는 후보 표준 발현 유전자를 실시간 PCR로 증폭하는 단계; 및,
2) 단계 1)의 대상 유전자의 발현 정도 및 후보 표준 발현 유전자의 발현 정도를 표준화하는 단계를 포함하는 대상 유전자의 게놈 DNA 내의 증폭여부 감별 방법
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1) 피검체로부터 수득된 게놈 DNA를 주형 DNA로 하여 대상 유전자를 증폭할 수 있는 프라이머쌍 및/또는 프로브를 이용하여 상기 대상 유전자를 실시간 PCR로 증폭하고, 제 16 항의 조성물을 이용하여 시료에 포함되어 있는 후보 표준 발현 유전자를 실시간 PCR로 증폭하는 단계; 및,
2) 단계 1)의 대상 유전자의 발현 정도 및 후보 표준 발현 유전자의 발현 정도를 표준화하는 단계를 포함하는 정량 대상 유전자의 게놈 DNA 내의 증폭여부 감별 방법
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