요약 | 본 발명은 하나의 종에 존재하는 방대한 단백질 상호작용 네트워크에서 규칙으로 표현되는 템플릿을 이용하여 의미가 있는 부분 단백질 상호작용 네트워크인 바이오 콤플렉스를 탐색하는 방법 및 장치에 관한 것이다. 본 발명에 따른 바이오 콤플렉스 탐색 방법은 (a) 하나 이상의 단백질로 구성되는 노드를 정의하고 상기 정의된 2개의 노드 및 하나의 관계로 구성되는 트리플을 정의하고 상기 트리플 또는 연산자를 이용하여 단일 규칙 및 복합 규칙을 정의함으로써 탐색을 원하는 콤플렉스에 대한 규칙 기반 템플릿을 정의하는 단계; (b) 상기 정의된 템플릿에 포함된 상기 노드에 해당하는 단백질 및 상기 트리플에 해당하는 단백질 상호작용 관계가 단백질 상호작용 네트워크에 실제로 존재하는지 여부를 분석함으로써 상기 템플릿에 정의된 규칙을 분석하는 단계; 및 (c) 상기 분석된 규칙에 포함된 트리플 및 상기 트리플에 포함된 노드를 실제 단백질 상호작용 네트워크의 단백질 상호작용 관계 및 단백질로 평가함으로써 상기 규칙과 일치하는 바이오 콤플렉스를 상기 단백질 상호작용 네트워크에서 탐색하는 단계;를 포함한다. |
---|---|
Int. CL | G06Q 50/10A0 (2008.03) G06F 17/30 (2006.01) |
CPC | G16B 20/00(2013.01) G16B 20/00(2013.01) |
출원번호/일자 | 1020060056529 (2006.06.22) |
출원인 | 한국전자통신연구원 |
등록번호/일자 | 10-0785780-0000 (2007.12.07) |
공개번호/일자 | 10-2007-0061185 (2007.06.13) 문서열기 |
공고번호/일자 | (20071218) 문서열기 |
국제출원번호/일자 | |
국제공개번호/일자 | |
우선권정보 |
대한민국 | 1020050120005 | 2005.12.08
|
법적상태 | 소멸 |
심사진행상태 | 수리 |
심판사항 | |
구분 | |
원출원번호/일자 | |
관련 출원번호 | |
심사청구여부/일자 | Y (2006.06.22) |
심사청구항수 | 8 |
번호 | 이름 | 국적 | 주소 |
---|---|---|---|
1 | 한국전자통신연구원 | 대한민국 | 대전광역시 유성구 |
번호 | 이름 | 국적 | 주소 |
---|---|---|---|
1 | 최재훈 | 대한민국 | 대전 유성구 |
2 | 박종민 | 대한민국 | 전북 전주시 완산구 |
3 | 박선희 | 대한민국 | 대전 서구 |
번호 | 이름 | 국적 | 주소 |
---|---|---|---|
1 | 리앤목특허법인 | 대한민국 | 서울 강남구 언주로 **길 **, *층, **층, **층, **층(도곡동, 대림아크로텔) |
번호 | 이름 | 국적 | 주소 |
---|---|---|---|
1 | 한국전자통신연구원 | 대한민국 | 대전광역시 유성구 |
번호 | 서류명 | 접수/발송일자 | 처리상태 | 접수/발송번호 |
---|---|---|---|---|
1 | 특허출원서 Patent Application |
2006.06.22 | 수리 (Accepted) | 1-1-2006-0442700-07 |
2 | 선행기술조사의뢰서 Request for Prior Art Search |
2007.02.08 | 수리 (Accepted) | 9-1-9999-9999999-89 |
3 | 선행기술조사보고서 Report of Prior Art Search |
2007.03.13 | 수리 (Accepted) | 9-1-2007-0013198-12 |
4 | 의견제출통지서 Notification of reason for refusal |
2007.08.06 | 발송처리완료 (Completion of Transmission) | 9-5-2007-0429712-75 |
5 | [명세서등 보정]보정서 [Amendment to Description, etc.] Amendment |
