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리가제 반응과 절단효소 증폭반응을 이용한 표적 유전자 또는 이의 돌연변이 검출방법

  • 기술번호 : KST2015115613
  • 담당센터 : 대전기술혁신센터
  • 전화번호 : 042-610-2279
요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 본 발명은 표적 유전자 또는 이의 돌연변이의 검출방법에 관한 것으로, 보다 상세하게는 (a) 중합효소연쇄반응(Polymerase Chain Reaction)으로 증폭된 표적 유전자의 증폭산물에 대하여, 표적 유전자의 5' 영역 및 3' 영역에 각각 상보적으로 결합하는 제 1 프로브 및 제 2 프로브를 사용하여 리가제 반응(Ligase reaction)을 수행하는 단계; (b) 상기 (a) 단계의 리가제 반응산물에 대해, 상기 반응산물에 포함된 제 1 프로브에 상보적으로 결합하는 절단효소 증폭 프라이머, 제 2 프로브의 절단효소 인식 염기서열을 인지하는 절단 효소, 및 중합효소의 혼합용액을 첨가하고 절단효소 증폭반응(Nicking Amplification)을 수행하는 단계; 및 (c) 상기 (b) 단계의 증폭반응에 의한 DNA 절편의 생성유무를 확인하여, 표적 유전자의 존재를 확인하는 단계를 포함하는 표적 유전자 또는 이의 돌연변이의 검출방법에 관한 것이다. 본 발명에 따른 표적 유전자 또는 이의 돌연변이 검출방법은 임의의 짧은 길이의 DNA 조각을 대량 합성하여 질량분석하기 때문에 민감도, 특이도 및 재현성이 우수할 뿐만 아니라 다수의 시료를 대상으로 표적 유전자의 여러 개의 돌연변이 여부를 동시에 신속 정확하게 분석할 수 있어 유전적 요인에 의한 질병의 예방, 조기 진단 및 개인 맞춤 의약품 개발과 처방뿐만 아니라, 현장진단을 위한 바이오센서의 플랫폼으로 유용하다.
Int. CL C12Q 1/68 (2006.01) C12Q 1/48 (2006.01) C12N 15/11 (2006.01)
CPC C12Q 1/6827(2013.01) C12Q 1/6827(2013.01) C12Q 1/6827(2013.01)
출원번호/일자 1020120015795 (2012.02.16)
출원인 한국과학기술원
등록번호/일자 10-1358416-0000 (2014.01.27)
공개번호/일자 10-2013-0094498 (2013.08.26) 문서열기
공고번호/일자 (20140211) 문서열기
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보
법적상태 등록
심사진행상태 수리
심판사항
구분 신규
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2012.02.16)
심사청구항수 12

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 한국과학기술원 대한민국 대전광역시 유성구

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 박현규 대한민국 대전광역시 유성구
2 박정훈 대한민국 대전광역시 유성구
3 정예림 대한민국 대전광역시 유성구
4 정철희 대한민국 대전광역시 유성구

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 이처영 대한민국 서울특별시 강남구 언주로 ***, **층 (역삼동, 윤익빌딩)(*T국제특허법률사무소)

