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규칙 기반 템플릿을 이용한 바이오 콤플렉스의 탐색 방법및 장치

  • 기술번호 : KST2015081650
  • 담당센터 : 대전기술혁신센터
  • 전화번호 : 042-610-2279
요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 본 발명은 하나의 종에 존재하는 방대한 단백질 상호작용 네트워크에서 규칙으로 표현되는 템플릿을 이용하여 의미가 있는 부분 단백질 상호작용 네트워크인 바이오 콤플렉스를 탐색하는 방법 및 장치에 관한 것이다. 본 발명에 따른 바이오 콤플렉스 탐색 방법은 (a) 하나 이상의 단백질로 구성되는 노드를 정의하고 상기 정의된 2개의 노드 및 하나의 관계로 구성되는 트리플을 정의하고 상기 트리플 또는 연산자를 이용하여 단일 규칙 및 복합 규칙을 정의함으로써 탐색을 원하는 콤플렉스에 대한 규칙 기반 템플릿을 정의하는 단계; (b) 상기 정의된 템플릿에 포함된 상기 노드에 해당하는 단백질 및 상기 트리플에 해당하는 단백질 상호작용 관계가 단백질 상호작용 네트워크에 실제로 존재하는지 여부를 분석함으로써 상기 템플릿에 정의된 규칙을 분석하는 단계; 및 (c) 상기 분석된 규칙에 포함된 트리플 및 상기 트리플에 포함된 노드를 실제 단백질 상호작용 네트워크의 단백질 상호작용 관계 및 단백질로 평가함으로써 상기 규칙과 일치하는 바이오 콤플렉스를 상기 단백질 상호작용 네트워크에서 탐색하는 단계;를 포함한다.
Int. CL G06Q 50/10A0 (2008.03) G06F 17/30 (2006.01)
CPC G16B 20/00(2013.01) G16B 20/00(2013.01)
출원번호/일자 1020060056529 (2006.06.22)
출원인 한국전자통신연구원
등록번호/일자 10-0785780-0000 (2007.12.07)
공개번호/일자 10-2007-0061185 (2007.06.13) 문서열기
공고번호/일자 (20071218) 문서열기
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보 대한민국  |   1020050120005   |   2005.12.08
법적상태 소멸
심사진행상태 수리
심판사항
구분
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2006.06.22)
심사청구항수 8

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 한국전자통신연구원 대한민국 대전광역시 유성구

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 최재훈 대한민국 대전 유성구
2 박종민 대한민국 전북 전주시 완산구
3 박선희 대한민국 대전 서구

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 리앤목특허법인 대한민국 서울 강남구 언주로 **길 **, *층, **층, **층, **층(도곡동, 대림아크로텔)