2007.09.10 | 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) | 1-1-2007-0655281-31 |
6 | [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견(답변, 소명)서 [Opinion according to the Notification of Reasons for Refusal] Written Opinion(Written Reply, Written Substantiation) |
2007.09.10 | 수리 (Accepted) | 1-1-2007-0655279-49 |
7 | 등록결정서 Decision to grant |
2007.11.02 | 발송처리완료 (Completion of Transmission) | 9-5-2007-0595455-39 |
8 | 출원인정보변경(경정)신고서 Notification of change of applicant's information |
2009.08.04 | 수리 (Accepted) | 4-1-2009-5150899-36 |
9 | 출원인정보변경(경정)신고서 Notification of change of applicant's information |
2015.02.02 | 수리 (Accepted) | 4-1-2015-0006137-44 |
번호 | 청구항 |
---|---|
1 |
1 바이오 콤플렉스의 탐색 장치에 의한 단백질 상호작용 네트워크에서 바이오 콤플렉스의 탐색 방법에 있어서,(a) 하나 이상의 단백질로 구성되는 노드를 정의하고 상기 정의된 2개의 노드 및 하나의 관계로 구성되는 트리플을 정의하고 상기 트리플 또는 연산자를 이용하여 단일 규칙 및 복합 규칙을 정의함으로써 탐색을 원하는 콤플렉스에 대한 규칙 기반 템플릿을 정의하는 단계; (b) 상기 정의된 템플릿에 포함된 상기 노드에 해당하는 단백질 및 상기 트리플에 해당하는 단백질 상호작용 관계가 단백질 상호작용 네트워크에 실제로 존재하는지 여부를 분석함으로써 상기 템플릿에 정의된 규칙을 분석하는 단계; 및 (c) 상기 분석된 규칙에 포함된 트리플 및 상기 트리플에 포함된 노드를 실제 단백질 상호작용 네트워크의 단백질 상호작용 관계 및 단백질로 평가함으로써 상기 규칙과 일치하는 바이오 콤플렉스를 상기 단백질 상호작용 네트워크에서 탐색하는 단계;를 포함하는 단백질 상호작용 네트워크에서 바이오 콤플렉스의 탐색 방법 |
2 |
2 제 1항에 있어서, 상기 (a) 단계는 (a1) 단백질 이름, 참조 정보 및 온톨로지 용어를 통하여 상기 템플릿에 포함되고 하나 이상의 단백질로 구성되는 노드를 정의하는 단계;(a2) 상기 정의된 2개의 노드 및 관계의 이름, 방향 및 관련도를 통하여 정의되는 하나의 관계로 구성되고 상기 템플릿에 포함되는 트리플을 정의하는 단계; (a3) 상기 정의된 하나의 트리플 또는 이미 정의된 규칙을 이용하여 상기 템플릿에 포함되는 단일 규칙을 정의하는 단계; 및(a4) 상기 정의된 트리플, 이미 정의된 규칙 및 연산자를 이용하여 상기 템플릿에 포함되는 복합 규칙을 정의하는 단계;를 포함하는 것을 특징으로 하는 바이오 콤플렉스의 탐색 방법 |
3 |
3 제 1항에 있어서,상기 (b) 단계는(b1) 상기 정의된 템플릿에 포함된 상기 노드에 해당하는 단백질이 단백질 상호작용 네트워크에 존재하는지를 분석하는 단계; (b2) 상기 정의된 템플릿에 포함된 상기 트리플에 해당하는 단백질 상호작용 관계가 단백질 상호작용 네트워크에 존재하는지를 분석하는 단계; 및 (b3) 상기 정의된 템플릿에 포함된 상기 복합 규칙들을 단일 규칙으로 확장하여 상기 모든 규칙이 상기에서 분석된 트리플 및 연산자만으로 구성되도록 확장함으로써 상기 복합 규칙을 분석하는 단계;를 포함하는 것을 특징으로 하는 바이오 콤플렉스의 탐색 방법 |
4 |
