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단백질 상호작용 네트워크에서의 콤플렉스 탐색 방법 및그 장치

기술번호 : KST2015099808
담당센터 : 대전기술혁신센터
전화번호 : 042-610-2279

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요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약	본 발명은 단백질 상호작용 네트워크(Protein-Protein Interaction Network)에서 이종 단백질들 사이의 유사성을 이용하여 단백질 콤플렉스(Protein Complex)를 탐색하는 방법 및 장치에 관한 것이다. 본 발명에 따른 단백질 상호작용 네트워크에서 콤플렉스를 탐색하는 방법은, (a) 이종 단백질들 사이의 호몰로지 정보를 이용하여, 이종의 콤플렉스에 포함된 단백질들을 해당 종의 단백질로 매핑하여 해당 종에 대한 가상의 콤플렉스를 생성하는 단계; 및 (b) 해당 종의 단백질 상호작용 네트워크에서 생성된 가상의 콤플렉스를 탐색하는 단계를 포함하는 것을 특징으로 한다. 이에 따라, 고비용의 생물학적 실험을 통하지 않고서도 기존의 밝혀진 하등생물의 유전정보를 이용하여 특정 고등생물의 콤플렉스를 자동으로 탐색할 수 있다. 단백질, 콤플렉스, 상호작용, 호몰로지
Int. CL	G6F1 9/12 (2011.01) G06F 19/18 (2011.01)
CPC	G16B 5/00(2013.01) G16B 5/00(2013.01)
출원번호/일자	1020040110350 (2004.12.22)
출원인	한국전자통신연구원
등록번호/일자	10-0871085-0000 (2008.11.24)
공개번호/일자	10-2006-0064437 (2006.06.13) 문서열기
공고번호/일자	(20081128) 문서열기
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보	대한민국 \| 1020040102915 \| 2004.12.08
법적상태	등록
심사진행상태	수리
심판사항	심판사항
구분
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자	Y (2007.01.24)
심사청구항수	8

출원인

번호, 이름, 국적, 주소의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 인명정보 - 출원인 표입니다.
번호	이름	국적	주소
1	한국전자통신연구원	대한민국	대전광역시 유성구

발명자

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번호	이름	국적	주소
1	최재훈	대한민국	대전광역시 유성구
2	박종민	대한민국	전라북도 전주시 완산구
3	정재영	대한민국	대전 유성구
4	박선희	대한민국	대전광역시 서구

대리인

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번호	이름	국적	주소
1	신영무	대한민국	서울특별시 강남구 영동대로 **(대치동) KT&G타워 층(에스앤엘파트너스)

최종권리자

번호, 이름, 국적, 주소의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 인명정보 - 최종권리자 표입니다.
번호	이름	국적	주소
1	대한민국(산업통상자원부장관)		세종특별자치시 한누리대