최종권리자

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번호 이름 국적 주소
1 한국전자통신연구원 대한민국 대전광역시 유성구
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번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 특허출원서
Patent Application
2006.06.22 수리 (Accepted) 1-1-2006-0442700-07
2 선행기술조사의뢰서
Request for Prior Art Search
2007.02.08 수리 (Accepted) 9-1-9999-9999999-89
3 선행기술조사보고서
Report of Prior Art Search
2007.03.13 수리 (Accepted) 9-1-2007-0013198-12
4 의견제출통지서
Notification of reason for refusal
2007.08.06 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2007-0429712-75
5 [명세서등 보정]보정서
[Amendment to Description, etc.] Amendment
2007.09.10 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) 1-1-2007-0655281-31
6 [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견(답변, 소명)서
[Opinion according to the Notification of Reasons for Refusal] Written Opinion(Written Reply, Written Substantiation)
2007.09.10 수리 (Accepted) 1-1-2007-0655279-49
7 등록결정서
Decision to grant
2007.11.02 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2007-0595455-39
8 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2009.08.04 수리 (Accepted) 4-1-2009-5150899-36
9 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2015.02.02 수리 (Accepted) 4-1-2015-0006137-44
번호, 청구항의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 청구항 표입니다.
번호 청구항
1 1
바이오 콤플렉스의 탐색 장치에 의한 단백질 상호작용 네트워크에서 바이오 콤플렉스의 탐색 방법에 있어서,(a) 하나 이상의 단백질로 구성되는 노드를 정의하고 상기 정의된 2개의 노드 및 하나의 관계로 구성되는 트리플을 정의하고 상기 트리플 또는 연산자를 이용하여 단일 규칙 및 복합 규칙을 정의함으로써 탐색을 원하는 콤플렉스에 대한 규칙 기반 템플릿을 정의하는 단계; (b) 상기 정의된 템플릿에 포함된 상기 노드에 해당하는 단백질 및 상기 트리플에 해당하는 단백질 상호작용 관계가 단백질 상호작용 네트워크에 실제로 존재하는지 여부를 분석함으로써 상기 템플릿에 정의된 규칙을 분석하는 단계; 및 (c) 상기 분석된 규칙에 포함된 트리플 및 상기 트리플에 포함된 노드를 실제 단백질 상호작용 네트워크의 단백질 상호작용 관계 및 단백질로 평가함으로써 상기 규칙과 일치하는 바이오 콤플렉스를 상기 단백질 상호작용 네트워크에서 탐색하는 단계;를 포함하는 단백질 상호작용 네트워크에서 바이오 콤플렉스의 탐색 방법
2 2
제 1항에 있어서, 상기 (a) 단계는 (a1) 단백질 이름, 참조 정보 및 온톨로지 용어를 통하여 상기 템플릿에 포함되고 하나 이상의 단백질로 구성되는 노드를 정의하는 단계;(a2) 상기 정의된 2개의 노드 및 관계의 이름, 방향 및 관련도를 통하여 정의되는 하나의 관계로 구성되고 상기 템플릿에 포함되는 트리플을 정의하는 단계; (a3) 상기 정의된 하나의 트리플 또는 이미 정의된 규칙을 이용하여 상기 템플릿에 포함되는 단일 규칙을 정의하는 단계; 및(a4) 상기 정의된 트리플, 이미 정의된 규칙 및 연산자를 이용하여 상기 템플릿에 포함되는 복합 규칙을 정의하는 단계;를 포함하는 것을 특징으로 하는 바이오 콤플렉스의 탐색 방법
3 3