최종권리자

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번호 이름 국적 주소
1 한국과학기술원 대전광역시 유성구
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번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 [특허출원]특허출원서
[Patent Application] Patent Application
2012.02.16 수리 (Accepted) 1-1-2012-0124931-63
2 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2013.02.01 수리 (Accepted) 4-1-2013-5019983-17
3 선행기술조사의뢰서
Request for Prior Art Search
2013.02.28 수리 (Accepted) 9-1-9999-9999999-89
4 선행기술조사보고서
Report of Prior Art Search
2013.04.09 수리 (Accepted) 9-1-2013-0027362-84
5 의견제출통지서
Notification of reason for refusal
2013.07.30 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2013-0524766-88
6 [명세서등 보정]보정서
[Amendment to Description, etc.] Amendment
2013.09.24 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) 1-1-2013-0864363-20
7 [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견(답변, 소명)서
[Opinion according to the Notification of Reasons for Refusal] Written Opinion(Written Reply, Written Substantiation)
2013.09.24 수리 (Accepted) 1-1-2013-0864362-85
8 등록결정서
Decision to grant
2014.01.24 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2014-0057086-52
9 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2014.12.24 수리 (Accepted) 4-1-2014-5157968-69
10 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2014.12.24 수리 (Accepted) 4-1-2014-5158129-58
11 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2014.12.24 수리 (Accepted) 4-1-2014-5157993-01
12 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2019.04.24 수리 (Accepted) 4-1-2019-5081392-49
13 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2020.05.15 수리 (Accepted) 4-1-2020-5108396-12
14 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2020.06.12 수리 (Accepted) 4-1-2020-5131486-63
번호, 청구항의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 청구항 표입니다.
번호 청구항
1 1
(a) 중합효소연쇄반응(Polymerase Chain Reaction)으로 증폭된 표적 유전자의 증폭산물에 대하여, 표적 유전자의 돌연변이 위치를 중심으로 5' 영역 및 3' 영역에 각각 상보적으로 결합하는 제 1 프로브 및 제 2 프로브를 사용하여 리가제 반응(Ligase reaction)을 수행하는 단계; (b) 상기 (a) 단계의 리가제 반응산물에 대해, 상기 반응산물에 포함된 제 1 프로브에 상보적으로 결합하는 절단효소 증폭 프라이머, 제 2 프로브의 절단효소 인식 염기서열을 인지하는 절단 효소, 및 중합효소의 혼합용액을 첨가하고 절단효소 증폭반응(Nicking Amplification)을 수행하는 단계; 및(c) 상기 (b) 단계의 증폭반응에 의한 DNA 절편의 생성유무를 확인하여, 표적 유전자의 존재를 확인하는 단계를 포함하는 표적 유전자의 돌연변이 검출방법에 있어서, 상기 제 1 프로브는 5' 말단에 상기 표적 유전자에 존재하는 돌연변이 위치와 상보적인 염기를 가지며, 3' 말단에 절단효소 증폭반응을 위한 프라이머 혼성화 염기서열을 포함하고,상기 제 2 프로브는 3' 말단에 표적 유전자에 존재하는 돌연변이 위치와 상보적인 염기를 가지며, 5' 말단에 절단효소 인식 염기서열을 포함하는 것을 특징으로 하는 표적 유전자의 돌연변이 검출방법
2 2
삭제
3 3
삭제
4 4
제1항에 있어서, 상기 (a) 단계의 리가제 반응에 사용하는 효소는 90N 리가제, E
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삭제
6 6
삭제
7 7
제1항에 있어서, 상기 (b) 단계의 절단효소는 Nb
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제1항에 있어서, 상기 (b) 단계의 중합효소는 Klenow DNA 중합효소, Bsu DNA 중합효소, Vent DNA 중합효소 및 Bst DNA 중합효소로 구성된 군으로부터 선택되는 것을 특징으로 하는 돌연변이 검출방법
9 9
제1항에 있어서, 상기 (c) 단계의 DNA 절편의 생성유무는 MALDI-TOF MS((Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization - Time of Flight Mass Spectrometry))를 이용하여 확인하는 것을 특징으로 하는 돌연변이 검출방법
10 10
제1항에 있어서, 상기 (c) 단계의 DNA 절편의 생성유무는 절단효소 증폭반응(Nicking Amplification)의 결과로 증폭된 DNA 절편과 상보적인 염기서열을 가지며, 형광물질(Fluorophore)와 소광제(Quencher)를 포함하는 분자 비콘(molecular beacon) 형태의 프로브를 이용하여 확인하는 것을 특징을 하는 돌연변이 검출방법
11 11
(a) 중합효소연쇄반응(Polymerase Chain Reaction)으로 증폭된 표적 유전자의 증폭산물에 대하여, 표적 유전자의 5' 영역 및 3' 영역에 각각 상보적으로 결합하는 제 1 프로브 및 제 2 프로브를 사용하여 리가제 반응(Ligase reaction)을 수행하는 단계; (b) 상기 (a) 단계의 리가제 반응산물에 대해, 상기 반응산물에 포함된 제 1 프로브에 상보적으로 결합하는 절단효소 증폭 프라이머, 제 2 프로브의 절단효소 인식 염기서열을 인지하는 절단 효소 및 중합효소의 혼합용액을 첨가하고 절단효소 증폭반응(Nicking Amplification)을 수행하는 단계; 및(c) 상기 (b) 단계의 증폭반응에 의한 DNA 절편의 생성유무를 확인하여, 표적 유전자의 존재를 확인하는 단계는 방법을 포함하는 표적 유전자의 검출방법에 있어서,상기 제 1 프로브는 3' 말단에 절단효소 증폭반응을 위한 프라이머 혼성화 염기서열을 포함하고,상기 제 2 프로브는 5' 말단에 절단효소 인식 염기서열을 포함하는 것을 특징으로 하는 표적 유전자의 검출방법
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삭제
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제11항에 있어서, 상기 (a) 단계의 리가제 반응에 사용하는 효소는 90N 리가제, E
15 15
제11항에 있어서, 상기 (b) 단계의 절단효소는 Nb
16 16
제11항에 있어서, 상기 (b) 단계의 중합효소는 Klenow DNA 중합효소, Bsu DNA 중합효소, Vent DNA 중합효소 및 Bst DNA 중합효소로 구성된 군으로부터 선택되는 것을 특징으로 하는 표적 유전자의 검출방법
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제11항에 있어서, 상기 (c) 단계의 DNA 절편의 생성유무는 MALDI-TOF MS((Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization - Time of Flight Mass Spectrometry)를 이용하여 확인하는 것을 특징으로 하는 표적 유전자의 검출방법
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제11항에 있어서, 상기 (c) 단계의 DNA 절편의 생성유무는 절단효소 증폭반응(Nicking Amplification)의 결과로 증폭된 DNA 절편과 상보적인 염기서열을 가지며, 형광물질(Fluorophore)와 소광제(Quencher)를 포함하는 분자 비콘(molecular beacon) 형태의 프로브를 이용하여 확인하는 것을 특징으로 하는 표적 유전자의 검출방법
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1 WO2013122319 WO 세계지적재산권기구(WIPO) FAMILY

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1 지식경제부 전자부품연구원 산업원천기술개발사업 유방암 및 비뇨생식기 질환의 조기진단을 위한 저가 보급형 질량분석기 개발