4 제 1항에 있어서,상기 (c) 단계는(c1) 상기에서 정의된 탐색을 원하는 콤플렉스에 대한 템플릿에 있어서 중순위 연산자 규칙을 후순위 연산자 규칙으로 변형하는 단계;(c2) 상기 후순위 연산자 규칙에 포함된 규칙 항목을 분리하는 단계; (c3) 상기 항목 중 트리플 및 트리플에 포함된 두 단백질을 실제 네트워크의 단백질 상호작용 관계 및 단백질로 평가하는 단계; 및(c3) 상기 항목 중 기본 연산자 및 그로부터 변형 가능한 트리플 연산자를 평가하는 단계;를 포함하는 것을 특징으로 하는 바이오 콤플렉스의 탐색 방법 |
5 |
5 하나 이상의 단백질로 구성되는 노드를 정의하고 상기 정의된 2개의 노드 및 하나의 관계로 구성되는 트리플을 정의하고 상기 트리플 또는 연산자를 이용하여 단일 규칙 및 복합 규칙을 정의함으로써 탐색을 원하는 콤플렉스에 대한 규칙 기반 템플릿을 정의하는 템플릿 정의부; 상기 정의된 템플릿에 포함된 상기 노드에 해당하는 단백질 및 상기 트리플에 해당하는 단백질 상호작용 관계가 단백질 상호작용 네트워크에 실제로 존재하는지 여부를 분석함으로써 상기 템플릿에 정의된 규칙을 분석하는 규칙 분석부; 및 상기 분석된 규칙에 포함된 트리플 및 상기 트리플에 포함된 노드를 실제 단백질 상호작용 네트워크의 단백질 상호작용 관계 및 단백질로 평가함으로써 상기 규칙과 일치하는 바이오 콤플렉스를 상기 단백질 상호작용 네트워크에서 탐색하는 규칙 평가부;를 포함하는 단백질 상호작용 네트워크에서 바이오 콤플렉스의 탐색 장치 |
6 |
6 제 5항에 있어서, 상기 템플릿 정의부는 (a1) 단백질 이름, 참조 정보 및 온톨로지 용어를 통하여 상기 템플릿에 포함되고 하나 이상의 단백질로 구성되는 노드를 정의하는 단계;(a2) 상기 정의된 2개의 노드 및 관계의 이름, 방향 및 관련도를 통하여 정의되는 하나의 관계로 구성되고 상기 템플릿에 포함되는 트리플을 정의하는 단계; (a3) 상기 정의된 하나의 트리플 또는 이미 정의된 규칙을 이용하여 상기 템플릿에 포함되는 단일 규칙을 정의하는 단계; 및(a4) 상기 정의된 트리플, 이미 정의된 규칙 및 연산자를 이용하여 상기 템플릿에 포함되는 복합 규칙을 정의하는 단계;를 수행하는 것을 특징으로 하는 바이오 콤플렉스의 탐색 장치 |
7 |
7 제 5항에 있어서,상기 규칙 분석부는(b1) 상기 정의된 템플릿에 포함된 상기 노드에 해당하는 단백질이 단백질 상호작용 네트워크에 존재하는지를 분석하는 단계; (b2) 상기 정의된 템플릿에 포함된 상기 트리플에 해당하는 단백질 상호작용 관계가 단백질 상호작용 네트워크에 존재하는지를 분석하는 단계; 및 (b3) 상기 정의된 템플릿에 포함된 상기 복합 규칙들을 단일 규칙으로 확장하여 상기 모든 규칙이 상기에서 분석된 트리플 및 연산자만으로 구성되도록 확장함으로써 상기 복합 규칙을 분석하는 단계;를 수행하는 것을 특징으로 하는 바이오 콤플렉스의 탐색 장치 |
8 |
8 제 5항에 있어서,상기 규칙 평가부는(c1) 상기에서 정의된 탐색을 원하는 콤플렉스에 대한 템플릿에 있어서 중순위 연산자 규칙을 후순위 연산자 규칙으로 변형하는 단계;(c2) 상기 후순위 연산자 규칙에 포함된 규칙 항목을 분리하는 단계; (c3) 상기 항목 중 트리플 및 트리플에 포함된 두 단백질을 실제 네트워크의 단백질 상호작용 관계 및 단백질로 평가하는 단계; 및(c3) 상기 항목 중 기본 연산자 및 그로부터 변형 가능한 트리플 연산자를 평가하는 단계;를 수행하는 것을 특징으로 하는 바이오 콤플렉스의 탐색 장치 |
지정국 정보가 없습니다 |
---|
순번 | 패밀리번호 | 국가코드 | 국가명 | 종류 |
---|---|---|---|---|
1 | US07869960 | US | 미국 | FAMILY |
2 | US20070136001 | US | 미국 | FAMILY |
순번 | 패밀리번호 | 국가코드 | 국가명 | 종류 |
---|---|---|---|---|
1 | US2007136001 | US | 미국 | DOCDBFAMILY |
2 | US7869960 | US | 미국 | DOCDBFAMILY |