번호, 서류명, 접수/발송일자, 처리상태, 접수/발송일자의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 행정처리 표입니다.
번호	서류명	접수/발송일자	처리상태	접수/발송번호
1	특허출원서 Patent Application	2004.12.22	수리 (Accepted)	1-1-2004-0606083-56
2	대리인변경신고서 Agent change Notification	2006.06.27	불수리 (Non-acceptance)	1-1-2006-0455226-60
3	서류반려이유안내서 Notice of Reason for Return of Document	2006.06.27	발송처리완료 (Completion of Transmission)	1-5-2006-0092477-36
4	대리인변경신고서 Agent change Notification	2006.06.28	수리 (Accepted)	1-1-2006-0461887-15
5	반려요청서 Request for Return	2006.07.27	수리 (Accepted)	1-1-2006-0540650-88
6	서류반려안내서 Notification for Return of Document	2006.07.28	발송처리완료 (Completion of Transmission)	1-5-2006-0106765-54
7	출원심사청구서 Request for Examination	2007.01.24	수리 (Accepted)	1-1-2007-0070741-22
8	의견제출통지서 Notification of reason for refusal	2008.04.03	발송처리완료 (Completion of Transmission)	9-5-2008-0187983-55
9	[명세서등 보정]보정서 [Amendment to Description, etc.] Amendment	2008.05.13	보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment)	1-1-2008-0336769-06
10	[거절이유 등 통지에 따른 의견]의견(답변, 소명)서 [Opinion according to the Notification of Reasons for Refusal] Written Opinion(Written Reply, Written Substantiation)	2008.05.13	수리 (Accepted)	1-1-2008-0336732-17
11	거절결정서 Decision to Refuse a Patent	2008.09.12	발송처리완료 (Completion of Transmission)	9-5-2008-0475997-16
12	명세서 등 보정서(심사전치) Amendment to Description, etc(Reexamination)	2008.11.07	보정승인 (Acceptance of amendment)	7-1-2008-0051095-75
13	[분할출원]특허출원서 [Divisional Application] Patent Application	2008.11.07	수리 (Accepted)	1-1-2008-0772525-88
14	등록결정서 Decision to grant	2008.11.20	발송처리완료 (Completion of Transmission)	9-5-2008-0585886-59
15	출원인정보변경(경정)신고서 Notification of change of applicant's information	2009.08.04	수리 (Accepted)	4-1-2009-5150899-36
16	출원인정보변경(경정)신고서 Notification of change of applicant's information	2015.02.02	수리 (Accepted)	4-1-2015-0006137-44