제 1항에 있어서,상기 (b) 단계는(b1) 상기 정의된 템플릿에 포함된 상기 노드에 해당하는 단백질이 단백질 상호작용 네트워크에 존재하는지를 분석하는 단계; (b2) 상기 정의된 템플릿에 포함된 상기 트리플에 해당하는 단백질 상호작용 관계가 단백질 상호작용 네트워크에 존재하는지를 분석하는 단계; 및 (b3) 상기 정의된 템플릿에 포함된 상기 복합 규칙들을 단일 규칙으로 확장하여 상기 모든 규칙이 상기에서 분석된 트리플 및 연산자만으로 구성되도록 확장함으로써 상기 복합 규칙을 분석하는 단계;를 포함하는 것을 특징으로 하는 바이오 콤플렉스의 탐색 방법
4 4
제 1항에 있어서,상기 (c) 단계는(c1) 상기에서 정의된 탐색을 원하는 콤플렉스에 대한 템플릿에 있어서 중순위 연산자 규칙을 후순위 연산자 규칙으로 변형하는 단계;(c2) 상기 후순위 연산자 규칙에 포함된 규칙 항목을 분리하는 단계; (c3) 상기 항목 중 트리플 및 트리플에 포함된 두 단백질을 실제 네트워크의 단백질 상호작용 관계 및 단백질로 평가하는 단계; 및(c3) 상기 항목 중 기본 연산자 및 그로부터 변형 가능한 트리플 연산자를 평가하는 단계;를 포함하는 것을 특징으로 하는 바이오 콤플렉스의 탐색 방법
5 5
하나 이상의 단백질로 구성되는 노드를 정의하고 상기 정의된 2개의 노드 및 하나의 관계로 구성되는 트리플을 정의하고 상기 트리플 또는 연산자를 이용하여 단일 규칙 및 복합 규칙을 정의함으로써 탐색을 원하는 콤플렉스에 대한 규칙 기반 템플릿을 정의하는 템플릿 정의부; 상기 정의된 템플릿에 포함된 상기 노드에 해당하는 단백질 및 상기 트리플에 해당하는 단백질 상호작용 관계가 단백질 상호작용 네트워크에 실제로 존재하는지 여부를 분석함으로써 상기 템플릿에 정의된 규칙을 분석하는 규칙 분석부; 및 상기 분석된 규칙에 포함된 트리플 및 상기 트리플에 포함된 노드를 실제 단백질 상호작용 네트워크의 단백질 상호작용 관계 및 단백질로 평가함으로써 상기 규칙과 일치하는 바이오 콤플렉스를 상기 단백질 상호작용 네트워크에서 탐색하는 규칙 평가부;를 포함하는 단백질 상호작용 네트워크에서 바이오 콤플렉스의 탐색 장치
6 6
제 5항에 있어서, 상기 템플릿 정의부는 (a1) 단백질 이름, 참조 정보 및 온톨로지 용어를 통하여 상기 템플릿에 포함되고 하나 이상의 단백질로 구성되는 노드를 정의하는 단계;(a2) 상기 정의된 2개의 노드 및 관계의 이름, 방향 및 관련도를 통하여 정의되는 하나의 관계로 구성되고 상기 템플릿에 포함되는 트리플을 정의하는 단계; (a3) 상기 정의된 하나의 트리플 또는 이미 정의된 규칙을 이용하여 상기 템플릿에 포함되는 단일 규칙을 정의하는 단계; 및(a4) 상기 정의된 트리플, 이미 정의된 규칙 및 연산자를 이용하여 상기 템플릿에 포함되는 복합 규칙을 정의하는 단계;를 수행하는 것을 특징으로 하는 바이오 콤플렉스의 탐색 장치
7 7
제 5항에 있어서,상기 규칙 분석부는(b1) 상기 정의된 템플릿에 포함된 상기 노드에 해당하는 단백질이 단백질 상호작용 네트워크에 존재하는지를 분석하는 단계; (b2) 상기 정의된 템플릿에 포함된 상기 트리플에 해당하는 단백질 상호작용 관계가 단백질 상호작용 네트워크에 존재하는지를 분석하는 단계; 및 (b3) 상기 정의된 템플릿에 포함된 상기 복합 규칙들을 단일 규칙으로 확장하여 상기 모든 규칙이 상기에서 분석된 트리플 및 연산자만으로 구성되도록 확장함으로써 상기 복합 규칙을 분석하는 단계;를 수행하는 것을 특징으로 하는 바이오 콤플렉스의 탐색 장치
8 8
제 5항에 있어서,상기 규칙 평가부는(c1) 상기에서 정의된 탐색을 원하는 콤플렉스에 대한 템플릿에 있어서 중순위 연산자 규칙을 후순위 연산자 규칙으로 변형하는 단계;(c2) 상기 후순위 연산자 규칙에 포함된 규칙 항목을 분리하는 단계; (c3) 상기 항목 중 트리플 및 트리플에 포함된 두 단백질을 실제 네트워크의 단백질 상호작용 관계 및 단백질로 평가하는 단계; 및(c3) 상기 항목 중 기본 연산자 및 그로부터 변형 가능한 트리플 연산자를 평가하는 단계;를 수행하는 것을 특징으로 하는 바이오 콤플렉스의 탐색 장치
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순번 패밀리번호 국가코드 국가명 종류
1 US07869960 US 미국 FAMILY
2 US20070136001 US 미국 FAMILY

DOCDB 패밀리 정보

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순번 패밀리번호 국가코드 국가명 종류
1 US2007136001 US 미국 DOCDBFAMILY
2 US7869960 US 미국 DOCDBFAMILY
국가 R&D 정보가 없습니다.