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단백질 상동성 관계를 이용한 단백질 상호작용 검증 방법및 시스템

  • 기술번호 : KST2015081408
  • 담당센터 : 대전기술혁신센터
  • 전화번호 : 042-610-2279
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요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 본 발명은 하나의 종에 존재하는 단백질 상호작용 관계를 이종에 대한 단백질 상호작용 관계의 상동성을 이용하여 검증하는 방법 및 시스템에 관한 것이다. 본 발명에 따른 단백질 상호작용 검증 방법은 (a) 한 종의 소스 단백질들과 관련성이 높은 이종 단백질들을 다른 종의 전체 이종 단백질들로부터 필터링하는 단계를 포함하는 한 종의 소스 단백질들 및 하나 이상의 다른 종의 이종 단백질들 사이의 하나 이상의 상동 관계를 생성하는 단계; (b) 상기 생성된 단백질 상동 관계를 이용하여 특정 소스 단백질 상호작용 관계에 대응하는 하나 이상의 이종 단백질 상호작용 관계를 생성하는 단계; 및 (c) 상기 생성된 하나 이상의 이종 단백질 상호작용 관계가 상기 하나 이상의 다른 종에 존재하는지 여부를 평가하는 단계;를 포함한다. 본 발명에 따르면, 고비용의 생물학적 실험을 통하지 않고서도 기존의 저비용으로 쉽게 실험을 할 수 있는 하등생물의 단백질 상호작용 관계들을 이용하여 특정 고등생물의 단백질 상호작용 관계를 자동으로 검증할 수 있다.바이오인포메틱스, 단백질 상호작용, 관계 검증, 상동
Int. CL G06F 17/30 (2006.01)
CPC
출원번호/일자 1020060025682 (2006.03.21)
출원인 한국전자통신연구원
등록번호/일자 10-0753827-0000 (2007.08.24)
공개번호/일자 10-2007-0060996 (2007.06.13) 문서열기
공고번호/일자 (20070831) 문서열기
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보 대한민국  |   1020050119280   |   2005.12.08
법적상태 소멸
심사진행상태 수리
심판사항
구분
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2006.03.21)
심사청구항수 11

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 한국전자통신연구원 대한민국 대전광역시 유성구

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 최재훈 대한민국 대전 유성구
2 박종민 대한민국 전북 전주시 완산구
3 박선희 대한민국 대전광역시 서구

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 리앤목특허법인 대한민국 서울 강남구 언주로 **길 **, *층, **층, **층, **층(도곡동, 대림아크로텔)

