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다중 전사 인자 조절 관계 예측 방법 및 장치

  • 기술번호 : KST2015081786
  • 담당센터 : 대전기술혁신센터
  • 전화번호 : 042-610-2279
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요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 본 발명은 실제 세포 내의 유전자 조절 방식인 다중 전사 인자 및 목표 유전자의 조절 관계를 예측할 수 있는 다중 전사 인자 조절 관계 예측 방법 및 장치를 제공한다. 본 발명에 따른 다중 전사 인자 조절 관계 예측 방법은 유전자 발현 프로파일 데이터를 전사 인자를 발현하는 유전자의 발현 프로파일 데이터 및 목표 유전자의 발현 프로파일 데이터로 분할하는 단계; 전사 인자들 및 목표 유전자들의 조합 가능한 모든 쌍들에 대해서 클러스터링하는 단계; 클러스터링 결과를 인터벌 그래프로 나타내는 단계; 및 전사 인자들 중에서 가장 적은 개수로 가장 많은 목표 유전자의 발현 구간을 차지하는 최적의 전사 인자들의 부분 집합을 계산하는 단계를 포함한다.
Int. CL G06Q 30/02D0 (2006.01)
CPC G06Q 30/02(2013.01) G06Q 30/02(2013.01)
출원번호/일자 1020060046520 (2006.05.24)
출원인 한국전자통신연구원
등록번호/일자 10-0759817-0000 (2007.09.12)
공개번호/일자 10-2007-0061107 (2007.06.13) 문서열기
공고번호/일자 (20070920) 문서열기
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보 대한민국  |   1020050119278   |   2005.12.08
법적상태 소멸
심사진행상태 수리
심판사항
구분
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2006.05.24)
심사청구항수 14

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 한국전자통신연구원 대한민국 대전광역시 유성구

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 정호열 대한민국 대전 유성구
2 김지은 대한민국 부산 사하구
3 박선희 대한민국 대전광역시 서구

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 리앤목특허법인 대한민국 서울 강남구 언주로 **길 **, *층, **층, **층, **층(도곡동, 대림아크로텔)