국가 R&D 정보가 없습니다. |
---|
특허 등록번호 | 10-0785780-0000 |
---|
표시번호 | 사항 |
---|---|
1 |
출원 연월일 : 20060622 출원 번호 : 1020060056529 공고 연월일 : 20071218 공고 번호 : 특허결정(심결)연월일 : 20071102 청구범위의 항수 : 4 유별 : G06F 17/00 발명의 명칭 : 규칙 기반 템플릿을 이용한 바이오 콤플렉스의 탐색 방법및 장치 존속기간(예정)만료일 : 20131208 |
순위번호 | 사항 |
---|---|
1 |
(권리자) 한국전자통신연구원 대전광역시 유성구... |
제 1 - 3 년분 | 금 액 | 256,500 원 | 2007년 12월 10일 | 납입 |
제 4 년분 | 금 액 | 216,000 원 | 2010년 12월 01일 | 납입 |
제 5 년분 | 금 액 | 216,000 원 | 2011년 11월 29일 | 납입 |
제 6 년분 | 금 액 | 128,000 원 | 2012년 11월 29일 | 납입 |
번호 | 서류명 | 접수/발송일자 | 처리상태 | 접수/발송번호 |
---|---|---|---|---|
1 | 특허출원서 | 2006.06.22 | 수리 (Accepted) | 1-1-2006-0442700-07 |
2 | 선행기술조사의뢰서 | 2007.02.08 | 수리 (Accepted) | 9-1-9999-9999999-89 |
3 | 선행기술조사보고서 | 2007.03.13 | 수리 (Accepted) | 9-1-2007-0013198-12 |
4 | 의견제출통지서 | 2007.08.06 | 발송처리완료 (Completion of Transmission) | 9-5-2007-0429712-75 |
5 | [명세서등 보정]보정서 | 2007.09.10 | 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) | 1-1-2007-0655281-31 |
6 | [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견(답변, 소명)서 | 2007.09.10 | 수리 (Accepted) | 1-1-2007-0655279-49 |
7 | 등록결정서 | 2007.11.02 | 발송처리완료 (Completion of Transmission) | 9-5-2007-0595455-39 |
8 | 출원인정보변경(경정)신고서 | 2009.08.04 | 수리 (Accepted) | 4-1-2009-5150899-36 |
9 | 출원인정보변경(경정)신고서 | 2015.02.02 | 수리 (Accepted) | 4-1-2015-0006137-44 |
기술정보가 없습니다 |
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과제고유번호 | 1440001147 |
---|---|
세부과제번호 | 2005-S-008 |
연구과제명 | 바이오데이터마이닝및통합관리핵심S/W컴포넌트개발 |
성과구분 | 등록 |
부처명 | 지식경제부 |
연구관리전문기관명 | 정보통신연구진흥원 |
연구주관기관명 | 한국전자통신연구원 |
성과제출연도 | 2005 |
연구기간 | 200302~200801 |
기여율 | 1 |
연구개발단계명 | 응용연구 |
6T분류명 | IT(정보기술) |
과제고유번호 | 1440000979 |
---|---|
세부과제번호 | 2004-S-088 |
연구과제명 | 광엑세스용광집적모듈 |
성과구분 | 출원 |
부처명 | 지식경제부 |
연구관리전문기관명 | 정보통신연구진흥원 |
연구주관기관명 | 한국전자통신연구원 |
성과제출연도 | 2005 |
연구기간 | 200302~200701 |
기여율 | 1 |
연구개발단계명 | 응용연구 |
6T분류명 | IT(정보기술) |
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