최종권리자

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번호 이름 국적 주소
1 한국전자통신연구원 대한민국 대전광역시 유성구
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번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 특허출원서
Patent Application		 2006.03.21 수리 (Accepted) 1-1-2006-0196469-94
2 의견제출통지서
Notification of reason for refusal		 2007.03.22 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2007-0149714-76
3 의견서
Written Opinion		 2007.05.22 수리 (Accepted) 1-1-2007-0375752-44
4 명세서등보정서
Amendment to Description, etc.		 2007.05.22 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) 1-1-2007-0375753-90
5 등록결정서
Decision to grant		 2007.07.25 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2007-0401615-00
6 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2009.08.04 수리 (Accepted) 4-1-2009-5150899-36
7 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2015.02.02 수리 (Accepted) 4-1-2015-0006137-44
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번호 청구항
1 1
단백질 상호작용 검증 시스템의 단백질 상호작용 검증 방법에 있어서,(a) 한 종의 소스 단백질들과 관련성이 높은 이종 단백질들을 다른 종의 전체 이종 단백질들로부터 필터링하는 단계를 포함하는 한 종의 소스 단백질들 및 하나 이상의 다른 종의 이종 단백질들 사이의 하나 이상의 상동 관계를 생성하는 단계; (b) 상기 생성된 단백질 상동 관계를 이용하여 특정 소스 단백질 상호작용 관계에 대응하는 하나 이상의 이종 단백질 상호작용 관계를 생성하는 단계; 및 (c) 상기 생성된 하나 이상의 이종 단백질 상호작용 관계가 상기 하나 이상의 다른 종에 존재하는지 여부를 평가하는 단계;를 포함하는 단백질 상호작용 검증 방법
2 2
제 1항에 있어서, 상기 (a) 단계는 (a1) 한 종의 소스 단백질들과 관련성이 높은 이종 단백질들을 다른 종의 전체 이종 단백질들로부터 필터링하는 단계;(a2) 상기 소스 단백질들 및 상기 필터링 된 이종 단백질들 사이의 상동성을 비교하는 단계; 및 (a3) 상기 소스 단백질들 및 상기 필터링 된 이종 단백질들 사이에 상동성이 존재하는 경우 상기 소스 단백질들 및 상기 이종 단백질들 사이의 상동 관계를 설정하는 단계;를 포함하는 것을 특징으로 하는 단백질 상호작용 검증 방법
3 3
제 2항에 있어서, 상기 (a1) 단계는단백질 이름 및 상기 단백질을 구성하는 유전자 이름을 통해 이종 단백질들을 필터링하는 단계; 및 단백질에 매핑된 개념을 통해 이종 단백질들을 필터링하는 단계;를 포함하는 것을 특징으로 하는 단백질 상호작용 검증 방법
4 4
제 2항에 있어서, 상기 (a2) 단계는단백질 이름 및 이 단백질을 구성하는 유전자 이름을 통해 이종의 두 단백질 상동 관계를 비교하는 단계;단백질에 매핑된 개념을 통해 이종의 두 단백질 상동 관계를 비교하는 단계;단백질 서열의 특징을 통해 이종의 두 단백질 상동 관계를 비교하는 단계; 및단백질 서열을 통해 이종의 두 단백질 상동 관계를 비교하는 단계;를 포함하는 것을 특징으로 하는 단백질 상호작용 검증 방법
5 5
제 1항에 있어서, 상기 (b) 단계는(b1) 상기 특정 소스 단백질 상호작용 관계에 포함된 두 단백질들에 대해 각각 상동 관계에 있는 이종의 두 상동 단백질들을 탐색하는 단계; 및(b2) 상기 탐색된 이종의 두 상동 단백질들 사이의 상호작용 관계를 설정하는 단계;를 포함하는 것을 특징으로 하는 단백질 상호작용 검증 방법
6 6
제 1항에 있어서, 상기 (c) 단계는 (c1) 상기 생성된 하나 이상의 단백질 상호작용 관계가 상기 하나 이상의 다른 종에 존재하는지 여부를 검색하는 단계; (c2) 상기 하나 이상의 단백질 상호작용 관계가 하나 이상의 다른 종에 존재하는 경우 신뢰도를 증가시키고 존재하지 않는 경우 신뢰도를 감소시키는 단계; 및 (c3) 상기 평가된 신뢰도에 따라 상기 소스 단백질 상호작용 관계를 검증하는 단계;를 포함하는 것을 특징으로 하는 단백질 상호작용 검증 방법
7 7
복수 종의 단백질들에 대한 정보를 저장하는 단백질 정보 데이터베이스;복수 종의 단백질 상호작용 관계들에 대한 정보를 저장하는 단백질 상호작용 관계 데이터베이스; 상기 단백질 정보 데이터베이스로부터 한 종의 소스 단백질들과 관련성이 높은 이종 단백질들을 다른 종의 전체 이종 단백질들로부터 필터링하는 단계를 포함하는 한 종의 소스 단백질들 및 하나 이상의 다른 종의 이종 단백질들 사이의 하나 이상의 상동 관계를 생성하는 상동 관계 생성부;상기 생성된 단백질 상동 관계를 이용하여 특정 소스 단백질 상호작용 관계에 대응하는 하나 이상의 이종 단백질 상호작용 관계를 생성하는 상호작용 관계 생성부; 및상기 단백질 상호작용 관계 데이터베이스를 이용하여 상기 생성된 하나 이상의 이종 단백질 상호작용 관계가 상기 하나 이상의 다른 종에 존재하는지 여부를 평가하는 상호작용 관계 평가부;를 포함하는 단백질 상호작용 검증 시스템
8 8
제 7항에 있어서, 상기 상동 관계 생성부로부터 생성된 상기 상동 관계에 대한 정보를 저장하는 단백질 상동 관계 데이터베이스를 추가로 포함하는 것을 특징으로 하는 단백질 상호작용 검증 시스템
9 9
제 7항에 있어서, 상기 상동 관계 생성부는한 종의 소스 단백질들과 관련성이 높은 이종 단백질들을 다른 종의 전체 이종 단백질들로부터 필터링하고, 상기 소스 단백질들 및 상기 필터링 된 이종 단백질들 사이의 상동성을 비교하며, 상기 소스 단백질들 및 상기 필터링 된 이종 단백질들 사이에 상동성이 존재하는 경우 상기 소스 단백질들 및 상기 이종 단백질들 사이의 상동 관계를 설정하는 것을 수행하는 것을 특징으로 하는 단백질 상호작용 검증 시스템
10 10
제 7항에 있어서, 상기 상호작용 관계 생성부는상기 특정 소스 단백질 상호작용 관계에 포함된 두 단백질들에 대해 각각 상동 관계에 있는 이종의 두 상동 단백질들을 탐색하며, 상기 탐색된 이종의 두 상동 단백질들 사이의 상호작용 관계를 설정하는 것을 수행하는 것을 특징으로 하는 단백질 상호작용 검증 시스템
11 11
제 7항에 있어서, 상기 상호작용 관계 평가부는 상기 생성된 하나 이상의 단백질 상호작용 관계가 상기 하나 이상의 다른 종에 존재하는지 여부를 검색하고, 상기 하나 이상의 단백질 상호작용 관계가 하나 이상의 다른 종에 존재하는 경우 신뢰도를 증가시키고 존재하지 않는 경우 신뢰도를 감소시키며, 상기 평가된 신뢰도에 따라 상기 소스 단백질 상호작용 관계를 검증하는 것을 수행하는 것을 특징으로 하는 단백질 상호작용 검증 시스템
지정국 정보가 없습니다
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순번 패밀리번호 국가코드 국가명 종류
1 US20070136003 US 미국 FAMILY

DOCDB 패밀리 정보

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순번 패밀리번호 국가코드 국가명 종류
1 US2007136003 US 미국 DOCDBFAMILY
국가 R&D 정보가 없습니다.