번호, 청구항의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 청구항 표입니다.
번호	청구항
1	1 하드웨어로 구현되는 콤플렉스 탐색 장치를 이용하여 단백질 상호작용 네트워크에서 콤플렉스를 탐색하는 방법에 있어서,상호작용 데이터베이스로부터 단백질 상호작용 네트워크를 선택하는 단계;콤플렉스 데이터베이스로부터 상기 선택된 단백질 상호작용 네트워크의 해당 종과 다른 이종의 콤플렉스를 선택하는 단계;호몰로지 데이터베이스에 저장된 이종 단백질들 사이의 호몰로지 정보를 이용하여 상기 이종의 콤플렉스에 대응하는 가상의 콤플렉스를 생성하는 단계; 및상기 상호작용 데이터베이스를 이용하여 상기 가상의 콤플렉스가 상기 단백질 상호작용 네트워크에 존재하는지 여부를 탐색하는 단계를 포함하는 콤플렉스 탐색 방법
2	2 제 1항에 있어서, 상기 가상의 콤플렉스를 생성하는 단계는, 상기 호몰로지 데이터베이스에 기반하여 상기 이종의 콤플렉스를 구성하는 단백질들을 상기 단백질 상호작용 네트워크의 해당 종의 호몰로지 단백질로 매핑하는 단계;상기 호몰로지 데이터베이스에 기반하여 상기 이종의 콤플렉스를 구성하는 단백질들 사이의 상호작용 관계를 상기 단백질 상호작용 네트워크의 해당 종의 호몰로지 단백질들 사이의 관계로 매핑하는 단계; 및 상기 매핑된 호몰로지 단백질 및 상기 매핑된 호몰로지 단백질들 사이의 관계를 이용하여 상기 가상의 콤플렉스를 생성하는 단계를 포함하는 콤플렉스 탐색 방법
3	3 제 2항에 있어서, 상기 가상의 콤플렉스가 상기 단백질 상호작용 네트워크에 존재하는지 여부를 탐색하는 단계는,상기 상호작용 데이터베이스에 기반하여 상기 가상의 콤플렉스를 구성하는 호몰로지 단백질들을 상기 단백질 상호작용 네트워크에 포함된 단백질로 매핑하는 단계;상기 상호작용 데이터베이스에 기반하여 상기 가상의 콤플렉스를 구성하는 단백질들 사이의 관계를 상기 단백질 상호작용 네트워크에 포함된 호몰로지 단백질들 사이의 관계로 매핑하는 단계;상기 매핑된 호몰로지 단백질 및 상기 매핑된 호몰로지 단백질들 사이의 관계를 이용하여 상기 가상의 콤플렉스에 대응하는 후보 콤플렉스를 생성하는 단계; 및상기 후보 콤플렉스를 상기 단백질 상호작용 네트워크에서 탐색하는 단계를 포함하는 콤플렉스 탐색 방법
4	4 제 3항에 있어서, 상기 가상의 콤플렉스가 상기 단백질 상호작용 네트워크에 존재하는지 여부를 탐색하는 단계는,상기 상호작용 데이터베이스에 기반한 매핑 과정을 통해 매핑되지 않는 호몰로지 단백질 및 호몰로지 단백질들 사이의 관계를 사용자의 입력에 기반하여 다시 매핑하는 단계를 더 포함하는 콤플렉스 탐색 방법
5	5 단백질 상호작용 네트워크에서 콤플렉스를 탐색하는 하드웨어 콤플렉스 탐색 장치에 있어서,하나의 종에 존재하는 콤플렉스 및 상기 콤플렉스를 구성하는 요소에 대한 정보들을 포함하는 콤플렉스 데이터베이스;단백질들의 상호작용 네트워크에 대한 정보를 포함하는 상호작용 데이터베이스;이종 간에 대응하는 호몰로지 단백질의 매핑 정보를 포함하는 호몰로지 데이터베이스; 및상기 콤플렉스 데이터베이스, 상기 상호작용 데이터베이스 및 상기 호몰로지 데이터베이스에 기반하여 이종의 콤플렉스에 포함된 단백질들을 해당 종의 단백질로 매핑하여 해당 종에 대한 가상의 콤플렉스를 생성하고, 해당 종의 단백질 상호작용 네트워크에서 상기 가상의 콤플렉스를 탐색하는 콤플렉스 탐색부를 포함하는 콤플렉스 탐색 장치
6	6 제 5항에 있어서, 상기 콤플렉스 탐색부는 상기 이종의 콤플렉스를 구성하는 단백질들을 해당 종의 호몰로지 단백질로 매핑하고, 상기 이종의 콤플렉스를 구성하는 단백질들 사이의 상호작용 관계를 해당 종의 호몰로지 단백질들 사이의 관계로 매핑하고, 상기 매핑된 호몰로지 단백질 및 상기 매핑된 호몰로지 단백질들 사이의 관계를 이용하여 상기 가상의 콤플렉스를 생성하는 콤플렉스 탐색 장치
7	7 제 6항에 있어서,상기 콤플렉스 탐색부는 상기 가상의 콤플렉스를 구성하는 단백질들을 상기 단백질 상호작용 네트워크에 포함된 호몰로지 단백질로 매핑하고, 상기 가상의 콤플렉스를 구성하는 단백질들 사이의 관계를 상기 단백질 상호작용 네트워크에 포함된 호몰로지 단백질들 사이의 관계로 매핑하고, 상기 매핑된 호모롤지 단백질 및 상기 매핑된 호몰로지 단백질들 사이의 관계를 이용하여 상기 가상의 콤플렉스에 대응하는 후보 콤플렉스를 생성하고, 상기 후보 콤플렉스를 상기 해당 종의 단백질 상호작용 네트워크에서 탐색하는 콤플렉스 탐색 장치
8	8 제 7항에 있어서,상기 콤플렉스 탐색부는 상기 후보 콤플렉스를 생성하는 과정에서 매핑되지 않는 호몰로지 단백질 및 호몰로지 단백질들 사이의 관계를 매핑하기 위한 정보를 사용자에게 제공하는 입출력부를 더 포함하는 콤플렉스 탐색 장치
9	8 제 7항에 있어서,상기 콤플렉스 탐색부는 상기 후보 콤플렉스를 생성하는 과정에서 매핑되지 않는 호몰로지 단백질 및 호몰로지 단백질들 사이의 관계를 매핑하기 위한 정보를 사용자에게 제공하는 입출력부를 더 포함하는 콤플렉스 탐색 장치

순번, 패밀리번호, 국가코드, 국가명, 종류의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 패밀리정보 - 패밀리정보 표입니다.
순번	패밀리번호	국가코드	국가명	종류
1	US20060147999	US	미국	FAMILY