최종권리자

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번호 이름 국적 주소
1 한국전자통신연구원 대한민국 대전광역시 유성구
번호, 서류명, 접수/발송일자, 처리상태, 접수/발송일자의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 행정처리 표입니다.
번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 특허출원서
Patent Application		 2006.05.24 수리 (Accepted) 1-1-2006-0363569-24
2 선행기술조사의뢰서
Request for Prior Art Search		 2007.05.07 수리 (Accepted) 9-1-9999-9999999-89
3 선행기술조사보고서
Report of Prior Art Search		 2007.06.13 수리 (Accepted) 9-1-2007-0036194-13
4 등록결정서
Decision to grant		 2007.08.22 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2007-0452829-47
5 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2009.08.04 수리 (Accepted) 4-1-2009-5150899-36
6 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2015.02.02 수리 (Accepted) 4-1-2015-0006137-44
번호, 청구항의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 청구항 표입니다.
번호 청구항
1 1
유전자 발현 프로파일 데이터를 전사 인자를 발현하는 유전자의 발현 프로파일 데이터 및 목표 유전자의 발현 프로파일 데이터로 분할하는 단계; 전사 인자들 및 목표 유전자들의 조합 가능한 모든 쌍들에 대해서 클러스터링하는 단계; 클러스터링 결과를 인터벌 그래프로 나타내는 단계; 및 전사 인자들 중에서 가장 적은 개수로 가장 많은 목표 유전자의 발현 구간을 차지하는 최적의 전사 인자들의 부분 집합을 계산하는 단계를 포함하는 다중 전사 인자 조절 관계 예측 방법
2 2
제 1항에 있어서, 상기 데이터 분할 단계는 전사 인자 데이터를 이용하여 수행되는 것을 특징으로 하는 방법
3 3
제 1항에 있어서, 상기 클러스터링 단계는 지역 클러스터링에 의해 수행되고, 그에 의해 동시 관계(simultaneous correlation), 시간 지연 관계(time-delayed correlation), 반전 관계(inverted correlation) 및 반전 및 시간 지연 관계(Inverted and time-delayed correlation)에 있는 조절 유전자 쌍이 클러스터링 되는 것을 특징으로 하는 방법
4 4
제 3항에 있어서, 상기 지역 클러스터링은 조합 가능한 모든 유전자 쌍의 조절 관계 정도를 수치로 계산하고 대응 매트릭스를 구하는 단계, 및 p-value를 이용하여 임계치 이상의 수치를 갖는 유전자 쌍을 선별하는 단계를 포함하는 것을 특징으로 하는 방법
5 5
제 1항에 있어서, 상기 부분 집합 계산 단계는 수학식 1에 의해 수행되는 것을 특징으로 하는 방법:<수학식 1>min{|S|} and max{(S0(1) - S0(0)) + (S1(1) - S1(0)) + … + (Sm(1) - Sm(0))}여기서, S는 전체 전사 인자들의 부분집합을 의미하고, l은 특정 시점을 의미하고, m은 특정 전사 인자를 의미한다
6 6
제 1항에 있어서, 상기 데이터 분할 단계 이전에 유전자 발현 프로파일 데이터 및 전사 인자 데이터를 입력하는 단계를 더 포함하는 것을 특징으로 하는 방법
7 7
제 1항에 있어서, 상기 데이터 분할 단계 이전에 누락 데이터 값 보정 및 유전자 발현 프로파일 데이터 정규화 단계를 더 포함하는 것을 특징으로 하는 방법
8 8
유전자 발현 프로파일 데이터를 전사 인자를 발현하는 유전자의 발현 프로파일 데이터 및 목표 유전자의 발현 프로파일 데이터로 분할하는 데이터 분할부; 전사 인자들 및 목표 유전자들의 조합 가능한 모든 쌍들에 대해서 클러스터링하는 클러스터링부; 클러스터링 결과를 인터벌 그래프로 나타내는 인터벌 그래프 생성부; 및 전사 인자들 중에서 가장 적은 개수로 가장 많은 목표 유전자의 발현 구간을 차지하는 최적의 전사 인자들의 부분 집합을 계산하는 최적화부를 포함하는 다중 전사 인자 조절 관계 예측 장치
9 9
제 8항에 있어서, 상기 데이터 분할부는 전사 인자 데이터를 이용하여 데이터 분할을 수행하는 것을 특징으로 하는 장치
10 10
제 8항에 있어서, 상기 클러스터링부는 지역 클러스터링을 수행하고, 그에 의해 동시 관계(simultaneous correlation), 시간 지연 관계(time-delayed correlation), 반전 관계(inverted correlation) 및 반전 및 시간 지연 관계(Inverted and time-delayed correlation)에 있는 조절 유전자 쌍을 클러스터링 하는 것을 특징으로 하는 장치
11 11
제 10항에 있어서, 상기 클러스터링부는 조합 가능한 모든 유전자 쌍의 조절 관계 정도를 수치로 계산하고 대응 매트릭스를 구하는 매트릭스 생성부, 및 p-value를 이용하여 임계치 이상의 수치를 갖는 유전자 쌍을 선별하는 선별부를 포함하는 것을 특징으로 하는 장치
12 12
제 8항에 있어서, 상기 최적부는 수학식 1을 이용하여 최적화를 수행하는 것을 특징으로 하는 장치:<수학식 1>min{|S|} and max{(S0(1) - S0(0)) + (S1(1) - S1(0)) + … + (Sm(1) - Sm(0))}여기서, S는 전체 전사 인자들의 부분집합을 의미하고, l은 특정 시점을 의미하고, m은 특정 전사 인자를 의미한다
13 13
제 8항에 있어서, 유전자 발현 프로파일 데이터 및 전사 인자 데이터를 수신하는 입력부를 더 포함하는 것을 특징으로 하는 장치
14 14
제 8항에 있어서, 누락 데이터 값 보정 및 유전자 발현 프로파일 데이터 정규화를 수행하는 데이터 처리부를 더 포함하는 것을 특징으로 하는 장치
지정국 정보가 없습니다
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순번 패밀리번호 국가코드 국가명 종류
1 US20070134705 US 미국 FAMILY

DOCDB 패밀리 정보

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순번 패밀리번호 국가코드 국가명 종류
1 US2007134705 US 미국 DOCDBFAMILY
국가 R&D 정보가 없습니다.