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단백질 정보 동기화 시스템에서의 단백질 상호작용 네트워크의 단백질 정보 동기화 방법에 있어서,(a) 단백질 상호작용 정보들을 저장하는 단백질 상호작용 네트워크 데이터베이스로부터 갱신이 요구되는 단백질을 선택하는 단계;(b) 공공에 제공되는 단백질 정보들을 저장하는 전역 단백질 데이터베이스로부터 상기 선택된 단백질에 대한 정보를 수신하고 상기 수신된 단백질 정보와 상기 단백질 상호작용 네트워크 데이터베이스에 대응하는 단백질에 관한 정보를 저장하는 지역 단백질 데이터베이스의 단백질에 대한 정보를 전역 동기화하여 상기 지역 단백질 데이터베이스를 최신화 정보로 유지하는 단계; 및 (c) 상기 지역 단백질 데이터베이스로부터 상기 동기화된 단백질에 대한 정보를 수신하고 상기 수신된 단백질 정보와 상기 단백질 상호작용 네트워크 데이터베이스의 단백질에 대한 정보를 지역 동기화하여 상기 단백질 상호작용 네트워크 데이터베이스를 최신화 정보로 유지하는 단계;를 포함하는 단백질 상호작용 네트워크의 단백질 정보 동기화 방법
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제 1항에 있어서,상기 (b) 단계는 (b1) 상기 선택된 단백질에 대해 갱신 요구 질의를 XML 형태로 변환하는 단계; (b2) 상기 XML 형태의 질의에 해당하는 최신 단백질 정보를 전역 단백질 데이터베이스로부터 HTML 형태로 수신하여 분석하는 단계;(b3) 상기 분석된 HTML를 XML 기반의 래퍼(wrapper)로 포장하는 단계;(b4) 상기 래퍼(wrapper)로부터 지역 단백질 데이터베이스에 필요한 항목을 추출하는 단계; 및(b5) 상기 추출된 항목 정보를 상기 지역 단백질 데이터베이스에 존재하던 단백질 정보에 병합하여 지역 단백질 데이터베이스를 수정하는 단계;를 포함하는 것을 특징으로 하는 단백질 상호작용 네트워크의 단백질 정보 동기화 방법
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제 1항에 있어서, 상기 (c) 단계는 (c1) 상기 선택된 단백질과 이름, 유전자 및 종이 유사한 단백질들을 지역 단백질 데이터베이스로부터 필터링하는 단계; (c2) 상기 필터링 된 단백질들 중에서 상기 선택된 단백질과 이름, 동의어, 유전자, 온톨로지 및 종의 상세 정보가 가장 유사한 하나의 단백질을 선정하는 단계; (c3) 상기 선정된 단백질 정보로부터 단백질 상호작용 네트워크 데이터베이스의 단백질에 필요한 항목을 추출하는 단계; 및 (c4) 상기 추출된 항목 정보를 상기 단백질 상호작용 네트워크 데이터베이스에 존재하던 단백질 정보에 병합하여 상기 단백질 상호작용 네트워크 데이터베이스를 수정하는 단계;를 포함하는 것을 특징으로 하는 단백질 상호작용 네트워크의 단백질 정보 동기화 방법
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공공에 제공되는 단백질 정보를 저장하는 전역 단백질 데이터베이스; 단백질 상호작용 정보의 집합을 저장하는 단백질 상호작용 네트워크 데이터베이스;상기 단백질 상호작용 네트워크 데이터베이스에 대응하는 단백질에 관한 정보를 저장하는 지역 단백질 데이터베이스; 상기 전역 단백질 데이터베이스로부터 선택된 단백질에 대한 정보를 수신하고 상기 수신된 단백질 정보와 상기 지역 단백질 데이터베이스의 단백질에 대한 정보를 전역 동기화하여 상기 지역 단백질 데이터베이스를 최신화 정보로 유지하는 전역 동기화부; 및 상기 지역 단백질 데이터베이스로부터 상기 동기화된 단백질에 대한 정보를 수신하고 상기 수신된 단백질 정보와 상기 단백질 상호작용 네트워크 데이터베이스의 단백질에 대한 정보를 지역 동기화하여 상기 단백질 상호작용 네트워크 데이터베이스를 최신화 정보로 유지하는 지역 동기화부;를 포함하는 단백질 상호작용 네트워크의 단백질 정보 동기화 시스템
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제 4항에 있어서, 상기 전역 동기화부는,상기 선택된 단백질에 대해 갱신 요구 질의를 XML 형태로 변환하고, 상기 XML 형태의 질의에 해당하는 최신 단백질 정보를 전역 단백질 데이터베이스로부터 HTML 형태로 수신하여 분석하고, 상기 분석된 HTML를 XML 기반의 래퍼(wrapper)로 포장하고, 상기 래퍼(wrapper)로부터 지역 단백질 데이터베이스에 필요한 항목을 추출하고, 상기 추출된 항목 정보를 상기 지역 단백질 데이터베이스에 존재하던 단백질 정보에 병합하여 지역 단백질 데이터베이스를 수정하는 것을 특징으로 하는 단백질 상호작용 네트워크의 단백질 정보 동기화 시스템
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제 4항에 있어서, 상기 지역 동기화부는,상기 선택된 단백질과 이름, 유전자 및 종이 유사한 단백질들을 지역 단백질 데이터베이스로부터 필터링하고, 상기 필터링 된 단백질들 중에서 상기 선택된 단백질과 이름, 동의어, 유전자, 온톨로지 및 종의 상세 정보가 가장 유사한 하나의 단백질을 선정하고, 상기 선정된 단백질 정보로부터 단백질 상호작용 네트워크 데이터베이스의 단백질에 필요한 항목을 추출하고, 상기 추출된 항목 정보를 상기 단백질 상호작용 네트워크 데이터베이스에 존재하던 단백질 정보에 병합하여 상기 단백질 상호작용 네트워크 데이터베이스를 수정하는 것을 특징으로 하는 단백질 상호작용 네트워크의 단백질 정보 동기화 시스템
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