DOCDB 패밀리 정보

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순번	패밀리번호	국가코드	국가명	종류
1	US2006147999	US	미국	DOCDBFAMILY

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특허 등록번호	10-0871085-0000

권리란

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표시번호	사항
1	출원 연월일 : 20041222 출원 번호 : 1020040110350 공고 연월일 : 20081128 공고 번호 : 특허결정(심결)연월일 : 20081120 청구범위의 항수 : 4 유별 : G06F 19/00 발명의 명칭 : 단백질 상호작용 네트워크에서의 콤플렉스 탐색 방법 및그 장치 존속기간(예정)만료일 :

특허권자란

순위번호, 사항의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 등록사항 > 특허권자란 표입니다.
순위번호	사항
1	(권리자) 한국전자통신연구원 대전광역시 유성구...
2	(권리자) 대한민국(산업통상자원부장관) 세종특별자치시 한누리대...
2	(의무자) 한국전자통신연구원 대전광역시 유성구...

등록료란

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제 1 - 3 년분	금 액	213,000 원	2008년 11월 25일	납입
제 4 년분	금 액	216,000 원	2011년 10월 28일	납입
제 5 년분	금 액	128,000 원	2012년 10월 31일	납입
제 6 - 17 년분	금 액	0 원	2013년 07월 30일	납입

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번호	서류명	접수/발송일자	처리상태	접수/발송번호
1	특허출원서	2004.12.22	수리 (Accepted)	1-1-2004-0606083-56
2	대리인변경신고서	2006.06.27	불수리 (Non-acceptance)	1-1-2006-0455226-60
3	서류반려이유안내서	2006.06.27	발송처리완료 (Completion of Transmission)	1-5-2006-0092477-36
4	대리인변경신고서	2006.06.28	수리 (Accepted)	1-1-2006-0461887-15
5	반려요청서	2006.07.27	수리 (Accepted)	1-1-2006-0540650-88
6	서류반려안내서	2006.07.28	발송처리완료 (Completion of Transmission)	1-5-2006-0106765-54
7	출원심사청구서	2007.01.24	수리 (Accepted)	1-1-2007-0070741-22
8	의견제출통지서	2008.04.03	발송처리완료 (Completion of Transmission)	9-5-2008-0187983-55
9	[명세서등 보정]보정서	2008.05.13	보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment)	1-1-2008-0336769-06
10	[거절이유 등 통지에 따른 의견]의견(답변, 소명)서	2008.05.13	수리 (Accepted)	1-1-2008-0336732-17
11	거절결정서	2008.09.12	발송처리완료 (Completion of Transmission)	9-5-2008-0475997-16
12	명세서 등 보정서(심사전치)	2008.11.07	보정승인 (Acceptance of amendment)	7-1-2008-0051095-75
13	[분할출원]특허출원서	2008.11.07	수리 (Accepted)	1-1-2008-0772525-88
14	등록결정서	2008.11.20	발송처리완료 (Completion of Transmission)	9-5-2008-0585886-59
15	출원인정보변경(경정)신고서	2009.08.04	수리 (Accepted)	4-1-2009-5150899-36
16	출원인정보변경(경정)신고서	2015.02.02	수리 (Accepted)	4-1-2015-0006137-44


과제고유번호	1440001147
세부과제번호	2005-S-008
연구과제명	바이오데이터마이닝및통합관리핵심S/W컴포넌트개발
성과구분	등록
부처명	지식경제부
연구관리전문기관명	정보통신연구진흥원
연구주관기관명	한국전자통신연구원
성과제출연도	2005
연구기간	200302~200801
기여율	1
연구개발단계명	응용연구
6T분류명	IT(정보기술)

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번호	심판번호(숫자)	심판번호(문자)	사건의표시	청구일	심결일자
1	2008101010523	2008원10523	2004년 특허출원 제0110350호 거절결정불복심판	2008.10.10	2008.11.20

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